Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Q3EDT7

Protein Details
Accession A0A1Q3EDT7    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
282-304ISLRPETKTKLKKVRETFEKTLKHydrophilic
340-365AEQQKILERERKRSIRKSQGKSVRKVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
347-365ERERKRSIRKSQGKSVRKV
Subcellular Location(s) golg 6, cyto 5.5, cyto_nucl 5, E.R. 4, nucl 3.5, mito 3, extr 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012879  CCDC47  
Gene Ontology GO:0005783  C:endoplasmic reticulum  
GO:0016020  C:membrane  
GO:0005509  F:calcium ion binding  
GO:0032469  P:endoplasmic reticulum calcium ion homeostasis  
Pfam View protein in Pfam  
PF07946  CCDC47  
CDD cd22249  UDM1_RNF168_RNF169-like  
Amino Acid Sequences MASFINVLSRLTPPPFAAPEEYDGLEYRWKLFVFRPAYFKNEVFLLGALLFYVAFFFVGQSVNAKKAEKWVSGYRDLLKRQFSNPDVNGLVRDGHSDFFTFSTGRRNVESLHTIFRLKPYHDLAQTVFLTVWSLVDLQYSPINDLQLDFKLFSSALPHDFVWAVVAKDELKNIKDSRWDLTFTKASENSNLPSNMSIMSELADVTEAIFKSTAILDALKDPKIAPYFRSLSVTDQPRERPSKLSKPEKHVILSLVCPSSSHVDDLNGLVSALFPFIDSLTKISLRPETKTKLKKVRETFEKTLKVEAEQAKKEELEQAREDQKAARRKVEEERVSKLSAAEQQKILERERKRSIRKSQGKSVRKV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.28
3 0.29
4 0.3
5 0.29
6 0.3
7 0.31
8 0.3
9 0.26
10 0.25
11 0.23
12 0.24
13 0.22
14 0.2
15 0.21
16 0.2
17 0.21
18 0.24
19 0.32
20 0.33
21 0.37
22 0.42
23 0.42
24 0.47
25 0.49
26 0.46
27 0.39
28 0.33
29 0.3
30 0.23
31 0.2
32 0.16
33 0.11
34 0.11
35 0.08
36 0.07
37 0.06
38 0.05
39 0.05
40 0.04
41 0.04
42 0.04
43 0.04
44 0.05
45 0.06
46 0.07
47 0.1
48 0.12
49 0.16
50 0.18
51 0.2
52 0.19
53 0.27
54 0.33
55 0.31
56 0.36
57 0.4
58 0.43
59 0.46
60 0.49
61 0.47
62 0.49
63 0.5
64 0.5
65 0.49
66 0.46
67 0.45
68 0.49
69 0.46
70 0.48
71 0.44
72 0.43
73 0.38
74 0.36
75 0.33
76 0.26
77 0.24
78 0.15
79 0.17
80 0.13
81 0.12
82 0.12
83 0.12
84 0.12
85 0.11
86 0.12
87 0.1
88 0.1
89 0.18
90 0.2
91 0.21
92 0.22
93 0.22
94 0.22
95 0.26
96 0.31
97 0.24
98 0.26
99 0.26
100 0.26
101 0.26
102 0.29
103 0.29
104 0.25
105 0.28
106 0.29
107 0.33
108 0.32
109 0.34
110 0.29
111 0.31
112 0.3
113 0.25
114 0.2
115 0.14
116 0.14
117 0.12
118 0.11
119 0.05
120 0.06
121 0.05
122 0.06
123 0.06
124 0.06
125 0.08
126 0.08
127 0.09
128 0.09
129 0.1
130 0.09
131 0.1
132 0.1
133 0.1
134 0.11
135 0.1
136 0.09
137 0.1
138 0.1
139 0.09
140 0.1
141 0.1
142 0.11
143 0.12
144 0.12
145 0.12
146 0.12
147 0.12
148 0.1
149 0.1
150 0.08
151 0.06
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.09
156 0.1
157 0.1
158 0.14
159 0.15
160 0.16
161 0.2
162 0.21
163 0.23
164 0.22
165 0.24
166 0.21
167 0.25
168 0.26
169 0.21
170 0.24
171 0.22
172 0.21
173 0.21
174 0.22
175 0.18
176 0.2
177 0.19
178 0.16
179 0.15
180 0.14
181 0.12
182 0.11
183 0.1
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.05
188 0.05
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.07
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.05
201 0.06
202 0.06
203 0.1
204 0.13
205 0.13
206 0.13
207 0.13
208 0.16
209 0.19
210 0.2
211 0.16
212 0.2
213 0.23
214 0.24
215 0.27
216 0.24
217 0.25
218 0.31
219 0.35
220 0.31
221 0.32
222 0.34
223 0.38
224 0.42
225 0.39
226 0.4
227 0.42
228 0.5
229 0.56
230 0.64
231 0.64
232 0.67
233 0.72
234 0.69
235 0.62
236 0.54
237 0.47
238 0.38
239 0.33
240 0.28
241 0.22
242 0.18
243 0.16
244 0.16
245 0.18
246 0.16
247 0.16
248 0.13
249 0.13
250 0.14
251 0.14
252 0.13
253 0.09
254 0.08
255 0.07
256 0.06
257 0.06
258 0.05
259 0.05
260 0.04
261 0.04
262 0.05
263 0.06
264 0.07
265 0.08
266 0.11
267 0.12
268 0.12
269 0.15
270 0.22
271 0.23
272 0.27
273 0.33
274 0.38
275 0.46
276 0.55
277 0.62
278 0.65
279 0.71
280 0.77
281 0.79
282 0.81
283 0.82
284 0.82
285 0.8
286 0.8
287 0.78
288 0.7
289 0.66
290 0.57
291 0.48
292 0.46
293 0.46
294 0.44
295 0.41
296 0.42
297 0.39
298 0.38
299 0.38
300 0.38
301 0.35
302 0.32
303 0.32
304 0.36
305 0.39
306 0.4
307 0.4
308 0.37
309 0.41
310 0.45
311 0.46
312 0.48
313 0.46
314 0.5
315 0.59
316 0.64
317 0.65
318 0.6
319 0.63
320 0.59
321 0.57
322 0.53
323 0.44
324 0.37
325 0.36
326 0.37
327 0.35
328 0.33
329 0.34
330 0.39
331 0.42
332 0.44
333 0.44
334 0.44
335 0.49
336 0.58
337 0.65
338 0.69
339 0.75
340 0.81
341 0.83
342 0.88
343 0.87
344 0.88
345 0.89