FuNGI

A0A1Q3EDT2

Protein Details

Accession

A0A1Q3EDT2

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
9-34	ISLLFHPKKNKKSTSISSPRPPPPNS	Hydrophilic
39-64	SRPSSPVKAKPSPKPSPPKPNADDDE	Hydrophilic
171-192	GKGLTNGKKKFQKKTRQVFIVP	Hydrophilic
607-630	TLLSSNGPPKPKKRKAHPTTAVAI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
17-21	KNKKS
27-31	PRPPP
38-56	GSRPSSPVKAKPSPKPSPP
171-183	GKGLTNGKKKFQK
614-622	PPKPKKRKA

Subcellular Location(s)

mito_nucl 13.833, nucl 13.5, mito 13, cyto_mito 7.333

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MAPKAKADISLLFHPKKNKKSTSISSPRPPPPNSALNGSRPSSPVKAKPSPKPSPPKPNADDDEADLQLPDGPYQEFRIMSSALNGWKYDVMKFDSRKSVDILRWQGPIKLNRKDLRREDPSMSGAGQAVRPMLGLDGQPVIGSDGKTVMVDSEGRPVTENGASGSGAGKGKGLTNGKKKFQKKTRQVFIVPDEVRNLRKEERYPWVIEDAPGSEVWTAQLDDLGKAETHAFFMPAANDVFKFVPSHRYYKFQKKLKHDMPTDTTSVESAYQKSLKRDPSTWLHQRNGKGPSAATAAMFKAEADGQPQANGSLVHQAQQSLGPGGRRLKAVDSGADDLFGEDDEDNGAAKRRAKEFGGEGDMDEMVYEEDFADDEEKMDVEDTNDQEAKELEERLKKEYKNANKTREGYIDESDEEEEKPGMTKQAKRMQKMLRAREGNDVYESEEEEDNPYASSEEEEDEEEEIVPQTGPAVQPQSKSPTPSQTSSSNLELMKATTQINGAVHTTASRATSPVPGLGGHSVVAKRATSPKVPKIKPNLTNTGRSGSPLASRASSPVSPVGAGGMTTATSPTPGSRAGSPAAVNGVQNGQSQNKKRKAEEAGSLSPTLLSSNGPPKPKKRKAHPTTAVAIPAGPLEERLLIEWLKNTPTANASTRECIQYFTPYLTDEEKKAQFTGLVKEIAQLKNGVLILRPAYRDSPAATPTASG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.55
2	0.61
3	0.66
4	0.71
5	0.7
6	0.7
7	0.75
8	0.8
9	0.81
10	0.82
11	0.82
12	0.81
13	0.83
14	0.83
15	0.81
16	0.75
17	0.71
18	0.67
19	0.66
20	0.6
21	0.58
22	0.55
23	0.54
24	0.57
25	0.52
26	0.48
27	0.42
28	0.43
29	0.42
30	0.44
31	0.45
32	0.48
33	0.56
34	0.61
35	0.7
36	0.75
37	0.77
38	0.8
39	0.83
40	0.84
41	0.86
42	0.85
43	0.85
44	0.8
45	0.8
46	0.75
47	0.7
48	0.62
49	0.55
50	0.52
51	0.42
52	0.37
53	0.27
54	0.23
55	0.19
56	0.17
57	0.14
58	0.1
59	0.11
60	0.13
61	0.16
62	0.19
63	0.16
64	0.17
65	0.19
66	0.19
67	0.18
68	0.19
69	0.19
70	0.2
71	0.22
72	0.21
73	0.19
74	0.22
75	0.23
76	0.22
77	0.23
78	0.24
79	0.31
80	0.34
81	0.38
82	0.43
83	0.44
84	0.44
85	0.44
86	0.45
87	0.41
88	0.47
89	0.48
90	0.42
91	0.45
92	0.44
93	0.46
94	0.46
95	0.5
96	0.5
97	0.51
98	0.57
99	0.59
100	0.65
101	0.7
102	0.71
103	0.72
104	0.71
105	0.68
106	0.63
107	0.61
108	0.56
109	0.48
110	0.4
111	0.31
112	0.25
113	0.21
114	0.17
115	0.14
116	0.12
117	0.1
118	0.1
119	0.09
120	0.08
121	0.08
122	0.07
123	0.08
124	0.08
125	0.08
126	0.08
127	0.08
128	0.1
129	0.1
130	0.1
131	0.09
132	0.09
133	0.1
134	0.1
135	0.1
136	0.08
137	0.08
138	0.09
139	0.1
140	0.16
141	0.16
142	0.16
143	0.18
144	0.18
145	0.2
146	0.19
147	0.19
148	0.12
149	0.13
150	0.13
151	0.11
152	0.12
153	0.12
154	0.12
155	0.11
156	0.11
157	0.1
158	0.12
159	0.18
160	0.24
161	0.29
162	0.38
163	0.46
164	0.53
165	0.62
166	0.67
167	0.72
168	0.76
169	0.79
170	0.79
171	0.83
172	0.84
173	0.83
174	0.79
175	0.74
176	0.68
177	0.67
178	0.57
179	0.47
180	0.41
181	0.36
182	0.35
183	0.31
184	0.31
185	0.26
186	0.3
187	0.32
188	0.34
189	0.4
190	0.42
191	0.42
192	0.4
193	0.39
194	0.34
195	0.31
196	0.27
197	0.2
198	0.17
199	0.14
200	0.13
201	0.09
202	0.08
203	0.09
204	0.08
205	0.07
206	0.06
207	0.08
208	0.08
209	0.08
210	0.09
211	0.09
212	0.08
213	0.08
214	0.09
215	0.08
216	0.09
217	0.09
218	0.09
219	0.08
220	0.09
221	0.09
222	0.09
223	0.1
224	0.09
225	0.09
226	0.1
227	0.1
228	0.1
229	0.11
230	0.1
231	0.19
232	0.21
233	0.27
234	0.27
235	0.35
236	0.41
237	0.51
238	0.59
239	0.57
240	0.63
241	0.66
242	0.75
243	0.74
244	0.77
245	0.69
246	0.66
247	0.64
248	0.59
249	0.52
250	0.41
251	0.34
252	0.25
253	0.22
254	0.18
255	0.13
256	0.11
257	0.13
258	0.17
259	0.19
260	0.23
261	0.28
262	0.33
263	0.35
264	0.36
265	0.38
266	0.4
267	0.47
268	0.52
269	0.52
270	0.5
271	0.52
272	0.53
273	0.54
274	0.51
275	0.44
276	0.36
277	0.29
278	0.27
279	0.24
280	0.22
281	0.16
282	0.13
283	0.11
284	0.1
285	0.1
286	0.08
287	0.06
288	0.06
289	0.06
290	0.07
291	0.09
292	0.08
293	0.09
294	0.09
295	0.08
296	0.08
297	0.08
298	0.07
299	0.11
300	0.11
301	0.12
302	0.12
303	0.13
304	0.12
305	0.13
306	0.13
307	0.09
308	0.1
309	0.08
310	0.11
311	0.14
312	0.15
313	0.15
314	0.15
315	0.15
316	0.18
317	0.18
318	0.16
319	0.16
320	0.17
321	0.16
322	0.15
323	0.14
324	0.1
325	0.09
326	0.08
327	0.06
328	0.04
329	0.04
330	0.04
331	0.04
332	0.04
333	0.04
334	0.06
335	0.07
336	0.11
337	0.14
338	0.16
339	0.18
340	0.18
341	0.2
342	0.21
343	0.22
344	0.21
345	0.18
346	0.16
347	0.15
348	0.14
349	0.12
350	0.1
351	0.07
352	0.04
353	0.03
354	0.03
355	0.03
356	0.03
357	0.03
358	0.03
359	0.04
360	0.04
361	0.05
362	0.05
363	0.05
364	0.05
365	0.05
366	0.05
367	0.05
368	0.08
369	0.08
370	0.11
371	0.12
372	0.12
373	0.12
374	0.12
375	0.13
376	0.11
377	0.12
378	0.13
379	0.17
380	0.18
381	0.23
382	0.29
383	0.27
384	0.34
385	0.41
386	0.48
387	0.54
388	0.61
389	0.63
390	0.64
391	0.66
392	0.62
393	0.56
394	0.5
395	0.42
396	0.35
397	0.3
398	0.23
399	0.21
400	0.19
401	0.16
402	0.13
403	0.11
404	0.09
405	0.07
406	0.08
407	0.08
408	0.12
409	0.16
410	0.2
411	0.28
412	0.36
413	0.42
414	0.44
415	0.52
416	0.53
417	0.58
418	0.62
419	0.61
420	0.61
421	0.58
422	0.58
423	0.58
424	0.53
425	0.45
426	0.38
427	0.31
428	0.24
429	0.21
430	0.2
431	0.13
432	0.12
433	0.11
434	0.11
435	0.11
436	0.1
437	0.09
438	0.09
439	0.07
440	0.07
441	0.08
442	0.07
443	0.07
444	0.07
445	0.08
446	0.08
447	0.09
448	0.09
449	0.08
450	0.08
451	0.07
452	0.07
453	0.06
454	0.05
455	0.05
456	0.06
457	0.06
458	0.08
459	0.13
460	0.14
461	0.15
462	0.18
463	0.25
464	0.26
465	0.3
466	0.31
467	0.34
468	0.37
469	0.38
470	0.39
471	0.35
472	0.38
473	0.37
474	0.36
475	0.31
476	0.27
477	0.26
478	0.22
479	0.2
480	0.17
481	0.15
482	0.14
483	0.11
484	0.11
485	0.12
486	0.12
487	0.12
488	0.12
489	0.1
490	0.1
491	0.09
492	0.09
493	0.09
494	0.09
495	0.09
496	0.09
497	0.1
498	0.13
499	0.13
500	0.13
501	0.13
502	0.12
503	0.13
504	0.13
505	0.12
506	0.09
507	0.12
508	0.11
509	0.12
510	0.13
511	0.12
512	0.13
513	0.2
514	0.23
515	0.28
516	0.36
517	0.43
518	0.52
519	0.55
520	0.61
521	0.64
522	0.7
523	0.7
524	0.7
525	0.71
526	0.65
527	0.68
528	0.63
529	0.56
530	0.46
531	0.4
532	0.34
533	0.26
534	0.25
535	0.21
536	0.21
537	0.18
538	0.18
539	0.19
540	0.21
541	0.2
542	0.19
543	0.18
544	0.17
545	0.15
546	0.15
547	0.14
548	0.1
549	0.09
550	0.08
551	0.06
552	0.05
553	0.05
554	0.06
555	0.05
556	0.06
557	0.07
558	0.07
559	0.09
560	0.1
561	0.12
562	0.13
563	0.16
564	0.17
565	0.19
566	0.18
567	0.17
568	0.19
569	0.17
570	0.16
571	0.14
572	0.15
573	0.14
574	0.16
575	0.18
576	0.21
577	0.28
578	0.37
579	0.46
580	0.53
581	0.57
582	0.58
583	0.63
584	0.65
585	0.63
586	0.64
587	0.61
588	0.58
589	0.55
590	0.53
591	0.44
592	0.36
593	0.3
594	0.22
595	0.15
596	0.1
597	0.12
598	0.2
599	0.25
600	0.33
601	0.39
602	0.49
603	0.6
604	0.69
605	0.75
606	0.77
607	0.84
608	0.85
609	0.9
610	0.89
611	0.84
612	0.8
613	0.73
614	0.64
615	0.52
616	0.43
617	0.32
618	0.24
619	0.18
620	0.12
621	0.09
622	0.08
623	0.1
624	0.1
625	0.11
626	0.13
627	0.13
628	0.14
629	0.16
630	0.17
631	0.18
632	0.19
633	0.19
634	0.18
635	0.21
636	0.25
637	0.26
638	0.29
639	0.31
640	0.34
641	0.36
642	0.38
643	0.36
644	0.33
645	0.31
646	0.33
647	0.31
648	0.29
649	0.27
650	0.24
651	0.27
652	0.3
653	0.31
654	0.27
655	0.33
656	0.34
657	0.35
658	0.35
659	0.32
660	0.3
661	0.3
662	0.34
663	0.31
664	0.29
665	0.27
666	0.31
667	0.37
668	0.34
669	0.33
670	0.27
671	0.23
672	0.26
673	0.27
674	0.23
675	0.17
676	0.19
677	0.21
678	0.24
679	0.26
680	0.24
681	0.26
682	0.27
683	0.29
684	0.29
685	0.3
686	0.27
687	0.28

A0A1Q3EDT2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer