Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Q3EIF6

Protein Details
Accession A0A1Q3EIF6    Localization Confidence High Confidence Score 22.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
91-111KGLPVRKPRAQNSKNHSNQKLHydrophilic
163-191LLKVIKGKVQAKKREKRGNKEKNDDDDSMHydrophilic
223-249DVKPTKQSVVPSKRPKKRAKEDSEIEGHydrophilic
254-273AENNPNKRPKKPSASHKGKSHydrophilic
327-346AKAISKPSSRKRTRKDESETHydrophilic
498-522GAALRAPKSRKKSSKKGKNTGDDDDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
168-183KGKVQAKKREKRGNKE
235-242KRPKKRAK
259-280NKRPKKPSASHKGKSPEKKPNK
306-341VKGKGKKISNQKPAPPKAKAPAKAISKPSSRKRTRK
368-381SKKLAPKGKPASKR
494-515KNPDGAALRAPKSRKKSSKKGK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012310  DNA_ligase_ATP-dep_cent  
IPR016059  DNA_ligase_ATP-dep_CS  
IPR029319  DNA_ligase_OB  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR007527  Znf_SWIM  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003910  F:DNA ligase (ATP) activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF01068  DNA_ligase_A_M  
PF14743  DNA_ligase_OB_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00333  DNA_LIGASE_A2  
PS50160  DNA_LIGASE_A3  
PS50966  ZF_SWIM  
CDD cd07896  Adenylation_kDNA_ligase_like  
cd08041  OBF_kDNA_ligase_like  
Amino Acid Sequences MVNDKLAEFNGIKPNFTLEEGEEKVIQPKFVTLKFTVKRNSEHFYCTCPAWRNQIGTPVNARTCKHLISLLGEQYEEARLEYMNPGGPPLKGLPVRKPRAQNSKNHSNQKLPSNPSPDSSGSQKKVLGATLTSKSTKPTSVPSSKPFSTSAAPQNAKPSSSSLLKVIKGKVQAKKREKRGNKEKNDDDDSMEVDDDENNMDDIGDLDDDVDMDEDENDDEDEDVKPTKQSVVPSKRPKKRAKEDSEIEGEEEEAENNPNKRPKKPSASHKGKSPEKKPNKGNEAISETEDDSDSNQEDNNKKSTLVKGKGKKISNQKPAPPKAKAPAKAISKPSSRKRTRKDESETDDDDHDANDSDNQADRKTPSNSKKLAPKGKPASKRQKVEEEEEGDEPEDNDERDDDEEEEGDDDDDGGDELASIKGIKPNVLMEDGEEMEVQSQTSSSTYKVKRTWDHYYCTCPAWRNQPSVPVNARSCKHLISLLGEKYEAARIKLKNPDGAALRAPKSRKKSSKKGKNTGDDDDNGGSSKTDVAVLLANSWDVDKGPDPTGWWVSEKLDGVRTFYDGKRMYSRLGNPFTPPQWFLDKLPKDVTLDGELFGGRGEFQNTVSIVKTMNSPHWKGITFHIFDIPSLSTQPFEARLEHLKKLFAPGTGSYASDKVIIVEQEKAKSRKHVLDKLKEIESLGGEGLMLRKPGSLYEGKRSSTLLKIKSFYDAEAVVTGYKPGKGRNAGVTGALKCKMASGKTFDVGSGLNDKQRKSPPKIGSIIVYRFQELTKDGVPRFPTYLGEAADKTKPKDAVVPDHRKAGAKKFDAPSE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.29
3 0.3
4 0.26
5 0.19
6 0.26
7 0.28
8 0.29
9 0.27
10 0.26
11 0.31
12 0.3
13 0.28
14 0.21
15 0.25
16 0.28
17 0.3
18 0.35
19 0.32
20 0.41
21 0.45
22 0.52
23 0.55
24 0.54
25 0.58
26 0.58
27 0.62
28 0.55
29 0.57
30 0.51
31 0.5
32 0.47
33 0.43
34 0.44
35 0.43
36 0.43
37 0.45
38 0.49
39 0.47
40 0.46
41 0.53
42 0.49
43 0.47
44 0.49
45 0.47
46 0.47
47 0.48
48 0.46
49 0.43
50 0.44
51 0.42
52 0.38
53 0.34
54 0.3
55 0.31
56 0.37
57 0.34
58 0.31
59 0.29
60 0.27
61 0.25
62 0.25
63 0.19
64 0.13
65 0.1
66 0.09
67 0.11
68 0.13
69 0.14
70 0.14
71 0.14
72 0.16
73 0.17
74 0.17
75 0.18
76 0.18
77 0.24
78 0.26
79 0.31
80 0.38
81 0.47
82 0.54
83 0.59
84 0.66
85 0.68
86 0.74
87 0.77
88 0.77
89 0.75
90 0.8
91 0.82
92 0.83
93 0.78
94 0.74
95 0.74
96 0.74
97 0.73
98 0.69
99 0.67
100 0.64
101 0.61
102 0.55
103 0.54
104 0.47
105 0.42
106 0.43
107 0.44
108 0.4
109 0.42
110 0.41
111 0.39
112 0.37
113 0.36
114 0.3
115 0.23
116 0.25
117 0.26
118 0.28
119 0.27
120 0.26
121 0.28
122 0.29
123 0.29
124 0.26
125 0.3
126 0.36
127 0.42
128 0.47
129 0.5
130 0.55
131 0.53
132 0.53
133 0.47
134 0.41
135 0.36
136 0.37
137 0.39
138 0.41
139 0.42
140 0.41
141 0.47
142 0.45
143 0.43
144 0.37
145 0.32
146 0.27
147 0.29
148 0.29
149 0.27
150 0.3
151 0.32
152 0.36
153 0.36
154 0.35
155 0.4
156 0.47
157 0.49
158 0.53
159 0.61
160 0.67
161 0.74
162 0.8
163 0.83
164 0.84
165 0.88
166 0.9
167 0.9
168 0.89
169 0.9
170 0.87
171 0.84
172 0.81
173 0.71
174 0.62
175 0.52
176 0.43
177 0.34
178 0.26
179 0.18
180 0.13
181 0.11
182 0.09
183 0.08
184 0.07
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.05
189 0.06
190 0.06
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.06
208 0.07
209 0.08
210 0.09
211 0.09
212 0.09
213 0.1
214 0.13
215 0.15
216 0.2
217 0.3
218 0.39
219 0.48
220 0.59
221 0.69
222 0.74
223 0.82
224 0.86
225 0.86
226 0.87
227 0.88
228 0.86
229 0.85
230 0.81
231 0.77
232 0.72
233 0.61
234 0.51
235 0.4
236 0.31
237 0.21
238 0.17
239 0.11
240 0.07
241 0.08
242 0.11
243 0.13
244 0.17
245 0.24
246 0.27
247 0.33
248 0.41
249 0.48
250 0.56
251 0.63
252 0.69
253 0.73
254 0.8
255 0.77
256 0.77
257 0.77
258 0.75
259 0.76
260 0.74
261 0.73
262 0.73
263 0.79
264 0.8
265 0.8
266 0.78
267 0.75
268 0.69
269 0.63
270 0.58
271 0.5
272 0.43
273 0.35
274 0.28
275 0.23
276 0.2
277 0.14
278 0.1
279 0.1
280 0.1
281 0.08
282 0.09
283 0.14
284 0.17
285 0.19
286 0.22
287 0.21
288 0.21
289 0.24
290 0.3
291 0.34
292 0.39
293 0.45
294 0.5
295 0.58
296 0.65
297 0.65
298 0.65
299 0.66
300 0.69
301 0.7
302 0.69
303 0.68
304 0.7
305 0.75
306 0.75
307 0.67
308 0.61
309 0.6
310 0.61
311 0.58
312 0.53
313 0.52
314 0.52
315 0.54
316 0.55
317 0.53
318 0.52
319 0.55
320 0.6
321 0.63
322 0.67
323 0.7
324 0.74
325 0.79
326 0.79
327 0.8
328 0.79
329 0.77
330 0.74
331 0.71
332 0.65
333 0.56
334 0.49
335 0.4
336 0.32
337 0.23
338 0.17
339 0.1
340 0.08
341 0.07
342 0.07
343 0.07
344 0.09
345 0.1
346 0.09
347 0.11
348 0.12
349 0.16
350 0.2
351 0.28
352 0.33
353 0.4
354 0.43
355 0.46
356 0.52
357 0.57
358 0.62
359 0.57
360 0.59
361 0.61
362 0.66
363 0.7
364 0.72
365 0.75
366 0.73
367 0.75
368 0.7
369 0.69
370 0.64
371 0.61
372 0.56
373 0.48
374 0.42
375 0.37
376 0.33
377 0.24
378 0.2
379 0.16
380 0.11
381 0.08
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.06
386 0.07
387 0.08
388 0.08
389 0.07
390 0.07
391 0.07
392 0.07
393 0.07
394 0.06
395 0.05
396 0.04
397 0.04
398 0.03
399 0.03
400 0.03
401 0.02
402 0.02
403 0.03
404 0.03
405 0.03
406 0.03
407 0.04
408 0.06
409 0.07
410 0.07
411 0.08
412 0.08
413 0.1
414 0.11
415 0.1
416 0.08
417 0.1
418 0.1
419 0.09
420 0.08
421 0.07
422 0.06
423 0.07
424 0.06
425 0.04
426 0.04
427 0.04
428 0.05
429 0.06
430 0.06
431 0.15
432 0.17
433 0.23
434 0.26
435 0.32
436 0.36
437 0.42
438 0.51
439 0.47
440 0.51
441 0.48
442 0.5
443 0.46
444 0.43
445 0.38
446 0.31
447 0.3
448 0.34
449 0.36
450 0.34
451 0.33
452 0.41
453 0.4
454 0.44
455 0.44
456 0.39
457 0.38
458 0.39
459 0.39
460 0.33
461 0.32
462 0.27
463 0.25
464 0.21
465 0.19
466 0.18
467 0.23
468 0.2
469 0.2
470 0.19
471 0.18
472 0.17
473 0.2
474 0.17
475 0.13
476 0.18
477 0.19
478 0.24
479 0.31
480 0.32
481 0.31
482 0.31
483 0.33
484 0.29
485 0.3
486 0.28
487 0.26
488 0.26
489 0.27
490 0.3
491 0.32
492 0.38
493 0.46
494 0.53
495 0.58
496 0.67
497 0.74
498 0.82
499 0.86
500 0.89
501 0.88
502 0.87
503 0.82
504 0.77
505 0.7
506 0.6
507 0.51
508 0.42
509 0.33
510 0.24
511 0.19
512 0.13
513 0.09
514 0.08
515 0.06
516 0.06
517 0.05
518 0.06
519 0.07
520 0.07
521 0.07
522 0.07
523 0.07
524 0.06
525 0.07
526 0.06
527 0.05
528 0.06
529 0.07
530 0.1
531 0.11
532 0.12
533 0.13
534 0.16
535 0.18
536 0.17
537 0.18
538 0.16
539 0.16
540 0.18
541 0.18
542 0.16
543 0.2
544 0.19
545 0.2
546 0.19
547 0.2
548 0.21
549 0.2
550 0.27
551 0.23
552 0.26
553 0.29
554 0.3
555 0.31
556 0.33
557 0.39
558 0.39
559 0.42
560 0.4
561 0.38
562 0.42
563 0.41
564 0.38
565 0.33
566 0.27
567 0.28
568 0.28
569 0.28
570 0.34
571 0.35
572 0.35
573 0.36
574 0.35
575 0.32
576 0.3
577 0.3
578 0.23
579 0.21
580 0.18
581 0.16
582 0.14
583 0.12
584 0.11
585 0.09
586 0.06
587 0.06
588 0.07
589 0.07
590 0.08
591 0.11
592 0.12
593 0.13
594 0.13
595 0.12
596 0.11
597 0.12
598 0.14
599 0.13
600 0.21
601 0.26
602 0.28
603 0.31
604 0.34
605 0.35
606 0.33
607 0.38
608 0.38
609 0.33
610 0.32
611 0.33
612 0.3
613 0.28
614 0.29
615 0.23
616 0.16
617 0.16
618 0.15
619 0.11
620 0.12
621 0.13
622 0.14
623 0.14
624 0.15
625 0.17
626 0.26
627 0.3
628 0.33
629 0.33
630 0.32
631 0.32
632 0.36
633 0.34
634 0.26
635 0.25
636 0.22
637 0.25
638 0.24
639 0.24
640 0.2
641 0.18
642 0.17
643 0.15
644 0.14
645 0.11
646 0.12
647 0.13
648 0.13
649 0.18
650 0.2
651 0.24
652 0.32
653 0.35
654 0.35
655 0.41
656 0.47
657 0.5
658 0.56
659 0.61
660 0.64
661 0.7
662 0.75
663 0.73
664 0.69
665 0.6
666 0.51
667 0.44
668 0.34
669 0.26
670 0.18
671 0.12
672 0.1
673 0.09
674 0.11
675 0.1
676 0.09
677 0.08
678 0.09
679 0.1
680 0.11
681 0.16
682 0.21
683 0.24
684 0.33
685 0.39
686 0.39
687 0.4
688 0.41
689 0.39
690 0.4
691 0.44
692 0.4
693 0.41
694 0.42
695 0.41
696 0.46
697 0.43
698 0.35
699 0.31
700 0.25
701 0.2
702 0.19
703 0.19
704 0.13
705 0.12
706 0.14
707 0.12
708 0.15
709 0.16
710 0.18
711 0.26
712 0.3
713 0.33
714 0.38
715 0.41
716 0.38
717 0.41
718 0.42
719 0.37
720 0.37
721 0.34
722 0.27
723 0.23
724 0.26
725 0.27
726 0.25
727 0.27
728 0.3
729 0.33
730 0.36
731 0.36
732 0.32
733 0.29
734 0.26
735 0.24
736 0.23
737 0.2
738 0.24
739 0.28
740 0.29
741 0.35
742 0.45
743 0.52
744 0.54
745 0.62
746 0.64
747 0.69
748 0.72
749 0.67
750 0.63
751 0.62
752 0.58
753 0.53
754 0.47
755 0.4
756 0.36
757 0.34
758 0.3
759 0.24
760 0.24
761 0.23
762 0.28
763 0.28
764 0.33
765 0.36
766 0.36
767 0.38
768 0.34
769 0.31
770 0.29
771 0.32
772 0.28
773 0.29
774 0.27
775 0.28
776 0.33
777 0.36
778 0.35
779 0.37
780 0.37
781 0.35
782 0.41
783 0.44
784 0.48
785 0.54
786 0.61
787 0.57
788 0.63
789 0.63
790 0.62
791 0.61
792 0.6
793 0.59
794 0.54
795 0.6