Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C4EKW6

Protein Details
Accession A0A0C4EKW6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
28-55GTSTSSQLFKKRKKKIPQNQIRKRTIDSHydrophilic
258-281IEKMNAKQERIKRQKEERRLEEEGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
37-44KKRKKKIP
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 14.5, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039971  CWC24-like  
IPR027370  Znf-RING_euk  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR017907  Znf_RING_CS  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00642  zf-CCCH  
PF13445  zf-RING_UBOX  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
PS00518  ZF_RING_1  
CDD cd16539  RING-HC_RNF113A_B  
Amino Acid Sequences MADNHHQVHPETNNETPNAPDRGLEKGGTSTSSQLFKKRKKKIPQNQIRKRTIDSEPVTTTTQDDSEKDNEPSVVNKNKKSKLEAEDDDDSKPQAVGVAYQALGSARQQAEESYQKAILEKRELGQQAREGLSQDQAELEADTESKVYLGTSKSKYQLPKGSQKYGPIKGGPNNIKTITVVDYQPDVCKDYKETGYCGFGDTCKVFLICRQPFNDPIVTKCQHYFCSGCAIKRFAKTPKCFACGTPTSGIFNKASRIIEKMNAKQERIKRQKEERRLEEEGLAGIEGLETRPSANQALDDEEQGSERSFYEDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.37
3 0.33
4 0.35
5 0.32
6 0.28
7 0.26
8 0.24
9 0.28
10 0.3
11 0.27
12 0.22
13 0.22
14 0.22
15 0.22
16 0.22
17 0.2
18 0.21
19 0.27
20 0.28
21 0.34
22 0.43
23 0.51
24 0.6
25 0.67
26 0.74
27 0.79
28 0.88
29 0.9
30 0.92
31 0.93
32 0.94
33 0.94
34 0.94
35 0.91
36 0.83
37 0.76
38 0.71
39 0.64
40 0.63
41 0.55
42 0.5
43 0.45
44 0.44
45 0.42
46 0.36
47 0.33
48 0.24
49 0.23
50 0.19
51 0.18
52 0.19
53 0.21
54 0.24
55 0.23
56 0.23
57 0.22
58 0.21
59 0.23
60 0.26
61 0.33
62 0.35
63 0.41
64 0.49
65 0.55
66 0.58
67 0.6
68 0.6
69 0.57
70 0.59
71 0.55
72 0.52
73 0.51
74 0.48
75 0.44
76 0.37
77 0.31
78 0.23
79 0.2
80 0.13
81 0.1
82 0.08
83 0.08
84 0.08
85 0.09
86 0.09
87 0.09
88 0.09
89 0.08
90 0.08
91 0.08
92 0.12
93 0.1
94 0.11
95 0.11
96 0.11
97 0.16
98 0.2
99 0.21
100 0.17
101 0.18
102 0.18
103 0.2
104 0.22
105 0.2
106 0.2
107 0.2
108 0.19
109 0.23
110 0.25
111 0.25
112 0.24
113 0.23
114 0.23
115 0.23
116 0.22
117 0.18
118 0.16
119 0.18
120 0.15
121 0.13
122 0.1
123 0.09
124 0.09
125 0.07
126 0.07
127 0.05
128 0.05
129 0.05
130 0.05
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.03
135 0.06
136 0.07
137 0.13
138 0.15
139 0.18
140 0.21
141 0.25
142 0.27
143 0.3
144 0.36
145 0.36
146 0.43
147 0.45
148 0.49
149 0.47
150 0.52
151 0.53
152 0.49
153 0.46
154 0.39
155 0.37
156 0.35
157 0.42
158 0.39
159 0.35
160 0.34
161 0.32
162 0.3
163 0.27
164 0.24
165 0.18
166 0.16
167 0.14
168 0.12
169 0.13
170 0.13
171 0.14
172 0.13
173 0.13
174 0.11
175 0.12
176 0.14
177 0.16
178 0.2
179 0.2
180 0.21
181 0.21
182 0.23
183 0.22
184 0.21
185 0.18
186 0.14
187 0.16
188 0.14
189 0.13
190 0.11
191 0.11
192 0.1
193 0.13
194 0.23
195 0.23
196 0.27
197 0.29
198 0.31
199 0.34
200 0.37
201 0.39
202 0.3
203 0.29
204 0.32
205 0.31
206 0.3
207 0.31
208 0.31
209 0.27
210 0.29
211 0.28
212 0.2
213 0.29
214 0.3
215 0.29
216 0.31
217 0.33
218 0.34
219 0.37
220 0.41
221 0.4
222 0.48
223 0.5
224 0.56
225 0.58
226 0.58
227 0.55
228 0.51
229 0.51
230 0.45
231 0.44
232 0.38
233 0.33
234 0.33
235 0.33
236 0.35
237 0.28
238 0.26
239 0.24
240 0.24
241 0.25
242 0.22
243 0.25
244 0.25
245 0.3
246 0.36
247 0.4
248 0.46
249 0.48
250 0.5
251 0.53
252 0.59
253 0.63
254 0.66
255 0.68
256 0.68
257 0.75
258 0.83
259 0.86
260 0.89
261 0.85
262 0.83
263 0.79
264 0.72
265 0.63
266 0.53
267 0.43
268 0.33
269 0.24
270 0.16
271 0.1
272 0.08
273 0.07
274 0.06
275 0.06
276 0.06
277 0.07
278 0.08
279 0.11
280 0.13
281 0.13
282 0.14
283 0.15
284 0.21
285 0.22
286 0.22
287 0.21
288 0.19
289 0.2
290 0.19
291 0.18
292 0.13
293 0.12