Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Q3E3M4

Protein Details
Accession A0A1Q3E3M4    Localization Confidence High Confidence Score 22.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
249-292DNDSADEKRSKKKRKHHSSDNERDDERSSRRKNKKSRTVDDSELBasic
312-359DSDATSSKTSRRKSKRKRMDSDVSDKESSDEKSTNKRRPKGKKSRQDLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
256-284KRSKKKRKHHSSDNERDDERSSRRKNKKS
304-305RK
319-329KTSRRKSKRKR
344-356STNKRRPKGKKSR
Subcellular Location(s) nucl 21, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007832  RNA_pol_Rpc34  
IPR016049  RNA_pol_Rpc34-like  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005666  C:RNA polymerase III complex  
GO:0006383  P:transcription by RNA polymerase III  
Pfam View protein in Pfam  
PF05158  RNA_pol_Rpc34  
Amino Acid Sequences MSLKVVYIKQPSHLQTIAKAAESIIADPAQRKDALNYLLAVGLLKPLKNSKGALIFRAVTRSEHTTNVGLSEEEKVVLGYIRGAQNEGIWVKHLKAKSNFHQTVLDRCIKTLEQKKLIKKVPSVQHPTRKIYMLEGLAPSVALTGGPWFTDGEFDTEFIETLMKACFKFIRDMSFRGRQTDGALYPIAKAPKYPTAQQVRNALKQARLTETDLTVEHVEILLNVLVLDGEIEKLPAFGSSLWDSGAIDDNDSADEKRSKKKRKHHSSDNERDDERSSRRKNKKSRTVDDSELEDDSSSGKNAKRKKGLSSDDSDATSSKTSRRKSKRKRMDSDVSDKESSDEKSTNKRRPKGKKSRQDL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.37
3 0.43
4 0.4
5 0.33
6 0.29
7 0.23
8 0.24
9 0.23
10 0.2
11 0.15
12 0.15
13 0.15
14 0.18
15 0.2
16 0.2
17 0.2
18 0.2
19 0.21
20 0.26
21 0.27
22 0.26
23 0.24
24 0.21
25 0.2
26 0.2
27 0.17
28 0.11
29 0.13
30 0.14
31 0.13
32 0.15
33 0.19
34 0.22
35 0.25
36 0.26
37 0.27
38 0.34
39 0.36
40 0.36
41 0.35
42 0.35
43 0.32
44 0.35
45 0.31
46 0.23
47 0.25
48 0.29
49 0.26
50 0.27
51 0.28
52 0.26
53 0.25
54 0.25
55 0.22
56 0.15
57 0.14
58 0.15
59 0.12
60 0.11
61 0.11
62 0.09
63 0.09
64 0.09
65 0.08
66 0.07
67 0.1
68 0.12
69 0.13
70 0.14
71 0.13
72 0.13
73 0.17
74 0.17
75 0.13
76 0.13
77 0.14
78 0.15
79 0.19
80 0.21
81 0.25
82 0.32
83 0.39
84 0.46
85 0.56
86 0.55
87 0.53
88 0.58
89 0.51
90 0.51
91 0.49
92 0.48
93 0.37
94 0.36
95 0.36
96 0.31
97 0.38
98 0.39
99 0.41
100 0.43
101 0.5
102 0.56
103 0.62
104 0.68
105 0.64
106 0.6
107 0.61
108 0.6
109 0.62
110 0.65
111 0.64
112 0.67
113 0.67
114 0.67
115 0.61
116 0.55
117 0.46
118 0.39
119 0.35
120 0.27
121 0.23
122 0.19
123 0.16
124 0.14
125 0.13
126 0.1
127 0.07
128 0.05
129 0.03
130 0.03
131 0.03
132 0.04
133 0.04
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.06
138 0.07
139 0.08
140 0.08
141 0.09
142 0.09
143 0.09
144 0.09
145 0.08
146 0.07
147 0.05
148 0.05
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.07
153 0.09
154 0.1
155 0.14
156 0.14
157 0.2
158 0.22
159 0.25
160 0.3
161 0.36
162 0.35
163 0.34
164 0.34
165 0.28
166 0.27
167 0.26
168 0.21
169 0.15
170 0.15
171 0.12
172 0.12
173 0.14
174 0.13
175 0.1
176 0.1
177 0.11
178 0.18
179 0.2
180 0.22
181 0.28
182 0.36
183 0.39
184 0.43
185 0.49
186 0.46
187 0.47
188 0.49
189 0.42
190 0.37
191 0.37
192 0.35
193 0.29
194 0.27
195 0.26
196 0.24
197 0.22
198 0.2
199 0.17
200 0.17
201 0.14
202 0.12
203 0.09
204 0.08
205 0.07
206 0.06
207 0.06
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.03
213 0.03
214 0.04
215 0.03
216 0.03
217 0.03
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.05
224 0.05
225 0.08
226 0.1
227 0.1
228 0.1
229 0.1
230 0.1
231 0.1
232 0.15
233 0.11
234 0.1
235 0.1
236 0.1
237 0.11
238 0.12
239 0.11
240 0.1
241 0.16
242 0.19
243 0.28
244 0.38
245 0.48
246 0.56
247 0.66
248 0.74
249 0.8
250 0.88
251 0.89
252 0.9
253 0.92
254 0.93
255 0.92
256 0.86
257 0.75
258 0.66
259 0.58
260 0.53
261 0.49
262 0.48
263 0.49
264 0.54
265 0.64
266 0.72
267 0.8
268 0.85
269 0.88
270 0.89
271 0.89
272 0.86
273 0.83
274 0.79
275 0.71
276 0.64
277 0.55
278 0.45
279 0.37
280 0.28
281 0.21
282 0.17
283 0.14
284 0.11
285 0.13
286 0.16
287 0.22
288 0.31
289 0.4
290 0.48
291 0.51
292 0.59
293 0.65
294 0.7
295 0.7
296 0.68
297 0.64
298 0.57
299 0.55
300 0.47
301 0.37
302 0.31
303 0.27
304 0.22
305 0.24
306 0.3
307 0.36
308 0.46
309 0.57
310 0.66
311 0.75
312 0.85
313 0.89
314 0.92
315 0.93
316 0.92
317 0.92
318 0.9
319 0.89
320 0.86
321 0.81
322 0.7
323 0.61
324 0.53
325 0.47
326 0.4
327 0.36
328 0.32
329 0.3
330 0.4
331 0.5
332 0.58
333 0.64
334 0.7
335 0.75
336 0.82
337 0.88
338 0.89
339 0.9