Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Q3EDA9

Protein Details
Accession A0A1Q3EDA9    Localization Confidence High Confidence Score 16.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
55-81TADPGSLTRHRKRRHEYVPERRKPRAEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
64-78HRKRRHEYVPERRKP
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006973  Cwf_Cwc_15  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF04889  Cwf_Cwc_15  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50157  ZINC_FINGER_C2H2_2  
Amino Acid Sequences MQKHLRGEERASRSFSCPYSNCDFQSLQKGNMDTHIRSVHTRIKDQECPDCEFATADPGSLTRHRKRRHEYVPERRKPRAEQTLSTSSASGTSDIIIINSGNRYPGHNPGRSASEVPQAPKALNQKASNPKLNASNTTTQARDVKGGSRQVSVRDMPSHTKLKFRQIGQTSTSEVDKRDLRAELLAAEQEARNKKRKAEGLPLEVEDTPAPVADDETNKRRKLLQDAIELDKDDDEEEEEENEKETERKKGQDDNEDDNSDDDESDEEDDTAALLRELEKIKRERAEDKARLEREQSASEAASREIDIATANPLLNLAAALGQPTNINTTAPGTFAVKRRWDDDLIFKNQAMSSRDKPQGQFVNDLLRTEFHKKFMSKFIK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.47
3 0.46
4 0.4
5 0.42
6 0.45
7 0.47
8 0.45
9 0.44
10 0.44
11 0.39
12 0.48
13 0.45
14 0.4
15 0.39
16 0.39
17 0.35
18 0.4
19 0.42
20 0.32
21 0.34
22 0.35
23 0.32
24 0.33
25 0.38
26 0.39
27 0.39
28 0.44
29 0.46
30 0.5
31 0.56
32 0.58
33 0.62
34 0.57
35 0.58
36 0.55
37 0.47
38 0.41
39 0.34
40 0.29
41 0.26
42 0.22
43 0.16
44 0.14
45 0.14
46 0.17
47 0.22
48 0.31
49 0.34
50 0.44
51 0.51
52 0.61
53 0.69
54 0.76
55 0.8
56 0.83
57 0.85
58 0.87
59 0.91
60 0.9
61 0.88
62 0.84
63 0.8
64 0.75
65 0.74
66 0.73
67 0.68
68 0.62
69 0.63
70 0.64
71 0.6
72 0.55
73 0.44
74 0.33
75 0.29
76 0.25
77 0.18
78 0.11
79 0.08
80 0.08
81 0.08
82 0.08
83 0.07
84 0.07
85 0.07
86 0.08
87 0.08
88 0.09
89 0.1
90 0.13
91 0.15
92 0.25
93 0.31
94 0.33
95 0.34
96 0.35
97 0.38
98 0.37
99 0.37
100 0.3
101 0.29
102 0.29
103 0.29
104 0.3
105 0.27
106 0.25
107 0.27
108 0.31
109 0.3
110 0.34
111 0.34
112 0.38
113 0.48
114 0.53
115 0.55
116 0.5
117 0.47
118 0.47
119 0.48
120 0.43
121 0.38
122 0.37
123 0.34
124 0.35
125 0.33
126 0.29
127 0.3
128 0.27
129 0.24
130 0.2
131 0.2
132 0.22
133 0.27
134 0.26
135 0.26
136 0.26
137 0.26
138 0.29
139 0.27
140 0.24
141 0.22
142 0.23
143 0.24
144 0.28
145 0.32
146 0.29
147 0.35
148 0.36
149 0.42
150 0.45
151 0.43
152 0.46
153 0.44
154 0.47
155 0.42
156 0.41
157 0.34
158 0.29
159 0.29
160 0.22
161 0.18
162 0.18
163 0.17
164 0.17
165 0.17
166 0.16
167 0.15
168 0.15
169 0.14
170 0.11
171 0.1
172 0.09
173 0.06
174 0.07
175 0.06
176 0.1
177 0.16
178 0.19
179 0.26
180 0.28
181 0.3
182 0.36
183 0.42
184 0.43
185 0.47
186 0.5
187 0.47
188 0.47
189 0.45
190 0.4
191 0.34
192 0.3
193 0.19
194 0.14
195 0.08
196 0.07
197 0.06
198 0.04
199 0.05
200 0.06
201 0.1
202 0.13
203 0.21
204 0.27
205 0.27
206 0.28
207 0.31
208 0.32
209 0.37
210 0.41
211 0.4
212 0.42
213 0.45
214 0.47
215 0.45
216 0.42
217 0.34
218 0.26
219 0.2
220 0.13
221 0.09
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.08
226 0.09
227 0.09
228 0.1
229 0.1
230 0.09
231 0.11
232 0.13
233 0.2
234 0.22
235 0.26
236 0.29
237 0.37
238 0.42
239 0.48
240 0.52
241 0.51
242 0.52
243 0.49
244 0.45
245 0.38
246 0.34
247 0.24
248 0.19
249 0.12
250 0.08
251 0.07
252 0.08
253 0.08
254 0.07
255 0.07
256 0.07
257 0.06
258 0.07
259 0.06
260 0.04
261 0.04
262 0.05
263 0.09
264 0.12
265 0.15
266 0.21
267 0.25
268 0.3
269 0.35
270 0.39
271 0.4
272 0.47
273 0.55
274 0.55
275 0.59
276 0.63
277 0.61
278 0.59
279 0.56
280 0.53
281 0.46
282 0.41
283 0.35
284 0.28
285 0.25
286 0.25
287 0.23
288 0.18
289 0.15
290 0.13
291 0.12
292 0.1
293 0.1
294 0.08
295 0.08
296 0.09
297 0.1
298 0.1
299 0.09
300 0.09
301 0.09
302 0.08
303 0.08
304 0.06
305 0.05
306 0.05
307 0.06
308 0.06
309 0.06
310 0.07
311 0.08
312 0.11
313 0.1
314 0.1
315 0.1
316 0.13
317 0.13
318 0.13
319 0.14
320 0.14
321 0.19
322 0.25
323 0.32
324 0.36
325 0.38
326 0.4
327 0.44
328 0.44
329 0.43
330 0.47
331 0.48
332 0.48
333 0.48
334 0.45
335 0.43
336 0.41
337 0.43
338 0.36
339 0.35
340 0.34
341 0.4
342 0.47
343 0.49
344 0.5
345 0.53
346 0.58
347 0.54
348 0.54
349 0.47
350 0.51
351 0.47
352 0.46
353 0.38
354 0.31
355 0.34
356 0.36
357 0.37
358 0.32
359 0.38
360 0.4
361 0.44