Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Q3EDW9

Protein Details
Accession A0A1Q3EDW9    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
201-235AGVSRSRTKGKKKATDKRKKDKAKRKPKDVQAYTWBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
205-228RSRTKGKKKATDKRKKDKAKRKPK
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 12, cyto 7, mito 2, plas 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013785  Aldolase_TIM  
IPR013798  Indole-3-glycerol_P_synth_dom  
IPR001468  Indole-3-GlycerolPSynthase_CS  
IPR011060  RibuloseP-bd_barrel  
IPR007198  Ssl1-like  
IPR002035  VWF_A  
IPR036465  vWFA_dom_sf  
Gene Ontology GO:0004425  F:indole-3-glycerol-phosphate synthase activity  
GO:0006541  P:glutamine metabolic process  
GO:0000162  P:tryptophan biosynthetic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF00218  IGPS  
PF04056  Ssl1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00614  IGPS  
CDD cd00331  IGPS  
cd01453  vWA_transcription_factor_IIH_type  
Amino Acid Sequences MSAPTILEKIYTQRQKDVEVAKATPGTKPEDIQTYLDMGLAPTQISLVPRLKSNPSIDTAEPSLSLMAEIKRASPSKGEIAMSKNPAKQGLIYALAGASVISVLTEPTWFKGSLLDMRLVRQAVDKLPNRPAILRKEFIFDEYQIAEARLHGADTVLLIVAMLTQELLASLYAYSVSLGMEPLVESHKCYISISDYEENEAGVSRSRTKGKKKATDKRKKDKAKRKPKDVQAYTWEANFARSWETVQEDEGGSLQGAVNDWMARGRRKRLLQPQNAIRRTIIRHMVLLIDLSSSMMDRDMRPTRFAVTLQYAREFVLEWFDQNPLGQMAVVGMRAGVGERICDMSGNPQDVLKSISDRHKLEPIGEPSLQNSIEMARNSMNHLPTHSSREILIIFGSLTTCDPGNIHDTLDECVKNRIRISIVALAAEMKICRDLCDKTGGQFGVALNEGHFKDLLFELVPPPAQRALPRSSAATGGAGFTASGKELSSSVSGEALCCCSIL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.47
3 0.53
4 0.52
5 0.5
6 0.47
7 0.45
8 0.42
9 0.44
10 0.41
11 0.37
12 0.34
13 0.33
14 0.3
15 0.31
16 0.31
17 0.32
18 0.34
19 0.34
20 0.32
21 0.28
22 0.26
23 0.24
24 0.21
25 0.15
26 0.14
27 0.12
28 0.1
29 0.08
30 0.08
31 0.09
32 0.1
33 0.15
34 0.18
35 0.19
36 0.23
37 0.27
38 0.31
39 0.36
40 0.4
41 0.38
42 0.37
43 0.41
44 0.38
45 0.39
46 0.36
47 0.31
48 0.26
49 0.23
50 0.19
51 0.14
52 0.13
53 0.12
54 0.11
55 0.13
56 0.13
57 0.14
58 0.2
59 0.22
60 0.23
61 0.23
62 0.26
63 0.28
64 0.32
65 0.32
66 0.29
67 0.34
68 0.38
69 0.41
70 0.43
71 0.4
72 0.38
73 0.39
74 0.36
75 0.31
76 0.28
77 0.26
78 0.23
79 0.2
80 0.18
81 0.16
82 0.15
83 0.14
84 0.1
85 0.06
86 0.03
87 0.03
88 0.03
89 0.03
90 0.03
91 0.04
92 0.05
93 0.06
94 0.08
95 0.11
96 0.11
97 0.11
98 0.13
99 0.16
100 0.2
101 0.22
102 0.25
103 0.23
104 0.24
105 0.28
106 0.25
107 0.23
108 0.21
109 0.21
110 0.21
111 0.29
112 0.31
113 0.33
114 0.39
115 0.42
116 0.41
117 0.42
118 0.44
119 0.44
120 0.47
121 0.45
122 0.4
123 0.4
124 0.39
125 0.37
126 0.33
127 0.25
128 0.21
129 0.19
130 0.19
131 0.15
132 0.16
133 0.13
134 0.1
135 0.11
136 0.09
137 0.08
138 0.07
139 0.07
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.04
144 0.04
145 0.03
146 0.03
147 0.03
148 0.03
149 0.03
150 0.02
151 0.02
152 0.02
153 0.03
154 0.03
155 0.03
156 0.03
157 0.03
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.05
170 0.07
171 0.07
172 0.08
173 0.1
174 0.11
175 0.11
176 0.12
177 0.12
178 0.12
179 0.14
180 0.17
181 0.19
182 0.19
183 0.2
184 0.2
185 0.18
186 0.15
187 0.14
188 0.1
189 0.08
190 0.09
191 0.1
192 0.14
193 0.21
194 0.28
195 0.36
196 0.45
197 0.52
198 0.61
199 0.69
200 0.76
201 0.81
202 0.85
203 0.87
204 0.89
205 0.9
206 0.91
207 0.91
208 0.92
209 0.92
210 0.92
211 0.91
212 0.91
213 0.89
214 0.88
215 0.88
216 0.81
217 0.75
218 0.68
219 0.65
220 0.55
221 0.46
222 0.38
223 0.26
224 0.24
225 0.19
226 0.14
227 0.1
228 0.09
229 0.1
230 0.09
231 0.11
232 0.1
233 0.11
234 0.11
235 0.09
236 0.09
237 0.09
238 0.08
239 0.06
240 0.05
241 0.05
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.06
249 0.08
250 0.13
251 0.17
252 0.22
253 0.28
254 0.32
255 0.41
256 0.49
257 0.58
258 0.61
259 0.66
260 0.69
261 0.73
262 0.71
263 0.63
264 0.53
265 0.46
266 0.41
267 0.38
268 0.34
269 0.24
270 0.23
271 0.22
272 0.22
273 0.18
274 0.16
275 0.11
276 0.06
277 0.05
278 0.05
279 0.04
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.05
284 0.06
285 0.13
286 0.19
287 0.2
288 0.22
289 0.23
290 0.24
291 0.24
292 0.24
293 0.21
294 0.21
295 0.24
296 0.23
297 0.24
298 0.22
299 0.21
300 0.2
301 0.18
302 0.12
303 0.13
304 0.11
305 0.11
306 0.11
307 0.12
308 0.12
309 0.11
310 0.12
311 0.07
312 0.07
313 0.06
314 0.05
315 0.05
316 0.06
317 0.06
318 0.04
319 0.04
320 0.04
321 0.04
322 0.04
323 0.05
324 0.04
325 0.05
326 0.06
327 0.07
328 0.07
329 0.08
330 0.08
331 0.14
332 0.17
333 0.18
334 0.18
335 0.17
336 0.18
337 0.18
338 0.2
339 0.13
340 0.13
341 0.16
342 0.23
343 0.29
344 0.31
345 0.34
346 0.37
347 0.37
348 0.37
349 0.4
350 0.37
351 0.36
352 0.34
353 0.32
354 0.27
355 0.3
356 0.28
357 0.2
358 0.16
359 0.13
360 0.16
361 0.16
362 0.16
363 0.15
364 0.15
365 0.19
366 0.23
367 0.23
368 0.2
369 0.22
370 0.26
371 0.27
372 0.34
373 0.31
374 0.27
375 0.25
376 0.27
377 0.25
378 0.2
379 0.18
380 0.1
381 0.09
382 0.09
383 0.09
384 0.06
385 0.07
386 0.07
387 0.07
388 0.07
389 0.07
390 0.09
391 0.12
392 0.12
393 0.12
394 0.12
395 0.13
396 0.15
397 0.19
398 0.18
399 0.16
400 0.23
401 0.27
402 0.3
403 0.3
404 0.32
405 0.3
406 0.3
407 0.34
408 0.33
409 0.3
410 0.26
411 0.25
412 0.22
413 0.2
414 0.19
415 0.14
416 0.08
417 0.11
418 0.11
419 0.14
420 0.17
421 0.2
422 0.21
423 0.29
424 0.29
425 0.27
426 0.34
427 0.31
428 0.28
429 0.27
430 0.25
431 0.21
432 0.21
433 0.19
434 0.13
435 0.18
436 0.18
437 0.17
438 0.17
439 0.13
440 0.15
441 0.15
442 0.16
443 0.11
444 0.12
445 0.12
446 0.15
447 0.17
448 0.15
449 0.18
450 0.19
451 0.2
452 0.23
453 0.27
454 0.3
455 0.33
456 0.34
457 0.34
458 0.33
459 0.33
460 0.3
461 0.26
462 0.21
463 0.17
464 0.15
465 0.12
466 0.1
467 0.09
468 0.09
469 0.08
470 0.08
471 0.08
472 0.09
473 0.09
474 0.11
475 0.12
476 0.13
477 0.12
478 0.14
479 0.14
480 0.14
481 0.16
482 0.16