Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Q3E423

Protein Details
Accession A0A1Q3E423    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
45-71DGVAPRAKMNQQRSRRFRAAKEARELRHydrophilic
1252-1271DYKTCNIKQRLRRLVALRKFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
57-78RSRRFRAAKEARELRQKAEAKG
Subcellular Location(s) mito 16.5, cyto_mito 11.5, cyto 5.5, nucl 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR016494  5_3_exoribonuclease_1  
IPR014722  Rib_L2_dom2  
IPR041385  SH3_12  
IPR040992  XRN1_D1  
IPR047007  XRN1_D1_sf  
IPR041106  XRN1_D2_D3  
IPR040486  Xrn1_D3  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR047008  XRN1_SH3_sf  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
Pfam View protein in Pfam  
PF18129  SH3_12  
PF18332  XRN1_D1  
PF18334  XRN1_D2_D3  
PF18194  Xrn1_D3  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGIPKFFRWISRTRYPNSIFTSIFAYVDHLFGKIKPKKLFFMAVDGVAPRAKMNQQRSRRFRAAKEARELRQKAEAKGEKLPEEKAFDSNCITPGTPFMARLSEQLKYFVNKKISEDSNWRDVQVVLSGHEVPGEGEHKIMEYIRLSRSQPDYDPNLRHCLYGLDADLIMLGLLSHDPHFCLLREEVKFGPTRKSRGNSSLDSINFYLLHLSLFREYLHLEFNSLATELPFEYSLERIIDDFVLLAVFVGNDFLPNLPDLHIHENGLEKLFEVYKKVLPTMEGYINDAGTINLPRLQFILDEMAQWEVDVFEKENSDTNWYKGKQAKYKNGATPKTNELVITKPQHDIFRAVRDWLMAKPTKALTMPNDFPAKDRLFILTIARDLNLSLAWDEYDEEGRNILSFSPAYPEDAFDDEEQEAQVAVLRVLRKYEKAPIDGGEEDFDTRATNALSHKMDEWKRGYYSGKLEFSYDDPEQMQKLVYRYVEGLQWVMYYYFTGVKSWAWFYDYHYAPRISDLSSKARWGGEGGIGRRGIAQLSFDFKLGQPFRPYEQLMGVLPAASKDHIPTAYHDLMTSSMSPISDFYPADFEQDLNGKRADWEAIVKIPFIDEKRLLAAMSTKEHLLTDTEKQRNTFGTTTKFTFRGLNVEPTEYPSSLPGFFPPLHRCMCKMEVFNLPTLDPDLNFPLVTGLVEGALTGPSALSGFPSLNTLPHTHTALGYHHVNVHGSESRNQSVIVYVKNTYEERKTEDIGREVLGNRTFIGWPFLSEGLVVGVSDELFRYETVKVGTPGRGTEKVLGTPHSQSGLGLWKVKADKIEGVYSKRFGVVTGPVEVLLHVRPLKGLKRLEDGSLVKEYEGIDKETEVAVQMTVSAVGAEDPRYLERPAPPLSEEFPEGSKIFFLGEHAYGVAAQVSATTDTSLSVILAFFPSDKAENAQFKAIAQEQTPSSASYYPAFRAAEMLGLSSRGIARITSSFLIISSDNQKHNIGLNIKFEAKSLKVIDYSRKEGRHWEFSEKAIKLIKEYQEAFPDVFKCLDINVDGMLRAVDVLPGANPDARVKDIRSWLKSKGVQDFEAVTLFCDQLGKETITQIEKLADDFNGNRSTTGIKKAIVKGIPRQAVLKPAHAIYRLQGQRFALSDRVIMVQDSGGVPLGAKGVVVGLNTKTMDVVWDMPFMSGTTLGDRCSQYRGLAVEFNSCLNLSDPQFVTSTNPKDQKQPLPVNHAAPFKPRSGPYPLDVARLCGGIMALKLNLDYKTCNIKQRLRRLVALRKFV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.64
3 0.67
4 0.66
5 0.63
6 0.54
7 0.47
8 0.47
9 0.38
10 0.34
11 0.26
12 0.23
13 0.17
14 0.19
15 0.18
16 0.14
17 0.14
18 0.17
19 0.27
20 0.31
21 0.38
22 0.44
23 0.48
24 0.53
25 0.57
26 0.63
27 0.54
28 0.55
29 0.49
30 0.43
31 0.4
32 0.35
33 0.31
34 0.24
35 0.22
36 0.14
37 0.16
38 0.22
39 0.29
40 0.39
41 0.47
42 0.57
43 0.68
44 0.76
45 0.81
46 0.84
47 0.83
48 0.79
49 0.8
50 0.81
51 0.78
52 0.8
53 0.8
54 0.76
55 0.79
56 0.75
57 0.67
58 0.67
59 0.63
60 0.56
61 0.58
62 0.58
63 0.51
64 0.57
65 0.58
66 0.54
67 0.52
68 0.52
69 0.46
70 0.45
71 0.43
72 0.41
73 0.38
74 0.34
75 0.35
76 0.33
77 0.31
78 0.27
79 0.26
80 0.2
81 0.21
82 0.24
83 0.21
84 0.2
85 0.2
86 0.21
87 0.21
88 0.25
89 0.25
90 0.24
91 0.24
92 0.26
93 0.28
94 0.29
95 0.33
96 0.36
97 0.4
98 0.38
99 0.41
100 0.47
101 0.47
102 0.49
103 0.54
104 0.52
105 0.54
106 0.52
107 0.49
108 0.42
109 0.38
110 0.33
111 0.29
112 0.24
113 0.16
114 0.18
115 0.18
116 0.17
117 0.17
118 0.15
119 0.1
120 0.13
121 0.13
122 0.11
123 0.1
124 0.11
125 0.11
126 0.12
127 0.12
128 0.12
129 0.13
130 0.18
131 0.21
132 0.25
133 0.26
134 0.31
135 0.36
136 0.37
137 0.37
138 0.39
139 0.44
140 0.47
141 0.52
142 0.49
143 0.52
144 0.48
145 0.46
146 0.39
147 0.33
148 0.28
149 0.24
150 0.22
151 0.16
152 0.15
153 0.14
154 0.14
155 0.11
156 0.09
157 0.06
158 0.04
159 0.03
160 0.04
161 0.05
162 0.06
163 0.07
164 0.08
165 0.1
166 0.12
167 0.12
168 0.15
169 0.17
170 0.24
171 0.25
172 0.28
173 0.27
174 0.3
175 0.34
176 0.33
177 0.39
178 0.38
179 0.42
180 0.47
181 0.51
182 0.53
183 0.57
184 0.61
185 0.55
186 0.53
187 0.55
188 0.47
189 0.46
190 0.4
191 0.34
192 0.27
193 0.23
194 0.2
195 0.13
196 0.13
197 0.09
198 0.11
199 0.1
200 0.11
201 0.11
202 0.11
203 0.12
204 0.13
205 0.16
206 0.14
207 0.14
208 0.14
209 0.14
210 0.14
211 0.13
212 0.12
213 0.08
214 0.09
215 0.08
216 0.09
217 0.09
218 0.08
219 0.09
220 0.09
221 0.11
222 0.11
223 0.11
224 0.1
225 0.1
226 0.1
227 0.09
228 0.08
229 0.06
230 0.06
231 0.05
232 0.05
233 0.04
234 0.03
235 0.03
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.05
240 0.05
241 0.06
242 0.07
243 0.08
244 0.08
245 0.09
246 0.13
247 0.17
248 0.18
249 0.18
250 0.18
251 0.2
252 0.21
253 0.21
254 0.17
255 0.13
256 0.14
257 0.16
258 0.15
259 0.15
260 0.17
261 0.19
262 0.21
263 0.21
264 0.2
265 0.19
266 0.21
267 0.23
268 0.24
269 0.21
270 0.23
271 0.22
272 0.21
273 0.2
274 0.17
275 0.13
276 0.1
277 0.1
278 0.09
279 0.11
280 0.12
281 0.12
282 0.12
283 0.13
284 0.11
285 0.12
286 0.15
287 0.12
288 0.12
289 0.13
290 0.13
291 0.12
292 0.12
293 0.1
294 0.06
295 0.07
296 0.07
297 0.08
298 0.08
299 0.09
300 0.1
301 0.13
302 0.14
303 0.19
304 0.19
305 0.21
306 0.28
307 0.28
308 0.34
309 0.38
310 0.45
311 0.48
312 0.56
313 0.63
314 0.63
315 0.7
316 0.71
317 0.74
318 0.71
319 0.66
320 0.61
321 0.56
322 0.5
323 0.43
324 0.36
325 0.28
326 0.27
327 0.3
328 0.3
329 0.27
330 0.28
331 0.3
332 0.31
333 0.31
334 0.33
335 0.29
336 0.31
337 0.3
338 0.29
339 0.26
340 0.25
341 0.25
342 0.21
343 0.25
344 0.21
345 0.2
346 0.22
347 0.22
348 0.23
349 0.23
350 0.24
351 0.22
352 0.27
353 0.28
354 0.3
355 0.32
356 0.3
357 0.31
358 0.35
359 0.31
360 0.25
361 0.24
362 0.21
363 0.19
364 0.2
365 0.21
366 0.16
367 0.16
368 0.15
369 0.14
370 0.12
371 0.11
372 0.1
373 0.08
374 0.07
375 0.06
376 0.06
377 0.05
378 0.06
379 0.06
380 0.07
381 0.09
382 0.09
383 0.09
384 0.09
385 0.09
386 0.09
387 0.09
388 0.08
389 0.07
390 0.06
391 0.07
392 0.1
393 0.1
394 0.13
395 0.13
396 0.14
397 0.14
398 0.15
399 0.17
400 0.13
401 0.15
402 0.12
403 0.12
404 0.11
405 0.1
406 0.08
407 0.06
408 0.08
409 0.06
410 0.06
411 0.08
412 0.1
413 0.1
414 0.13
415 0.15
416 0.15
417 0.17
418 0.24
419 0.25
420 0.27
421 0.28
422 0.26
423 0.28
424 0.27
425 0.25
426 0.19
427 0.15
428 0.14
429 0.12
430 0.11
431 0.07
432 0.07
433 0.07
434 0.06
435 0.07
436 0.09
437 0.14
438 0.15
439 0.16
440 0.17
441 0.24
442 0.26
443 0.31
444 0.32
445 0.3
446 0.3
447 0.32
448 0.32
449 0.28
450 0.32
451 0.32
452 0.32
453 0.29
454 0.29
455 0.27
456 0.26
457 0.28
458 0.22
459 0.17
460 0.15
461 0.16
462 0.15
463 0.14
464 0.14
465 0.11
466 0.12
467 0.14
468 0.13
469 0.13
470 0.14
471 0.14
472 0.15
473 0.13
474 0.12
475 0.09
476 0.09
477 0.08
478 0.07
479 0.06
480 0.05
481 0.06
482 0.08
483 0.09
484 0.09
485 0.09
486 0.1
487 0.11
488 0.12
489 0.12
490 0.1
491 0.1
492 0.14
493 0.22
494 0.22
495 0.23
496 0.25
497 0.25
498 0.23
499 0.25
500 0.22
501 0.15
502 0.18
503 0.19
504 0.22
505 0.22
506 0.23
507 0.22
508 0.21
509 0.2
510 0.17
511 0.14
512 0.13
513 0.16
514 0.16
515 0.18
516 0.18
517 0.18
518 0.17
519 0.16
520 0.12
521 0.09
522 0.09
523 0.07
524 0.11
525 0.12
526 0.11
527 0.12
528 0.12
529 0.2
530 0.2
531 0.22
532 0.21
533 0.22
534 0.24
535 0.27
536 0.28
537 0.2
538 0.2
539 0.18
540 0.15
541 0.15
542 0.12
543 0.09
544 0.08
545 0.07
546 0.07
547 0.06
548 0.06
549 0.05
550 0.07
551 0.08
552 0.09
553 0.11
554 0.17
555 0.18
556 0.18
557 0.17
558 0.16
559 0.16
560 0.16
561 0.14
562 0.08
563 0.07
564 0.07
565 0.07
566 0.07
567 0.08
568 0.09
569 0.08
570 0.08
571 0.11
572 0.11
573 0.13
574 0.13
575 0.12
576 0.11
577 0.15
578 0.16
579 0.14
580 0.14
581 0.12
582 0.12
583 0.13
584 0.12
585 0.08
586 0.09
587 0.08
588 0.11
589 0.11
590 0.11
591 0.1
592 0.09
593 0.11
594 0.1
595 0.12
596 0.1
597 0.11
598 0.12
599 0.12
600 0.12
601 0.1
602 0.12
603 0.11
604 0.12
605 0.12
606 0.11
607 0.11
608 0.11
609 0.11
610 0.1
611 0.1
612 0.14
613 0.22
614 0.26
615 0.27
616 0.27
617 0.28
618 0.28
619 0.29
620 0.26
621 0.2
622 0.21
623 0.23
624 0.24
625 0.26
626 0.25
627 0.22
628 0.22
629 0.19
630 0.2
631 0.19
632 0.23
633 0.21
634 0.22
635 0.21
636 0.23
637 0.24
638 0.19
639 0.17
640 0.13
641 0.13
642 0.12
643 0.12
644 0.09
645 0.11
646 0.11
647 0.15
648 0.17
649 0.19
650 0.21
651 0.22
652 0.23
653 0.24
654 0.27
655 0.26
656 0.25
657 0.24
658 0.28
659 0.29
660 0.29
661 0.25
662 0.21
663 0.18
664 0.18
665 0.15
666 0.09
667 0.09
668 0.09
669 0.09
670 0.09
671 0.08
672 0.07
673 0.07
674 0.07
675 0.05
676 0.04
677 0.03
678 0.03
679 0.03
680 0.03
681 0.03
682 0.03
683 0.03
684 0.03
685 0.02
686 0.03
687 0.03
688 0.03
689 0.04
690 0.04
691 0.04
692 0.06
693 0.07
694 0.07
695 0.09
696 0.1
697 0.12
698 0.13
699 0.15
700 0.13
701 0.13
702 0.14
703 0.13
704 0.15
705 0.14
706 0.13
707 0.13
708 0.13
709 0.13
710 0.12
711 0.13
712 0.13
713 0.14
714 0.18
715 0.2
716 0.21
717 0.21
718 0.21
719 0.18
720 0.17
721 0.18
722 0.14
723 0.13
724 0.13
725 0.13
726 0.15
727 0.16
728 0.16
729 0.17
730 0.18
731 0.21
732 0.23
733 0.24
734 0.26
735 0.28
736 0.27
737 0.25
738 0.24
739 0.2
740 0.18
741 0.21
742 0.17
743 0.15
744 0.13
745 0.13
746 0.13
747 0.12
748 0.14
749 0.1
750 0.1
751 0.12
752 0.12
753 0.1
754 0.1
755 0.1
756 0.07
757 0.07
758 0.05
759 0.04
760 0.03
761 0.03
762 0.04
763 0.04
764 0.04
765 0.04
766 0.05
767 0.06
768 0.07
769 0.08
770 0.1
771 0.12
772 0.13
773 0.14
774 0.16
775 0.15
776 0.17
777 0.2
778 0.21
779 0.2
780 0.22
781 0.21
782 0.22
783 0.23
784 0.23
785 0.21
786 0.21
787 0.2
788 0.17
789 0.16
790 0.13
791 0.14
792 0.17
793 0.16
794 0.17
795 0.17
796 0.19
797 0.2
798 0.21
799 0.21
800 0.17
801 0.18
802 0.18
803 0.23
804 0.23
805 0.26
806 0.27
807 0.27
808 0.26
809 0.24
810 0.21
811 0.16
812 0.15
813 0.15
814 0.15
815 0.16
816 0.15
817 0.14
818 0.14
819 0.14
820 0.13
821 0.09
822 0.1
823 0.09
824 0.09
825 0.1
826 0.14
827 0.18
828 0.24
829 0.27
830 0.26
831 0.32
832 0.33
833 0.33
834 0.35
835 0.32
836 0.28
837 0.28
838 0.25
839 0.19
840 0.19
841 0.19
842 0.17
843 0.17
844 0.16
845 0.13
846 0.13
847 0.14
848 0.13
849 0.13
850 0.09
851 0.08
852 0.06
853 0.05
854 0.05
855 0.04
856 0.04
857 0.04
858 0.03
859 0.03
860 0.04
861 0.05
862 0.05
863 0.06
864 0.07
865 0.09
866 0.11
867 0.12
868 0.14
869 0.16
870 0.21
871 0.23
872 0.24
873 0.24
874 0.24
875 0.25
876 0.24
877 0.23
878 0.19
879 0.17
880 0.18
881 0.17
882 0.15
883 0.13
884 0.11
885 0.1
886 0.08
887 0.09
888 0.09
889 0.09
890 0.09
891 0.09
892 0.09
893 0.08
894 0.08
895 0.07
896 0.04
897 0.04
898 0.04
899 0.05
900 0.05
901 0.06
902 0.06
903 0.06
904 0.06
905 0.07
906 0.06
907 0.06
908 0.05
909 0.05
910 0.05
911 0.05
912 0.05
913 0.05
914 0.06
915 0.07
916 0.08
917 0.09
918 0.11
919 0.16
920 0.21
921 0.22
922 0.23
923 0.22
924 0.21
925 0.24
926 0.25
927 0.21
928 0.17
929 0.19
930 0.17
931 0.2
932 0.21
933 0.17
934 0.16
935 0.15
936 0.16
937 0.16
938 0.17
939 0.16
940 0.19
941 0.19
942 0.17
943 0.17
944 0.16
945 0.16
946 0.14
947 0.14
948 0.09
949 0.1
950 0.1
951 0.09
952 0.09
953 0.07
954 0.08
955 0.07
956 0.09
957 0.1
958 0.13
959 0.12
960 0.13
961 0.12
962 0.12
963 0.14
964 0.12
965 0.13
966 0.18
967 0.23
968 0.24
969 0.26
970 0.27
971 0.26
972 0.28
973 0.31
974 0.28
975 0.27
976 0.29
977 0.3
978 0.31
979 0.3
980 0.28
981 0.26
982 0.22
983 0.24
984 0.23
985 0.22
986 0.23
987 0.26
988 0.34
989 0.36
990 0.42
991 0.43
992 0.44
993 0.43
994 0.49
995 0.53
996 0.53
997 0.51
998 0.52
999 0.48
1000 0.49
1001 0.57
1002 0.48
1003 0.45
1004 0.4
1005 0.36
1006 0.33
1007 0.37
1008 0.37
1009 0.35
1010 0.37
1011 0.36
1012 0.36
1013 0.37
1014 0.34
1015 0.3
1016 0.27
1017 0.23
1018 0.2
1019 0.18
1020 0.14
1021 0.12
1022 0.13
1023 0.11
1024 0.1
1025 0.1
1026 0.1
1027 0.09
1028 0.09
1029 0.09
1030 0.07
1031 0.07
1032 0.06
1033 0.05
1034 0.05
1035 0.05
1036 0.05
1037 0.06
1038 0.08
1039 0.09
1040 0.1
1041 0.12
1042 0.14
1043 0.16
1044 0.19
1045 0.21
1046 0.26
1047 0.34
1048 0.41
1049 0.45
1050 0.47
1051 0.48
1052 0.54
1053 0.56
1054 0.55
1055 0.55
1056 0.52
1057 0.46
1058 0.45
1059 0.43
1060 0.35
1061 0.32
1062 0.26
1063 0.18
1064 0.15
1065 0.14
1066 0.12
1067 0.11
1068 0.09
1069 0.11
1070 0.15
1071 0.15
1072 0.15
1073 0.17
1074 0.21
1075 0.22
1076 0.22
1077 0.2
1078 0.19
1079 0.18
1080 0.18
1081 0.17
1082 0.14
1083 0.15
1084 0.15
1085 0.19
1086 0.21
1087 0.21
1088 0.2
1089 0.2
1090 0.24
1091 0.24
1092 0.3
1093 0.28
1094 0.27
1095 0.33
1096 0.37
1097 0.43
1098 0.44
1099 0.45
1100 0.46
1101 0.52
1102 0.54
1103 0.48
1104 0.47
1105 0.42
1106 0.46
1107 0.44
1108 0.39
1109 0.33
1110 0.31
1111 0.34
1112 0.33
1113 0.32
1114 0.25
1115 0.33
1116 0.34
1117 0.32
1118 0.34
1119 0.32
1120 0.33
1121 0.34
1122 0.35
1123 0.28
1124 0.24
1125 0.23
1126 0.21
1127 0.21
1128 0.19
1129 0.17
1130 0.15
1131 0.11
1132 0.12
1133 0.11
1134 0.1
1135 0.09
1136 0.08
1137 0.08
1138 0.08
1139 0.09
1140 0.07
1141 0.06
1142 0.05
1143 0.06
1144 0.07
1145 0.08
1146 0.1
1147 0.09
1148 0.13
1149 0.14
1150 0.14
1151 0.13
1152 0.11
1153 0.13
1154 0.12
1155 0.16
1156 0.14
1157 0.15
1158 0.16
1159 0.16
1160 0.16
1161 0.15
1162 0.14
1163 0.11
1164 0.1
1165 0.13
1166 0.14
1167 0.15
1168 0.19
1169 0.21
1170 0.22
1171 0.25
1172 0.26
1173 0.22
1174 0.26
1175 0.26
1176 0.24
1177 0.27
1178 0.26
1179 0.27
1180 0.26
1181 0.26
1182 0.23
1183 0.21
1184 0.19
1185 0.17
1186 0.21
1187 0.18
1188 0.23
1189 0.23
1190 0.24
1191 0.24
1192 0.23
1193 0.27
1194 0.31
1195 0.35
1196 0.38
1197 0.44
1198 0.44
1199 0.53
1200 0.6
1201 0.63
1202 0.65
1203 0.69
1204 0.66
1205 0.69
1206 0.72
1207 0.69
1208 0.67
1209 0.64
1210 0.56
1211 0.53
1212 0.5
1213 0.44
1214 0.46
1215 0.43
1216 0.41
1217 0.43
1218 0.45
1219 0.4
1220 0.47
1221 0.45
1222 0.45
1223 0.43
1224 0.42
1225 0.35
1226 0.32
1227 0.29
1228 0.19
1229 0.18
1230 0.12
1231 0.13
1232 0.12
1233 0.1
1234 0.1
1235 0.12
1236 0.14
1237 0.15
1238 0.15
1239 0.17
1240 0.2
1241 0.3
1242 0.34
1243 0.43
1244 0.49
1245 0.57
1246 0.65
1247 0.73
1248 0.79
1249 0.75
1250 0.78
1251 0.79
1252 0.81