Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Q3DZ40

Protein Details
Accession A0A1Q3DZ40    Localization Confidence High Confidence Score 20.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
54-75IKEWRVYRDKSEKKSHNSSKSDHydrophilic
212-235SESDEKPIKKKPTKKTNKTSSSSSHydrophilic
292-315DTSTKNKAKKSTKTTDNKKKAKTVHydrophilic
420-447IVTRGAGFRKEKNKKKRGSYKGGNITMEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
219-226IKKKPTKK
426-438GFRKEKNKKKRGS
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MGDQHLAAAYTHIYAFLKSRDHNDVAKALKKAAKGVVVLKDSQDDATPSLDEIIKEWRVYRDKSEKKSHNSSKSDVSAPKNKQGNASTLVKTKSKKPASSSSSEASTSDSDSDASTEKIEKKAEQPAATSDSEDSDSSSDESSTSGKKVTKILARESSSTLSTGSEKGKKEKTSQKQTVAAVKSKSEVPKKLSKAKSSSVSASSSSASSSESESDEKPIKKKPTKKTNKTSSSSSSSSSSSDSESDTEPKKPTKTAKRKVLEEDKASSSSDSDPTSSSSSSSSSNSSESESDTSTKNKAKKSTKTTDNKKKAKTVDVDVVVSKQHSVDSTLEDQKKVTKKRRTSESGAAVPTATVSTARDIATKSSALEAPKLGKRRTTNERFQRIDPDKVPAHLIRDNRYENKAAPENDYGAKAHADLIVTRGAGFRKEKNKKKRGSYKGGNITMESHSYKFPDTDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.15
3 0.18
4 0.23
5 0.24
6 0.3
7 0.35
8 0.39
9 0.41
10 0.42
11 0.45
12 0.45
13 0.49
14 0.45
15 0.43
16 0.43
17 0.41
18 0.42
19 0.39
20 0.37
21 0.34
22 0.38
23 0.4
24 0.39
25 0.39
26 0.35
27 0.33
28 0.3
29 0.28
30 0.23
31 0.17
32 0.16
33 0.16
34 0.15
35 0.13
36 0.15
37 0.16
38 0.14
39 0.14
40 0.2
41 0.2
42 0.21
43 0.23
44 0.28
45 0.33
46 0.36
47 0.44
48 0.48
49 0.55
50 0.63
51 0.72
52 0.73
53 0.75
54 0.83
55 0.84
56 0.83
57 0.79
58 0.74
59 0.71
60 0.66
61 0.65
62 0.6
63 0.57
64 0.57
65 0.56
66 0.6
67 0.59
68 0.56
69 0.56
70 0.52
71 0.5
72 0.46
73 0.47
74 0.42
75 0.41
76 0.43
77 0.42
78 0.42
79 0.45
80 0.49
81 0.52
82 0.54
83 0.55
84 0.61
85 0.62
86 0.65
87 0.62
88 0.54
89 0.48
90 0.44
91 0.38
92 0.3
93 0.25
94 0.21
95 0.17
96 0.14
97 0.12
98 0.11
99 0.12
100 0.11
101 0.1
102 0.1
103 0.14
104 0.17
105 0.2
106 0.22
107 0.23
108 0.26
109 0.34
110 0.38
111 0.35
112 0.33
113 0.33
114 0.35
115 0.34
116 0.3
117 0.22
118 0.18
119 0.19
120 0.17
121 0.14
122 0.1
123 0.11
124 0.11
125 0.11
126 0.09
127 0.08
128 0.09
129 0.1
130 0.11
131 0.11
132 0.14
133 0.15
134 0.17
135 0.21
136 0.26
137 0.29
138 0.31
139 0.37
140 0.41
141 0.41
142 0.41
143 0.4
144 0.36
145 0.32
146 0.28
147 0.22
148 0.15
149 0.14
150 0.15
151 0.18
152 0.22
153 0.23
154 0.29
155 0.35
156 0.37
157 0.44
158 0.52
159 0.57
160 0.62
161 0.67
162 0.67
163 0.66
164 0.66
165 0.65
166 0.59
167 0.53
168 0.43
169 0.36
170 0.32
171 0.31
172 0.34
173 0.32
174 0.33
175 0.34
176 0.41
177 0.46
178 0.55
179 0.56
180 0.56
181 0.55
182 0.55
183 0.55
184 0.49
185 0.46
186 0.39
187 0.35
188 0.29
189 0.25
190 0.21
191 0.16
192 0.13
193 0.11
194 0.09
195 0.08
196 0.08
197 0.08
198 0.09
199 0.11
200 0.11
201 0.14
202 0.19
203 0.2
204 0.22
205 0.28
206 0.36
207 0.42
208 0.51
209 0.59
210 0.65
211 0.74
212 0.81
213 0.85
214 0.86
215 0.87
216 0.81
217 0.76
218 0.69
219 0.64
220 0.55
221 0.46
222 0.38
223 0.3
224 0.27
225 0.23
226 0.19
227 0.14
228 0.13
229 0.12
230 0.11
231 0.12
232 0.15
233 0.15
234 0.18
235 0.2
236 0.22
237 0.23
238 0.26
239 0.34
240 0.41
241 0.51
242 0.57
243 0.65
244 0.68
245 0.71
246 0.75
247 0.75
248 0.7
249 0.62
250 0.56
251 0.48
252 0.43
253 0.4
254 0.31
255 0.23
256 0.18
257 0.17
258 0.14
259 0.12
260 0.12
261 0.13
262 0.15
263 0.14
264 0.13
265 0.12
266 0.12
267 0.13
268 0.14
269 0.14
270 0.13
271 0.14
272 0.14
273 0.15
274 0.14
275 0.14
276 0.15
277 0.14
278 0.14
279 0.15
280 0.17
281 0.2
282 0.25
283 0.28
284 0.32
285 0.4
286 0.47
287 0.55
288 0.62
289 0.67
290 0.72
291 0.77
292 0.83
293 0.85
294 0.87
295 0.86
296 0.82
297 0.8
298 0.74
299 0.71
300 0.65
301 0.59
302 0.56
303 0.49
304 0.46
305 0.38
306 0.35
307 0.28
308 0.23
309 0.18
310 0.11
311 0.09
312 0.08
313 0.1
314 0.11
315 0.15
316 0.2
317 0.28
318 0.29
319 0.29
320 0.29
321 0.34
322 0.41
323 0.46
324 0.51
325 0.52
326 0.6
327 0.68
328 0.77
329 0.78
330 0.77
331 0.77
332 0.75
333 0.7
334 0.62
335 0.53
336 0.43
337 0.35
338 0.28
339 0.19
340 0.11
341 0.06
342 0.06
343 0.08
344 0.1
345 0.11
346 0.12
347 0.13
348 0.15
349 0.18
350 0.17
351 0.16
352 0.17
353 0.19
354 0.18
355 0.19
356 0.2
357 0.23
358 0.28
359 0.35
360 0.34
361 0.38
362 0.42
363 0.49
364 0.57
365 0.6
366 0.66
367 0.69
368 0.77
369 0.74
370 0.72
371 0.74
372 0.69
373 0.68
374 0.59
375 0.55
376 0.47
377 0.44
378 0.47
379 0.38
380 0.38
381 0.35
382 0.38
383 0.36
384 0.42
385 0.48
386 0.48
387 0.5
388 0.48
389 0.46
390 0.49
391 0.51
392 0.45
393 0.43
394 0.41
395 0.4
396 0.39
397 0.38
398 0.31
399 0.25
400 0.24
401 0.19
402 0.17
403 0.15
404 0.14
405 0.12
406 0.14
407 0.14
408 0.14
409 0.14
410 0.15
411 0.15
412 0.2
413 0.24
414 0.3
415 0.39
416 0.5
417 0.6
418 0.69
419 0.78
420 0.82
421 0.89
422 0.91
423 0.9
424 0.91
425 0.91
426 0.9
427 0.91
428 0.88
429 0.79
430 0.69
431 0.62
432 0.53
433 0.48
434 0.4
435 0.31
436 0.27
437 0.27
438 0.28