Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Q3E139

Protein Details
Accession A0A1Q3E139    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
48-94DAPALSHAEKRRQKKKEKLAARKDKGLEPPPSKKRKTDNQKEATDSTHydrophilic
236-256LLDAHRKKPRKDKDSKKEEEDBasic
372-396GTGDEKSSNRRKDKPDYRHNAEDSQHydrophilic
415-434KDQEGVPRHKGPRNRPKPGABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
56-83EKRRQKKKEKLAARKDKGLEPPPSKKRK
241-252RKKPRKDKDSKK
414-435RKDQEGVPRHKGPRNRPKPGAA
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSSSSSSSSSGSASPEPSLKRRREGKSADDVEATQSSSSDSDSSDEDDAPALSHAEKRRQKKKEKLAARKDKGLEPPPSKKRKTDNQKEATDSTSQRQNSVWVGNLSFKTTTDALRKFFDGVGEITRINLPMKVATRPNMPGENRGFAYVDFATADAKNVAIALSEKPLLGRKLLIKDGDDFAGRPAAPDVEESLGGKTHSKTALKILRIQKQPPAPTLFFGNLPFETTEDSIRQLLDAHRKKPRKDKDSKKEEEDVEEEKDEGKGEKEEENWIRKIRLGTFEDSGLCKGFAFVDFSSTDNATSALINPKNHHLNGRNLVVEYASADAVKRGPNKPRAVAGEGGPGDFKRKFGPGVNGSQNKPFRRNERGVGTGDEKSSNRRKDKPDYRHNAEDSQTVDHEESSTPQFGRRPYRKDQEGVPRHKGPRNRPKPGAALAQAKRQSAAIVPTSGKKIIF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.26
3 0.3
4 0.38
5 0.46
6 0.47
7 0.54
8 0.62
9 0.66
10 0.71
11 0.73
12 0.72
13 0.74
14 0.73
15 0.66
16 0.58
17 0.52
18 0.46
19 0.39
20 0.32
21 0.21
22 0.16
23 0.15
24 0.13
25 0.14
26 0.11
27 0.11
28 0.11
29 0.13
30 0.15
31 0.16
32 0.15
33 0.15
34 0.15
35 0.14
36 0.13
37 0.12
38 0.1
39 0.09
40 0.16
41 0.2
42 0.3
43 0.38
44 0.48
45 0.58
46 0.67
47 0.76
48 0.81
49 0.87
50 0.87
51 0.9
52 0.92
53 0.93
54 0.94
55 0.9
56 0.87
57 0.8
58 0.75
59 0.73
60 0.7
61 0.68
62 0.65
63 0.69
64 0.71
65 0.77
66 0.75
67 0.74
68 0.75
69 0.77
70 0.8
71 0.81
72 0.81
73 0.81
74 0.82
75 0.8
76 0.73
77 0.65
78 0.59
79 0.51
80 0.44
81 0.42
82 0.37
83 0.33
84 0.31
85 0.31
86 0.28
87 0.28
88 0.26
89 0.21
90 0.21
91 0.25
92 0.25
93 0.25
94 0.22
95 0.2
96 0.2
97 0.19
98 0.23
99 0.26
100 0.29
101 0.29
102 0.31
103 0.32
104 0.29
105 0.29
106 0.25
107 0.19
108 0.16
109 0.16
110 0.15
111 0.14
112 0.14
113 0.14
114 0.14
115 0.13
116 0.12
117 0.1
118 0.12
119 0.15
120 0.18
121 0.21
122 0.22
123 0.26
124 0.28
125 0.31
126 0.34
127 0.33
128 0.36
129 0.36
130 0.37
131 0.33
132 0.31
133 0.28
134 0.21
135 0.23
136 0.16
137 0.13
138 0.1
139 0.1
140 0.1
141 0.1
142 0.11
143 0.07
144 0.07
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.05
149 0.06
150 0.06
151 0.08
152 0.08
153 0.08
154 0.09
155 0.13
156 0.13
157 0.13
158 0.15
159 0.17
160 0.21
161 0.24
162 0.24
163 0.22
164 0.23
165 0.24
166 0.22
167 0.18
168 0.14
169 0.12
170 0.14
171 0.12
172 0.1
173 0.1
174 0.09
175 0.09
176 0.09
177 0.1
178 0.08
179 0.08
180 0.08
181 0.08
182 0.08
183 0.08
184 0.1
185 0.09
186 0.11
187 0.15
188 0.15
189 0.15
190 0.23
191 0.28
192 0.28
193 0.35
194 0.39
195 0.44
196 0.47
197 0.48
198 0.46
199 0.46
200 0.47
201 0.43
202 0.41
203 0.33
204 0.3
205 0.3
206 0.25
207 0.21
208 0.19
209 0.17
210 0.12
211 0.12
212 0.11
213 0.1
214 0.1
215 0.1
216 0.1
217 0.09
218 0.1
219 0.09
220 0.09
221 0.09
222 0.09
223 0.12
224 0.21
225 0.25
226 0.29
227 0.38
228 0.44
229 0.49
230 0.58
231 0.65
232 0.65
233 0.71
234 0.77
235 0.79
236 0.84
237 0.84
238 0.79
239 0.75
240 0.66
241 0.58
242 0.5
243 0.42
244 0.33
245 0.28
246 0.23
247 0.17
248 0.16
249 0.13
250 0.11
251 0.09
252 0.08
253 0.1
254 0.11
255 0.12
256 0.19
257 0.24
258 0.28
259 0.29
260 0.3
261 0.29
262 0.29
263 0.31
264 0.27
265 0.29
266 0.28
267 0.28
268 0.27
269 0.28
270 0.26
271 0.25
272 0.22
273 0.16
274 0.13
275 0.1
276 0.09
277 0.08
278 0.08
279 0.1
280 0.09
281 0.11
282 0.12
283 0.12
284 0.14
285 0.14
286 0.13
287 0.1
288 0.1
289 0.08
290 0.08
291 0.09
292 0.15
293 0.18
294 0.2
295 0.21
296 0.27
297 0.32
298 0.32
299 0.37
300 0.34
301 0.39
302 0.43
303 0.44
304 0.39
305 0.34
306 0.34
307 0.27
308 0.22
309 0.15
310 0.1
311 0.07
312 0.06
313 0.06
314 0.07
315 0.09
316 0.13
317 0.18
318 0.22
319 0.31
320 0.39
321 0.44
322 0.46
323 0.5
324 0.51
325 0.49
326 0.45
327 0.38
328 0.37
329 0.32
330 0.3
331 0.25
332 0.2
333 0.21
334 0.19
335 0.19
336 0.15
337 0.17
338 0.19
339 0.23
340 0.32
341 0.33
342 0.4
343 0.49
344 0.52
345 0.51
346 0.57
347 0.59
348 0.55
349 0.57
350 0.56
351 0.54
352 0.58
353 0.62
354 0.61
355 0.61
356 0.6
357 0.56
358 0.54
359 0.5
360 0.43
361 0.39
362 0.35
363 0.29
364 0.33
365 0.4
366 0.45
367 0.48
368 0.54
369 0.6
370 0.68
371 0.78
372 0.8
373 0.82
374 0.83
375 0.84
376 0.84
377 0.8
378 0.74
379 0.66
380 0.59
381 0.5
382 0.43
383 0.35
384 0.29
385 0.25
386 0.2
387 0.2
388 0.17
389 0.17
390 0.18
391 0.21
392 0.19
393 0.22
394 0.26
395 0.31
396 0.41
397 0.47
398 0.51
399 0.57
400 0.67
401 0.69
402 0.69
403 0.71
404 0.72
405 0.73
406 0.75
407 0.73
408 0.72
409 0.73
410 0.75
411 0.76
412 0.76
413 0.77
414 0.79
415 0.81
416 0.78
417 0.78
418 0.78
419 0.76
420 0.73
421 0.69
422 0.68
423 0.62
424 0.64
425 0.62
426 0.55
427 0.5
428 0.41
429 0.36
430 0.29
431 0.31
432 0.25
433 0.25
434 0.27
435 0.31
436 0.35