Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Q3EDR6

Protein Details
Accession A0A1Q3EDR6    Localization Confidence High Confidence Score 24
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
24-59EDVQIIPQPKKRKSSRSKDNKKSTKKLRSETPIDNSHydrophilic
440-471RQHGSGRSDKDRERKRNQYRDRDSPREDRNLKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
32-51PKKRKSSRSKDNKKSTKKLR
377-398RDGAKKNPGNGQKPPSQPKKMR
448-484DKDRERKRNQYRDRDSPREDRNLKREQDRGREKGREQ
Subcellular Location(s) nucl 25
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MAQPEIIDLTLPSSQSPHASFADEDVQIIPQPKKRKSSRSKDNKKSTKKLRSETPIDNSKLFIVDLDPSEALRPTISTIPQEHESNEGKLLLPAHVSVLGSVPVEIIAPASEDQDYVEYLDYGGPDELGVTRYFQLEPDRTKTASVIVCKHCGVKGDHKTSACSVIICLTCGVRNEHSTYSCPISKVCFACGMKGHLSASCPNRGKLANTYDDCDRCGSSAHATSECPTHWRIYHYVKDADRISTMEARRSKKTRPLGQGGEGYIAEDSWCYNCGECGHWGDDCEVMRHVHDIPDENSAFGITNLLTGPFSEIETGNTDRAPREWELDSTEWNDWGGRVPINVGRQAKKKEIARMRAHLLDDEDEDDPFSRLAKPMRDGAKKNPGNGQKPPSQPKKMRFELKVKGASNQASGPQDLLRRISSDVGSKGSGRPKDNDTYHRQHGSGRSDKDRERKRNQYRDRDSPREDRNLKREQDRGREKGREQGPRYKGGYSNGYYR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.19
3 0.21
4 0.22
5 0.21
6 0.24
7 0.24
8 0.25
9 0.29
10 0.24
11 0.23
12 0.19
13 0.19
14 0.19
15 0.24
16 0.25
17 0.27
18 0.36
19 0.42
20 0.51
21 0.6
22 0.69
23 0.74
24 0.81
25 0.86
26 0.88
27 0.92
28 0.93
29 0.95
30 0.95
31 0.95
32 0.94
33 0.94
34 0.93
35 0.92
36 0.89
37 0.87
38 0.86
39 0.83
40 0.8
41 0.78
42 0.76
43 0.7
44 0.63
45 0.54
46 0.45
47 0.38
48 0.3
49 0.21
50 0.14
51 0.13
52 0.14
53 0.16
54 0.15
55 0.14
56 0.15
57 0.15
58 0.14
59 0.12
60 0.11
61 0.11
62 0.15
63 0.17
64 0.19
65 0.21
66 0.26
67 0.29
68 0.3
69 0.28
70 0.3
71 0.31
72 0.29
73 0.28
74 0.24
75 0.2
76 0.21
77 0.21
78 0.15
79 0.13
80 0.12
81 0.11
82 0.12
83 0.11
84 0.1
85 0.1
86 0.1
87 0.09
88 0.09
89 0.07
90 0.06
91 0.06
92 0.06
93 0.05
94 0.04
95 0.06
96 0.06
97 0.07
98 0.07
99 0.07
100 0.08
101 0.08
102 0.09
103 0.08
104 0.08
105 0.07
106 0.07
107 0.08
108 0.08
109 0.08
110 0.08
111 0.07
112 0.06
113 0.06
114 0.07
115 0.07
116 0.08
117 0.08
118 0.09
119 0.1
120 0.11
121 0.12
122 0.18
123 0.22
124 0.26
125 0.29
126 0.32
127 0.31
128 0.32
129 0.3
130 0.3
131 0.28
132 0.28
133 0.31
134 0.3
135 0.33
136 0.33
137 0.34
138 0.29
139 0.3
140 0.3
141 0.32
142 0.39
143 0.42
144 0.46
145 0.45
146 0.46
147 0.44
148 0.43
149 0.33
150 0.24
151 0.18
152 0.18
153 0.18
154 0.16
155 0.15
156 0.12
157 0.13
158 0.14
159 0.17
160 0.14
161 0.16
162 0.19
163 0.21
164 0.22
165 0.22
166 0.23
167 0.25
168 0.24
169 0.23
170 0.2
171 0.21
172 0.24
173 0.23
174 0.22
175 0.25
176 0.23
177 0.25
178 0.26
179 0.27
180 0.23
181 0.23
182 0.23
183 0.16
184 0.18
185 0.21
186 0.22
187 0.27
188 0.27
189 0.26
190 0.29
191 0.29
192 0.29
193 0.29
194 0.31
195 0.3
196 0.29
197 0.31
198 0.32
199 0.32
200 0.3
201 0.26
202 0.21
203 0.14
204 0.14
205 0.13
206 0.12
207 0.15
208 0.16
209 0.15
210 0.15
211 0.16
212 0.17
213 0.16
214 0.15
215 0.13
216 0.13
217 0.14
218 0.16
219 0.2
220 0.25
221 0.3
222 0.31
223 0.36
224 0.34
225 0.37
226 0.35
227 0.31
228 0.26
229 0.21
230 0.19
231 0.19
232 0.19
233 0.21
234 0.26
235 0.29
236 0.34
237 0.37
238 0.39
239 0.42
240 0.51
241 0.53
242 0.54
243 0.57
244 0.54
245 0.54
246 0.52
247 0.44
248 0.36
249 0.28
250 0.21
251 0.14
252 0.11
253 0.07
254 0.05
255 0.05
256 0.04
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.06
261 0.07
262 0.09
263 0.1
264 0.12
265 0.12
266 0.12
267 0.13
268 0.13
269 0.14
270 0.13
271 0.12
272 0.11
273 0.11
274 0.11
275 0.11
276 0.11
277 0.11
278 0.11
279 0.13
280 0.13
281 0.18
282 0.18
283 0.16
284 0.16
285 0.14
286 0.13
287 0.1
288 0.1
289 0.04
290 0.05
291 0.05
292 0.06
293 0.05
294 0.05
295 0.07
296 0.06
297 0.07
298 0.07
299 0.08
300 0.08
301 0.12
302 0.13
303 0.13
304 0.13
305 0.14
306 0.13
307 0.13
308 0.16
309 0.14
310 0.16
311 0.16
312 0.17
313 0.21
314 0.21
315 0.22
316 0.22
317 0.21
318 0.18
319 0.17
320 0.16
321 0.11
322 0.12
323 0.12
324 0.09
325 0.09
326 0.11
327 0.14
328 0.16
329 0.22
330 0.25
331 0.28
332 0.35
333 0.4
334 0.43
335 0.46
336 0.49
337 0.53
338 0.57
339 0.61
340 0.61
341 0.61
342 0.61
343 0.58
344 0.54
345 0.46
346 0.39
347 0.3
348 0.24
349 0.22
350 0.18
351 0.14
352 0.13
353 0.13
354 0.11
355 0.1
356 0.1
357 0.09
358 0.12
359 0.16
360 0.2
361 0.22
362 0.28
363 0.37
364 0.44
365 0.47
366 0.52
367 0.59
368 0.57
369 0.58
370 0.59
371 0.59
372 0.57
373 0.61
374 0.58
375 0.56
376 0.62
377 0.69
378 0.7
379 0.72
380 0.74
381 0.75
382 0.79
383 0.79
384 0.8
385 0.77
386 0.76
387 0.75
388 0.75
389 0.75
390 0.66
391 0.61
392 0.57
393 0.52
394 0.45
395 0.38
396 0.34
397 0.27
398 0.27
399 0.24
400 0.22
401 0.24
402 0.23
403 0.25
404 0.21
405 0.21
406 0.22
407 0.24
408 0.22
409 0.24
410 0.24
411 0.24
412 0.24
413 0.24
414 0.28
415 0.33
416 0.37
417 0.36
418 0.38
419 0.41
420 0.49
421 0.54
422 0.57
423 0.58
424 0.6
425 0.64
426 0.63
427 0.58
428 0.55
429 0.56
430 0.57
431 0.57
432 0.56
433 0.56
434 0.6
435 0.66
436 0.71
437 0.74
438 0.75
439 0.77
440 0.81
441 0.84
442 0.88
443 0.91
444 0.92
445 0.91
446 0.92
447 0.91
448 0.9
449 0.86
450 0.84
451 0.82
452 0.81
453 0.8
454 0.78
455 0.76
456 0.76
457 0.76
458 0.74
459 0.74
460 0.73
461 0.76
462 0.77
463 0.76
464 0.76
465 0.78
466 0.72
467 0.73
468 0.73
469 0.72
470 0.69
471 0.71
472 0.67
473 0.67
474 0.68
475 0.63
476 0.59
477 0.54
478 0.56