FuNGI

A0A1Q3EH12

Protein Details

Accession

A0A1Q3EH12

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
78-106	TSAPDPKREEVRQRDEKRRKLKLQLLLAD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 13.5, cyto_nucl 11, nucl 7.5, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR004871 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_C IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003676 F:nucleic acid binding
Pfam	View protein in Pfam PF03178 CPSF_A

Amino Acid Sequences

MRLFHAYPVLQDCFGIVNFGQTYGSTQGPSVLLKTNMVESEEDDTDREVDNGNDVRAPAGEDDDMYDDDADIYGPSHTSAPDPKREEVRQRDEKRRKLKLQLLLADYLPSYGSINDMAFGLTKNGDKPTPILITATSTYQHGGFTLFQRDLPVKVTKKRMHILGGTKGLWSFALQKKVEKGSGTGHHNGTGNSNGGERDTKDVMMIISTDANPSPGFSRITIPPPSSTTPSTPSIVNISNNDITARIQGTSIGAGPFFGGVVVLQVMTGSIRVLETDGTERQVIKDVESSSSSTVSTPRARIRACSISDPYVLILREDDTMGLFIGEVSKGKLRRKDMSMLGGKTSKYLTGCFFTDHTGMLEKNVFSPNPKVDLGQRSSDGLNNQWLLLVRPQGVLELWSLPKMTLAFSVAIPFATLENVLMDSGEGVASSIPVPAATTVTSATSPSAPPVPPTAPAMLRSQSQTQDVTMTPVESDAGDAGAAMQNKEKPESMNQTKETDGRDTGAIEQVLLAPLGETRPELHLFVLLRSGQLAIYQAIPAPAPPLHSTAVEALNGVEPTSPTIAATPSTLNSRLVRLRIAFVKVLSKTFELQNSNIAGAGNGPGGVGSMGSASGSALTDQKKFTRMFLPFVTPNVSSSLTIPQNKQKKGTTTYSGVFFTGENPSWIISTDRGGVHLYPSGHAVVHAFTACPVLASRDPRIGGEFLIYSDEGPTLLEWIPDFGLDFPLPMRSVPRGRAYSSVVFDSSTSLVVAAAVLEARFASFDEDNNRIWTPDASNISDPTTECSALELISPDLWVSMDGYEFATNEVVNAVACVTLETSSTETGSKEFIAVGTTINRGEDLAAKGATYIFEIVEVVADPMLAPNRWYKLRLRCRDDAKGPVTAVCGLNGYLVSSMGQKIFVRAFDSDERLNLLLVGDAVKSVSFVAFQEDPYKLVLLAKDKRHLCVITADFFFAENEMTIFTHDEEGILRLYDYNPHDPESGDGRHLLMRSEFNSQAEYRTTALIARRTSTDTVIPQAKLLYGATNGSIATITPVEESAAKRLQLLQGQLTRNIQHVAGLNPRALRIVRNDYVSKPLSKGVLDANLLVHFESSSITRQREMTKQIGTEIGIVRRDWMALDGPW

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.2
2	0.19
3	0.13
4	0.15
5	0.15
6	0.16
7	0.16
8	0.13
9	0.17
10	0.17
11	0.19
12	0.14
13	0.14
14	0.16
15	0.18
16	0.18
17	0.18
18	0.2
19	0.2
20	0.21
21	0.22
22	0.23
23	0.23
24	0.23
25	0.21
26	0.18
27	0.22
28	0.22
29	0.22
30	0.19
31	0.19
32	0.19
33	0.19
34	0.17
35	0.13
36	0.12
37	0.18
38	0.19
39	0.19
40	0.19
41	0.19
42	0.19
43	0.18
44	0.19
45	0.14
46	0.14
47	0.13
48	0.12
49	0.14
50	0.16
51	0.16
52	0.15
53	0.14
54	0.11
55	0.11
56	0.11
57	0.09
58	0.07
59	0.07
60	0.06
61	0.07
62	0.08
63	0.08
64	0.09
65	0.13
66	0.22
67	0.27
68	0.36
69	0.41
70	0.45
71	0.52
72	0.6
73	0.66
74	0.67
75	0.72
76	0.74
77	0.78
78	0.84
79	0.86
80	0.89
81	0.89
82	0.89
83	0.87
84	0.87
85	0.86
86	0.84
87	0.83
88	0.8
89	0.73
90	0.65
91	0.57
92	0.47
93	0.38
94	0.3
95	0.2
96	0.13
97	0.1
98	0.08
99	0.09
100	0.09
101	0.09
102	0.09
103	0.09
104	0.09
105	0.09
106	0.1
107	0.1
108	0.1
109	0.12
110	0.14
111	0.18
112	0.18
113	0.19
114	0.2
115	0.24
116	0.25
117	0.24
118	0.22
119	0.2
120	0.23
121	0.23
122	0.23
123	0.17
124	0.15
125	0.16
126	0.15
127	0.15
128	0.11
129	0.12
130	0.13
131	0.16
132	0.2
133	0.2
134	0.2
135	0.23
136	0.25
137	0.24
138	0.26
139	0.31
140	0.32
141	0.39
142	0.49
143	0.51
144	0.58
145	0.62
146	0.62
147	0.59
148	0.59
149	0.58
150	0.56
151	0.56
152	0.48
153	0.44
154	0.39
155	0.34
156	0.27
157	0.21
158	0.22
159	0.22
160	0.31
161	0.31
162	0.34
163	0.4
164	0.44
165	0.46
166	0.38
167	0.35
168	0.34
169	0.4
170	0.42
171	0.42
172	0.39
173	0.39
174	0.39
175	0.37
176	0.33
177	0.28
178	0.23
179	0.19
180	0.19
181	0.16
182	0.16
183	0.18
184	0.16
185	0.19
186	0.19
187	0.19
188	0.18
189	0.18
190	0.16
191	0.14
192	0.13
193	0.09
194	0.09
195	0.09
196	0.11
197	0.1
198	0.11
199	0.1
200	0.11
201	0.12
202	0.13
203	0.14
204	0.14
205	0.18
206	0.21
207	0.26
208	0.3
209	0.3
210	0.3
211	0.32
212	0.35
213	0.35
214	0.34
215	0.32
216	0.32
217	0.33
218	0.32
219	0.28
220	0.26
221	0.26
222	0.26
223	0.26
224	0.23
225	0.25
226	0.25
227	0.24
228	0.23
229	0.19
230	0.17
231	0.17
232	0.16
233	0.11
234	0.1
235	0.1
236	0.11
237	0.11
238	0.11
239	0.09
240	0.08
241	0.08
242	0.08
243	0.07
244	0.06
245	0.05
246	0.03
247	0.03
248	0.04
249	0.04
250	0.04
251	0.03
252	0.03
253	0.04
254	0.04
255	0.04
256	0.03
257	0.03
258	0.04
259	0.04
260	0.05
261	0.05
262	0.06
263	0.1
264	0.11
265	0.13
266	0.14
267	0.14
268	0.14
269	0.21
270	0.2
271	0.18
272	0.21
273	0.2
274	0.21
275	0.22
276	0.23
277	0.18
278	0.18
279	0.17
280	0.13
281	0.14
282	0.17
283	0.2
284	0.23
285	0.27
286	0.33
287	0.33
288	0.36
289	0.4
290	0.42
291	0.41
292	0.42
293	0.4
294	0.36
295	0.36
296	0.34
297	0.28
298	0.24
299	0.21
300	0.16
301	0.13
302	0.11
303	0.11
304	0.11
305	0.1
306	0.07
307	0.07
308	0.07
309	0.06
310	0.05
311	0.04
312	0.05
313	0.05
314	0.05
315	0.07
316	0.11
317	0.16
318	0.22
319	0.28
320	0.33
321	0.39
322	0.43
323	0.48
324	0.48
325	0.52
326	0.53
327	0.48
328	0.46
329	0.42
330	0.38
331	0.32
332	0.29
333	0.23
334	0.17
335	0.17
336	0.16
337	0.17
338	0.17
339	0.18
340	0.18
341	0.18
342	0.18
343	0.16
344	0.15
345	0.14
346	0.13
347	0.13
348	0.14
349	0.12
350	0.14
351	0.16
352	0.15
353	0.15
354	0.2
355	0.2
356	0.22
357	0.23
358	0.21
359	0.25
360	0.31
361	0.32
362	0.3
363	0.29
364	0.27
365	0.27
366	0.28
367	0.24
368	0.18
369	0.19
370	0.16
371	0.15
372	0.15
373	0.14
374	0.14
375	0.15
376	0.15
377	0.12
378	0.13
379	0.13
380	0.12
381	0.12
382	0.11
383	0.1
384	0.1
385	0.09
386	0.09
387	0.1
388	0.09
389	0.1
390	0.1
391	0.09
392	0.07
393	0.09
394	0.09
395	0.09
396	0.1
397	0.09
398	0.09
399	0.08
400	0.07
401	0.06
402	0.05
403	0.05
404	0.04
405	0.04
406	0.05
407	0.05
408	0.04
409	0.04
410	0.04
411	0.04
412	0.03
413	0.03
414	0.03
415	0.03
416	0.03
417	0.04
418	0.04
419	0.03
420	0.03
421	0.04
422	0.04
423	0.05
424	0.05
425	0.05
426	0.06
427	0.06
428	0.07
429	0.07
430	0.07
431	0.08
432	0.08
433	0.08
434	0.11
435	0.1
436	0.11
437	0.14
438	0.15
439	0.15
440	0.17
441	0.18
442	0.15
443	0.17
444	0.19
445	0.17
446	0.17
447	0.18
448	0.19
449	0.19
450	0.2
451	0.18
452	0.16
453	0.17
454	0.15
455	0.16
456	0.13
457	0.11
458	0.09
459	0.09
460	0.09
461	0.06
462	0.06
463	0.04
464	0.04
465	0.03
466	0.03
467	0.04
468	0.05
469	0.06
470	0.06
471	0.07
472	0.09
473	0.1
474	0.12
475	0.12
476	0.12
477	0.17
478	0.26
479	0.3
480	0.35
481	0.36
482	0.37
483	0.38
484	0.38
485	0.35
486	0.28
487	0.23
488	0.18
489	0.16
490	0.15
491	0.14
492	0.14
493	0.11
494	0.09
495	0.09
496	0.08
497	0.07
498	0.06
499	0.05
500	0.03
501	0.03
502	0.04
503	0.04
504	0.04
505	0.05
506	0.07
507	0.08
508	0.09
509	0.08
510	0.11
511	0.11
512	0.11
513	0.12
514	0.1
515	0.09
516	0.09
517	0.09
518	0.06
519	0.06
520	0.07
521	0.05
522	0.06
523	0.06
524	0.06
525	0.06
526	0.06
527	0.05
528	0.06
529	0.06
530	0.08
531	0.09
532	0.11
533	0.11
534	0.11
535	0.12
536	0.13
537	0.13
538	0.11
539	0.1
540	0.08
541	0.08
542	0.08
543	0.07
544	0.05
545	0.05
546	0.06
547	0.06
548	0.06
549	0.05
550	0.05
551	0.06
552	0.06
553	0.07
554	0.06
555	0.07
556	0.09
557	0.1
558	0.11
559	0.11
560	0.14
561	0.15
562	0.16
563	0.17
564	0.15
565	0.17
566	0.17
567	0.19
568	0.16
569	0.15
570	0.18
571	0.17
572	0.17
573	0.17
574	0.15
575	0.15
576	0.16
577	0.19
578	0.17
579	0.17
580	0.19
581	0.18
582	0.17
583	0.16
584	0.14
585	0.1
586	0.08
587	0.08
588	0.05
589	0.04
590	0.04
591	0.03
592	0.03
593	0.03
594	0.03
595	0.02
596	0.02
597	0.02
598	0.02
599	0.03
600	0.02
601	0.03
602	0.03
603	0.04
604	0.07
605	0.08
606	0.1
607	0.12
608	0.13
609	0.18
610	0.18
611	0.2
612	0.24
613	0.24
614	0.26
615	0.27
616	0.3
617	0.26
618	0.27
619	0.27
620	0.2
621	0.19
622	0.18
623	0.17
624	0.13
625	0.13
626	0.18
627	0.19
628	0.22
629	0.23
630	0.29
631	0.36
632	0.38
633	0.41
634	0.39
635	0.4
636	0.43
637	0.46
638	0.43
639	0.39
640	0.39
641	0.37
642	0.34
643	0.28
644	0.23
645	0.18
646	0.15
647	0.14
648	0.12
649	0.1
650	0.1
651	0.1
652	0.1
653	0.1
654	0.1
655	0.07
656	0.08
657	0.11
658	0.1
659	0.11
660	0.12
661	0.11
662	0.11
663	0.14
664	0.13
665	0.1
666	0.11
667	0.11
668	0.1
669	0.1
670	0.09
671	0.07
672	0.07
673	0.07
674	0.06
675	0.05
676	0.06
677	0.06
678	0.06
679	0.06
680	0.08
681	0.11
682	0.14
683	0.16
684	0.18
685	0.19
686	0.19
687	0.21
688	0.18
689	0.15
690	0.13
691	0.12
692	0.09
693	0.1
694	0.09
695	0.07
696	0.07
697	0.07
698	0.06
699	0.06
700	0.05
701	0.06
702	0.06
703	0.07
704	0.06
705	0.07
706	0.07
707	0.07
708	0.07
709	0.05
710	0.07
711	0.07
712	0.07
713	0.07
714	0.08
715	0.09
716	0.09
717	0.1
718	0.13
719	0.17
720	0.21
721	0.27
722	0.28
723	0.29
724	0.32
725	0.35
726	0.34
727	0.32
728	0.3
729	0.23
730	0.21
731	0.19
732	0.18
733	0.14
734	0.1
735	0.08
736	0.07
737	0.06
738	0.06
739	0.06
740	0.04
741	0.03
742	0.03
743	0.03
744	0.03
745	0.03
746	0.03
747	0.03
748	0.04
749	0.07
750	0.07
751	0.09
752	0.13
753	0.16
754	0.17
755	0.2
756	0.2
757	0.17
758	0.17
759	0.17
760	0.15
761	0.18
762	0.21
763	0.2
764	0.22
765	0.22
766	0.23
767	0.22
768	0.21
769	0.18
770	0.17
771	0.15
772	0.14
773	0.14
774	0.13
775	0.12
776	0.12
777	0.09
778	0.08
779	0.08
780	0.08
781	0.06
782	0.06
783	0.06
784	0.05
785	0.05
786	0.05
787	0.05
788	0.06
789	0.07
790	0.07
791	0.07
792	0.08
793	0.07
794	0.07
795	0.07
796	0.06
797	0.05
798	0.05
799	0.05
800	0.04
801	0.04
802	0.04
803	0.04
804	0.04
805	0.05
806	0.05
807	0.06
808	0.08
809	0.08
810	0.09
811	0.1
812	0.1
813	0.1
814	0.11
815	0.1
816	0.09
817	0.08
818	0.08
819	0.08
820	0.08
821	0.08
822	0.09
823	0.1
824	0.1
825	0.1
826	0.1
827	0.09
828	0.09
829	0.12
830	0.12
831	0.13
832	0.13
833	0.12
834	0.12
835	0.13
836	0.12
837	0.09
838	0.08
839	0.06
840	0.06
841	0.06
842	0.06
843	0.06
844	0.06
845	0.05
846	0.04
847	0.04
848	0.04
849	0.06
850	0.08
851	0.07
852	0.08
853	0.12
854	0.17
855	0.19
856	0.22
857	0.28
858	0.37
859	0.48
860	0.57
861	0.61
862	0.64
863	0.7
864	0.76
865	0.73
866	0.71
867	0.62
868	0.56
869	0.49
870	0.42
871	0.37
872	0.31
873	0.26
874	0.18
875	0.16
876	0.12
877	0.12
878	0.11
879	0.1
880	0.07
881	0.07
882	0.07
883	0.08
884	0.09
885	0.09
886	0.11
887	0.11
888	0.13
889	0.15
890	0.15
891	0.17
892	0.16
893	0.21
894	0.22
895	0.26
896	0.24
897	0.23
898	0.24
899	0.22
900	0.21
901	0.16
902	0.13
903	0.09
904	0.08
905	0.08
906	0.06
907	0.06
908	0.06
909	0.05
910	0.05
911	0.05
912	0.05
913	0.05
914	0.06
915	0.11
916	0.11
917	0.12
918	0.16
919	0.17
920	0.17
921	0.18
922	0.18
923	0.13
924	0.15
925	0.17
926	0.22
927	0.29
928	0.33
929	0.4
930	0.41
931	0.43
932	0.46
933	0.43
934	0.37
935	0.38
936	0.36
937	0.33
938	0.32
939	0.3
940	0.25
941	0.25
942	0.24
943	0.15
944	0.12
945	0.07
946	0.07
947	0.07
948	0.07
949	0.08
950	0.09
951	0.09
952	0.11
953	0.1
954	0.1
955	0.1
956	0.11
957	0.11
958	0.1
959	0.09
960	0.09
961	0.1
962	0.16
963	0.2
964	0.25
965	0.26
966	0.29
967	0.29
968	0.29
969	0.31
970	0.31
971	0.28
972	0.23
973	0.22
974	0.21
975	0.23
976	0.23
977	0.22
978	0.19
979	0.21
980	0.21
981	0.26
982	0.27
983	0.25
984	0.28
985	0.27
986	0.27
987	0.26
988	0.25
989	0.21
990	0.2
991	0.19
992	0.19
993	0.23
994	0.27
995	0.26
996	0.26
997	0.27
998	0.31
999	0.32
1000	0.31
1001	0.31
1002	0.27
1003	0.32
1004	0.36
1005	0.33
1006	0.3
1007	0.29
1008	0.27
1009	0.23
1010	0.21
1011	0.16
1012	0.12
1013	0.13
1014	0.12
1015	0.12
1016	0.12
1017	0.11
1018	0.1
1019	0.08
1020	0.09
1021	0.09
1022	0.09
1023	0.08
1024	0.09
1025	0.1
1026	0.13
1027	0.15
1028	0.18
1029	0.22
1030	0.22
1031	0.22
1032	0.25
1033	0.29
1034	0.3
1035	0.32
1036	0.33
1037	0.37
1038	0.39
1039	0.42
1040	0.43
1041	0.39
1042	0.38
1043	0.36
1044	0.28
1045	0.24
1046	0.24
1047	0.25
1048	0.29
1049	0.29
1050	0.3
1051	0.29
1052	0.3
1053	0.3
1054	0.28
1055	0.27
1056	0.27
1057	0.34
1058	0.35
1059	0.4
1060	0.42
1061	0.41
1062	0.48
1063	0.48
1064	0.43
1065	0.36
1066	0.36
1067	0.33
1068	0.3
1069	0.3
1070	0.27
1071	0.29
1072	0.27
1073	0.26
1074	0.24
1075	0.23
1076	0.23
1077	0.2
1078	0.16
1079	0.1
1080	0.09
1081	0.1
1082	0.1
1083	0.16
1084	0.21
1085	0.23
1086	0.26
1087	0.3
1088	0.36
1089	0.42
1090	0.47
1091	0.47
1092	0.47
1093	0.46
1094	0.46
1095	0.44
1096	0.39
1097	0.36
1098	0.34
1099	0.32
1100	0.29
1101	0.28
1102	0.27
1103	0.26
1104	0.25
1105	0.2
1106	0.18

A0A1Q3EH12

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer