Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C4F5U8

Protein Details
Accession A0A0C4F5U8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
241-263PSPYHSRTSRRSRSPLPPRRSPTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
228-260SPSPYRARSSRRSPSPYHSRTSRRSRSPLPPRR
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto 7, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
Amino Acid Sequences MGKTTLFVAGFGSLRAKELAYEFERYGRLVRCDIPAAKSSTAKSRTPVHLRRIIVTLHVVSSKKMAYPRSHYDLITSEAEASDLESLSTIHLPSFSLRAISSSPLPAIDRFRSSHPPPRTSAPAPLARQERQHLRTRLFLLFLRPAPSLLPSLPCHPSCFICGGMPLQVCFVEFEDERDAADAYYEMHGRRLDGDTLNVQWAKNAPSSSWRYERRDRSPVYPRRSYRSPSPYRARSSRRSPSPYHSRTSRRSRSPLPPRRSPTPLDKVDDRDRLPSERPKDHKDDRDDYHHSRPAHDEPVVKSERAISRSPRDA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.15
3 0.14
4 0.13
5 0.15
6 0.21
7 0.21
8 0.25
9 0.24
10 0.27
11 0.28
12 0.27
13 0.31
14 0.29
15 0.29
16 0.29
17 0.31
18 0.31
19 0.36
20 0.37
21 0.36
22 0.36
23 0.37
24 0.36
25 0.37
26 0.36
27 0.39
28 0.41
29 0.39
30 0.39
31 0.42
32 0.48
33 0.56
34 0.61
35 0.6
36 0.63
37 0.62
38 0.61
39 0.56
40 0.47
41 0.39
42 0.34
43 0.27
44 0.21
45 0.23
46 0.21
47 0.19
48 0.21
49 0.19
50 0.19
51 0.23
52 0.27
53 0.29
54 0.36
55 0.43
56 0.47
57 0.49
58 0.45
59 0.43
60 0.4
61 0.38
62 0.31
63 0.24
64 0.18
65 0.15
66 0.15
67 0.12
68 0.11
69 0.07
70 0.06
71 0.05
72 0.05
73 0.05
74 0.06
75 0.07
76 0.07
77 0.06
78 0.06
79 0.07
80 0.08
81 0.09
82 0.08
83 0.09
84 0.09
85 0.1
86 0.11
87 0.12
88 0.13
89 0.12
90 0.12
91 0.12
92 0.13
93 0.14
94 0.17
95 0.18
96 0.19
97 0.2
98 0.24
99 0.31
100 0.34
101 0.42
102 0.44
103 0.45
104 0.45
105 0.48
106 0.5
107 0.44
108 0.45
109 0.41
110 0.42
111 0.39
112 0.43
113 0.43
114 0.38
115 0.39
116 0.38
117 0.41
118 0.39
119 0.47
120 0.45
121 0.43
122 0.46
123 0.46
124 0.42
125 0.36
126 0.32
127 0.26
128 0.25
129 0.24
130 0.22
131 0.18
132 0.18
133 0.16
134 0.16
135 0.14
136 0.11
137 0.13
138 0.12
139 0.15
140 0.18
141 0.18
142 0.19
143 0.19
144 0.19
145 0.17
146 0.17
147 0.15
148 0.11
149 0.11
150 0.1
151 0.12
152 0.11
153 0.1
154 0.09
155 0.08
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.08
160 0.08
161 0.1
162 0.11
163 0.11
164 0.11
165 0.11
166 0.11
167 0.08
168 0.08
169 0.06
170 0.05
171 0.06
172 0.08
173 0.07
174 0.1
175 0.1
176 0.1
177 0.12
178 0.13
179 0.14
180 0.13
181 0.15
182 0.14
183 0.14
184 0.17
185 0.16
186 0.14
187 0.13
188 0.14
189 0.15
190 0.16
191 0.15
192 0.13
193 0.19
194 0.24
195 0.29
196 0.36
197 0.4
198 0.45
199 0.54
200 0.62
201 0.62
202 0.67
203 0.65
204 0.65
205 0.68
206 0.71
207 0.69
208 0.7
209 0.66
210 0.64
211 0.66
212 0.63
213 0.62
214 0.64
215 0.64
216 0.64
217 0.71
218 0.7
219 0.73
220 0.77
221 0.74
222 0.72
223 0.74
224 0.75
225 0.74
226 0.73
227 0.7
228 0.71
229 0.74
230 0.7
231 0.67
232 0.66
233 0.65
234 0.68
235 0.74
236 0.75
237 0.72
238 0.76
239 0.77
240 0.79
241 0.82
242 0.83
243 0.8
244 0.81
245 0.79
246 0.78
247 0.75
248 0.7
249 0.68
250 0.68
251 0.66
252 0.62
253 0.59
254 0.59
255 0.63
256 0.64
257 0.56
258 0.52
259 0.5
260 0.48
261 0.5
262 0.52
263 0.52
264 0.55
265 0.6
266 0.61
267 0.67
268 0.73
269 0.75
270 0.75
271 0.74
272 0.71
273 0.73
274 0.73
275 0.7
276 0.7
277 0.67
278 0.59
279 0.54
280 0.54
281 0.51
282 0.49
283 0.47
284 0.43
285 0.4
286 0.48
287 0.48
288 0.42
289 0.37
290 0.38
291 0.41
292 0.4
293 0.42
294 0.41