FuNGI

A0A1Q3E2R0

Protein Details

Accession

A0A1Q3E2R0

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
63-82	VERGSPSGSKHKKRVEDYNE	Hydrophilic
240-262	PAEPLPSKKARPRPKPLPAKSSS	Hydrophilic
710-732	SAKLYTKGKRKGKGKEKAKETVR	Basic
771-820	EMIHQEQTKRHRKGKSKRKNPVVQTPSPQNSKPKPRPKPKAIQKSANSAS	Hydrophilic
932-959	DSDSNIRTRKSRKQTRKMSTRTRSPSIE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
54-76	IGSRSSKERVERGSPSGSKHKKR
225-259	IRRTKGERKGLERSTPAEPLPSKKARPRPKPLPAK
716-728	KGKRKGKGKEKAK
779-811	KRHRKGKSKRKNPVVQTPSPQNSKPKPRPKPKA

Subcellular Location(s)

nucl 24, cyto_nucl 14.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039024 RTC4 IPR028094 RTC4_C
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF14474 RTC4

Amino Acid Sequences

MERMFEDMSHKGTTFDTDQTLRTKKLRGNGQLAQDLGSSGFASKHIKQSHKPSIGSRSSKERVERGSPSGSKHKKRVEDYNEEPDELDFLSGMDSENEFDTKSSMPLVSSQLSTHDPEHQLARSNTLKGLKFNKNKSENDNASIPSKPRGPSSSILEPKSPNLSSASRLSPPTKPAAKSSSQSRKVSQSSHVASRKPSVEKASSRSVLRVVGSSSSSDKDDARSIRRTKGERKGLERSTPAEPLPSKKARPRPKPLPAKSSSSSVSSALLKPPVGKLQPAPPADLPVSLSPEHMPRMNPKSLLSKPERFPLAASPERENTPKNHKSLLNVRPAAFPLSPSLSGRRKDVQKKSASNQYELMREDSDDDEALSKTKTNAVSKAAPFPLNSPYPKSMISIPNKSVGKRSSNVSPQEDDSPLKRQRRDDDMVISSPPQNLHYSDDSDDDDYFYNPSVDANTLCPYCDEPLPASPTPHLKHLLATTAKKSIRAPRPTNPMGRKTAVSVFINVCQRHQFESKILPEAEAKGWPKSIGWDLIHERVMRMKNHLEALMENSMLENERGDVDYDEENDTGEGSGQCKRARDKCVFWEDVIKEVKQKGTRAAANVKSQFANFQNTQPGYYGELGSVLIHQSLYELFPPENTPPESVSPLSPKEFINRVLLPEVALKLIMEDKSLSGSSGARKALEILRDSTTYGVAMFPEDAGERVEGASAKLYTKGKRKGKGKEKAKETVRYHSEDTEIETTEMSVADKMVMEKARRRRLELEKETEQEEMIHQEQTKRHRKGKSKRKNPVVQTPSPQNSKPKPRPKPKAIQKSANSASLAGMDVGSEPEAGWRSTFSDGPAEYSDNNGMYMEASDVDAGNEFVNWALDDSANMGAFFLTTENNRSPPNSISGLSFSSKHRDVGFPPPSSSSKPDSAGSTSHTMIISTSEDSDSNIRTRKSRKQTRKMSTRTRSPSIEISSPDTKPISVLARPPPSSFDMDDTPKASRSQLSLFPVVPSTSFSRRNGGGAVDRNSGETSHTDSDVVLSRWHNDPDKSAIKT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.24
2	0.24
3	0.26
4	0.26
5	0.29
6	0.35
7	0.4
8	0.4
9	0.41
10	0.45
11	0.44
12	0.51
13	0.58
14	0.59
15	0.62
16	0.63
17	0.65
18	0.63
19	0.59
20	0.51
21	0.42
22	0.33
23	0.25
24	0.2
25	0.13
26	0.09
27	0.1
28	0.11
29	0.17
30	0.2
31	0.29
32	0.36
33	0.43
34	0.5
35	0.6
36	0.68
37	0.7
38	0.7
39	0.67
40	0.7
41	0.72
42	0.71
43	0.65
44	0.64
45	0.61
46	0.64
47	0.64
48	0.6
49	0.57
50	0.58
51	0.59
52	0.54
53	0.58
54	0.55
55	0.55
56	0.6
57	0.63
58	0.64
59	0.69
60	0.72
61	0.72
62	0.76
63	0.8
64	0.79
65	0.78
66	0.77
67	0.78
68	0.71
69	0.63
70	0.56
71	0.45
72	0.37
73	0.27
74	0.2
75	0.1
76	0.07
77	0.07
78	0.07
79	0.07
80	0.08
81	0.08
82	0.09
83	0.1
84	0.11
85	0.1
86	0.11
87	0.12
88	0.12
89	0.12
90	0.13
91	0.12
92	0.12
93	0.15
94	0.19
95	0.19
96	0.19
97	0.18
98	0.2
99	0.22
100	0.24
101	0.23
102	0.26
103	0.26
104	0.27
105	0.31
106	0.29
107	0.35
108	0.32
109	0.37
110	0.34
111	0.34
112	0.36
113	0.39
114	0.39
115	0.38
116	0.47
117	0.5
118	0.56
119	0.63
120	0.68
121	0.7
122	0.72
123	0.72
124	0.74
125	0.68
126	0.63
127	0.58
128	0.5
129	0.45
130	0.44
131	0.39
132	0.33
133	0.34
134	0.31
135	0.32
136	0.33
137	0.36
138	0.37
139	0.42
140	0.48
141	0.5
142	0.51
143	0.5
144	0.48
145	0.46
146	0.48
147	0.4
148	0.31
149	0.29
150	0.28
151	0.28
152	0.31
153	0.32
154	0.29
155	0.33
156	0.35
157	0.35
158	0.36
159	0.41
160	0.43
161	0.41
162	0.43
163	0.45
164	0.46
165	0.47
166	0.54
167	0.57
168	0.59
169	0.61
170	0.59
171	0.61
172	0.6
173	0.59
174	0.54
175	0.52
176	0.49
177	0.54
178	0.55
179	0.5
180	0.48
181	0.51
182	0.51
183	0.46
184	0.45
185	0.42
186	0.45
187	0.47
188	0.49
189	0.52
190	0.5
191	0.47
192	0.45
193	0.4
194	0.35
195	0.31
196	0.27
197	0.2
198	0.18
199	0.17
200	0.17
201	0.18
202	0.17
203	0.17
204	0.17
205	0.17
206	0.17
207	0.23
208	0.26
209	0.29
210	0.37
211	0.39
212	0.45
213	0.52
214	0.56
215	0.6
216	0.65
217	0.7
218	0.68
219	0.71
220	0.73
221	0.71
222	0.7
223	0.64
224	0.57
225	0.5
226	0.46
227	0.39
228	0.36
229	0.33
230	0.32
231	0.37
232	0.4
233	0.42
234	0.48
235	0.58
236	0.62
237	0.7
238	0.76
239	0.77
240	0.82
241	0.87
242	0.86
243	0.86
244	0.79
245	0.76
246	0.68
247	0.62
248	0.53
249	0.45
250	0.39
251	0.3
252	0.28
253	0.23
254	0.22
255	0.21
256	0.21
257	0.19
258	0.18
259	0.2
260	0.24
261	0.22
262	0.22
263	0.22
264	0.28
265	0.35
266	0.35
267	0.36
268	0.3
269	0.33
270	0.31
271	0.29
272	0.24
273	0.18
274	0.2
275	0.16
276	0.17
277	0.15
278	0.17
279	0.18
280	0.18
281	0.18
282	0.23
283	0.29
284	0.31
285	0.31
286	0.31
287	0.38
288	0.39
289	0.46
290	0.45
291	0.46
292	0.45
293	0.5
294	0.5
295	0.42
296	0.4
297	0.37
298	0.38
299	0.35
300	0.36
301	0.33
302	0.34
303	0.36
304	0.37
305	0.33
306	0.3
307	0.36
308	0.39
309	0.38
310	0.41
311	0.4
312	0.45
313	0.52
314	0.55
315	0.54
316	0.51
317	0.5
318	0.46
319	0.45
320	0.42
321	0.32
322	0.25
323	0.18
324	0.18
325	0.18
326	0.18
327	0.24
328	0.26
329	0.28
330	0.31
331	0.35
332	0.41
333	0.5
334	0.58
335	0.6
336	0.63
337	0.68
338	0.69
339	0.72
340	0.65
341	0.58
342	0.54
343	0.48
344	0.43
345	0.38
346	0.34
347	0.25
348	0.23
349	0.22
350	0.18
351	0.16
352	0.12
353	0.11
354	0.1
355	0.1
356	0.1
357	0.08
358	0.08
359	0.08
360	0.13
361	0.17
362	0.18
363	0.2
364	0.24
365	0.3
366	0.3
367	0.35
368	0.33
369	0.3
370	0.28
371	0.27
372	0.28
373	0.26
374	0.26
375	0.25
376	0.24
377	0.25
378	0.25
379	0.25
380	0.25
381	0.29
382	0.34
383	0.35
384	0.34
385	0.4
386	0.41
387	0.4
388	0.4
389	0.36
390	0.34
391	0.31
392	0.33
393	0.32
394	0.38
395	0.42
396	0.4
397	0.38
398	0.35
399	0.36
400	0.35
401	0.29
402	0.25
403	0.28
404	0.32
405	0.36
406	0.38
407	0.4
408	0.43
409	0.5
410	0.52
411	0.47
412	0.46
413	0.42
414	0.4
415	0.36
416	0.31
417	0.25
418	0.21
419	0.19
420	0.15
421	0.13
422	0.13
423	0.16
424	0.17
425	0.18
426	0.18
427	0.19
428	0.18
429	0.18
430	0.17
431	0.14
432	0.13
433	0.11
434	0.1
435	0.09
436	0.08
437	0.06
438	0.07
439	0.06
440	0.07
441	0.07
442	0.08
443	0.1
444	0.1
445	0.1
446	0.1
447	0.11
448	0.11
449	0.11
450	0.11
451	0.1
452	0.13
453	0.18
454	0.18
455	0.18
456	0.18
457	0.23
458	0.23
459	0.25
460	0.25
461	0.2
462	0.21
463	0.21
464	0.25
465	0.23
466	0.23
467	0.22
468	0.27
469	0.27
470	0.27
471	0.29
472	0.33
473	0.38
474	0.46
475	0.49
476	0.49
477	0.57
478	0.6
479	0.65
480	0.61
481	0.57
482	0.52
483	0.48
484	0.42
485	0.36
486	0.34
487	0.3
488	0.25
489	0.22
490	0.19
491	0.21
492	0.26
493	0.23
494	0.22
495	0.2
496	0.21
497	0.22
498	0.23
499	0.2
500	0.18
501	0.23
502	0.24
503	0.25
504	0.24
505	0.21
506	0.2
507	0.2
508	0.19
509	0.17
510	0.16
511	0.13
512	0.14
513	0.13
514	0.12
515	0.12
516	0.13
517	0.13
518	0.13
519	0.16
520	0.18
521	0.2
522	0.22
523	0.2
524	0.19
525	0.2
526	0.23
527	0.2
528	0.22
529	0.21
530	0.21
531	0.22
532	0.23
533	0.18
534	0.15
535	0.17
536	0.14
537	0.12
538	0.1
539	0.09
540	0.08
541	0.08
542	0.08
543	0.05
544	0.04
545	0.05
546	0.05
547	0.06
548	0.06
549	0.08
550	0.08
551	0.09
552	0.1
553	0.1
554	0.09
555	0.08
556	0.08
557	0.06
558	0.07
559	0.06
560	0.06
561	0.1
562	0.13
563	0.15
564	0.18
565	0.23
566	0.28
567	0.35
568	0.38
569	0.39
570	0.43
571	0.49
572	0.47
573	0.43
574	0.44
575	0.38
576	0.38
577	0.36
578	0.28
579	0.24
580	0.25
581	0.29
582	0.24
583	0.25
584	0.24
585	0.27
586	0.29
587	0.3
588	0.36
589	0.36
590	0.39
591	0.4
592	0.37
593	0.32
594	0.3
595	0.3
596	0.25
597	0.26
598	0.2
599	0.21
600	0.25
601	0.25
602	0.26
603	0.23
604	0.22
605	0.19
606	0.18
607	0.16
608	0.1
609	0.1
610	0.09
611	0.09
612	0.08
613	0.06
614	0.05
615	0.04
616	0.04
617	0.04
618	0.05
619	0.05
620	0.06
621	0.07
622	0.07
623	0.08
624	0.1
625	0.11
626	0.14
627	0.14
628	0.15
629	0.15
630	0.17
631	0.19
632	0.18
633	0.18
634	0.18
635	0.2
636	0.2
637	0.2
638	0.19
639	0.21
640	0.23
641	0.23
642	0.25
643	0.23
644	0.23
645	0.23
646	0.22
647	0.18
648	0.18
649	0.16
650	0.1
651	0.1
652	0.08
653	0.07
654	0.09
655	0.09
656	0.08
657	0.08
658	0.08
659	0.1
660	0.1
661	0.09
662	0.08
663	0.1
664	0.12
665	0.15
666	0.16
667	0.14
668	0.14
669	0.17
670	0.19
671	0.2
672	0.2
673	0.18
674	0.2
675	0.2
676	0.2
677	0.18
678	0.15
679	0.12
680	0.1
681	0.08
682	0.06
683	0.06
684	0.06
685	0.05
686	0.06
687	0.06
688	0.06
689	0.06
690	0.06
691	0.06
692	0.06
693	0.07
694	0.06
695	0.07
696	0.08
697	0.08
698	0.09
699	0.13
700	0.17
701	0.22
702	0.31
703	0.4
704	0.46
705	0.54
706	0.62
707	0.68
708	0.75
709	0.8
710	0.81
711	0.81
712	0.8
713	0.8
714	0.79
715	0.78
716	0.71
717	0.7
718	0.64
719	0.59
720	0.55
721	0.47
722	0.42
723	0.33
724	0.33
725	0.26
726	0.22
727	0.18
728	0.16
729	0.14
730	0.12
731	0.12
732	0.08
733	0.06
734	0.05
735	0.06
736	0.06
737	0.07
738	0.1
739	0.14
740	0.16
741	0.24
742	0.33
743	0.43
744	0.44
745	0.48
746	0.53
747	0.6
748	0.68
749	0.69
750	0.67
751	0.63
752	0.63
753	0.6
754	0.51
755	0.41
756	0.31
757	0.23
758	0.2
759	0.15
760	0.16
761	0.16
762	0.2
763	0.25
764	0.34
765	0.44
766	0.47
767	0.53
768	0.6
769	0.69
770	0.76
771	0.83
772	0.84
773	0.85
774	0.87
775	0.91
776	0.91
777	0.88
778	0.88
779	0.85
780	0.8
781	0.75
782	0.74
783	0.7
784	0.65
785	0.61
786	0.59
787	0.6
788	0.65
789	0.69
790	0.71
791	0.75
792	0.82
793	0.89
794	0.89
795	0.91
796	0.91
797	0.92
798	0.9
799	0.89
800	0.82
801	0.81
802	0.74
803	0.67
804	0.56
805	0.45
806	0.37
807	0.28
808	0.24
809	0.14
810	0.11
811	0.07
812	0.07
813	0.07
814	0.06
815	0.06
816	0.05
817	0.07
818	0.09
819	0.09
820	0.09
821	0.1
822	0.12
823	0.14
824	0.15
825	0.14
826	0.17
827	0.17
828	0.2
829	0.21
830	0.21
831	0.19
832	0.21
833	0.21
834	0.16
835	0.17
836	0.13
837	0.12
838	0.1
839	0.1
840	0.08
841	0.07
842	0.07
843	0.07
844	0.07
845	0.07
846	0.07
847	0.07
848	0.06
849	0.06
850	0.06
851	0.05
852	0.06
853	0.06
854	0.06
855	0.06
856	0.06
857	0.07
858	0.08
859	0.1
860	0.1
861	0.09
862	0.09
863	0.07
864	0.07
865	0.08
866	0.07
867	0.07
868	0.08
869	0.13
870	0.16
871	0.18
872	0.2
873	0.21
874	0.24
875	0.24
876	0.28
877	0.26
878	0.24
879	0.24
880	0.25
881	0.27
882	0.25
883	0.25
884	0.23
885	0.28
886	0.28
887	0.29
888	0.29
889	0.29
890	0.31
891	0.39
892	0.44
893	0.4
894	0.4
895	0.42
896	0.43
897	0.44
898	0.45
899	0.4
900	0.37
901	0.37
902	0.37
903	0.35
904	0.34
905	0.32
906	0.32
907	0.3
908	0.26
909	0.26
910	0.24
911	0.2
912	0.18
913	0.19
914	0.16
915	0.13
916	0.14
917	0.13
918	0.13
919	0.15
920	0.18
921	0.18
922	0.22
923	0.26
924	0.27
925	0.33
926	0.41
927	0.5
928	0.58
929	0.67
930	0.73
931	0.78
932	0.87
933	0.9
934	0.93
935	0.93
936	0.93
937	0.92
938	0.91
939	0.88
940	0.84
941	0.77
942	0.7
943	0.68
944	0.62
945	0.57
946	0.49
947	0.48
948	0.47
949	0.43
950	0.42
951	0.36
952	0.3
953	0.26
954	0.27
955	0.26
956	0.23
957	0.3
958	0.35
959	0.42
960	0.44
961	0.45
962	0.45
963	0.44
964	0.45
965	0.4
966	0.36
967	0.33
968	0.37
969	0.39
970	0.37
971	0.35
972	0.33
973	0.33
974	0.3
975	0.27
976	0.26
977	0.28
978	0.32
979	0.36
980	0.37
981	0.37
982	0.36
983	0.35
984	0.31
985	0.27
986	0.24
987	0.24
988	0.28
989	0.33
990	0.34
991	0.38
992	0.38
993	0.4
994	0.38
995	0.37
996	0.37
997	0.38
998	0.41
999	0.39
1000	0.38
1001	0.37
1002	0.36
1003	0.32
1004	0.26
1005	0.21
1006	0.23
1007	0.22
1008	0.23
1009	0.21
1010	0.2
1011	0.23
1012	0.26
1013	0.25
1014	0.22
1015	0.21
1016	0.24
1017	0.28
1018	0.34
1019	0.37
1020	0.34
1021	0.37
1022	0.41

A0A1Q3E2R0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer