Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C4EJD8

Protein Details
Accession A0A0C4EJD8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
424-450IANPSQVKRKSAKPKPKVRFGDPSHDSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
431-441KRKSAKPKPKV
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 10, mito 5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008728  Elongator_complex_protein_4  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0033588  C:elongator holoenzyme complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0002098  P:tRNA wobble uridine modification  
Pfam View protein in Pfam  
PF05625  PAXNEB  
CDD cd19494  Elp4  
Amino Acid Sequences MSSFKRNLNPTNRKQTPSSYPAGFHPSHYNGVPTASTGIASLDDLLGGGLPIASSFLIDEDQDGGYAKLMLRYSIAQGIVSNQHLIIVGSSLDEGGDPEKIVDRLMSLDDSDEPIEPTSSSNQHQSTASCSTPQSDQSKQTPPSGPADDDEEGDEDDDEDTEKVKSQRMKIAWRYENLGHHHSESESIYQQSRCHSFNLSKTMKISPDLRSKIDCLDVKNLENLPTSLLARIKQIIENKQKVSSSNPSFRIVIQSIGSIGWPPMEDHMIFRFLKDLETVLRAPDAPMIAIISFPSAYRSSDLAKILPWATSGSLSLQSFAGDEKSQAAFPNHQGAVHFIRLPSPSSLSPPATKLSVIRALGGASEAGIGSNLGFKLGRRKGFRIEMMGLGLDLENDNPTEEAPATPRRDEPSEVPTDDIDQLKIANPSQVKRKSAKPKPKVRFGDPSHDSSHDILKNTDW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.74
2 0.72
3 0.7
4 0.66
5 0.62
6 0.54
7 0.49
8 0.49
9 0.52
10 0.45
11 0.39
12 0.4
13 0.37
14 0.38
15 0.37
16 0.35
17 0.28
18 0.3
19 0.27
20 0.2
21 0.18
22 0.14
23 0.13
24 0.11
25 0.11
26 0.1
27 0.1
28 0.09
29 0.07
30 0.06
31 0.06
32 0.06
33 0.05
34 0.04
35 0.04
36 0.03
37 0.03
38 0.03
39 0.04
40 0.04
41 0.04
42 0.04
43 0.05
44 0.06
45 0.06
46 0.07
47 0.08
48 0.08
49 0.09
50 0.09
51 0.09
52 0.08
53 0.1
54 0.1
55 0.12
56 0.12
57 0.12
58 0.13
59 0.14
60 0.16
61 0.18
62 0.18
63 0.14
64 0.14
65 0.17
66 0.19
67 0.19
68 0.17
69 0.13
70 0.13
71 0.13
72 0.13
73 0.1
74 0.07
75 0.06
76 0.06
77 0.06
78 0.05
79 0.05
80 0.05
81 0.05
82 0.05
83 0.06
84 0.06
85 0.06
86 0.09
87 0.09
88 0.09
89 0.09
90 0.09
91 0.09
92 0.11
93 0.11
94 0.09
95 0.1
96 0.1
97 0.12
98 0.12
99 0.11
100 0.11
101 0.11
102 0.11
103 0.1
104 0.11
105 0.13
106 0.16
107 0.17
108 0.23
109 0.23
110 0.24
111 0.25
112 0.25
113 0.25
114 0.26
115 0.25
116 0.21
117 0.2
118 0.2
119 0.21
120 0.27
121 0.27
122 0.27
123 0.32
124 0.36
125 0.44
126 0.44
127 0.48
128 0.45
129 0.42
130 0.44
131 0.41
132 0.36
133 0.29
134 0.31
135 0.26
136 0.23
137 0.21
138 0.16
139 0.13
140 0.13
141 0.12
142 0.07
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.05
147 0.06
148 0.06
149 0.1
150 0.11
151 0.15
152 0.2
153 0.23
154 0.3
155 0.34
156 0.43
157 0.47
158 0.55
159 0.55
160 0.52
161 0.53
162 0.49
163 0.49
164 0.45
165 0.41
166 0.32
167 0.28
168 0.28
169 0.23
170 0.22
171 0.17
172 0.15
173 0.14
174 0.14
175 0.16
176 0.16
177 0.17
178 0.19
179 0.21
180 0.2
181 0.2
182 0.22
183 0.23
184 0.27
185 0.35
186 0.33
187 0.31
188 0.32
189 0.33
190 0.31
191 0.3
192 0.28
193 0.25
194 0.32
195 0.34
196 0.33
197 0.32
198 0.32
199 0.31
200 0.33
201 0.29
202 0.22
203 0.25
204 0.25
205 0.25
206 0.26
207 0.25
208 0.21
209 0.2
210 0.18
211 0.13
212 0.12
213 0.11
214 0.1
215 0.11
216 0.1
217 0.1
218 0.12
219 0.12
220 0.14
221 0.18
222 0.26
223 0.33
224 0.37
225 0.37
226 0.38
227 0.38
228 0.36
229 0.37
230 0.37
231 0.34
232 0.36
233 0.38
234 0.37
235 0.37
236 0.36
237 0.36
238 0.28
239 0.23
240 0.16
241 0.14
242 0.12
243 0.11
244 0.11
245 0.07
246 0.06
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.06
251 0.07
252 0.07
253 0.08
254 0.1
255 0.14
256 0.13
257 0.13
258 0.14
259 0.13
260 0.14
261 0.12
262 0.12
263 0.09
264 0.12
265 0.12
266 0.11
267 0.11
268 0.11
269 0.1
270 0.11
271 0.1
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.06
276 0.06
277 0.06
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.07
282 0.08
283 0.09
284 0.1
285 0.12
286 0.14
287 0.17
288 0.18
289 0.16
290 0.16
291 0.18
292 0.16
293 0.15
294 0.13
295 0.11
296 0.1
297 0.1
298 0.1
299 0.09
300 0.12
301 0.12
302 0.12
303 0.12
304 0.11
305 0.11
306 0.11
307 0.11
308 0.08
309 0.08
310 0.1
311 0.11
312 0.12
313 0.14
314 0.16
315 0.16
316 0.18
317 0.25
318 0.23
319 0.22
320 0.22
321 0.24
322 0.25
323 0.25
324 0.24
325 0.17
326 0.19
327 0.2
328 0.22
329 0.2
330 0.19
331 0.18
332 0.21
333 0.26
334 0.26
335 0.26
336 0.26
337 0.27
338 0.24
339 0.24
340 0.21
341 0.21
342 0.25
343 0.23
344 0.22
345 0.2
346 0.19
347 0.18
348 0.18
349 0.12
350 0.06
351 0.06
352 0.05
353 0.04
354 0.04
355 0.04
356 0.04
357 0.07
358 0.06
359 0.07
360 0.08
361 0.09
362 0.19
363 0.26
364 0.34
365 0.37
366 0.41
367 0.48
368 0.55
369 0.58
370 0.54
371 0.5
372 0.44
373 0.39
374 0.35
375 0.27
376 0.2
377 0.16
378 0.1
379 0.08
380 0.07
381 0.06
382 0.07
383 0.08
384 0.07
385 0.07
386 0.09
387 0.09
388 0.1
389 0.14
390 0.22
391 0.25
392 0.27
393 0.31
394 0.34
395 0.37
396 0.4
397 0.4
398 0.4
399 0.43
400 0.41
401 0.39
402 0.35
403 0.34
404 0.33
405 0.3
406 0.23
407 0.17
408 0.17
409 0.18
410 0.2
411 0.18
412 0.21
413 0.24
414 0.28
415 0.38
416 0.44
417 0.48
418 0.5
419 0.6
420 0.65
421 0.72
422 0.78
423 0.79
424 0.82
425 0.86
426 0.91
427 0.89
428 0.86
429 0.86
430 0.81
431 0.81
432 0.75
433 0.7
434 0.64
435 0.58
436 0.53
437 0.44
438 0.47
439 0.4
440 0.37