FuNGI

A0A1Q3DX79

Protein Details

Accession

A0A1Q3DX79

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
109-128	GVAPRAKMNQQRSRRFRAAQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 13, cyto_nucl 11.5, cyto 8, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4 IPR001878 Znf_CCHC
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N PF00098 zf-CCHC
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPALFRWLSKKYPKIIYPVQEEEEVQVPDENDEIVVIPPRMADSNPNGVEFDNLYLDMNGIVHPCTHPEGRPAPETEEEMMVEIFKYTERVVNMVRPRKLLFMAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRAAQEAKEKDEQRKESVLLWEAMGKELSEEEKNKVAWDTNAITPGTPFMDLLAASLRYWVVSKMNTDDGWKGIQVIISDASVPGEGEHKIMDWIRRQRANPGHDPNTRHVIYGLDADLIMLALATHEPHFRVLREDVFGESNSTACRKCGQEGHYAAQCTAELAQIQKKPPSEKKPFIFLDVAVLREYLEVELDVPQAYFPFDFERSIDDWVLLIFFVGNDFLPHLPSLEIREGAIDTLLRIWKQELPRMGGYVTNHGRLELPRVQIILEGLAKREDDIFRRRREGEERQEANAKRRKLEEENSKNGFTAGPSSSLSLTASTSSLTNNTTVAHPSLPPRPDFAARADSIGLGAKPNAESIQNIPAATQALAGSNHDVVANRRAIRMANMSAAEVLKAELAGLVPVKPTASNVDNVPNVLLPSGPEPSMIISDATATPSVDITMTVDSEDEVPGFGAQSVTDENAPSVSTDFDIPFSEKNNVGTFENGTVGADDVEADPNMAGTKRKLDEMNIEETDETVVVDDDEPPVDGPHSSLAFKVNPDGTVSQEDTVKLWEPGYRDRYYRQKFDVEPNDKEFRRQITKHYVEGMAWVLCYYYQGTPSWQWYYPYHFAPFAADFEDRQDMNGKRMAWQGVALLPFIDPVRLLEAMKEPYTKLTEDEIRRNTWGNNSIFTSDAHPIHPFYEQLYGKRRPKEPLQIDHNLTKGVSGSVLPNPECLPGSTYLTPLVEQNLPDIKNDRSLSVFYFFPKQLTPHRSVLLPGVTRSPRMLSANDLEHARNGGRGRGRGSGYDRGGRDRGGNDRNDPFHSRPPNYGNGRGNSREPYRGQYRGDNGSYNDRGRGRPSPNNSYSNGYGNGRDVSSASNNSYGGYGGYGGGPARDYGNGPTGGYGSAPTGGYGVGNVRGGYGGTSRGYSGSAGNAGGGGARDYEGYGGYGNAGGAGGGPAAYRNNGGYGNAGGNFPGASRGRGSYGDDNHSRYPANGYTNPSHGNGGYSNATQGGPYNTPSRGRGRGW

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.58
2	0.62
3	0.66
4	0.7
5	0.69
6	0.68
7	0.66
8	0.61
9	0.54
10	0.5
11	0.44
12	0.4
13	0.33
14	0.25
15	0.22
16	0.19
17	0.18
18	0.18
19	0.15
20	0.1
21	0.1
22	0.1
23	0.09
24	0.13
25	0.12
26	0.12
27	0.12
28	0.14
29	0.15
30	0.15
31	0.2
32	0.22
33	0.31
34	0.32
35	0.33
36	0.32
37	0.31
38	0.32
39	0.27
40	0.23
41	0.15
42	0.14
43	0.14
44	0.13
45	0.13
46	0.11
47	0.1
48	0.09
49	0.09
50	0.09
51	0.09
52	0.1
53	0.12
54	0.17
55	0.19
56	0.2
57	0.27
58	0.33
59	0.37
60	0.41
61	0.41
62	0.41
63	0.41
64	0.43
65	0.37
66	0.32
67	0.27
68	0.23
69	0.21
70	0.16
71	0.13
72	0.1
73	0.09
74	0.07
75	0.09
76	0.09
77	0.13
78	0.14
79	0.17
80	0.2
81	0.28
82	0.37
83	0.44
84	0.46
85	0.46
86	0.47
87	0.47
88	0.46
89	0.42
90	0.34
91	0.29
92	0.29
93	0.25
94	0.25
95	0.21
96	0.21
97	0.17
98	0.16
99	0.12
100	0.14
101	0.2
102	0.27
103	0.37
104	0.45
105	0.55
106	0.66
107	0.74
108	0.79
109	0.81
110	0.78
111	0.74
112	0.75
113	0.75
114	0.73
115	0.76
116	0.72
117	0.69
118	0.72
119	0.7
120	0.68
121	0.67
122	0.62
123	0.57
124	0.56
125	0.52
126	0.48
127	0.49
128	0.44
129	0.35
130	0.31
131	0.29
132	0.25
133	0.24
134	0.2
135	0.14
136	0.11
137	0.12
138	0.14
139	0.16
140	0.18
141	0.2
142	0.24
143	0.25
144	0.26
145	0.26
146	0.26
147	0.22
148	0.25
149	0.26
150	0.24
151	0.27
152	0.26
153	0.24
154	0.22
155	0.22
156	0.18
157	0.14
158	0.12
159	0.08
160	0.1
161	0.09
162	0.1
163	0.11
164	0.1
165	0.1
166	0.11
167	0.1
168	0.1
169	0.11
170	0.12
171	0.12
172	0.13
173	0.16
174	0.19
175	0.23
176	0.23
177	0.25
178	0.25
179	0.23
180	0.23
181	0.2
182	0.17
183	0.15
184	0.15
185	0.13
186	0.13
187	0.12
188	0.11
189	0.11
190	0.1
191	0.09
192	0.08
193	0.08
194	0.06
195	0.08
196	0.08
197	0.08
198	0.08
199	0.08
200	0.11
201	0.14
202	0.18
203	0.25
204	0.33
205	0.41
206	0.47
207	0.47
208	0.55
209	0.6
210	0.63
211	0.64
212	0.65
213	0.65
214	0.65
215	0.68
216	0.63
217	0.62
218	0.55
219	0.46
220	0.37
221	0.3
222	0.26
223	0.24
224	0.2
225	0.12
226	0.11
227	0.1
228	0.1
229	0.08
230	0.06
231	0.03
232	0.03
233	0.03
234	0.03
235	0.04
236	0.06
237	0.07
238	0.08
239	0.12
240	0.14
241	0.14
242	0.18
243	0.21
244	0.22
245	0.23
246	0.23
247	0.22
248	0.22
249	0.21
250	0.19
251	0.16
252	0.14
253	0.14
254	0.15
255	0.14
256	0.13
257	0.17
258	0.17
259	0.21
260	0.27
261	0.29
262	0.36
263	0.39
264	0.43
265	0.43
266	0.42
267	0.38
268	0.32
269	0.28
270	0.19
271	0.16
272	0.12
273	0.08
274	0.1
275	0.17
276	0.2
277	0.23
278	0.26
279	0.3
280	0.37
281	0.45
282	0.53
283	0.57
284	0.62
285	0.62
286	0.67
287	0.64
288	0.6
289	0.53
290	0.42
291	0.4
292	0.32
293	0.3
294	0.21
295	0.2
296	0.16
297	0.14
298	0.15
299	0.07
300	0.06
301	0.05
302	0.05
303	0.07
304	0.07
305	0.07
306	0.06
307	0.06
308	0.06
309	0.07
310	0.07
311	0.06
312	0.09
313	0.1
314	0.11
315	0.12
316	0.15
317	0.16
318	0.18
319	0.17
320	0.14
321	0.13
322	0.12
323	0.12
324	0.07
325	0.06
326	0.04
327	0.03
328	0.03
329	0.04
330	0.04
331	0.04
332	0.05
333	0.06
334	0.07
335	0.07
336	0.07
337	0.08
338	0.08
339	0.12
340	0.13
341	0.13
342	0.12
343	0.12
344	0.12
345	0.11
346	0.11
347	0.07
348	0.05
349	0.08
350	0.1
351	0.09
352	0.09
353	0.11
354	0.15
355	0.18
356	0.23
357	0.24
358	0.27
359	0.28
360	0.29
361	0.27
362	0.25
363	0.23
364	0.27
365	0.25
366	0.24
367	0.23
368	0.22
369	0.24
370	0.21
371	0.27
372	0.23
373	0.23
374	0.2
375	0.21
376	0.2
377	0.19
378	0.19
379	0.14
380	0.12
381	0.11
382	0.11
383	0.11
384	0.11
385	0.11
386	0.14
387	0.14
388	0.16
389	0.25
390	0.32
391	0.35
392	0.4
393	0.42
394	0.44
395	0.49
396	0.54
397	0.54
398	0.58
399	0.56
400	0.53
401	0.6
402	0.57
403	0.58
404	0.55
405	0.47
406	0.39
407	0.4
408	0.43
409	0.42
410	0.49
411	0.51
412	0.53
413	0.59
414	0.6
415	0.57
416	0.51
417	0.45
418	0.36
419	0.25
420	0.21
421	0.13
422	0.12
423	0.12
424	0.12
425	0.12
426	0.12
427	0.12
428	0.09
429	0.09
430	0.07
431	0.07
432	0.07
433	0.07
434	0.07
435	0.08
436	0.08
437	0.08
438	0.08
439	0.09
440	0.09
441	0.1
442	0.11
443	0.1
444	0.11
445	0.13
446	0.19
447	0.2
448	0.2
449	0.21
450	0.23
451	0.24
452	0.25
453	0.24
454	0.24
455	0.22
456	0.22
457	0.2
458	0.17
459	0.15
460	0.14
461	0.11
462	0.07
463	0.07
464	0.06
465	0.06
466	0.07
467	0.07
468	0.07
469	0.07
470	0.09
471	0.13
472	0.14
473	0.13
474	0.13
475	0.13
476	0.13
477	0.12
478	0.11
479	0.06
480	0.07
481	0.07
482	0.07
483	0.08
484	0.07
485	0.07
486	0.07
487	0.08
488	0.08
489	0.12
490	0.15
491	0.15
492	0.15
493	0.16
494	0.16
495	0.17
496	0.19
497	0.16
498	0.14
499	0.14
500	0.13
501	0.13
502	0.13
503	0.11
504	0.08
505	0.07
506	0.04
507	0.04
508	0.04
509	0.03
510	0.03
511	0.04
512	0.04
513	0.04
514	0.04
515	0.04
516	0.05
517	0.04
518	0.05
519	0.08
520	0.09
521	0.1
522	0.11
523	0.15
524	0.15
525	0.15
526	0.15
527	0.11
528	0.1
529	0.09
530	0.08
531	0.05
532	0.06
533	0.07
534	0.06
535	0.06
536	0.06
537	0.07
538	0.07
539	0.07
540	0.06
541	0.05
542	0.06
543	0.06
544	0.07
545	0.06
546	0.06
547	0.05
548	0.05
549	0.06
550	0.04
551	0.04
552	0.04
553	0.05
554	0.05
555	0.05
556	0.05
557	0.05
558	0.05
559	0.05
560	0.04
561	0.04
562	0.04
563	0.04
564	0.04
565	0.04
566	0.03
567	0.03
568	0.04
569	0.04
570	0.05
571	0.05
572	0.05
573	0.05
574	0.05
575	0.06
576	0.05
577	0.05
578	0.05
579	0.05
580	0.06
581	0.06
582	0.07
583	0.08
584	0.08
585	0.09
586	0.1
587	0.12
588	0.12
589	0.13
590	0.14
591	0.14
592	0.14
593	0.14
594	0.13
595	0.12
596	0.12
597	0.1
598	0.08
599	0.07
600	0.06
601	0.05
602	0.05
603	0.04
604	0.04
605	0.05
606	0.05
607	0.05
608	0.04
609	0.04
610	0.05
611	0.05
612	0.06
613	0.06
614	0.11
615	0.12
616	0.14
617	0.15
618	0.16
619	0.22
620	0.24
621	0.29
622	0.25
623	0.24
624	0.22
625	0.21
626	0.2
627	0.13
628	0.1
629	0.04
630	0.04
631	0.04
632	0.04
633	0.04
634	0.04
635	0.05
636	0.05
637	0.05
638	0.05
639	0.05
640	0.05
641	0.05
642	0.07
643	0.08
644	0.08
645	0.08
646	0.11
647	0.11
648	0.12
649	0.14
650	0.12
651	0.11
652	0.13
653	0.13
654	0.13
655	0.15
656	0.15
657	0.14
658	0.14
659	0.14
660	0.12
661	0.13
662	0.12
663	0.1
664	0.09
665	0.11
666	0.12
667	0.19
668	0.24
669	0.25
670	0.25
671	0.3
672	0.4
673	0.44
674	0.46
675	0.43
676	0.43
677	0.44
678	0.52
679	0.57
680	0.53
681	0.51
682	0.52
683	0.55
684	0.49
685	0.49
686	0.43
687	0.38
688	0.4
689	0.38
690	0.39
691	0.43
692	0.47
693	0.46
694	0.46
695	0.4
696	0.32
697	0.32
698	0.27
699	0.16
700	0.12
701	0.1
702	0.07
703	0.06
704	0.07
705	0.07
706	0.06
707	0.08
708	0.09
709	0.11
710	0.13
711	0.17
712	0.2
713	0.19
714	0.22
715	0.22
716	0.29
717	0.3
718	0.3
719	0.28
720	0.25
721	0.24
722	0.24
723	0.23
724	0.16
725	0.15
726	0.13
727	0.12
728	0.14
729	0.17
730	0.14
731	0.14
732	0.2
733	0.18
734	0.2
735	0.24
736	0.21
737	0.21
738	0.25
739	0.25
740	0.18
741	0.18
742	0.16
743	0.15
744	0.16
745	0.13
746	0.1
747	0.09
748	0.09
749	0.09
750	0.08
751	0.05
752	0.05
753	0.08
754	0.08
755	0.09
756	0.09
757	0.13
758	0.16
759	0.17
760	0.17
761	0.15
762	0.17
763	0.19
764	0.18
765	0.16
766	0.18
767	0.25
768	0.28
769	0.36
770	0.37
771	0.37
772	0.38
773	0.38
774	0.35
775	0.33
776	0.36
777	0.29
778	0.28
779	0.27
780	0.27
781	0.26
782	0.25
783	0.23
784	0.19
785	0.19
786	0.18
787	0.17
788	0.17
789	0.18
790	0.18
791	0.15
792	0.12
793	0.19
794	0.2
795	0.24
796	0.31
797	0.39
798	0.44
799	0.51
800	0.54
801	0.51
802	0.57
803	0.63
804	0.64
805	0.64
806	0.65
807	0.65
808	0.65
809	0.62
810	0.55
811	0.45
812	0.36
813	0.28
814	0.21
815	0.14
816	0.1
817	0.08
818	0.09
819	0.11
820	0.15
821	0.15
822	0.16
823	0.16
824	0.17
825	0.17
826	0.15
827	0.15
828	0.14
829	0.19
830	0.18
831	0.18
832	0.18
833	0.18
834	0.18
835	0.16
836	0.17
837	0.14
838	0.13
839	0.16
840	0.19
841	0.19
842	0.2
843	0.23
844	0.21
845	0.26
846	0.27
847	0.25
848	0.21
849	0.22
850	0.23
851	0.23
852	0.23
853	0.17
854	0.22
855	0.21
856	0.21
857	0.21
858	0.22
859	0.29
860	0.34
861	0.38
862	0.37
863	0.38
864	0.37
865	0.37
866	0.37
867	0.34
868	0.29
869	0.24
870	0.27
871	0.27
872	0.27
873	0.27
874	0.25
875	0.23
876	0.24
877	0.24
878	0.22
879	0.25
880	0.27
881	0.27
882	0.27
883	0.24
884	0.22
885	0.23
886	0.19
887	0.18
888	0.17
889	0.21
890	0.23
891	0.26
892	0.28
893	0.32
894	0.33
895	0.34
896	0.39
897	0.41
898	0.4
899	0.43
900	0.42
901	0.41
902	0.41
903	0.37
904	0.35
905	0.31
906	0.36
907	0.36
908	0.38
909	0.39
910	0.43
911	0.45
912	0.47
913	0.5
914	0.45
915	0.48
916	0.53
917	0.5
918	0.5
919	0.52
920	0.57
921	0.56
922	0.6
923	0.58
924	0.54
925	0.58
926	0.55
927	0.54
928	0.51
929	0.49
930	0.47
931	0.42
932	0.45
933	0.45
934	0.48
935	0.47
936	0.48
937	0.5
938	0.5
939	0.5
940	0.46
941	0.42
942	0.45
943	0.47
944	0.41
945	0.41
946	0.37
947	0.37
948	0.39
949	0.45
950	0.44
951	0.48
952	0.55
953	0.59
954	0.62
955	0.65
956	0.62
957	0.59
958	0.54
959	0.49
960	0.45
961	0.37
962	0.31
963	0.29
964	0.29
965	0.23
966	0.21
967	0.17
968	0.17
969	0.2
970	0.21
971	0.2
972	0.21
973	0.21
974	0.21
975	0.2
976	0.17
977	0.13
978	0.1
979	0.09
980	0.07
981	0.07
982	0.08
983	0.07
984	0.08
985	0.08
986	0.08
987	0.09
988	0.09
989	0.11
990	0.12
991	0.17
992	0.18
993	0.17
994	0.17
995	0.17
996	0.16
997	0.15
998	0.13
999	0.09
1000	0.1
1001	0.1
1002	0.09
1003	0.09
1004	0.08
1005	0.08
1006	0.08
1007	0.09
1008	0.09
1009	0.11
1010	0.1
1011	0.1
1012	0.1
1013	0.11
1014	0.11
1015	0.11
1016	0.11
1017	0.11
1018	0.12
1019	0.12
1020	0.13
1021	0.13
1022	0.13
1023	0.13
1024	0.12
1025	0.13
1026	0.12
1027	0.11
1028	0.11
1029	0.1
1030	0.09
1031	0.09
1032	0.07
1033	0.06
1034	0.06
1035	0.07
1036	0.07
1037	0.08
1038	0.07
1039	0.08
1040	0.08
1041	0.07
1042	0.07
1043	0.08
1044	0.07
1045	0.07
1046	0.06
1047	0.05
1048	0.05
1049	0.05
1050	0.04
1051	0.04
1052	0.04
1053	0.06
1054	0.07
1055	0.08
1056	0.09
1057	0.1
1058	0.12
1059	0.13
1060	0.14
1061	0.14
1062	0.15
1063	0.17
1064	0.17
1065	0.16
1066	0.14
1067	0.14
1068	0.13
1069	0.11
1070	0.16
1071	0.14
1072	0.15
1073	0.18
1074	0.19
1075	0.22
1076	0.24
1077	0.3
1078	0.31
1079	0.36
1080	0.42
1081	0.44
1082	0.48
1083	0.47
1084	0.48
1085	0.43
1086	0.35
1087	0.36
1088	0.33
1089	0.36
1090	0.35
1091	0.4
1092	0.41
1093	0.45
1094	0.47
1095	0.43
1096	0.4
1097	0.33
1098	0.31
1099	0.25
1100	0.26
1101	0.24
1102	0.22
1103	0.21
1104	0.2
1105	0.2
1106	0.17
1107	0.19
1108	0.2
1109	0.19
1110	0.22
1111	0.25
1112	0.27
1113	0.31
1114	0.35
1115	0.4

A0A1Q3DX79

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer