FuNGI

A0A0C4F3A2

Protein Details

Accession

A0A0C4F3A2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
163-192	QRPRLQTDQARRRPARRKSHPDRRTQPLCQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
173-184	RRRPARRKSHPD

Subcellular Location(s)

cyto 15.5, cyto_mito 9.5, nucl 7, mito 2.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR047192 Euk_RPA1_DBD_C IPR012340 NA-bd_OB-fold IPR004365 NA-bd_OB_tRNA IPR013955 Rep_factor-A_C IPR007199 Rep_factor-A_N IPR031657 REPA_OB_2 IPR004591 Rfa1
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0046872 F:metal ion binding GO:0006310 P:DNA recombination GO:0006281 P:DNA repair GO:0006260 P:DNA replication
Pfam	View protein in Pfam PF04057 Rep-A_N PF08646 Rep_fac-A_C PF16900 REPA_OB_2 PF01336 tRNA_anti-codon
CDD	cd04474 RPA1_DBD_A cd04475 RPA1_DBD_B cd04476 RPA1_DBD_C cd04477 RPA1N

Amino Acid Sequences

MAVQLTQDAIKRMFEDQNLEIENLTVQVISIKSVGAANMAAAPQRWRIIISDGQMFITAMLATQLNHFVQNNQIKKHSILRVPSYTVNVIGSRHVVVLLGVEVVQSDYPERIGNPVTCDGEANAAKENSASKPAPAPGQPRAAQSRPQARGRRQAETIDLQAQRPRLQTDQARRRPARRKSHPDRRTQPLCQQAFRSWKIKARVSQKSEIKRWSNARGDGKLFSVTFLDESGQVRATGFNDAVDNLYDSLQEGKVYLVSRGKINIAKKQYNNTGHDYEIVFENATEVEECQDSADTPKIVLQKLTKLGDLNDVEKDSMVDVVAVVKEVGEIAEIIGKVSQKTMIKRDITLVDQSAYSVRMTLWGKTAETFEAPTESIVAFQGVKVGDFGGRNLSMLSSSAMLVNPDIPEAFELKGWYDNEGVNATIQSFSSTAGGIGREITEDSLKTIAEIKEAPLGMAERGDFFNFRATIMYIKNETISYPACPTERCNKKLLRDGDDEWRCEKCDKLFPAPDHRYLIQMTAQDHTGTIWLSGFNEVGQVVLPLTANELVAIKESDEAQYQRTVAEATAKTYTMVCRAKEETYNDVSRTKYSVIRLAPVDWAAAGLQLVDSLLKAYSA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.28
2	0.31
3	0.29
4	0.34
5	0.35
6	0.33
7	0.28
8	0.24
9	0.22
10	0.16
11	0.15
12	0.08
13	0.06
14	0.09
15	0.09
16	0.1
17	0.1
18	0.09
19	0.1
20	0.11
21	0.11
22	0.09
23	0.09
24	0.08
25	0.1
26	0.1
27	0.11
28	0.11
29	0.13
30	0.16
31	0.17
32	0.17
33	0.17
34	0.18
35	0.23
36	0.26
37	0.27
38	0.29
39	0.28
40	0.28
41	0.27
42	0.25
43	0.2
44	0.16
45	0.12
46	0.06
47	0.07
48	0.07
49	0.07
50	0.08
51	0.12
52	0.12
53	0.15
54	0.15
55	0.16
56	0.24
57	0.33
58	0.37
59	0.38
60	0.41
61	0.41
62	0.44
63	0.51
64	0.5
65	0.47
66	0.48
67	0.52
68	0.52
69	0.53
70	0.53
71	0.48
72	0.41
73	0.36
74	0.31
75	0.25
76	0.21
77	0.19
78	0.18
79	0.15
80	0.14
81	0.13
82	0.11
83	0.09
84	0.09
85	0.08
86	0.06
87	0.05
88	0.05
89	0.05
90	0.06
91	0.06
92	0.06
93	0.06
94	0.06
95	0.08
96	0.09
97	0.09
98	0.11
99	0.15
100	0.16
101	0.2
102	0.23
103	0.24
104	0.23
105	0.24
106	0.21
107	0.24
108	0.23
109	0.2
110	0.2
111	0.19
112	0.18
113	0.19
114	0.21
115	0.16
116	0.21
117	0.2
118	0.17
119	0.21
120	0.23
121	0.27
122	0.29
123	0.33
124	0.32
125	0.39
126	0.4
127	0.41
128	0.46
129	0.45
130	0.46
131	0.49
132	0.54
133	0.53
134	0.6
135	0.63
136	0.63
137	0.7
138	0.69
139	0.66
140	0.59
141	0.55
142	0.51
143	0.45
144	0.42
145	0.39
146	0.36
147	0.32
148	0.32
149	0.32
150	0.31
151	0.29
152	0.29
153	0.24
154	0.29
155	0.36
156	0.44
157	0.52
158	0.57
159	0.66
160	0.67
161	0.75
162	0.78
163	0.8
164	0.8
165	0.8
166	0.83
167	0.84
168	0.9
169	0.89
170	0.9
171	0.87
172	0.86
173	0.83
174	0.77
175	0.73
176	0.72
177	0.68
178	0.59
179	0.55
180	0.52
181	0.52
182	0.51
183	0.47
184	0.41
185	0.44
186	0.48
187	0.5
188	0.5
189	0.52
190	0.57
191	0.59
192	0.65
193	0.66
194	0.68
195	0.68
196	0.7
197	0.64
198	0.62
199	0.61
200	0.6
201	0.58
202	0.57
203	0.56
204	0.52
205	0.5
206	0.44
207	0.4
208	0.34
209	0.28
210	0.21
211	0.16
212	0.12
213	0.1
214	0.09
215	0.09
216	0.08
217	0.09
218	0.1
219	0.1
220	0.09
221	0.09
222	0.1
223	0.1
224	0.1
225	0.09
226	0.08
227	0.08
228	0.08
229	0.09
230	0.08
231	0.08
232	0.07
233	0.07
234	0.06
235	0.06
236	0.08
237	0.07
238	0.07
239	0.07
240	0.06
241	0.08
242	0.09
243	0.11
244	0.12
245	0.13
246	0.14
247	0.15
248	0.17
249	0.19
250	0.22
251	0.26
252	0.31
253	0.36
254	0.38
255	0.42
256	0.48
257	0.51
258	0.51
259	0.5
260	0.44
261	0.38
262	0.38
263	0.32
264	0.25
265	0.19
266	0.15
267	0.1
268	0.08
269	0.08
270	0.06
271	0.06
272	0.05
273	0.04
274	0.05
275	0.05
276	0.05
277	0.05
278	0.05
279	0.05
280	0.07
281	0.08
282	0.07
283	0.07
284	0.1
285	0.13
286	0.13
287	0.15
288	0.15
289	0.17
290	0.22
291	0.23
292	0.21
293	0.19
294	0.19
295	0.22
296	0.22
297	0.19
298	0.16
299	0.15
300	0.14
301	0.14
302	0.13
303	0.07
304	0.06
305	0.05
306	0.04
307	0.03
308	0.04
309	0.04
310	0.04
311	0.04
312	0.03
313	0.03
314	0.03
315	0.03
316	0.02
317	0.03
318	0.03
319	0.05
320	0.05
321	0.05
322	0.06
323	0.07
324	0.07
325	0.07
326	0.11
327	0.12
328	0.15
329	0.2
330	0.26
331	0.27
332	0.27
333	0.3
334	0.28
335	0.27
336	0.25
337	0.21
338	0.15
339	0.14
340	0.14
341	0.11
342	0.1
343	0.08
344	0.07
345	0.06
346	0.11
347	0.12
348	0.12
349	0.14
350	0.15
351	0.15
352	0.16
353	0.17
354	0.12
355	0.12
356	0.12
357	0.09
358	0.1
359	0.1
360	0.09
361	0.09
362	0.08
363	0.07
364	0.07
365	0.07
366	0.06
367	0.05
368	0.08
369	0.07
370	0.07
371	0.07
372	0.07
373	0.08
374	0.09
375	0.09
376	0.1
377	0.1
378	0.1
379	0.1
380	0.09
381	0.08
382	0.08
383	0.08
384	0.06
385	0.06
386	0.07
387	0.07
388	0.07
389	0.07
390	0.08
391	0.07
392	0.07
393	0.07
394	0.06
395	0.07
396	0.08
397	0.08
398	0.08
399	0.08
400	0.09
401	0.13
402	0.13
403	0.14
404	0.14
405	0.14
406	0.14
407	0.15
408	0.14
409	0.1
410	0.1
411	0.09
412	0.08
413	0.07
414	0.07
415	0.07
416	0.07
417	0.07
418	0.07
419	0.07
420	0.08
421	0.08
422	0.07
423	0.07
424	0.07
425	0.07
426	0.07
427	0.08
428	0.08
429	0.08
430	0.09
431	0.09
432	0.09
433	0.09
434	0.14
435	0.13
436	0.14
437	0.14
438	0.14
439	0.17
440	0.18
441	0.17
442	0.13
443	0.14
444	0.12
445	0.12
446	0.11
447	0.09
448	0.1
449	0.11
450	0.1
451	0.1
452	0.16
453	0.15
454	0.15
455	0.15
456	0.14
457	0.17
458	0.18
459	0.21
460	0.17
461	0.18
462	0.18
463	0.17
464	0.17
465	0.16
466	0.16
467	0.15
468	0.15
469	0.17
470	0.17
471	0.18
472	0.22
473	0.3
474	0.38
475	0.39
476	0.44
477	0.48
478	0.54
479	0.62
480	0.64
481	0.61
482	0.57
483	0.58
484	0.61
485	0.6
486	0.55
487	0.49
488	0.44
489	0.39
490	0.35
491	0.35
492	0.3
493	0.34
494	0.37
495	0.43
496	0.49
497	0.51
498	0.6
499	0.63
500	0.62
501	0.58
502	0.53
503	0.46
504	0.4
505	0.37
506	0.3
507	0.27
508	0.24
509	0.21
510	0.21
511	0.19
512	0.18
513	0.16
514	0.14
515	0.11
516	0.1
517	0.09
518	0.08
519	0.09
520	0.1
521	0.1
522	0.08
523	0.09
524	0.08
525	0.08
526	0.07
527	0.06
528	0.06
529	0.06
530	0.06
531	0.05
532	0.08
533	0.08
534	0.08
535	0.08
536	0.09
537	0.08
538	0.1
539	0.11
540	0.09
541	0.09
542	0.1
543	0.12
544	0.16
545	0.17
546	0.17
547	0.19
548	0.19
549	0.18
550	0.18
551	0.17
552	0.13
553	0.21
554	0.19
555	0.2
556	0.22
557	0.22
558	0.22
559	0.23
560	0.25
561	0.25
562	0.3
563	0.27
564	0.31
565	0.34
566	0.37
567	0.42
568	0.44
569	0.42
570	0.44
571	0.47
572	0.44
573	0.44
574	0.42
575	0.38
576	0.37
577	0.33
578	0.31
579	0.31
580	0.36
581	0.35
582	0.39
583	0.39
584	0.36
585	0.36
586	0.32
587	0.28
588	0.2
589	0.19
590	0.13
591	0.11
592	0.1
593	0.07
594	0.06
595	0.05
596	0.06
597	0.05
598	0.05
599	0.05

A0A0C4F3A2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer