Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Q3EFE9

Protein Details
Accession A0A1Q3EFE9    Localization Confidence Low Confidence Score 5.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
287-306SKLDRRYKRCPLRYYIRWAGHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) extr 9, mito 4, cyto 3.5, cyto_nucl 3.5, pero 3, nucl 2.5, plas 2, golg 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016197  Chromo-like_dom_sf  
IPR000953  Chromo/chromo_shadow_dom  
IPR001584  Integrase_cat-core  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003964  F:RNA-directed DNA polymerase activity  
GO:0015074  P:DNA integration  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50013  CHROMO_2  
PS50994  INTEGRASE  
Amino Acid Sequences MSNGFTAILVVVDRSSKQAIFIPTHDTITSEQLAELFVIHVFSKHGVPNHVTSDRGSEFVSAFFRALGKALSMELHYTSGYHPEADGQTERVNQTLEQYIRIYCSYQQDDWSPLLPIAEFAYNNAPNASTGITPFFANKGCPEVDMKSDLARDFVVNLDELHVFLREEILLAQSRYKEQADRKRISHTRSSRSAPKYLFLLSTFALLVLLKNSQKNILVLSRSSVDLVLCLTSFKLPDYLRRIHPVFHVSQLEPVTPNPFPNRTQSPPPPIEVDGEEEYNIAEILDSKLDRRYKRCPLRYYIRWAGFEGTDDEFSWVAAYPQQTWTLITQNHFIPFSFFAALRRSLLCAFRG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.15
3 0.14
4 0.16
5 0.21
6 0.25
7 0.28
8 0.29
9 0.33
10 0.32
11 0.34
12 0.32
13 0.28
14 0.25
15 0.26
16 0.25
17 0.19
18 0.17
19 0.15
20 0.15
21 0.14
22 0.12
23 0.08
24 0.07
25 0.07
26 0.07
27 0.08
28 0.08
29 0.1
30 0.13
31 0.16
32 0.19
33 0.21
34 0.25
35 0.28
36 0.34
37 0.34
38 0.32
39 0.29
40 0.33
41 0.3
42 0.28
43 0.24
44 0.19
45 0.18
46 0.19
47 0.2
48 0.14
49 0.13
50 0.13
51 0.13
52 0.11
53 0.12
54 0.1
55 0.08
56 0.08
57 0.08
58 0.09
59 0.09
60 0.1
61 0.1
62 0.11
63 0.1
64 0.1
65 0.1
66 0.14
67 0.14
68 0.13
69 0.12
70 0.14
71 0.15
72 0.17
73 0.18
74 0.15
75 0.17
76 0.2
77 0.2
78 0.18
79 0.18
80 0.15
81 0.17
82 0.22
83 0.2
84 0.19
85 0.2
86 0.19
87 0.2
88 0.21
89 0.19
90 0.16
91 0.22
92 0.24
93 0.24
94 0.26
95 0.26
96 0.28
97 0.27
98 0.25
99 0.19
100 0.15
101 0.14
102 0.12
103 0.1
104 0.09
105 0.09
106 0.08
107 0.09
108 0.14
109 0.15
110 0.15
111 0.15
112 0.13
113 0.12
114 0.13
115 0.13
116 0.07
117 0.07
118 0.08
119 0.09
120 0.09
121 0.09
122 0.1
123 0.09
124 0.1
125 0.1
126 0.12
127 0.11
128 0.12
129 0.13
130 0.13
131 0.14
132 0.16
133 0.16
134 0.14
135 0.16
136 0.15
137 0.13
138 0.12
139 0.11
140 0.09
141 0.09
142 0.08
143 0.07
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.04
154 0.05
155 0.05
156 0.06
157 0.06
158 0.07
159 0.08
160 0.08
161 0.09
162 0.11
163 0.12
164 0.15
165 0.22
166 0.32
167 0.39
168 0.43
169 0.44
170 0.51
171 0.55
172 0.54
173 0.56
174 0.54
175 0.51
176 0.53
177 0.56
178 0.55
179 0.55
180 0.56
181 0.47
182 0.41
183 0.36
184 0.32
185 0.28
186 0.2
187 0.18
188 0.12
189 0.12
190 0.11
191 0.09
192 0.08
193 0.07
194 0.06
195 0.05
196 0.08
197 0.09
198 0.1
199 0.11
200 0.12
201 0.13
202 0.13
203 0.15
204 0.16
205 0.15
206 0.15
207 0.16
208 0.15
209 0.15
210 0.14
211 0.13
212 0.09
213 0.08
214 0.08
215 0.07
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.07
221 0.07
222 0.12
223 0.12
224 0.19
225 0.25
226 0.3
227 0.32
228 0.39
229 0.39
230 0.36
231 0.39
232 0.37
233 0.32
234 0.32
235 0.33
236 0.26
237 0.3
238 0.29
239 0.26
240 0.22
241 0.21
242 0.2
243 0.17
244 0.2
245 0.21
246 0.23
247 0.24
248 0.3
249 0.36
250 0.37
251 0.45
252 0.49
253 0.53
254 0.53
255 0.53
256 0.49
257 0.44
258 0.41
259 0.33
260 0.31
261 0.24
262 0.22
263 0.2
264 0.17
265 0.15
266 0.13
267 0.12
268 0.06
269 0.04
270 0.05
271 0.06
272 0.09
273 0.09
274 0.1
275 0.18
276 0.25
277 0.3
278 0.35
279 0.44
280 0.52
281 0.62
282 0.71
283 0.71
284 0.74
285 0.78
286 0.8
287 0.8
288 0.79
289 0.74
290 0.67
291 0.61
292 0.55
293 0.45
294 0.39
295 0.33
296 0.25
297 0.2
298 0.19
299 0.19
300 0.16
301 0.15
302 0.14
303 0.11
304 0.09
305 0.11
306 0.12
307 0.12
308 0.15
309 0.17
310 0.17
311 0.19
312 0.21
313 0.25
314 0.27
315 0.27
316 0.29
317 0.3
318 0.32
319 0.31
320 0.29
321 0.26
322 0.24
323 0.25
324 0.23
325 0.21
326 0.2
327 0.24
328 0.26
329 0.25
330 0.24
331 0.25
332 0.26