FuNGI

A0A1Q3EMS6

Protein Details

Accession

A0A1Q3EMS6

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
840-861	EVSARRTRTKFKPDPNIPLRRS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 10.5, cyto_nucl 9.5, nucl 7.5, pero 5, cysk 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR025724 GAG-pre-integrase_dom IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR013103 RVT_2 IPR001878 Znf_CCHC
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003887 F:DNA-directed DNA polymerase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0015074 P:DNA integration GO:0032196 P:transposition
Pfam	View protein in Pfam PF13976 gag_pre-integrs PF14223 Retrotran_gag_2 PF00665 rve PF07727 RVT_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE PS50158 ZF_CCHC

Amino Acid Sequences

MASNGAVPPPIPEVSADLKFDGGIKVSWTPVKRRIVNSLKTQGLLGYTDGTISKPPPIIITISPPARTPTIDPTITSTISPAPSQDPPKATAIFSLTPSLEEWIFRNDRAKGIIESHVEDLPSLMPDVDARTAKEVLDTLEKEFARKDGMRKVLTERNLRSLTFRETIPIDEFLNQLRALRKDAIEAGNSITDAQFREIIIAAFPTSAFDNIIQNITANPSLYTTAASVIQQISFQYSRVENHPNAVVTGDRISQAHSVAAPISPQAALMSRIEQLESMIASKMARSGNSDKKCDNCGRVGHLKDECFRKGGGKEGQYPSWWRGKRDDTVVSTTPSSSSMAIGEPTLHYAMTASDETQKVGELYADSGATDHFFRNRDDFITYTECDRVGQSSEKSTGLVIKGFGRAKKTVLEKGKSVVLIFEGALHCPSVTSDLISIAKLDDRGYQIHFGNGCAKFFSPGGTHFLTGIGSGGLYRLEEVNTKVLTAKSRSLHRLVDLSIWHRRLAHAGLQRLDILKNNDLVDGFVVAKNTLEGEGKCENCLHGSAVRRPFDAHVPVESGVLERVHLDLTGPMRTMARGGFFYSLPIVDGHSAFTRDYYLANKEAETTLMAMERYRVFAENQTGEKLRCVRVDGGREFINDRWSEWADMHGIRLEQTPAYSSSANGVAERKHGVTFAKVRTVLHESKLPENLWAMAAAYVVYTENLLPSTRNGLRIPAEVFWGSRQDISHLRPFGARGWATIVDGTLGKMDMRAREGKMVGYGERGVYLLYLPSGKVITSRDVVFEEGLPQRTLTPGGGEMEEDQGNNDHDLLFPPNATAASDATLPEKSDMNTLDIPTEVSARRTRTKFKPDPNIPLRRSTRLASSASSSTSMRTLETQPHANLASVIQSFDEVTAEFNTALTAIGIAPVPKSYSKAMEDPERWSPAIDKEIQRMEEFGVFGPLQEPPAGATILVPLWVLAHKFDGNGNIIEEKARLVVNGKTQEEGRDYYQTFAAVLRFESLRILIALWVTLGYHIWQIDFASAYLNAELDKEIYAWPPEGFPGKGTGKVMRIRKSIYGMMQAGRNWWRTLDGTYKELGYSRSQADQCVRSRVSSTGETMTGTYTDDTLGGSSSNEEMEKAKREIGSRYRIKETDSVQFALGMKLTHD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.26
3	0.25
4	0.22
5	0.22
6	0.22
7	0.22
8	0.19
9	0.15
10	0.12
11	0.14
12	0.15
13	0.19
14	0.25
15	0.28
16	0.34
17	0.41
18	0.5
19	0.54
20	0.56
21	0.64
22	0.67
23	0.71
24	0.73
25	0.73
26	0.66
27	0.6
28	0.56
29	0.46
30	0.38
31	0.31
32	0.22
33	0.16
34	0.13
35	0.13
36	0.13
37	0.13
38	0.15
39	0.14
40	0.18
41	0.17
42	0.18
43	0.19
44	0.2
45	0.23
46	0.22
47	0.28
48	0.31
49	0.33
50	0.34
51	0.33
52	0.34
53	0.33
54	0.33
55	0.3
56	0.3
57	0.34
58	0.34
59	0.33
60	0.36
61	0.38
62	0.37
63	0.33
64	0.27
65	0.23
66	0.24
67	0.24
68	0.2
69	0.2
70	0.26
71	0.31
72	0.35
73	0.34
74	0.36
75	0.4
76	0.4
77	0.36
78	0.33
79	0.33
80	0.29
81	0.28
82	0.28
83	0.23
84	0.22
85	0.23
86	0.22
87	0.17
88	0.16
89	0.16
90	0.21
91	0.23
92	0.24
93	0.29
94	0.28
95	0.31
96	0.32
97	0.34
98	0.28
99	0.29
100	0.34
101	0.31
102	0.31
103	0.31
104	0.29
105	0.26
106	0.23
107	0.2
108	0.15
109	0.13
110	0.11
111	0.09
112	0.07
113	0.08
114	0.11
115	0.15
116	0.16
117	0.16
118	0.19
119	0.2
120	0.2
121	0.21
122	0.19
123	0.17
124	0.23
125	0.23
126	0.21
127	0.27
128	0.27
129	0.27
130	0.28
131	0.26
132	0.26
133	0.28
134	0.32
135	0.33
136	0.42
137	0.43
138	0.44
139	0.5
140	0.51
141	0.55
142	0.58
143	0.53
144	0.53
145	0.54
146	0.52
147	0.49
148	0.45
149	0.44
150	0.37
151	0.33
152	0.28
153	0.27
154	0.29
155	0.28
156	0.26
157	0.21
158	0.2
159	0.21
160	0.19
161	0.21
162	0.18
163	0.18
164	0.21
165	0.22
166	0.25
167	0.28
168	0.26
169	0.26
170	0.31
171	0.3
172	0.27
173	0.26
174	0.23
175	0.2
176	0.2
177	0.18
178	0.13
179	0.12
180	0.12
181	0.12
182	0.12
183	0.11
184	0.12
185	0.12
186	0.12
187	0.11
188	0.11
189	0.09
190	0.08
191	0.08
192	0.08
193	0.08
194	0.08
195	0.09
196	0.09
197	0.12
198	0.13
199	0.14
200	0.13
201	0.12
202	0.12
203	0.14
204	0.14
205	0.12
206	0.11
207	0.11
208	0.12
209	0.12
210	0.12
211	0.1
212	0.1
213	0.11
214	0.11
215	0.12
216	0.11
217	0.11
218	0.11
219	0.11
220	0.14
221	0.14
222	0.14
223	0.15
224	0.16
225	0.18
226	0.23
227	0.3
228	0.25
229	0.28
230	0.3
231	0.28
232	0.26
233	0.24
234	0.2
235	0.14
236	0.16
237	0.13
238	0.12
239	0.11
240	0.13
241	0.13
242	0.14
243	0.13
244	0.11
245	0.11
246	0.11
247	0.11
248	0.09
249	0.08
250	0.08
251	0.07
252	0.07
253	0.07
254	0.07
255	0.09
256	0.1
257	0.11
258	0.12
259	0.12
260	0.12
261	0.12
262	0.11
263	0.1
264	0.1
265	0.09
266	0.07
267	0.08
268	0.08
269	0.08
270	0.11
271	0.12
272	0.12
273	0.17
274	0.25
275	0.34
276	0.4
277	0.44
278	0.43
279	0.45
280	0.51
281	0.51
282	0.47
283	0.42
284	0.39
285	0.42
286	0.48
287	0.46
288	0.45
289	0.44
290	0.43
291	0.43
292	0.45
293	0.4
294	0.33
295	0.32
296	0.31
297	0.28
298	0.33
299	0.34
300	0.33
301	0.4
302	0.43
303	0.44
304	0.41
305	0.43
306	0.39
307	0.42
308	0.4
309	0.34
310	0.37
311	0.41
312	0.44
313	0.46
314	0.48
315	0.43
316	0.46
317	0.45
318	0.4
319	0.35
320	0.31
321	0.26
322	0.21
323	0.18
324	0.12
325	0.11
326	0.09
327	0.09
328	0.09
329	0.09
330	0.09
331	0.08
332	0.09
333	0.09
334	0.08
335	0.07
336	0.07
337	0.07
338	0.09
339	0.09
340	0.08
341	0.12
342	0.13
343	0.14
344	0.13
345	0.13
346	0.11
347	0.11
348	0.1
349	0.06
350	0.07
351	0.07
352	0.07
353	0.06
354	0.06
355	0.06
356	0.07
357	0.08
358	0.08
359	0.1
360	0.12
361	0.13
362	0.16
363	0.17
364	0.18
365	0.19
366	0.19
367	0.19
368	0.22
369	0.21
370	0.2
371	0.2
372	0.18
373	0.17
374	0.16
375	0.14
376	0.13
377	0.16
378	0.15
379	0.17
380	0.19
381	0.19
382	0.19
383	0.18
384	0.17
385	0.15
386	0.14
387	0.12
388	0.12
389	0.17
390	0.2
391	0.21
392	0.22
393	0.23
394	0.23
395	0.27
396	0.3
397	0.33
398	0.38
399	0.39
400	0.36
401	0.37
402	0.38
403	0.33
404	0.29
405	0.21
406	0.14
407	0.12
408	0.1
409	0.11
410	0.09
411	0.09
412	0.09
413	0.09
414	0.08
415	0.07
416	0.07
417	0.07
418	0.07
419	0.07
420	0.07
421	0.09
422	0.1
423	0.1
424	0.1
425	0.07
426	0.08
427	0.08
428	0.09
429	0.09
430	0.11
431	0.12
432	0.14
433	0.16
434	0.16
435	0.18
436	0.18
437	0.16
438	0.22
439	0.21
440	0.2
441	0.17
442	0.17
443	0.16
444	0.15
445	0.16
446	0.1
447	0.11
448	0.15
449	0.15
450	0.15
451	0.14
452	0.14
453	0.12
454	0.11
455	0.1
456	0.05
457	0.04
458	0.04
459	0.04
460	0.03
461	0.03
462	0.04
463	0.04
464	0.05
465	0.06
466	0.08
467	0.11
468	0.11
469	0.11
470	0.12
471	0.13
472	0.15
473	0.17
474	0.2
475	0.21
476	0.26
477	0.29
478	0.31
479	0.3
480	0.29
481	0.28
482	0.24
483	0.23
484	0.2
485	0.2
486	0.23
487	0.23
488	0.22
489	0.2
490	0.2
491	0.2
492	0.2
493	0.22
494	0.21
495	0.24
496	0.24
497	0.25
498	0.25
499	0.24
500	0.22
501	0.19
502	0.17
503	0.15
504	0.16
505	0.16
506	0.16
507	0.15
508	0.14
509	0.11
510	0.09
511	0.08
512	0.07
513	0.07
514	0.06
515	0.06
516	0.06
517	0.06
518	0.06
519	0.07
520	0.06
521	0.11
522	0.14
523	0.15
524	0.15
525	0.15
526	0.15
527	0.14
528	0.14
529	0.11
530	0.11
531	0.14
532	0.2
533	0.26
534	0.27
535	0.27
536	0.27
537	0.27
538	0.27
539	0.27
540	0.21
541	0.16
542	0.17
543	0.17
544	0.16
545	0.14
546	0.11
547	0.08
548	0.07
549	0.07
550	0.05
551	0.05
552	0.05
553	0.05
554	0.05
555	0.06
556	0.07
557	0.08
558	0.08
559	0.08
560	0.08
561	0.08
562	0.09
563	0.07
564	0.07
565	0.07
566	0.08
567	0.09
568	0.09
569	0.09
570	0.09
571	0.08
572	0.07
573	0.07
574	0.07
575	0.06
576	0.06
577	0.07
578	0.07
579	0.08
580	0.08
581	0.08
582	0.08
583	0.08
584	0.08
585	0.09
586	0.11
587	0.12
588	0.13
589	0.13
590	0.13
591	0.13
592	0.12
593	0.1
594	0.08
595	0.06
596	0.07
597	0.07
598	0.06
599	0.08
600	0.08
601	0.08
602	0.09
603	0.09
604	0.09
605	0.12
606	0.16
607	0.17
608	0.17
609	0.18
610	0.19
611	0.18
612	0.2
613	0.2
614	0.19
615	0.17
616	0.18
617	0.2
618	0.23
619	0.29
620	0.28
621	0.27
622	0.26
623	0.26
624	0.25
625	0.22
626	0.23
627	0.16
628	0.16
629	0.17
630	0.17
631	0.17
632	0.15
633	0.16
634	0.13
635	0.13
636	0.13
637	0.11
638	0.1
639	0.1
640	0.11
641	0.1
642	0.08
643	0.08
644	0.09
645	0.09
646	0.11
647	0.1
648	0.1
649	0.1
650	0.12
651	0.12
652	0.12
653	0.12
654	0.1
655	0.12
656	0.13
657	0.13
658	0.11
659	0.12
660	0.12
661	0.15
662	0.2
663	0.2
664	0.23
665	0.23
666	0.23
667	0.26
668	0.31
669	0.29
670	0.25
671	0.27
672	0.25
673	0.27
674	0.3
675	0.27
676	0.21
677	0.2
678	0.19
679	0.14
680	0.12
681	0.1
682	0.07
683	0.06
684	0.05
685	0.04
686	0.04
687	0.04
688	0.04
689	0.04
690	0.04
691	0.04
692	0.05
693	0.05
694	0.05
695	0.06
696	0.13
697	0.14
698	0.17
699	0.17
700	0.19
701	0.21
702	0.22
703	0.23
704	0.18
705	0.18
706	0.15
707	0.16
708	0.14
709	0.14
710	0.13
711	0.13
712	0.12
713	0.13
714	0.18
715	0.21
716	0.26
717	0.24
718	0.25
719	0.24
720	0.25
721	0.24
722	0.26
723	0.22
724	0.16
725	0.19
726	0.19
727	0.18
728	0.17
729	0.14
730	0.09
731	0.09
732	0.09
733	0.06
734	0.06
735	0.05
736	0.07
737	0.09
738	0.09
739	0.13
740	0.16
741	0.17
742	0.2
743	0.2
744	0.19
745	0.2
746	0.2
747	0.17
748	0.15
749	0.15
750	0.12
751	0.11
752	0.11
753	0.08
754	0.07
755	0.07
756	0.05
757	0.05
758	0.05
759	0.05
760	0.06
761	0.06
762	0.06
763	0.08
764	0.09
765	0.12
766	0.14
767	0.14
768	0.15
769	0.15
770	0.16
771	0.15
772	0.13
773	0.15
774	0.16
775	0.17
776	0.16
777	0.15
778	0.15
779	0.15
780	0.16
781	0.12
782	0.1
783	0.09
784	0.1
785	0.1
786	0.1
787	0.1
788	0.12
789	0.12
790	0.11
791	0.1
792	0.1
793	0.11
794	0.11
795	0.1
796	0.07
797	0.07
798	0.09
799	0.11
800	0.1
801	0.1
802	0.09
803	0.1
804	0.1
805	0.1
806	0.09
807	0.07
808	0.07
809	0.08
810	0.08
811	0.1
812	0.1
813	0.1
814	0.11
815	0.12
816	0.11
817	0.14
818	0.14
819	0.17
820	0.18
821	0.18
822	0.17
823	0.16
824	0.16
825	0.13
826	0.15
827	0.12
828	0.14
829	0.18
830	0.22
831	0.3
832	0.33
833	0.41
834	0.47
835	0.58
836	0.63
837	0.69
838	0.75
839	0.74
840	0.81
841	0.82
842	0.83
843	0.74
844	0.75
845	0.7
846	0.64
847	0.6
848	0.51
849	0.47
850	0.42
851	0.42
852	0.34
853	0.33
854	0.29
855	0.27
856	0.27
857	0.21
858	0.18
859	0.18
860	0.16
861	0.13
862	0.15
863	0.17
864	0.21
865	0.25
866	0.29
867	0.27
868	0.3
869	0.29
870	0.26
871	0.24
872	0.18
873	0.18
874	0.13
875	0.13
876	0.1
877	0.1
878	0.1
879	0.1
880	0.1
881	0.06
882	0.07
883	0.08
884	0.09
885	0.08
886	0.08
887	0.08
888	0.07
889	0.07
890	0.06
891	0.05
892	0.04
893	0.05
894	0.05
895	0.06
896	0.06
897	0.06
898	0.09
899	0.09
900	0.12
901	0.13
902	0.18
903	0.21
904	0.25
905	0.29
906	0.35
907	0.37
908	0.39
909	0.43
910	0.41
911	0.38
912	0.35
913	0.33
914	0.28
915	0.31
916	0.33
917	0.3
918	0.33
919	0.37
920	0.38
921	0.36
922	0.33
923	0.3
924	0.25
925	0.23
926	0.17
927	0.16
928	0.14
929	0.14
930	0.14
931	0.12
932	0.11
933	0.11
934	0.1
935	0.08
936	0.1
937	0.1
938	0.09
939	0.08
940	0.09
941	0.08
942	0.09
943	0.07
944	0.05
945	0.06
946	0.08
947	0.08
948	0.08
949	0.11
950	0.11
951	0.12
952	0.13
953	0.16
954	0.17
955	0.17
956	0.18
957	0.16
958	0.16
959	0.16
960	0.15
961	0.12
962	0.11
963	0.1
964	0.09
965	0.11
966	0.14
967	0.21
968	0.28
969	0.28
970	0.28
971	0.29
972	0.32
973	0.33
974	0.33
975	0.29
976	0.29
977	0.29
978	0.29
979	0.29
980	0.26
981	0.23
982	0.21
983	0.19
984	0.13
985	0.12
986	0.13
987	0.12
988	0.12
989	0.13
990	0.12
991	0.11
992	0.11
993	0.11
994	0.09
995	0.09
996	0.09
997	0.07
998	0.07
999	0.06
1000	0.06
1001	0.06
1002	0.06
1003	0.08
1004	0.09
1005	0.09
1006	0.09
1007	0.1
1008	0.11
1009	0.11
1010	0.1
1011	0.1
1012	0.1
1013	0.11
1014	0.1
1015	0.1
1016	0.09
1017	0.09
1018	0.09
1019	0.08
1020	0.08
1021	0.08
1022	0.09
1023	0.11
1024	0.13
1025	0.14
1026	0.14
1027	0.14
1028	0.16
1029	0.19
1030	0.19
1031	0.17
1032	0.22
1033	0.23
1034	0.26
1035	0.28
1036	0.3
1037	0.33
1038	0.4
1039	0.47
1040	0.47
1041	0.5
1042	0.5
1043	0.52
1044	0.53
1045	0.51
1046	0.47
1047	0.47
1048	0.42
1049	0.4
1050	0.4
1051	0.36
1052	0.37
1053	0.38
1054	0.37
1055	0.3
1056	0.28
1057	0.29
1058	0.27
1059	0.31
1060	0.34
1061	0.32
1062	0.32
1063	0.32
1064	0.32
1065	0.3
1066	0.3
1067	0.28
1068	0.23
1069	0.24
1070	0.25
1071	0.31
1072	0.31
1073	0.35
1074	0.4
1075	0.45
1076	0.45
1077	0.49
1078	0.47
1079	0.41
1080	0.43
1081	0.41
1082	0.39
1083	0.35
1084	0.34
1085	0.29
1086	0.29
1087	0.28
1088	0.25
1089	0.24
1090	0.19
1091	0.17
1092	0.14
1093	0.11
1094	0.11
1095	0.1
1096	0.1
1097	0.09
1098	0.09
1099	0.08
1100	0.07
1101	0.09
1102	0.09
1103	0.11
1104	0.1
1105	0.11
1106	0.14
1107	0.18
1108	0.24
1109	0.25
1110	0.28
1111	0.3
1112	0.33
1113	0.42
1114	0.47
1115	0.53
1116	0.55
1117	0.59
1118	0.63
1119	0.61
1120	0.62
1121	0.6
1122	0.55
1123	0.54
1124	0.5
1125	0.46
1126	0.38
1127	0.4
1128	0.36
1129	0.31
1130	0.28

A0A1Q3EMS6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer