FuNGI

A0A1Q3E268

Protein Details

Accession

A0A1Q3E268

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
64-95	DDEDDEEERKRRKRRKKHHRRRREEEEDLEED	Acidic
103-124	NTGGTFKKSRLKRLVRRGASES	Hydrophilic
189-217	PMDERAREERRKERRRQQQEFRRKSRGAH	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
72-86	RKRRKRRKKHHRRRR
114-114	K
194-215	AREERRKERRRQQQEFRRKSRG

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012337 RNaseH-like_sf IPR028083 Spt6_acidic_N_dom IPR032706 Spt6_HHH IPR028088 Spt6_HTH_DNA-bd_dom IPR028231 Spt6_YqgF IPR023323 Tex-like_dom_sf IPR023319 Tex-like_HTH_dom_sf IPR017072 TF_Spt6
Gene Ontology	GO:0003677 F:DNA binding GO:0003746 F:translation elongation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF14635 HHH_7 PF14641 HTH_44 PF14632 SPT6_acidic PF14639 YqgF

Amino Acid Sequences

MASPVSAYPPEDDPMQGAAEEEEEEGEGDIVGPGEPDDSSEEEEEDADEERRIREGFIVDEDEDDEDDEEERKRRKRRKKHHRRRREEEEDLEEDDLDLLEENTGGTFKKSRLKRLVRRGASESPPTASSSRRRAVVESSDEDLDDDPLPKVQDIQQIWDDQRDEFDDDADGDIDDFIEYDDEEEGGMPMDERAREERRKERRRQQQEFRRKSRGAHPELAGIDANAWAEIHDVFGDGHEYDWALVADEEAEYEQETQKDMTLQNVFEPSEIREHLLTEDDNLIRARDTPERMQLTTSSLSEAASISLHQTIIAEDLNKDGARWVTLRLSPEKQKEFFSANGAYQHLQGELVMAVTFALRAMFVEEYEVPFIWTHRRDYISHFDVNDTRSPRLELLSLPELWRIYALGQKYRSLVERRNALSASYRRLGVTDTYYTDEIFPAIDSVELVADTSEWLLMKYKDKKENVAAFRFHDDDEAEVEKKHKMPSRISAYELAKKSIVSRLADGFGIASHEVVLNFVNETRLHYVDNQNLDPLIYAEQFADPDPAKALAPEELLRRARMIIATELGKDPLLRDHMRQLFKKNAVVSVSPTERGRAKIDEQHVYYPFKYLYNKPIENVLGSSQFLYILKAEQELLVTVSIYLPPDIKANFERRLIDAFSSDLLRESTKAWNEERSRVVQEVMEQHLVPAAVKWTREFLREEEEDYVANRCGDQLRKRIDVSPYYNPQNSPMKLGDTPSVLAVSWGKGDPQKDAICVVFMDDGGHMREWIKIDNLVDTETRDEFIDIIRQRKRDVIIVGGFTTATAKLSQRVKEIVSGHFSYDPNSTFGDSFDIPVIYVPDELACIYHHSPQSKVEFSSLPPNARYCVGLARYAQSPLNEYAAVGSDITALSFNDDNQHLVPKDKLLVALEQALVDIVNKVGVDIN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.19
2	0.18
3	0.15
4	0.13
5	0.12
6	0.11
7	0.12
8	0.1
9	0.08
10	0.08
11	0.08
12	0.08
13	0.08
14	0.07
15	0.06
16	0.06
17	0.06
18	0.06
19	0.06
20	0.05
21	0.06
22	0.06
23	0.07
24	0.1
25	0.11
26	0.15
27	0.15
28	0.16
29	0.15
30	0.16
31	0.15
32	0.13
33	0.13
34	0.11
35	0.12
36	0.13
37	0.14
38	0.17
39	0.17
40	0.17
41	0.18
42	0.19
43	0.2
44	0.22
45	0.25
46	0.22
47	0.22
48	0.22
49	0.2
50	0.18
51	0.16
52	0.13
53	0.1
54	0.1
55	0.11
56	0.14
57	0.2
58	0.28
59	0.36
60	0.45
61	0.56
62	0.66
63	0.76
64	0.83
65	0.88
66	0.92
67	0.95
68	0.96
69	0.97
70	0.97
71	0.96
72	0.96
73	0.94
74	0.91
75	0.87
76	0.83
77	0.74
78	0.66
79	0.56
80	0.45
81	0.35
82	0.26
83	0.18
84	0.11
85	0.08
86	0.06
87	0.05
88	0.05
89	0.05
90	0.05
91	0.06
92	0.06
93	0.08
94	0.11
95	0.15
96	0.24
97	0.3
98	0.4
99	0.5
100	0.61
101	0.69
102	0.77
103	0.84
104	0.82
105	0.83
106	0.79
107	0.77
108	0.72
109	0.67
110	0.58
111	0.5
112	0.44
113	0.41
114	0.36
115	0.34
116	0.35
117	0.38
118	0.41
119	0.42
120	0.43
121	0.42
122	0.46
123	0.48
124	0.46
125	0.41
126	0.4
127	0.36
128	0.34
129	0.32
130	0.27
131	0.21
132	0.16
133	0.13
134	0.11
135	0.12
136	0.13
137	0.13
138	0.14
139	0.17
140	0.24
141	0.23
142	0.28
143	0.29
144	0.32
145	0.33
146	0.36
147	0.32
148	0.25
149	0.26
150	0.23
151	0.23
152	0.19
153	0.18
154	0.15
155	0.14
156	0.15
157	0.13
158	0.1
159	0.07
160	0.07
161	0.07
162	0.06
163	0.05
164	0.04
165	0.04
166	0.04
167	0.05
168	0.05
169	0.05
170	0.05
171	0.05
172	0.05
173	0.05
174	0.05
175	0.05
176	0.05
177	0.08
178	0.08
179	0.1
180	0.17
181	0.24
182	0.3
183	0.38
184	0.47
185	0.56
186	0.66
187	0.75
188	0.79
189	0.83
190	0.88
191	0.9
192	0.91
193	0.91
194	0.92
195	0.93
196	0.91
197	0.89
198	0.8
199	0.75
200	0.73
201	0.73
202	0.69
203	0.64
204	0.57
205	0.52
206	0.5
207	0.47
208	0.37
209	0.26
210	0.19
211	0.13
212	0.12
213	0.07
214	0.06
215	0.05
216	0.05
217	0.05
218	0.05
219	0.05
220	0.05
221	0.05
222	0.06
223	0.07
224	0.06
225	0.07
226	0.06
227	0.07
228	0.06
229	0.07
230	0.07
231	0.06
232	0.05
233	0.05
234	0.05
235	0.05
236	0.05
237	0.05
238	0.05
239	0.05
240	0.06
241	0.08
242	0.08
243	0.09
244	0.09
245	0.1
246	0.13
247	0.13
248	0.16
249	0.17
250	0.17
251	0.18
252	0.2
253	0.19
254	0.17
255	0.17
256	0.14
257	0.15
258	0.15
259	0.15
260	0.13
261	0.14
262	0.14
263	0.15
264	0.14
265	0.11
266	0.15
267	0.13
268	0.14
269	0.14
270	0.14
271	0.12
272	0.13
273	0.15
274	0.17
275	0.21
276	0.22
277	0.3
278	0.33
279	0.33
280	0.33
281	0.3
282	0.29
283	0.27
284	0.24
285	0.17
286	0.14
287	0.14
288	0.13
289	0.12
290	0.09
291	0.07
292	0.07
293	0.06
294	0.07
295	0.07
296	0.06
297	0.06
298	0.06
299	0.07
300	0.08
301	0.07
302	0.07
303	0.08
304	0.09
305	0.09
306	0.09
307	0.09
308	0.09
309	0.1
310	0.1
311	0.11
312	0.13
313	0.16
314	0.19
315	0.22
316	0.27
317	0.32
318	0.39
319	0.43
320	0.41
321	0.41
322	0.41
323	0.39
324	0.35
325	0.33
326	0.27
327	0.23
328	0.23
329	0.22
330	0.2
331	0.18
332	0.17
333	0.13
334	0.1
335	0.09
336	0.07
337	0.06
338	0.06
339	0.04
340	0.04
341	0.04
342	0.04
343	0.04
344	0.03
345	0.03
346	0.03
347	0.03
348	0.04
349	0.05
350	0.05
351	0.07
352	0.07
353	0.08
354	0.09
355	0.09
356	0.08
357	0.08
358	0.09
359	0.13
360	0.15
361	0.16
362	0.19
363	0.22
364	0.22
365	0.28
366	0.35
367	0.33
368	0.34
369	0.32
370	0.3
371	0.29
372	0.31
373	0.3
374	0.24
375	0.21
376	0.19
377	0.2
378	0.19
379	0.18
380	0.16
381	0.12
382	0.14
383	0.16
384	0.16
385	0.15
386	0.16
387	0.15
388	0.14
389	0.13
390	0.09
391	0.07
392	0.09
393	0.11
394	0.14
395	0.15
396	0.17
397	0.17
398	0.19
399	0.22
400	0.24
401	0.28
402	0.27
403	0.33
404	0.33
405	0.34
406	0.33
407	0.29
408	0.32
409	0.29
410	0.29
411	0.24
412	0.23
413	0.2
414	0.2
415	0.21
416	0.15
417	0.16
418	0.13
419	0.13
420	0.14
421	0.15
422	0.14
423	0.14
424	0.12
425	0.09
426	0.08
427	0.06
428	0.04
429	0.04
430	0.04
431	0.03
432	0.03
433	0.03
434	0.03
435	0.03
436	0.03
437	0.03
438	0.03
439	0.03
440	0.03
441	0.03
442	0.04
443	0.06
444	0.07
445	0.14
446	0.21
447	0.28
448	0.35
449	0.36
450	0.39
451	0.44
452	0.51
453	0.5
454	0.47
455	0.42
456	0.37
457	0.38
458	0.36
459	0.28
460	0.21
461	0.16
462	0.12
463	0.12
464	0.13
465	0.11
466	0.1
467	0.11
468	0.12
469	0.14
470	0.18
471	0.2
472	0.23
473	0.25
474	0.34
475	0.41
476	0.41
477	0.41
478	0.42
479	0.41
480	0.44
481	0.41
482	0.34
483	0.26
484	0.24
485	0.23
486	0.21
487	0.22
488	0.16
489	0.17
490	0.17
491	0.17
492	0.17
493	0.15
494	0.11
495	0.08
496	0.08
497	0.06
498	0.05
499	0.04
500	0.05
501	0.05
502	0.05
503	0.05
504	0.05
505	0.05
506	0.05
507	0.06
508	0.06
509	0.09
510	0.11
511	0.11
512	0.12
513	0.15
514	0.18
515	0.21
516	0.24
517	0.22
518	0.2
519	0.19
520	0.18
521	0.15
522	0.12
523	0.09
524	0.06
525	0.06
526	0.07
527	0.07
528	0.07
529	0.08
530	0.1
531	0.08
532	0.08
533	0.09
534	0.09
535	0.09
536	0.09
537	0.09
538	0.07
539	0.09
540	0.1
541	0.11
542	0.16
543	0.17
544	0.17
545	0.17
546	0.16
547	0.16
548	0.15
549	0.15
550	0.11
551	0.12
552	0.12
553	0.13
554	0.13
555	0.12
556	0.12
557	0.1
558	0.09
559	0.1
560	0.15
561	0.15
562	0.16
563	0.24
564	0.31
565	0.37
566	0.39
567	0.42
568	0.44
569	0.45
570	0.47
571	0.4
572	0.36
573	0.32
574	0.3
575	0.28
576	0.25
577	0.24
578	0.23
579	0.22
580	0.21
581	0.21
582	0.23
583	0.23
584	0.21
585	0.23
586	0.28
587	0.33
588	0.36
589	0.36
590	0.38
591	0.38
592	0.37
593	0.34
594	0.29
595	0.25
596	0.23
597	0.25
598	0.24
599	0.3
600	0.35
601	0.36
602	0.34
603	0.37
604	0.35
605	0.32
606	0.29
607	0.23
608	0.16
609	0.15
610	0.15
611	0.11
612	0.11
613	0.1
614	0.1
615	0.08
616	0.08
617	0.08
618	0.08
619	0.08
620	0.08
621	0.08
622	0.07
623	0.08
624	0.06
625	0.06
626	0.06
627	0.06
628	0.06
629	0.06
630	0.07
631	0.06
632	0.07
633	0.1
634	0.1
635	0.13
636	0.17
637	0.22
638	0.26
639	0.28
640	0.29
641	0.28
642	0.31
643	0.29
644	0.25
645	0.2
646	0.17
647	0.15
648	0.14
649	0.13
650	0.11
651	0.1
652	0.1
653	0.1
654	0.11
655	0.16
656	0.19
657	0.23
658	0.23
659	0.31
660	0.34
661	0.39
662	0.4
663	0.38
664	0.38
665	0.35
666	0.34
667	0.26
668	0.26
669	0.26
670	0.26
671	0.23
672	0.2
673	0.19
674	0.19
675	0.18
676	0.15
677	0.11
678	0.11
679	0.11
680	0.12
681	0.13
682	0.17
683	0.19
684	0.22
685	0.24
686	0.22
687	0.27
688	0.28
689	0.3
690	0.27
691	0.26
692	0.23
693	0.22
694	0.22
695	0.16
696	0.15
697	0.12
698	0.11
699	0.15
700	0.22
701	0.28
702	0.34
703	0.38
704	0.42
705	0.44
706	0.48
707	0.49
708	0.5
709	0.5
710	0.5
711	0.51
712	0.53
713	0.53
714	0.49
715	0.49
716	0.5
717	0.44
718	0.4
719	0.35
720	0.33
721	0.32
722	0.33
723	0.3
724	0.23
725	0.23
726	0.19
727	0.18
728	0.14
729	0.14
730	0.12
731	0.11
732	0.11
733	0.1
734	0.12
735	0.15
736	0.16
737	0.17
738	0.23
739	0.23
740	0.22
741	0.24
742	0.22
743	0.2
744	0.19
745	0.17
746	0.12
747	0.1
748	0.1
749	0.09
750	0.1
751	0.11
752	0.11
753	0.1
754	0.1
755	0.13
756	0.14
757	0.15
758	0.16
759	0.17
760	0.17
761	0.19
762	0.2
763	0.19
764	0.18
765	0.17
766	0.19
767	0.16
768	0.17
769	0.14
770	0.14
771	0.12
772	0.13
773	0.19
774	0.2
775	0.28
776	0.32
777	0.34
778	0.35
779	0.4
780	0.41
781	0.38
782	0.37
783	0.36
784	0.34
785	0.35
786	0.33
787	0.29
788	0.26
789	0.2
790	0.19
791	0.12
792	0.1
793	0.1
794	0.1
795	0.17
796	0.23
797	0.26
798	0.29
799	0.31
800	0.32
801	0.36
802	0.37
803	0.35
804	0.36
805	0.34
806	0.32
807	0.34
808	0.33
809	0.29
810	0.3
811	0.27
812	0.23
813	0.23
814	0.22
815	0.18
816	0.18
817	0.21
818	0.17
819	0.17
820	0.17
821	0.15
822	0.14
823	0.14
824	0.15
825	0.11
826	0.11
827	0.1
828	0.08
829	0.09
830	0.09
831	0.08
832	0.08
833	0.12
834	0.14
835	0.2
836	0.25
837	0.26
838	0.28
839	0.34
840	0.4
841	0.38
842	0.38
843	0.35
844	0.33
845	0.33
846	0.42
847	0.4
848	0.38
849	0.37
850	0.37
851	0.35
852	0.35
853	0.33
854	0.24
855	0.27
856	0.26
857	0.27
858	0.27
859	0.29
860	0.29
861	0.31
862	0.32
863	0.25
864	0.27
865	0.25
866	0.26
867	0.23
868	0.21
869	0.19
870	0.18
871	0.18
872	0.14
873	0.12
874	0.09
875	0.09
876	0.1
877	0.09
878	0.07
879	0.1
880	0.11
881	0.11
882	0.15
883	0.16
884	0.18
885	0.19
886	0.26
887	0.24
888	0.27
889	0.28
890	0.26
891	0.29
892	0.28
893	0.29
894	0.24
895	0.25
896	0.24
897	0.26
898	0.23
899	0.19
900	0.18
901	0.15
902	0.13
903	0.11
904	0.1
905	0.06
906	0.07
907	0.07

A0A1Q3E268

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer