FuNGI

A0A1Q3E036

Protein Details

Accession

A0A1Q3E036

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
871-901	LAEYRARKIQREKSKSKKKKTELPHEFLRKE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
876-890	ARKIQREKSKSKKKK

Subcellular Location(s)

cyto 15, cysk 6, nucl 3, pero 2, mito_nucl 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR024075 DNA-dir_RNA_pol_helix_hairp_sf IPR046950 DNA-dir_Rpol_C_phage-type IPR002092 DNA-dir_Rpol_phage-type IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR037159 RNA_POL_N_sf IPR029262 RPOL_N
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF00940 RNA_pol PF14700 RPOL_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS00900 RNA_POL_PHAGE_1 PS00489 RNA_POL_PHAGE_2

Amino Acid Sequences

MGMSKAADNREFWIDCAWELFTTMEAGQEKVEPSAGTYATMLKAWIRFGPDSPNYVPDTGAVPPVDMLISILNRDIPIENVVADRVFETSSEAAEVIKLLSKAAADLGHTEVIARLGQTEAIGAHYEDILADIPEVMPVMRVKKKEPSESSSGEEEQEPEYEVPFNLSNLRRHLSRVCFARRVLPEDVAARQKLLEDTVYETAMDRLKHESDVFEQLGLDTGHMRQPDLRRWMWDWHTKLQERLQEEIKNIELIENKKEDRLQLSPYLSLVKPERLSLITIFEIMRLQGSGGVSEGMKTTRALIAVGKAVENEYKAQICKKNNIILPSIGRLGDNGYFSNLGYNSLLERRIVAARHMSDGEAWTATWTQATRAKIGGILVECLMDVAKVTRSATHKVTNEILTEVQPAFHHSYEHSRGQKLGVIRLNPAVSERLANDNVRDTIHPRHLPMLVKPKPWLGLKKGGYMFSEVSAMRFKESIEQQSYLNHASELGNVELVYAGLDVLGSTPWQINRKVFDVVLKVWNSGEKLGKLPPAVFADPEPVLPEGADIKTRTTYIHRMKGWTQAKANNHSDRCSVNYKIEIARTFLGDTIYFPHNIDFRGRAYPIPPHLNHIGNDLSRGLLIFAESKPLGERGLRWLQIHLANLYGYDKANFDERVQFVQDHLDDIYDSATKPLEGRRWWIHADDPWQCLSACMELHAALTSENPIEYESCLPVHQDGTCNGLQHYAALGGDSRGAQQVNLSAGERPSDVYTYVGNMAEEIIKRDIAKGEKYAAVLQGKITRKIVKQTVMTTVYGVTFIGAREQIERQIKLTKQFEEEDVWGASAYLAKVVLGCIGDLFTGAKDIQLWLTLCARLISKAIPEDRIAESLAEYRARKIQREKSKSKKKKTELPHEFLRKEQMTSVVWTTPLGLPIVQPYRKPNRKQIVTSMQTVYISDPNSPSEVNTMKQASAFPPNFIHSLDATHMMLTALECRTQGLTFAAVHDSYWTHACDIDEMSGIIRDTFIALHSSDVLKKLHDEFKERYQNYKIPLASLHTGVLAKALKQAGSRITVTPEQAQSLPSIANLVDVSKTGNSSIQDNADSVDLKALLVDLAQERKAATATGNSKYPEEHEEELEEEEEEDWESPRSKAARLRKASADLQSIELLGKFVNLVDLLPPLPKKGDFKVEAIKASQYFFS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.26
2	0.24
3	0.25
4	0.22
5	0.15
6	0.16
7	0.15
8	0.12
9	0.13
10	0.12
11	0.15
12	0.14
13	0.15
14	0.15
15	0.17
16	0.17
17	0.16
18	0.18
19	0.13
20	0.14
21	0.18
22	0.17
23	0.16
24	0.16
25	0.18
26	0.17
27	0.17
28	0.16
29	0.15
30	0.17
31	0.18
32	0.2
33	0.22
34	0.23
35	0.24
36	0.33
37	0.33
38	0.37
39	0.37
40	0.38
41	0.36
42	0.35
43	0.33
44	0.25
45	0.24
46	0.2
47	0.22
48	0.17
49	0.15
50	0.14
51	0.15
52	0.13
53	0.11
54	0.1
55	0.09
56	0.1
57	0.1
58	0.11
59	0.12
60	0.12
61	0.13
62	0.13
63	0.12
64	0.13
65	0.13
66	0.13
67	0.13
68	0.14
69	0.13
70	0.12
71	0.11
72	0.1
73	0.09
74	0.09
75	0.12
76	0.11
77	0.12
78	0.12
79	0.12
80	0.11
81	0.11
82	0.11
83	0.08
84	0.11
85	0.1
86	0.1
87	0.1
88	0.1
89	0.11
90	0.12
91	0.12
92	0.1
93	0.12
94	0.14
95	0.14
96	0.14
97	0.13
98	0.12
99	0.12
100	0.12
101	0.1
102	0.08
103	0.08
104	0.09
105	0.08
106	0.08
107	0.07
108	0.08
109	0.09
110	0.09
111	0.09
112	0.08
113	0.08
114	0.07
115	0.08
116	0.07
117	0.06
118	0.06
119	0.06
120	0.06
121	0.06
122	0.07
123	0.06
124	0.07
125	0.1
126	0.17
127	0.22
128	0.25
129	0.29
130	0.38
131	0.45
132	0.53
133	0.57
134	0.57
135	0.59
136	0.6
137	0.6
138	0.56
139	0.49
140	0.41
141	0.35
142	0.3
143	0.24
144	0.21
145	0.19
146	0.15
147	0.15
148	0.14
149	0.13
150	0.15
151	0.14
152	0.15
153	0.19
154	0.23
155	0.27
156	0.3
157	0.34
158	0.32
159	0.35
160	0.42
161	0.41
162	0.44
163	0.49
164	0.51
165	0.53
166	0.53
167	0.57
168	0.53
169	0.53
170	0.49
171	0.42
172	0.37
173	0.35
174	0.39
175	0.35
176	0.32
177	0.27
178	0.23
179	0.23
180	0.21
181	0.2
182	0.16
183	0.12
184	0.16
185	0.17
186	0.17
187	0.16
188	0.15
189	0.16
190	0.19
191	0.18
192	0.15
193	0.18
194	0.19
195	0.21
196	0.21
197	0.21
198	0.21
199	0.27
200	0.26
201	0.22
202	0.2
203	0.18
204	0.2
205	0.17
206	0.14
207	0.09
208	0.1
209	0.13
210	0.13
211	0.14
212	0.17
213	0.22
214	0.3
215	0.36
216	0.36
217	0.38
218	0.41
219	0.48
220	0.5
221	0.53
222	0.51
223	0.51
224	0.59
225	0.57
226	0.59
227	0.56
228	0.55
229	0.49
230	0.48
231	0.46
232	0.4
233	0.39
234	0.37
235	0.32
236	0.27
237	0.24
238	0.23
239	0.22
240	0.21
241	0.25
242	0.26
243	0.26
244	0.28
245	0.29
246	0.29
247	0.28
248	0.29
249	0.29
250	0.3
251	0.31
252	0.29
253	0.29
254	0.3
255	0.26
256	0.27
257	0.26
258	0.25
259	0.24
260	0.24
261	0.25
262	0.22
263	0.24
264	0.2
265	0.21
266	0.16
267	0.17
268	0.16
269	0.14
270	0.13
271	0.11
272	0.11
273	0.07
274	0.07
275	0.08
276	0.08
277	0.07
278	0.07
279	0.08
280	0.08
281	0.08
282	0.09
283	0.07
284	0.08
285	0.08
286	0.09
287	0.1
288	0.1
289	0.1
290	0.11
291	0.12
292	0.14
293	0.14
294	0.13
295	0.11
296	0.12
297	0.13
298	0.13
299	0.13
300	0.12
301	0.14
302	0.16
303	0.22
304	0.28
305	0.31
306	0.36
307	0.4
308	0.45
309	0.45
310	0.47
311	0.43
312	0.4
313	0.38
314	0.34
315	0.3
316	0.23
317	0.2
318	0.17
319	0.17
320	0.15
321	0.14
322	0.12
323	0.12
324	0.12
325	0.12
326	0.15
327	0.12
328	0.12
329	0.11
330	0.11
331	0.11
332	0.13
333	0.14
334	0.11
335	0.11
336	0.12
337	0.15
338	0.15
339	0.15
340	0.19
341	0.19
342	0.22
343	0.21
344	0.19
345	0.17
346	0.18
347	0.16
348	0.11
349	0.1
350	0.09
351	0.09
352	0.08
353	0.09
354	0.08
355	0.1
356	0.15
357	0.16
358	0.17
359	0.17
360	0.17
361	0.17
362	0.17
363	0.16
364	0.12
365	0.11
366	0.1
367	0.09
368	0.09
369	0.08
370	0.07
371	0.04
372	0.04
373	0.04
374	0.06
375	0.07
376	0.07
377	0.12
378	0.15
379	0.2
380	0.23
381	0.29
382	0.29
383	0.31
384	0.34
385	0.31
386	0.29
387	0.26
388	0.23
389	0.17
390	0.18
391	0.14
392	0.12
393	0.11
394	0.14
395	0.15
396	0.14
397	0.15
398	0.14
399	0.21
400	0.25
401	0.32
402	0.32
403	0.3
404	0.31
405	0.31
406	0.32
407	0.27
408	0.28
409	0.25
410	0.23
411	0.23
412	0.25
413	0.24
414	0.21
415	0.21
416	0.15
417	0.12
418	0.12
419	0.12
420	0.14
421	0.16
422	0.16
423	0.16
424	0.17
425	0.18
426	0.17
427	0.17
428	0.16
429	0.19
430	0.26
431	0.27
432	0.25
433	0.27
434	0.29
435	0.3
436	0.33
437	0.38
438	0.35
439	0.36
440	0.36
441	0.35
442	0.36
443	0.38
444	0.38
445	0.32
446	0.37
447	0.37
448	0.43
449	0.43
450	0.4
451	0.37
452	0.34
453	0.29
454	0.2
455	0.21
456	0.14
457	0.13
458	0.14
459	0.14
460	0.12
461	0.12
462	0.11
463	0.15
464	0.18
465	0.22
466	0.23
467	0.24
468	0.23
469	0.25
470	0.27
471	0.22
472	0.2
473	0.13
474	0.11
475	0.11
476	0.11
477	0.12
478	0.09
479	0.08
480	0.08
481	0.08
482	0.07
483	0.06
484	0.05
485	0.03
486	0.03
487	0.02
488	0.02
489	0.02
490	0.03
491	0.03
492	0.03
493	0.03
494	0.05
495	0.07
496	0.1
497	0.13
498	0.15
499	0.17
500	0.2
501	0.2
502	0.2
503	0.2
504	0.2
505	0.2
506	0.23
507	0.21
508	0.19
509	0.18
510	0.19
511	0.17
512	0.16
513	0.16
514	0.12
515	0.13
516	0.15
517	0.16
518	0.16
519	0.15
520	0.16
521	0.17
522	0.16
523	0.15
524	0.14
525	0.15
526	0.14
527	0.14
528	0.12
529	0.09
530	0.09
531	0.08
532	0.08
533	0.07
534	0.07
535	0.09
536	0.08
537	0.09
538	0.1
539	0.1
540	0.11
541	0.13
542	0.22
543	0.27
544	0.33
545	0.34
546	0.36
547	0.37
548	0.46
549	0.46
550	0.41
551	0.38
552	0.36
553	0.39
554	0.43
555	0.48
556	0.45
557	0.43
558	0.4
559	0.39
560	0.34
561	0.34
562	0.31
563	0.26
564	0.21
565	0.21
566	0.21
567	0.21
568	0.22
569	0.19
570	0.17
571	0.16
572	0.15
573	0.14
574	0.12
575	0.11
576	0.09
577	0.08
578	0.1
579	0.1
580	0.1
581	0.1
582	0.11
583	0.11
584	0.12
585	0.13
586	0.11
587	0.12
588	0.14
589	0.14
590	0.13
591	0.14
592	0.17
593	0.2
594	0.25
595	0.23
596	0.25
597	0.27
598	0.29
599	0.28
600	0.27
601	0.24
602	0.18
603	0.19
604	0.15
605	0.11
606	0.09
607	0.09
608	0.06
609	0.04
610	0.05
611	0.06
612	0.05
613	0.08
614	0.08
615	0.08
616	0.09
617	0.09
618	0.1
619	0.08
620	0.09
621	0.13
622	0.18
623	0.2
624	0.2
625	0.2
626	0.22
627	0.24
628	0.24
629	0.17
630	0.13
631	0.11
632	0.11
633	0.11
634	0.09
635	0.07
636	0.07
637	0.07
638	0.07
639	0.1
640	0.1
641	0.11
642	0.15
643	0.16
644	0.17
645	0.18
646	0.17
647	0.15
648	0.17
649	0.16
650	0.12
651	0.11
652	0.09
653	0.08
654	0.08
655	0.09
656	0.06
657	0.06
658	0.06
659	0.06
660	0.06
661	0.07
662	0.1
663	0.15
664	0.15
665	0.2
666	0.23
667	0.27
668	0.28
669	0.28
670	0.27
671	0.25
672	0.3
673	0.28
674	0.27
675	0.24
676	0.23
677	0.22
678	0.2
679	0.18
680	0.14
681	0.1
682	0.09
683	0.09
684	0.08
685	0.08
686	0.08
687	0.07
688	0.06
689	0.06
690	0.06
691	0.05
692	0.05
693	0.05
694	0.05
695	0.06
696	0.07
697	0.08
698	0.08
699	0.08
700	0.09
701	0.09
702	0.09
703	0.1
704	0.1
705	0.1
706	0.1
707	0.14
708	0.15
709	0.15
710	0.14
711	0.14
712	0.13
713	0.12
714	0.11
715	0.07
716	0.06
717	0.06
718	0.06
719	0.05
720	0.06
721	0.06
722	0.06
723	0.07
724	0.07
725	0.07
726	0.07
727	0.09
728	0.09
729	0.1
730	0.1
731	0.09
732	0.1
733	0.11
734	0.1
735	0.1
736	0.09
737	0.09
738	0.09
739	0.09
740	0.09
741	0.09
742	0.11
743	0.1
744	0.09
745	0.08
746	0.08
747	0.09
748	0.09
749	0.1
750	0.1
751	0.1
752	0.11
753	0.12
754	0.15
755	0.16
756	0.18
757	0.17
758	0.19
759	0.2
760	0.21
761	0.21
762	0.21
763	0.19
764	0.18
765	0.18
766	0.22
767	0.23
768	0.25
769	0.26
770	0.27
771	0.28
772	0.35
773	0.38
774	0.36
775	0.37
776	0.37
777	0.4
778	0.38
779	0.36
780	0.29
781	0.25
782	0.2
783	0.17
784	0.14
785	0.08
786	0.06
787	0.06
788	0.07
789	0.07
790	0.07
791	0.09
792	0.1
793	0.17
794	0.21
795	0.22
796	0.22
797	0.28
798	0.3
799	0.36
800	0.39
801	0.35
802	0.34
803	0.34
804	0.34
805	0.31
806	0.3
807	0.24
808	0.2
809	0.18
810	0.14
811	0.13
812	0.11
813	0.09
814	0.08
815	0.06
816	0.05
817	0.05
818	0.05
819	0.05
820	0.07
821	0.05
822	0.05
823	0.05
824	0.05
825	0.05
826	0.05
827	0.06
828	0.04
829	0.06
830	0.06
831	0.06
832	0.06
833	0.07
834	0.07
835	0.1
836	0.1
837	0.1
838	0.12
839	0.13
840	0.13
841	0.13
842	0.13
843	0.11
844	0.12
845	0.11
846	0.12
847	0.17
848	0.18
849	0.19
850	0.19
851	0.22
852	0.22
853	0.22
854	0.2
855	0.15
856	0.14
857	0.15
858	0.16
859	0.17
860	0.16
861	0.17
862	0.24
863	0.26
864	0.31
865	0.38
866	0.46
867	0.53
868	0.63
869	0.71
870	0.75
871	0.85
872	0.89
873	0.91
874	0.91
875	0.89
876	0.88
877	0.88
878	0.89
879	0.87
880	0.83
881	0.82
882	0.81
883	0.74
884	0.66
885	0.64
886	0.54
887	0.45
888	0.39
889	0.33
890	0.26
891	0.27
892	0.27
893	0.2
894	0.19
895	0.17
896	0.18
897	0.15
898	0.15
899	0.12
900	0.1
901	0.1
902	0.16
903	0.23
904	0.23
905	0.24
906	0.32
907	0.42
908	0.51
909	0.57
910	0.61
911	0.65
912	0.7
913	0.72
914	0.74
915	0.73
916	0.68
917	0.67
918	0.58
919	0.49
920	0.41
921	0.37
922	0.3
923	0.23
924	0.2
925	0.17
926	0.16
927	0.16
928	0.18
929	0.17
930	0.15
931	0.18
932	0.19
933	0.18
934	0.22
935	0.22
936	0.21
937	0.22
938	0.23
939	0.2
940	0.28
941	0.27
942	0.25
943	0.25
944	0.27
945	0.28
946	0.27
947	0.26
948	0.16
949	0.18
950	0.17
951	0.18
952	0.15
953	0.14
954	0.14
955	0.11
956	0.11
957	0.1
958	0.12
959	0.1
960	0.1
961	0.1
962	0.11
963	0.13
964	0.12
965	0.13
966	0.11
967	0.12
968	0.12
969	0.13
970	0.14
971	0.13
972	0.13
973	0.13
974	0.12
975	0.12
976	0.14
977	0.13
978	0.12
979	0.13
980	0.14
981	0.14
982	0.15
983	0.14
984	0.13
985	0.12
986	0.12
987	0.12
988	0.11
989	0.1
990	0.08
991	0.07
992	0.07
993	0.07
994	0.08
995	0.08
996	0.08
997	0.09
998	0.11
999	0.13
1000	0.14
1001	0.17
1002	0.17
1003	0.16
1004	0.19
1005	0.24
1006	0.29
1007	0.31
1008	0.36
1009	0.38
1010	0.47
1011	0.57
1012	0.55
1013	0.56
1014	0.56
1015	0.56
1016	0.55
1017	0.57
1018	0.47
1019	0.38
1020	0.39
1021	0.38
1022	0.33
1023	0.3
1024	0.26
1025	0.2
1026	0.2
1027	0.18
1028	0.2
1029	0.16
1030	0.14
1031	0.18
1032	0.18
1033	0.18
1034	0.19
1035	0.23
1036	0.22
1037	0.25
1038	0.27
1039	0.23
1040	0.27
1041	0.29
1042	0.3
1043	0.32
1044	0.3
1045	0.29
1046	0.27
1047	0.27
1048	0.22
1049	0.21
1050	0.18
1051	0.13
1052	0.13
1053	0.1
1054	0.11
1055	0.1
1056	0.1
1057	0.09
1058	0.09
1059	0.12
1060	0.11
1061	0.12
1062	0.11
1063	0.15
1064	0.15
1065	0.17
1066	0.2
1067	0.2
1068	0.2
1069	0.2
1070	0.2
1071	0.18
1072	0.18
1073	0.16
1074	0.15
1075	0.12
1076	0.11
1077	0.11
1078	0.1
1079	0.08
1080	0.07
1081	0.09
1082	0.1
1083	0.14
1084	0.15
1085	0.15
1086	0.15
1087	0.16
1088	0.17
1089	0.15
1090	0.13
1091	0.18
1092	0.23
1093	0.27
1094	0.31
1095	0.31
1096	0.32
1097	0.33
1098	0.34
1099	0.31
1100	0.31
1101	0.3
1102	0.28
1103	0.28
1104	0.29
1105	0.29
1106	0.27
1107	0.22
1108	0.16
1109	0.14
1110	0.12
1111	0.11
1112	0.1
1113	0.1
1114	0.12
1115	0.13
1116	0.13
1117	0.19
1118	0.21
1119	0.25
1120	0.33
1121	0.43
1122	0.5
1123	0.56
1124	0.62
1125	0.62
1126	0.66
1127	0.67
1128	0.64
1129	0.6
1130	0.51
1131	0.46
1132	0.41
1133	0.35
1134	0.29
1135	0.24
1136	0.18
1137	0.11
1138	0.1
1139	0.08
1140	0.07
1141	0.08
1142	0.07
1143	0.08
1144	0.08
1145	0.1
1146	0.11
1147	0.16
1148	0.17
1149	0.17
1150	0.2
1151	0.24
1152	0.28
1153	0.32
1154	0.41
1155	0.4
1156	0.45
1157	0.52
1158	0.53
1159	0.53
1160	0.5
1161	0.49
1162	0.4

A0A1Q3E036

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer