Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C4F2X7

Protein Details
Accession A0A0C4F2X7    Localization Confidence High Confidence Score 22.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
58-88ILNQSESQTKPDKKKKKRKKDDNEREIDETAHydrophilic
96-123APSQADQGGKKKKRKKQTDSSNPSNPGEHydrophilic
140-162VDMVDAKDKKKKQKAQNSLDPIAHydrophilic
203-230STKDVENTKKTKKNKKEKKGQTHALPFLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
67-77KPDKKKKKRKK
104-111GKKKKRKK
211-221KKTKKNKKEKK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, mito_nucl 11, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR000629  RNA-helicase_DEAD-box_CS  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0000464  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 upstream of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF00271  Helicase_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00039  DEAD_ATP_HELICASE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd00268  DEADc  
cd18787  SF2_C_DEAD  
Amino Acid Sequences MNFHIHQPSSKERTAGPTQLNIHLDIVAMSSLKTGKQKCSKEEGGSKASQKNAANDQILNQSESQTKPDKKKKKRKKDDNEREIDETAATDSKTQAPSQADQGGKKKKRKKQTDSSNPSNPGETPVAKDAVPETIPTADVDMVDAKDKKKKQKAQNSLDPIAGESVQNNVPASTAPNGDSSSTSKPTNSASDDKITEPCASISTKDVENTKKTKKNKKEKKGQTHALPFLLHPSRNTKIEQFISSNKLTYEPPEIVTELPPVLKFEDVVVHDSLRKAFSSFQKPSPIQSAVWPVLMAGRDVVGIAETGSGKTLAFGVPALQHILNGDKKSKAINVLVIAPTRELAMQTETTLSDLGKLVSPPIKSLCVYGGVDKNIQRKALAGSAVRVVAGTPGRLLDLANEGHLKLDQVSWLILDEADRMLDKGFENDIRAIINLCRPSRSGDSYGRLTTMFSATWPTSVRRLAADFMHEPVRILVGADELTASCSVEQTVEVLEETRGKEWKLLSTLQQLGKDSLYNKSKDKVIVFALYKKEASRLHEFLLRKGYQACCIEGNMSQDKRTKSLDDFMTGKSTILVATDVAARGLDIPKVEFVINVTFPLTIEDYIHRIGRTGRAGRTGKSITFFTDEDKSHAGELMRVLKDAGQVVPEALKQWGGQIKKKTHAAYGDHWKEVDTTIKVSRISC
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.52
3 0.46
4 0.46
5 0.47
6 0.51
7 0.51
8 0.44
9 0.38
10 0.31
11 0.27
12 0.2
13 0.17
14 0.11
15 0.09
16 0.08
17 0.09
18 0.1
19 0.13
20 0.21
21 0.24
22 0.33
23 0.43
24 0.5
25 0.55
26 0.63
27 0.66
28 0.68
29 0.72
30 0.69
31 0.66
32 0.65
33 0.65
34 0.61
35 0.58
36 0.56
37 0.51
38 0.5
39 0.5
40 0.51
41 0.47
42 0.42
43 0.42
44 0.42
45 0.41
46 0.36
47 0.29
48 0.26
49 0.28
50 0.28
51 0.31
52 0.33
53 0.4
54 0.49
55 0.59
56 0.67
57 0.74
58 0.84
59 0.9
60 0.92
61 0.95
62 0.96
63 0.97
64 0.97
65 0.98
66 0.97
67 0.95
68 0.89
69 0.81
70 0.71
71 0.6
72 0.48
73 0.37
74 0.28
75 0.21
76 0.16
77 0.12
78 0.13
79 0.18
80 0.2
81 0.2
82 0.23
83 0.25
84 0.27
85 0.31
86 0.36
87 0.34
88 0.37
89 0.46
90 0.52
91 0.57
92 0.65
93 0.7
94 0.72
95 0.8
96 0.85
97 0.86
98 0.87
99 0.89
100 0.91
101 0.91
102 0.91
103 0.89
104 0.82
105 0.73
106 0.64
107 0.53
108 0.46
109 0.4
110 0.33
111 0.27
112 0.25
113 0.26
114 0.24
115 0.24
116 0.2
117 0.19
118 0.18
119 0.15
120 0.13
121 0.13
122 0.13
123 0.13
124 0.13
125 0.1
126 0.09
127 0.1
128 0.1
129 0.1
130 0.14
131 0.17
132 0.18
133 0.26
134 0.33
135 0.42
136 0.51
137 0.6
138 0.66
139 0.75
140 0.83
141 0.85
142 0.88
143 0.86
144 0.78
145 0.7
146 0.59
147 0.48
148 0.39
149 0.29
150 0.19
151 0.11
152 0.12
153 0.11
154 0.12
155 0.12
156 0.1
157 0.1
158 0.1
159 0.12
160 0.11
161 0.11
162 0.11
163 0.13
164 0.14
165 0.14
166 0.16
167 0.17
168 0.2
169 0.22
170 0.22
171 0.21
172 0.22
173 0.23
174 0.26
175 0.27
176 0.27
177 0.27
178 0.3
179 0.31
180 0.32
181 0.3
182 0.28
183 0.24
184 0.2
185 0.18
186 0.15
187 0.15
188 0.14
189 0.14
190 0.15
191 0.15
192 0.17
193 0.21
194 0.24
195 0.3
196 0.37
197 0.43
198 0.49
199 0.57
200 0.66
201 0.72
202 0.78
203 0.83
204 0.86
205 0.88
206 0.91
207 0.93
208 0.93
209 0.9
210 0.88
211 0.85
212 0.77
213 0.68
214 0.57
215 0.46
216 0.43
217 0.38
218 0.3
219 0.23
220 0.26
221 0.28
222 0.29
223 0.31
224 0.27
225 0.29
226 0.31
227 0.32
228 0.29
229 0.3
230 0.32
231 0.31
232 0.29
233 0.23
234 0.23
235 0.2
236 0.19
237 0.2
238 0.15
239 0.16
240 0.17
241 0.17
242 0.16
243 0.16
244 0.15
245 0.11
246 0.11
247 0.1
248 0.09
249 0.09
250 0.09
251 0.08
252 0.07
253 0.11
254 0.11
255 0.14
256 0.13
257 0.13
258 0.14
259 0.15
260 0.15
261 0.12
262 0.12
263 0.1
264 0.14
265 0.21
266 0.29
267 0.31
268 0.34
269 0.41
270 0.41
271 0.43
272 0.43
273 0.38
274 0.29
275 0.28
276 0.3
277 0.23
278 0.23
279 0.2
280 0.15
281 0.15
282 0.15
283 0.12
284 0.06
285 0.06
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.03
290 0.03
291 0.03
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.04
296 0.05
297 0.04
298 0.05
299 0.05
300 0.04
301 0.04
302 0.04
303 0.05
304 0.05
305 0.06
306 0.07
307 0.07
308 0.07
309 0.07
310 0.1
311 0.12
312 0.13
313 0.15
314 0.14
315 0.14
316 0.16
317 0.16
318 0.16
319 0.14
320 0.15
321 0.14
322 0.16
323 0.16
324 0.15
325 0.14
326 0.11
327 0.1
328 0.09
329 0.08
330 0.06
331 0.05
332 0.07
333 0.07
334 0.07
335 0.08
336 0.07
337 0.08
338 0.08
339 0.07
340 0.06
341 0.06
342 0.06
343 0.06
344 0.06
345 0.08
346 0.11
347 0.11
348 0.11
349 0.12
350 0.13
351 0.13
352 0.14
353 0.13
354 0.12
355 0.13
356 0.15
357 0.16
358 0.16
359 0.18
360 0.21
361 0.25
362 0.24
363 0.24
364 0.2
365 0.19
366 0.19
367 0.19
368 0.18
369 0.14
370 0.13
371 0.14
372 0.14
373 0.13
374 0.11
375 0.08
376 0.08
377 0.08
378 0.07
379 0.06
380 0.06
381 0.07
382 0.07
383 0.07
384 0.05
385 0.08
386 0.08
387 0.08
388 0.09
389 0.09
390 0.09
391 0.09
392 0.09
393 0.06
394 0.07
395 0.06
396 0.06
397 0.06
398 0.06
399 0.06
400 0.06
401 0.05
402 0.05
403 0.05
404 0.05
405 0.05
406 0.05
407 0.05
408 0.05
409 0.06
410 0.06
411 0.07
412 0.09
413 0.1
414 0.11
415 0.12
416 0.12
417 0.11
418 0.11
419 0.11
420 0.1
421 0.13
422 0.17
423 0.17
424 0.18
425 0.18
426 0.22
427 0.26
428 0.29
429 0.3
430 0.3
431 0.34
432 0.36
433 0.36
434 0.32
435 0.28
436 0.24
437 0.2
438 0.16
439 0.12
440 0.09
441 0.12
442 0.11
443 0.13
444 0.14
445 0.15
446 0.17
447 0.18
448 0.19
449 0.17
450 0.18
451 0.19
452 0.18
453 0.21
454 0.18
455 0.19
456 0.21
457 0.19
458 0.18
459 0.16
460 0.16
461 0.11
462 0.1
463 0.08
464 0.06
465 0.06
466 0.06
467 0.06
468 0.05
469 0.06
470 0.06
471 0.06
472 0.05
473 0.05
474 0.06
475 0.06
476 0.06
477 0.05
478 0.05
479 0.06
480 0.06
481 0.06
482 0.07
483 0.1
484 0.11
485 0.13
486 0.14
487 0.14
488 0.17
489 0.18
490 0.21
491 0.22
492 0.23
493 0.25
494 0.3
495 0.36
496 0.36
497 0.37
498 0.34
499 0.32
500 0.31
501 0.29
502 0.24
503 0.26
504 0.28
505 0.29
506 0.3
507 0.32
508 0.35
509 0.37
510 0.37
511 0.32
512 0.3
513 0.33
514 0.33
515 0.35
516 0.36
517 0.33
518 0.33
519 0.3
520 0.33
521 0.29
522 0.33
523 0.35
524 0.34
525 0.34
526 0.39
527 0.4
528 0.38
529 0.44
530 0.38
531 0.32
532 0.34
533 0.33
534 0.34
535 0.35
536 0.33
537 0.25
538 0.26
539 0.26
540 0.23
541 0.27
542 0.28
543 0.27
544 0.29
545 0.34
546 0.35
547 0.37
548 0.38
549 0.37
550 0.32
551 0.39
552 0.37
553 0.36
554 0.37
555 0.35
556 0.36
557 0.32
558 0.28
559 0.21
560 0.18
561 0.13
562 0.12
563 0.1
564 0.06
565 0.07
566 0.09
567 0.09
568 0.09
569 0.08
570 0.08
571 0.09
572 0.11
573 0.11
574 0.1
575 0.11
576 0.12
577 0.14
578 0.14
579 0.11
580 0.12
581 0.16
582 0.15
583 0.15
584 0.15
585 0.13
586 0.13
587 0.16
588 0.15
589 0.11
590 0.13
591 0.14
592 0.16
593 0.19
594 0.21
595 0.18
596 0.18
597 0.21
598 0.25
599 0.31
600 0.34
601 0.35
602 0.42
603 0.45
604 0.45
605 0.51
606 0.48
607 0.42
608 0.4
609 0.38
610 0.31
611 0.33
612 0.32
613 0.28
614 0.3
615 0.29
616 0.3
617 0.31
618 0.28
619 0.24
620 0.27
621 0.23
622 0.19
623 0.23
624 0.27
625 0.26
626 0.25
627 0.25
628 0.24
629 0.26
630 0.26
631 0.22
632 0.14
633 0.14
634 0.15
635 0.17
636 0.15
637 0.14
638 0.13
639 0.14
640 0.12
641 0.18
642 0.24
643 0.27
644 0.34
645 0.42
646 0.49
647 0.55
648 0.63
649 0.59
650 0.59
651 0.61
652 0.59
653 0.59
654 0.63
655 0.6
656 0.55
657 0.53
658 0.47
659 0.41
660 0.37
661 0.35
662 0.27
663 0.25
664 0.28
665 0.32