Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Q3EDB0

Protein Details
Accession A0A1Q3EDB0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
111-137NAEAKTAKNRAKRQKKKGKAKNAGSESHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
102-132KRKREEAEANAEAKTAKNRAKRQKKKGKAKN
Subcellular Location(s) nucl 20.5, mito_nucl 13, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009548  Prkrip1  
Gene Ontology GO:0003725  F:double-stranded RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF06658  DUF1168  
Amino Acid Sequences MSAQTSDVVPPVNRHKLTAVERQRAQLDKLLKDPTKAAYVPPPPKEKTIRPAREMMKNVQGSSAGAGSGEFHVYKASRRREYERISLLEEAARKEVEDAEFKRKREEAEANAEAKTAKNRAKRQKKKGKAKNAGSESTHGATSSQKEGADGNDIPFKKRRLVNGRELVFRKQGEDGEDSDENEDEQSVPNHPATEASDPPLGMSASDTRPPPVAPSKIRLYLALKEDLKQLI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.38
3 0.43
4 0.48
5 0.53
6 0.54
7 0.54
8 0.55
9 0.58
10 0.61
11 0.55
12 0.52
13 0.47
14 0.44
15 0.39
16 0.42
17 0.46
18 0.42
19 0.41
20 0.41
21 0.37
22 0.36
23 0.33
24 0.3
25 0.3
26 0.38
27 0.44
28 0.48
29 0.52
30 0.5
31 0.56
32 0.6
33 0.57
34 0.58
35 0.62
36 0.63
37 0.6
38 0.65
39 0.64
40 0.66
41 0.64
42 0.58
43 0.56
44 0.5
45 0.46
46 0.39
47 0.34
48 0.26
49 0.23
50 0.18
51 0.09
52 0.07
53 0.06
54 0.07
55 0.07
56 0.08
57 0.06
58 0.06
59 0.08
60 0.09
61 0.15
62 0.22
63 0.3
64 0.35
65 0.4
66 0.46
67 0.53
68 0.58
69 0.6
70 0.57
71 0.51
72 0.47
73 0.43
74 0.37
75 0.31
76 0.27
77 0.2
78 0.16
79 0.13
80 0.11
81 0.11
82 0.12
83 0.11
84 0.15
85 0.17
86 0.26
87 0.3
88 0.31
89 0.33
90 0.33
91 0.32
92 0.33
93 0.35
94 0.29
95 0.33
96 0.36
97 0.34
98 0.32
99 0.31
100 0.26
101 0.21
102 0.19
103 0.15
104 0.18
105 0.24
106 0.33
107 0.44
108 0.55
109 0.65
110 0.75
111 0.81
112 0.86
113 0.9
114 0.91
115 0.91
116 0.9
117 0.88
118 0.86
119 0.8
120 0.73
121 0.63
122 0.55
123 0.46
124 0.37
125 0.29
126 0.2
127 0.15
128 0.14
129 0.14
130 0.14
131 0.13
132 0.12
133 0.13
134 0.13
135 0.14
136 0.16
137 0.14
138 0.14
139 0.18
140 0.18
141 0.2
142 0.25
143 0.26
144 0.28
145 0.31
146 0.39
147 0.43
148 0.49
149 0.57
150 0.61
151 0.62
152 0.63
153 0.62
154 0.56
155 0.52
156 0.46
157 0.37
158 0.3
159 0.29
160 0.25
161 0.25
162 0.23
163 0.23
164 0.23
165 0.22
166 0.21
167 0.19
168 0.16
169 0.14
170 0.13
171 0.08
172 0.09
173 0.09
174 0.1
175 0.13
176 0.13
177 0.14
178 0.13
179 0.14
180 0.16
181 0.2
182 0.19
183 0.21
184 0.22
185 0.21
186 0.21
187 0.21
188 0.17
189 0.12
190 0.14
191 0.15
192 0.16
193 0.2
194 0.21
195 0.21
196 0.23
197 0.23
198 0.27
199 0.31
200 0.36
201 0.36
202 0.42
203 0.47
204 0.51
205 0.52
206 0.5
207 0.46
208 0.45
209 0.45
210 0.47
211 0.41
212 0.37