Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Q3ET53

Protein Details
Accession A0A1Q3ET53    Localization Confidence High Confidence Score 20.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
19-42EFAPYQKVPPEKKKLDPRNGTIEKHydrophilic
319-340GSKPSSPKRDRGGSKRKNSVSSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
114-127SRKEDAGKKKGGKI
263-273RKSRKEREKER
325-335PKRDRGGSKRK
396-408RGGRRGRGRGARG
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039722  Upf3  
IPR005120  UPF3_dom  
Gene Ontology GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
Pfam View protein in Pfam  
PF03467  Smg4_UPF3  
Amino Acid Sequences MDTYSKTNQAGNEAHAVVEFAPYQKVPPEKKKLDPRNGTIEKDENYISFIESLTASANREPVSIETLIASTQPVPQPKTTPLLEALKAEKNAIKEKAAVKEKVAIMRNAALEASRKEDAGKKKGGKIGSDPSTSSSAPPPSSKKALNKKAVSNANNTSGPASTPAAGGPSAKSGGPPSKFSKASRQQLSQPQTRTQPSVQPPTKLLTHNPPVAPSNSESQSKTDPSSSTAPTPAPRRVRPMLGLASRQFEAALSGAGVNAAERKSRKEREKEREAAAANKDKEHSPQEQALALVIGKDAPSISTNIPTANTNNTLVSSGSKPSSPKRDRGGSKRKNSVSSNSGTPIATTPKVPSILQRAVIADVSTGSIPPVIPPRGGDESVSGPSPSVETGSGTRGGRRGRGRGARGGSNSTTPGRSG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.25
3 0.24
4 0.17
5 0.17
6 0.14
7 0.1
8 0.12
9 0.12
10 0.14
11 0.19
12 0.27
13 0.35
14 0.44
15 0.54
16 0.58
17 0.68
18 0.78
19 0.83
20 0.85
21 0.85
22 0.81
23 0.81
24 0.8
25 0.73
26 0.68
27 0.63
28 0.54
29 0.48
30 0.42
31 0.32
32 0.28
33 0.25
34 0.2
35 0.15
36 0.13
37 0.11
38 0.1
39 0.1
40 0.11
41 0.12
42 0.12
43 0.13
44 0.16
45 0.15
46 0.15
47 0.16
48 0.15
49 0.18
50 0.17
51 0.16
52 0.13
53 0.13
54 0.13
55 0.12
56 0.11
57 0.08
58 0.12
59 0.16
60 0.21
61 0.24
62 0.26
63 0.3
64 0.32
65 0.37
66 0.33
67 0.32
68 0.32
69 0.34
70 0.33
71 0.32
72 0.33
73 0.32
74 0.32
75 0.31
76 0.28
77 0.27
78 0.32
79 0.32
80 0.29
81 0.29
82 0.33
83 0.4
84 0.45
85 0.42
86 0.37
87 0.42
88 0.43
89 0.45
90 0.43
91 0.35
92 0.3
93 0.32
94 0.31
95 0.24
96 0.22
97 0.16
98 0.15
99 0.16
100 0.18
101 0.15
102 0.15
103 0.17
104 0.24
105 0.31
106 0.34
107 0.42
108 0.42
109 0.47
110 0.51
111 0.52
112 0.47
113 0.45
114 0.47
115 0.44
116 0.41
117 0.36
118 0.34
119 0.35
120 0.32
121 0.28
122 0.23
123 0.22
124 0.22
125 0.25
126 0.28
127 0.29
128 0.34
129 0.38
130 0.43
131 0.5
132 0.58
133 0.64
134 0.63
135 0.63
136 0.67
137 0.7
138 0.63
139 0.58
140 0.52
141 0.47
142 0.42
143 0.38
144 0.3
145 0.22
146 0.2
147 0.16
148 0.14
149 0.1
150 0.09
151 0.09
152 0.09
153 0.09
154 0.09
155 0.07
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.08
160 0.1
161 0.16
162 0.18
163 0.22
164 0.25
165 0.3
166 0.33
167 0.34
168 0.42
169 0.45
170 0.52
171 0.53
172 0.52
173 0.52
174 0.58
175 0.63
176 0.58
177 0.52
178 0.46
179 0.46
180 0.45
181 0.43
182 0.35
183 0.37
184 0.36
185 0.43
186 0.41
187 0.38
188 0.37
189 0.36
190 0.38
191 0.32
192 0.29
193 0.26
194 0.29
195 0.31
196 0.3
197 0.29
198 0.28
199 0.27
200 0.26
201 0.2
202 0.19
203 0.18
204 0.2
205 0.19
206 0.2
207 0.21
208 0.21
209 0.21
210 0.19
211 0.17
212 0.18
213 0.22
214 0.21
215 0.19
216 0.19
217 0.2
218 0.22
219 0.25
220 0.29
221 0.32
222 0.32
223 0.38
224 0.39
225 0.4
226 0.38
227 0.38
228 0.37
229 0.33
230 0.34
231 0.29
232 0.28
233 0.26
234 0.24
235 0.2
236 0.14
237 0.12
238 0.08
239 0.07
240 0.05
241 0.05
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.03
246 0.05
247 0.06
248 0.09
249 0.1
250 0.16
251 0.25
252 0.34
253 0.42
254 0.51
255 0.61
256 0.68
257 0.77
258 0.76
259 0.71
260 0.68
261 0.61
262 0.56
263 0.52
264 0.5
265 0.41
266 0.38
267 0.36
268 0.31
269 0.33
270 0.32
271 0.3
272 0.26
273 0.28
274 0.28
275 0.27
276 0.26
277 0.22
278 0.18
279 0.14
280 0.1
281 0.07
282 0.06
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.06
288 0.08
289 0.09
290 0.12
291 0.12
292 0.13
293 0.14
294 0.15
295 0.16
296 0.17
297 0.19
298 0.18
299 0.17
300 0.17
301 0.17
302 0.16
303 0.17
304 0.15
305 0.15
306 0.15
307 0.17
308 0.2
309 0.26
310 0.37
311 0.4
312 0.45
313 0.5
314 0.59
315 0.65
316 0.73
317 0.77
318 0.76
319 0.81
320 0.83
321 0.81
322 0.78
323 0.74
324 0.7
325 0.64
326 0.58
327 0.53
328 0.45
329 0.42
330 0.34
331 0.31
332 0.27
333 0.26
334 0.23
335 0.2
336 0.2
337 0.22
338 0.25
339 0.24
340 0.27
341 0.3
342 0.33
343 0.34
344 0.33
345 0.3
346 0.29
347 0.29
348 0.24
349 0.16
350 0.12
351 0.12
352 0.1
353 0.09
354 0.07
355 0.08
356 0.07
357 0.1
358 0.17
359 0.18
360 0.18
361 0.19
362 0.25
363 0.3
364 0.31
365 0.28
366 0.24
367 0.26
368 0.27
369 0.28
370 0.21
371 0.16
372 0.16
373 0.16
374 0.14
375 0.12
376 0.1
377 0.11
378 0.13
379 0.16
380 0.21
381 0.21
382 0.24
383 0.28
384 0.31
385 0.37
386 0.42
387 0.47
388 0.51
389 0.6
390 0.62
391 0.66
392 0.68
393 0.67
394 0.64
395 0.63
396 0.56
397 0.5
398 0.48
399 0.43