FuNGI

A0A1Q3E8N6

Protein Details

Accession

A0A1Q3E8N6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
126-155	IRPPDRYRDDRRHPPPPPRRSPSPPIRRPS	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
136-153	RRHPPPPPRRSPSPPIRR

Subcellular Location(s)

mito_nucl 10.833, mito 10.5, nucl 10, cyto_nucl 7.833, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR029123 RBM39_linker IPR006509 RBM39_SF IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF15519 RBM39linker PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12284 RRM2_RBM23_RBM39 cd12285 RRM3_RBM39_like

Amino Acid Sequences

MSTSLRITSPLAITRRIHDTLVVPSGLPQENEVIARTEDVMTENDQALTESAMRETARERGIAKGTANGTGIDDVVNGTMTVTVVIGIVKEVKVDIAVTVMTETKRIAEENESTTTNKVCWISSLIRPPDRYRDDRRHPPPPPRRSPSPPIRRPSPTYETPVDEPYNPDEPKEDDSEARSVFVSQLAARLTARDLGYFFEEKLGENTVMDSRIVTDRLSRRSKGIGYVEFRSMDLVEKAMALTGTVVMGLPIMVQLTESERNRLHPGDGNLNLPPGVNAPHGTMQLYVGSLHFNLTESDIKQVFEPFGALEFVDLHRDPMTGRSKGYAFVQYKRAEDAKMALEQMEGFELAGRQLRVNTVHEKGATRYTQQDTLDESGGGNLNAASRQALMQKLARIDTPSSLPEPTKLNIPQQAMQSRSVLLKNMFDPEEESEKDWDKDLADDVKSECEEKYGPVEAIKVEKETQGEIYVKFDSVESAKKAVQGLNARYFYRKPRWDNASHQRFLHPESQKNNESNYLKVDSLCSSHLFQFIHPVHYCVFITHAVYFGRRFFACPLDASCACIQIWYPSFILAISLVRNFIFNANGFDNLLSTAL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.37
2	0.42
3	0.4
4	0.37
5	0.33
6	0.33
7	0.32
8	0.34
9	0.3
10	0.23
11	0.23
12	0.29
13	0.28
14	0.25
15	0.21
16	0.19
17	0.21
18	0.22
19	0.2
20	0.17
21	0.15
22	0.16
23	0.16
24	0.14
25	0.13
26	0.14
27	0.15
28	0.15
29	0.17
30	0.17
31	0.16
32	0.15
33	0.15
34	0.14
35	0.14
36	0.12
37	0.1
38	0.1
39	0.13
40	0.12
41	0.13
42	0.15
43	0.19
44	0.2
45	0.22
46	0.23
47	0.26
48	0.3
49	0.31
50	0.3
51	0.3
52	0.29
53	0.29
54	0.29
55	0.24
56	0.21
57	0.18
58	0.17
59	0.11
60	0.1
61	0.08
62	0.08
63	0.07
64	0.06
65	0.05
66	0.06
67	0.05
68	0.06
69	0.05
70	0.05
71	0.05
72	0.05
73	0.05
74	0.05
75	0.07
76	0.07
77	0.07
78	0.07
79	0.07
80	0.07
81	0.08
82	0.07
83	0.06
84	0.06
85	0.06
86	0.07
87	0.09
88	0.09
89	0.1
90	0.1
91	0.1
92	0.12
93	0.12
94	0.14
95	0.16
96	0.2
97	0.23
98	0.26
99	0.26
100	0.26
101	0.27
102	0.26
103	0.21
104	0.21
105	0.18
106	0.15
107	0.15
108	0.19
109	0.22
110	0.27
111	0.36
112	0.38
113	0.42
114	0.46
115	0.48
116	0.53
117	0.56
118	0.57
119	0.58
120	0.62
121	0.66
122	0.74
123	0.78
124	0.78
125	0.78
126	0.82
127	0.83
128	0.83
129	0.84
130	0.8
131	0.81
132	0.79
133	0.82
134	0.82
135	0.83
136	0.81
137	0.77
138	0.77
139	0.75
140	0.72
141	0.71
142	0.67
143	0.61
144	0.58
145	0.54
146	0.51
147	0.47
148	0.46
149	0.4
150	0.33
151	0.31
152	0.29
153	0.33
154	0.29
155	0.27
156	0.24
157	0.24
158	0.27
159	0.28
160	0.25
161	0.19
162	0.22
163	0.25
164	0.23
165	0.21
166	0.18
167	0.15
168	0.14
169	0.13
170	0.12
171	0.08
172	0.11
173	0.1
174	0.11
175	0.11
176	0.11
177	0.11
178	0.14
179	0.14
180	0.12
181	0.12
182	0.12
183	0.16
184	0.16
185	0.15
186	0.13
187	0.13
188	0.13
189	0.14
190	0.15
191	0.12
192	0.11
193	0.12
194	0.11
195	0.11
196	0.11
197	0.09
198	0.09
199	0.1
200	0.11
201	0.1
202	0.16
203	0.2
204	0.28
205	0.34
206	0.33
207	0.33
208	0.36
209	0.37
210	0.37
211	0.36
212	0.34
213	0.33
214	0.35
215	0.34
216	0.31
217	0.3
218	0.24
219	0.2
220	0.15
221	0.11
222	0.09
223	0.07
224	0.07
225	0.07
226	0.06
227	0.06
228	0.04
229	0.04
230	0.04
231	0.03
232	0.03
233	0.03
234	0.03
235	0.03
236	0.03
237	0.02
238	0.02
239	0.02
240	0.02
241	0.03
242	0.03
243	0.06
244	0.12
245	0.12
246	0.16
247	0.16
248	0.19
249	0.22
250	0.22
251	0.21
252	0.2
253	0.22
254	0.24
255	0.25
256	0.24
257	0.22
258	0.21
259	0.2
260	0.15
261	0.13
262	0.08
263	0.08
264	0.07
265	0.07
266	0.09
267	0.1
268	0.11
269	0.11
270	0.1
271	0.09
272	0.09
273	0.08
274	0.07
275	0.06
276	0.06
277	0.05
278	0.06
279	0.05
280	0.06
281	0.06
282	0.08
283	0.09
284	0.09
285	0.12
286	0.12
287	0.13
288	0.12
289	0.13
290	0.11
291	0.09
292	0.09
293	0.06
294	0.06
295	0.06
296	0.05
297	0.05
298	0.05
299	0.05
300	0.08
301	0.08
302	0.08
303	0.08
304	0.08
305	0.08
306	0.15
307	0.2
308	0.18
309	0.18
310	0.2
311	0.2
312	0.21
313	0.23
314	0.24
315	0.21
316	0.24
317	0.3
318	0.3
319	0.31
320	0.32
321	0.32
322	0.24
323	0.22
324	0.21
325	0.16
326	0.15
327	0.15
328	0.12
329	0.11
330	0.1
331	0.1
332	0.07
333	0.05
334	0.04
335	0.04
336	0.04
337	0.05
338	0.07
339	0.07
340	0.07
341	0.07
342	0.09
343	0.11
344	0.15
345	0.18
346	0.18
347	0.19
348	0.2
349	0.21
350	0.21
351	0.25
352	0.23
353	0.2
354	0.24
355	0.25
356	0.28
357	0.27
358	0.27
359	0.24
360	0.25
361	0.24
362	0.19
363	0.16
364	0.13
365	0.13
366	0.11
367	0.08
368	0.06
369	0.06
370	0.06
371	0.06
372	0.05
373	0.05
374	0.06
375	0.09
376	0.1
377	0.12
378	0.14
379	0.16
380	0.18
381	0.18
382	0.18
383	0.18
384	0.18
385	0.17
386	0.17
387	0.17
388	0.17
389	0.17
390	0.17
391	0.17
392	0.19
393	0.18
394	0.22
395	0.22
396	0.26
397	0.29
398	0.32
399	0.33
400	0.36
401	0.41
402	0.37
403	0.36
404	0.32
405	0.28
406	0.28
407	0.25
408	0.23
409	0.19
410	0.19
411	0.19
412	0.21
413	0.2
414	0.18
415	0.19
416	0.19
417	0.23
418	0.22
419	0.22
420	0.22
421	0.24
422	0.24
423	0.23
424	0.2
425	0.16
426	0.16
427	0.17
428	0.18
429	0.16
430	0.17
431	0.17
432	0.19
433	0.19
434	0.19
435	0.15
436	0.14
437	0.14
438	0.14
439	0.16
440	0.16
441	0.16
442	0.15
443	0.17
444	0.15
445	0.18
446	0.18
447	0.17
448	0.16
449	0.18
450	0.18
451	0.18
452	0.18
453	0.19
454	0.2
455	0.18
456	0.2
457	0.18
458	0.17
459	0.16
460	0.15
461	0.13
462	0.14
463	0.18
464	0.17
465	0.19
466	0.2
467	0.22
468	0.24
469	0.24
470	0.28
471	0.31
472	0.35
473	0.4
474	0.42
475	0.41
476	0.43
477	0.45
478	0.47
479	0.5
480	0.53
481	0.51
482	0.58
483	0.65
484	0.68
485	0.74
486	0.77
487	0.77
488	0.71
489	0.66
490	0.61
491	0.55
492	0.52
493	0.51
494	0.47
495	0.45
496	0.47
497	0.53
498	0.55
499	0.56
500	0.54
501	0.54
502	0.49
503	0.43
504	0.43
505	0.38
506	0.33
507	0.31
508	0.3
509	0.23
510	0.24
511	0.23
512	0.21
513	0.2
514	0.21
515	0.25
516	0.24
517	0.22
518	0.3
519	0.29
520	0.34
521	0.32
522	0.32
523	0.28
524	0.31
525	0.31
526	0.21
527	0.22
528	0.17
529	0.19
530	0.17
531	0.19
532	0.17
533	0.19
534	0.21
535	0.2
536	0.23
537	0.21
538	0.23
539	0.23
540	0.26
541	0.26
542	0.26
543	0.28
544	0.31
545	0.3
546	0.33
547	0.3
548	0.28
549	0.25
550	0.23
551	0.21
552	0.21
553	0.23
554	0.22
555	0.21
556	0.2
557	0.2
558	0.19
559	0.19
560	0.13
561	0.12
562	0.12
563	0.13
564	0.13
565	0.13
566	0.14
567	0.14
568	0.15
569	0.16
570	0.15
571	0.2
572	0.2
573	0.22
574	0.22
575	0.21
576	0.19

A0A1Q3E8N6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer