FuNGI

A0A1Q3ETH0

Protein Details

Accession

A0A1Q3ETH0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
3-22	KVKQQQTKVKEENARRARAR	Hydrophilic
365-387	LKERERTRETRKRDTQKLFREMQ	Basic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto_nucl 13.5, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027417 P-loop_NTPase IPR003395 RecF/RecN/SMC_N IPR027131 SMC5
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0030915 C:Smc5-Smc6 complex GO:0005524 F:ATP binding GO:0016887 F:ATP hydrolysis activity GO:0000724 P:double-strand break repair via homologous recombination
Pfam	View protein in Pfam PF02463 SMC_N

Amino Acid Sequences

MEKVKQQQTKVKEENARRARARVEEQERGDGLDVDADADTDEEEDFDNQGSGSPKGRKRARANTDGDSRPSQFQDGTSCAPRSVTLPRDPKDNFIPGSIVRIQLRNFVTYDYVEFRPGPYLNMIIGPNGTGKSSIACAIALGLNFSPKVLGRADEISAYVKNGTPDGHIEIELKTPAGKPNLVIHRKLVAYSKSSTFMLNGKNATGKEVSQRMAELGVQVGNLCSFLPQDKVSEFAMMTPQQLLKETQKAAGDTNLTSWHETLIEAGKESSLIKEKVASEQSQLTQMNARNAAIEHDVERYHERRKIEDMIKILEVYIPCASYRELLARYHELKVVQRKMHQKVLRLKAKNEPAHELLNVLKSDLKERERTRETRKRDTQKLFREMQQMYDSNEKMENHADTLQSKLEHLVQAERDRQRQIRDLEGKIQRMEAEYNQPLPDEVVVVLEDKNGAIKRQKLELVRERNDIRSRRGECDSRLREKLEEKAVIMRKIEQAQRNLHQLDSADHQKLQRLAQFNQDTADAVVWLRSNKHRFKKDIIEPAILTLTVPNIRYAPAVESVMSGDRFKTFVAQCREDYDLLNELVNDQEELQALHFDGYLSDFVSCPPGMLWFLKNDISLHRIAVTLNNNSVDVNRATQAVARSGGATFIVGSVINNVSRSRYGRKAVSNVTREVRPAKLLANHGVDADAKRRFESEIVQHKVDVAAHDEEIGRFKEEERKIEAEAKEHDKRGAAIQDRTDAAQRARALKEKLNLAIAREKIMLRQKRAAPSADQEREDIRAELVGVAKKRVKVVKDYLAIAKKVVVEQQETTRIGLEYLQISANRAFLDELCKRKDEKYNQAMEEFAEIDAEYNDAKKHSKDALNESRDALNNTTDEIREQYNEAMAKRTEYENALQTAESNGTTPPSAEGVDLRTADEYRAELESQEAQLELVSKTQPGVIEQYEKRKRDIEQLEKTLEERQRNAAKVERSIQLTLDHWKPALEKLIGSIGQKFSAAFDRIGCAGEIRISENEDYDKWAIDILVKFRDEEKLQLLTGQRQSGGERSLTTILYLMSLTEEARAPFSLVDEINQGMDQRAERVVHDNMVDVTCKDDSAQYFLITPKLLPDLKYHERMKILCVNNGEWLPEETKVGNLMNLIEGFLSTRRNTTANGH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.78
2	0.79
3	0.81
4	0.73
5	0.71
6	0.67
7	0.66
8	0.65
9	0.64
10	0.64
11	0.63
12	0.63
13	0.64
14	0.59
15	0.52
16	0.45
17	0.35
18	0.27
19	0.21
20	0.17
21	0.12
22	0.12
23	0.1
24	0.09
25	0.08
26	0.08
27	0.06
28	0.06
29	0.06
30	0.07
31	0.08
32	0.09
33	0.09
34	0.09
35	0.08
36	0.12
37	0.14
38	0.15
39	0.21
40	0.29
41	0.34
42	0.44
43	0.52
44	0.59
45	0.67
46	0.75
47	0.78
48	0.79
49	0.79
50	0.78
51	0.79
52	0.73
53	0.68
54	0.62
55	0.56
56	0.51
57	0.47
58	0.41
59	0.33
60	0.31
61	0.31
62	0.31
63	0.33
64	0.34
65	0.33
66	0.31
67	0.3
68	0.29
69	0.27
70	0.31
71	0.32
72	0.36
73	0.44
74	0.45
75	0.53
76	0.54
77	0.56
78	0.54
79	0.54
80	0.46
81	0.39
82	0.4
83	0.32
84	0.37
85	0.33
86	0.31
87	0.27
88	0.3
89	0.29
90	0.33
91	0.35
92	0.31
93	0.3
94	0.27
95	0.27
96	0.24
97	0.26
98	0.23
99	0.22
100	0.23
101	0.22
102	0.22
103	0.24
104	0.24
105	0.22
106	0.2
107	0.2
108	0.18
109	0.21
110	0.2
111	0.16
112	0.16
113	0.14
114	0.14
115	0.13
116	0.13
117	0.1
118	0.1
119	0.11
120	0.12
121	0.13
122	0.12
123	0.11
124	0.1
125	0.11
126	0.13
127	0.11
128	0.11
129	0.1
130	0.11
131	0.11
132	0.11
133	0.11
134	0.1
135	0.13
136	0.12
137	0.13
138	0.14
139	0.17
140	0.18
141	0.17
142	0.18
143	0.18
144	0.17
145	0.17
146	0.15
147	0.14
148	0.14
149	0.15
150	0.15
151	0.14
152	0.16
153	0.19
154	0.19
155	0.18
156	0.19
157	0.18
158	0.2
159	0.19
160	0.16
161	0.14
162	0.14
163	0.18
164	0.21
165	0.21
166	0.2
167	0.29
168	0.39
169	0.43
170	0.42
171	0.4
172	0.42
173	0.41
174	0.41
175	0.38
176	0.32
177	0.31
178	0.33
179	0.33
180	0.3
181	0.3
182	0.29
183	0.25
184	0.26
185	0.27
186	0.27
187	0.26
188	0.24
189	0.28
190	0.27
191	0.29
192	0.25
193	0.22
194	0.24
195	0.28
196	0.28
197	0.25
198	0.25
199	0.22
200	0.22
201	0.21
202	0.14
203	0.11
204	0.1
205	0.09
206	0.09
207	0.08
208	0.07
209	0.07
210	0.06
211	0.05
212	0.06
213	0.07
214	0.1
215	0.11
216	0.13
217	0.13
218	0.16
219	0.16
220	0.17
221	0.16
222	0.14
223	0.18
224	0.16
225	0.17
226	0.16
227	0.17
228	0.16
229	0.18
230	0.2
231	0.2
232	0.26
233	0.26
234	0.28
235	0.29
236	0.29
237	0.29
238	0.28
239	0.26
240	0.19
241	0.2
242	0.2
243	0.19
244	0.19
245	0.18
246	0.16
247	0.14
248	0.13
249	0.14
250	0.14
251	0.13
252	0.12
253	0.12
254	0.12
255	0.12
256	0.13
257	0.14
258	0.16
259	0.16
260	0.15
261	0.19
262	0.2
263	0.26
264	0.3
265	0.28
266	0.24
267	0.27
268	0.28
269	0.3
270	0.29
271	0.24
272	0.25
273	0.27
274	0.29
275	0.27
276	0.26
277	0.21
278	0.21
279	0.22
280	0.18
281	0.16
282	0.13
283	0.14
284	0.14
285	0.15
286	0.2
287	0.21
288	0.25
289	0.28
290	0.29
291	0.3
292	0.35
293	0.41
294	0.41
295	0.42
296	0.39
297	0.38
298	0.37
299	0.34
300	0.29
301	0.23
302	0.18
303	0.16
304	0.14
305	0.11
306	0.1
307	0.12
308	0.12
309	0.1
310	0.12
311	0.14
312	0.15
313	0.16
314	0.2
315	0.25
316	0.27
317	0.27
318	0.28
319	0.26
320	0.3
321	0.38
322	0.41
323	0.39
324	0.43
325	0.51
326	0.54
327	0.62
328	0.59
329	0.58
330	0.61
331	0.67
332	0.7
333	0.65
334	0.63
335	0.62
336	0.69
337	0.65
338	0.58
339	0.53
340	0.46
341	0.44
342	0.41
343	0.34
344	0.26
345	0.25
346	0.21
347	0.16
348	0.16
349	0.14
350	0.19
351	0.23
352	0.25
353	0.3
354	0.33
355	0.42
356	0.46
357	0.53
358	0.59
359	0.62
360	0.67
361	0.69
362	0.76
363	0.77
364	0.8
365	0.83
366	0.82
367	0.82
368	0.81
369	0.74
370	0.69
371	0.67
372	0.58
373	0.52
374	0.47
375	0.39
376	0.34
377	0.36
378	0.31
379	0.25
380	0.28
381	0.25
382	0.22
383	0.23
384	0.21
385	0.16
386	0.18
387	0.18
388	0.15
389	0.16
390	0.16
391	0.14
392	0.13
393	0.13
394	0.13
395	0.13
396	0.13
397	0.15
398	0.16
399	0.21
400	0.28
401	0.3
402	0.32
403	0.35
404	0.38
405	0.38
406	0.42
407	0.4
408	0.42
409	0.44
410	0.43
411	0.47
412	0.49
413	0.47
414	0.41
415	0.39
416	0.3
417	0.25
418	0.25
419	0.19
420	0.2
421	0.2
422	0.21
423	0.2
424	0.2
425	0.18
426	0.17
427	0.15
428	0.08
429	0.07
430	0.05
431	0.05
432	0.06
433	0.06
434	0.06
435	0.06
436	0.05
437	0.08
438	0.08
439	0.1
440	0.13
441	0.18
442	0.2
443	0.23
444	0.28
445	0.28
446	0.36
447	0.44
448	0.49
449	0.48
450	0.51
451	0.49
452	0.51
453	0.55
454	0.5
455	0.46
456	0.46
457	0.46
458	0.45
459	0.48
460	0.45
461	0.42
462	0.49
463	0.51
464	0.48
465	0.48
466	0.45
467	0.43
468	0.42
469	0.43
470	0.38
471	0.32
472	0.27
473	0.31
474	0.34
475	0.33
476	0.3
477	0.27
478	0.25
479	0.29
480	0.34
481	0.31
482	0.32
483	0.35
484	0.38
485	0.41
486	0.38
487	0.33
488	0.29
489	0.25
490	0.21
491	0.2
492	0.21
493	0.17
494	0.18
495	0.18
496	0.2
497	0.22
498	0.22
499	0.22
500	0.22
501	0.22
502	0.3
503	0.31
504	0.28
505	0.27
506	0.25
507	0.21
508	0.17
509	0.16
510	0.07
511	0.05
512	0.06
513	0.06
514	0.07
515	0.09
516	0.15
517	0.22
518	0.3
519	0.39
520	0.44
521	0.47
522	0.52
523	0.59
524	0.6
525	0.63
526	0.58
527	0.51
528	0.45
529	0.42
530	0.37
531	0.27
532	0.2
533	0.1
534	0.08
535	0.07
536	0.07
537	0.07
538	0.07
539	0.08
540	0.08
541	0.09
542	0.09
543	0.09
544	0.09
545	0.08
546	0.08
547	0.08
548	0.1
549	0.1
550	0.08
551	0.07
552	0.07
553	0.08
554	0.07
555	0.12
556	0.12
557	0.19
558	0.24
559	0.27
560	0.27
561	0.29
562	0.31
563	0.26
564	0.26
565	0.2
566	0.16
567	0.14
568	0.13
569	0.1
570	0.09
571	0.08
572	0.08
573	0.06
574	0.04
575	0.05
576	0.05
577	0.05
578	0.05
579	0.05
580	0.05
581	0.05
582	0.05
583	0.04
584	0.04
585	0.05
586	0.05
587	0.05
588	0.05
589	0.05
590	0.05
591	0.07
592	0.07
593	0.06
594	0.06
595	0.07
596	0.08
597	0.09
598	0.1
599	0.08
600	0.1
601	0.11
602	0.11
603	0.11
604	0.11
605	0.13
606	0.12
607	0.11
608	0.1
609	0.1
610	0.1
611	0.13
612	0.15
613	0.14
614	0.14
615	0.15
616	0.14
617	0.14
618	0.14
619	0.12
620	0.1
621	0.09
622	0.09
623	0.09
624	0.09
625	0.11
626	0.11
627	0.1
628	0.1
629	0.1
630	0.09
631	0.09
632	0.09
633	0.07
634	0.06
635	0.05
636	0.04
637	0.04
638	0.04
639	0.04
640	0.05
641	0.06
642	0.06
643	0.07
644	0.07
645	0.08
646	0.1
647	0.13
648	0.17
649	0.21
650	0.25
651	0.29
652	0.33
653	0.36
654	0.42
655	0.47
656	0.45
657	0.43
658	0.42
659	0.38
660	0.36
661	0.34
662	0.28
663	0.21
664	0.19
665	0.18
666	0.19
667	0.21
668	0.24
669	0.24
670	0.23
671	0.21
672	0.21
673	0.19
674	0.16
675	0.18
676	0.17
677	0.15
678	0.15
679	0.15
680	0.16
681	0.16
682	0.19
683	0.23
684	0.31
685	0.34
686	0.34
687	0.33
688	0.33
689	0.32
690	0.29
691	0.2
692	0.14
693	0.11
694	0.1
695	0.11
696	0.11
697	0.11
698	0.13
699	0.13
700	0.1
701	0.1
702	0.11
703	0.19
704	0.22
705	0.25
706	0.27
707	0.29
708	0.29
709	0.36
710	0.35
711	0.3
712	0.32
713	0.36
714	0.35
715	0.34
716	0.33
717	0.27
718	0.27
719	0.27
720	0.29
721	0.26
722	0.25
723	0.25
724	0.27
725	0.27
726	0.27
727	0.25
728	0.21
729	0.17
730	0.19
731	0.2
732	0.22
733	0.24
734	0.28
735	0.29
736	0.31
737	0.35
738	0.33
739	0.33
740	0.33
741	0.31
742	0.28
743	0.31
744	0.27
745	0.25
746	0.24
747	0.23
748	0.23
749	0.31
750	0.34
751	0.33
752	0.4
753	0.43
754	0.47
755	0.5
756	0.47
757	0.41
758	0.42
759	0.48
760	0.45
761	0.41
762	0.35
763	0.33
764	0.33
765	0.32
766	0.26
767	0.16
768	0.12
769	0.11
770	0.11
771	0.13
772	0.13
773	0.13
774	0.17
775	0.19
776	0.2
777	0.25
778	0.28
779	0.28
780	0.31
781	0.37
782	0.42
783	0.42
784	0.43
785	0.45
786	0.45
787	0.43
788	0.36
789	0.31
790	0.24
791	0.21
792	0.22
793	0.17
794	0.16
795	0.17
796	0.21
797	0.25
798	0.25
799	0.24
800	0.22
801	0.2
802	0.18
803	0.17
804	0.15
805	0.1
806	0.1
807	0.11
808	0.1
809	0.12
810	0.13
811	0.13
812	0.11
813	0.11
814	0.11
815	0.09
816	0.17
817	0.2
818	0.25
819	0.26
820	0.29
821	0.3
822	0.35
823	0.44
824	0.45
825	0.51
826	0.55
827	0.6
828	0.59
829	0.58
830	0.53
831	0.44
832	0.37
833	0.27
834	0.17
835	0.1
836	0.08
837	0.08
838	0.07
839	0.08
840	0.06
841	0.06
842	0.07
843	0.09
844	0.11
845	0.11
846	0.16
847	0.22
848	0.27
849	0.31
850	0.4
851	0.49
852	0.51
853	0.51
854	0.49
855	0.45
856	0.42
857	0.4
858	0.31
859	0.23
860	0.19
861	0.19
862	0.19
863	0.16
864	0.15
865	0.15
866	0.15
867	0.14
868	0.15
869	0.14
870	0.16
871	0.18
872	0.18
873	0.2
874	0.19
875	0.19
876	0.2
877	0.21
878	0.19
879	0.2
880	0.22
881	0.22
882	0.23
883	0.23
884	0.2
885	0.19
886	0.19
887	0.17
888	0.14
889	0.1
890	0.09
891	0.1
892	0.1
893	0.1
894	0.09
895	0.09
896	0.1
897	0.09
898	0.1
899	0.12
900	0.15
901	0.15
902	0.14
903	0.15
904	0.15
905	0.15
906	0.14
907	0.12
908	0.11
909	0.12
910	0.12
911	0.1
912	0.12
913	0.14
914	0.14
915	0.13
916	0.11
917	0.1
918	0.1
919	0.12
920	0.1
921	0.09
922	0.09
923	0.09
924	0.1
925	0.11
926	0.11
927	0.11
928	0.15
929	0.15
930	0.23
931	0.26
932	0.37
933	0.44
934	0.46
935	0.47
936	0.47
937	0.47
938	0.49
939	0.56
940	0.56
941	0.56
942	0.61
943	0.6
944	0.57
945	0.56
946	0.53
947	0.49
948	0.43
949	0.36
950	0.39
951	0.43
952	0.44
953	0.47
954	0.46
955	0.44
956	0.45
957	0.47
958	0.43
959	0.4
960	0.39
961	0.36
962	0.31
963	0.29
964	0.3
965	0.28
966	0.25
967	0.22
968	0.22
969	0.22
970	0.23
971	0.27
972	0.22
973	0.19
974	0.2
975	0.25
976	0.26
977	0.25
978	0.27
979	0.22
980	0.21
981	0.21
982	0.19
983	0.16
984	0.21
985	0.22
986	0.18
987	0.17
988	0.19
989	0.2
990	0.21
991	0.18
992	0.13
993	0.12
994	0.13
995	0.13
996	0.13
997	0.14
998	0.16
999	0.16
1000	0.17
1001	0.19
1002	0.18
1003	0.21
1004	0.19
1005	0.18
1006	0.16
1007	0.16
1008	0.15
1009	0.17
1010	0.2
1011	0.19
1012	0.23
1013	0.23
1014	0.24
1015	0.25
1016	0.31
1017	0.27
1018	0.28
1019	0.28
1020	0.26
1021	0.26
1022	0.29
1023	0.31
1024	0.32
1025	0.35
1026	0.33
1027	0.3
1028	0.28
1029	0.3
1030	0.3
1031	0.3
1032	0.24
1033	0.21
1034	0.22
1035	0.24
1036	0.22
1037	0.2
1038	0.17
1039	0.14
1040	0.14
1041	0.12
1042	0.09
1043	0.08
1044	0.08
1045	0.08
1046	0.09
1047	0.11
1048	0.11
1049	0.13
1050	0.13
1051	0.13
1052	0.12
1053	0.14
1054	0.16
1055	0.14
1056	0.15
1057	0.15
1058	0.15
1059	0.15
1060	0.15
1061	0.14
1062	0.11
1063	0.14
1064	0.13
1065	0.13
1066	0.17
1067	0.17
1068	0.18
1069	0.23
1070	0.24
1071	0.24
1072	0.24
1073	0.23
1074	0.22
1075	0.22
1076	0.22
1077	0.16
1078	0.18
1079	0.15
1080	0.15
1081	0.14
1082	0.17
1083	0.17
1084	0.22
1085	0.23
1086	0.2
1087	0.22
1088	0.24
1089	0.26
1090	0.22
1091	0.2
1092	0.17
1093	0.22
1094	0.24
1095	0.23
1096	0.27
1097	0.33
1098	0.4
1099	0.49
1100	0.49
1101	0.48
1102	0.52
1103	0.52
1104	0.53
1105	0.53
1106	0.49
1107	0.46
1108	0.47
1109	0.43
1110	0.42
1111	0.42
1112	0.37
1113	0.29
1114	0.29
1115	0.25
1116	0.22
1117	0.23
1118	0.18
1119	0.18
1120	0.2
1121	0.19
1122	0.16
1123	0.15
1124	0.15
1125	0.16
1126	0.15
1127	0.14
1128	0.11
1129	0.11
1130	0.11
1131	0.13
1132	0.16
1133	0.15
1134	0.17
1135	0.2
1136	0.22

A0A1Q3ETH0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer