FuNGI

A0A1Q3EHB5

Protein Details

Accession

A0A1Q3EHB5

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
514-543	DPESKKARKAAVKARQAERRADKKATKQIF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
277-283	KGKRRHK
516-539	ESKKARKAAVKARQAERRADKKAT

Subcellular Location(s)

nucl 21, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPPKSIFRQPGARHFQVVHRSQRDPLIHDPDVSQHVLKEIARQSDKKGKSRADLEATLDHAEIARDAEARVGEAATYGIYYNDTEYDYMQHLRPVGVQEAGVESVLIEAPSTKKLNKKAEGSKTKPGILLRDLPQEVLPSTSELPRTYESQQDIPQSISGFQPDMDPHLRQTLEALEDDAFVDDDLADDFFGVLIEGGARDSDEGVEFEFYEHGPPEDRQNVLPEKEPDTWEERFAQFKAARKASPLSSTSDDEHDFASEGGDTVSGLPAISVIGGKGKRRHKGGSDASGYSMSSSSMYRNEALQTLDERFDQVMLKQYNDEEEDEDDEASFLSDEDNDEAPQLITSREDFGSMMDEFLNDYEILGRKMKPKLDGDTGAEKLDTLRRAMGQDERIRGSLADAEDRDNDDDNEFLRIDEEKKDRWDCETILTTYSNLENHPRLIRVRHSKPVPKICLDPKTGLPSVIDATSKPASKHTSKIKKDFDSFANESDDSPYEDTSPQLSEKVTRPRNEDPESKKARKAAVKARQAERRADKKATKQIFGKELSHFILM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.57
2	0.58
3	0.58
4	0.59
5	0.59
6	0.56
7	0.56
8	0.56
9	0.61
10	0.58
11	0.53
12	0.54
13	0.52
14	0.48
15	0.46
16	0.44
17	0.4
18	0.4
19	0.37
20	0.29
21	0.2
22	0.21
23	0.23
24	0.22
25	0.26
26	0.27
27	0.34
28	0.4
29	0.42
30	0.48
31	0.54
32	0.61
33	0.62
34	0.65
35	0.62
36	0.63
37	0.67
38	0.67
39	0.64
40	0.59
41	0.55
42	0.49
43	0.46
44	0.39
45	0.33
46	0.25
47	0.18
48	0.16
49	0.12
50	0.1
51	0.09
52	0.09
53	0.09
54	0.11
55	0.1
56	0.11
57	0.11
58	0.1
59	0.08
60	0.08
61	0.08
62	0.06
63	0.06
64	0.06
65	0.05
66	0.06
67	0.07
68	0.08
69	0.09
70	0.1
71	0.1
72	0.1
73	0.13
74	0.15
75	0.17
76	0.17
77	0.18
78	0.18
79	0.18
80	0.19
81	0.2
82	0.19
83	0.17
84	0.16
85	0.14
86	0.15
87	0.15
88	0.12
89	0.09
90	0.07
91	0.07
92	0.07
93	0.06
94	0.05
95	0.06
96	0.07
97	0.12
98	0.15
99	0.18
100	0.25
101	0.34
102	0.44
103	0.49
104	0.57
105	0.62
106	0.7
107	0.77
108	0.76
109	0.77
110	0.71
111	0.67
112	0.61
113	0.53
114	0.47
115	0.41
116	0.41
117	0.35
118	0.39
119	0.37
120	0.34
121	0.33
122	0.29
123	0.26
124	0.2
125	0.17
126	0.12
127	0.13
128	0.15
129	0.17
130	0.16
131	0.19
132	0.19
133	0.22
134	0.22
135	0.26
136	0.27
137	0.29
138	0.32
139	0.32
140	0.31
141	0.28
142	0.28
143	0.23
144	0.21
145	0.17
146	0.15
147	0.12
148	0.11
149	0.12
150	0.11
151	0.15
152	0.17
153	0.17
154	0.17
155	0.21
156	0.21
157	0.18
158	0.19
159	0.17
160	0.15
161	0.15
162	0.15
163	0.11
164	0.11
165	0.11
166	0.1
167	0.08
168	0.06
169	0.06
170	0.04
171	0.04
172	0.04
173	0.04
174	0.04
175	0.04
176	0.04
177	0.03
178	0.03
179	0.03
180	0.03
181	0.03
182	0.03
183	0.03
184	0.03
185	0.03
186	0.03
187	0.03
188	0.04
189	0.04
190	0.05
191	0.05
192	0.05
193	0.06
194	0.06
195	0.06
196	0.07
197	0.06
198	0.07
199	0.07
200	0.07
201	0.09
202	0.09
203	0.14
204	0.16
205	0.17
206	0.17
207	0.22
208	0.25
209	0.24
210	0.28
211	0.25
212	0.27
213	0.28
214	0.28
215	0.25
216	0.27
217	0.26
218	0.24
219	0.25
220	0.21
221	0.21
222	0.21
223	0.25
224	0.23
225	0.28
226	0.33
227	0.33
228	0.32
229	0.32
230	0.35
231	0.3
232	0.32
233	0.27
234	0.24
235	0.24
236	0.25
237	0.24
238	0.24
239	0.23
240	0.19
241	0.18
242	0.14
243	0.11
244	0.09
245	0.08
246	0.06
247	0.05
248	0.04
249	0.04
250	0.04
251	0.04
252	0.04
253	0.03
254	0.03
255	0.03
256	0.03
257	0.03
258	0.03
259	0.03
260	0.03
261	0.07
262	0.08
263	0.11
264	0.19
265	0.25
266	0.29
267	0.33
268	0.36
269	0.36
270	0.44
271	0.47
272	0.47
273	0.44
274	0.4
275	0.37
276	0.34
277	0.31
278	0.22
279	0.16
280	0.09
281	0.07
282	0.07
283	0.07
284	0.08
285	0.1
286	0.1
287	0.11
288	0.11
289	0.12
290	0.12
291	0.12
292	0.12
293	0.12
294	0.12
295	0.11
296	0.11
297	0.1
298	0.1
299	0.1
300	0.09
301	0.15
302	0.15
303	0.16
304	0.15
305	0.15
306	0.16
307	0.17
308	0.17
309	0.11
310	0.11
311	0.12
312	0.12
313	0.12
314	0.1
315	0.08
316	0.08
317	0.06
318	0.05
319	0.04
320	0.03
321	0.04
322	0.04
323	0.07
324	0.07
325	0.07
326	0.07
327	0.08
328	0.08
329	0.08
330	0.08
331	0.06
332	0.06
333	0.07
334	0.09
335	0.09
336	0.1
337	0.09
338	0.09
339	0.12
340	0.11
341	0.11
342	0.08
343	0.08
344	0.08
345	0.08
346	0.09
347	0.05
348	0.05
349	0.07
350	0.09
351	0.1
352	0.13
353	0.15
354	0.19
355	0.24
356	0.27
357	0.3
358	0.33
359	0.36
360	0.39
361	0.4
362	0.39
363	0.4
364	0.38
365	0.33
366	0.29
367	0.24
368	0.2
369	0.21
370	0.18
371	0.13
372	0.14
373	0.15
374	0.16
375	0.18
376	0.22
377	0.25
378	0.29
379	0.32
380	0.32
381	0.32
382	0.31
383	0.29
384	0.24
385	0.21
386	0.16
387	0.17
388	0.15
389	0.17
390	0.18
391	0.2
392	0.2
393	0.18
394	0.17
395	0.14
396	0.14
397	0.13
398	0.14
399	0.12
400	0.1
401	0.1
402	0.11
403	0.12
404	0.19
405	0.22
406	0.23
407	0.3
408	0.34
409	0.34
410	0.37
411	0.39
412	0.33
413	0.34
414	0.36
415	0.3
416	0.28
417	0.28
418	0.24
419	0.21
420	0.22
421	0.17
422	0.14
423	0.19
424	0.19
425	0.22
426	0.24
427	0.25
428	0.27
429	0.31
430	0.39
431	0.44
432	0.48
433	0.54
434	0.6
435	0.66
436	0.72
437	0.78
438	0.74
439	0.68
440	0.69
441	0.68
442	0.66
443	0.62
444	0.56
445	0.5
446	0.51
447	0.48
448	0.41
449	0.34
450	0.28
451	0.26
452	0.24
453	0.2
454	0.13
455	0.18
456	0.21
457	0.23
458	0.22
459	0.25
460	0.3
461	0.34
462	0.42
463	0.48
464	0.54
465	0.61
466	0.7
467	0.74
468	0.75
469	0.76
470	0.73
471	0.67
472	0.65
473	0.59
474	0.52
475	0.47
476	0.4
477	0.35
478	0.33
479	0.3
480	0.23
481	0.22
482	0.2
483	0.17
484	0.18
485	0.18
486	0.17
487	0.18
488	0.16
489	0.17
490	0.17
491	0.2
492	0.27
493	0.37
494	0.43
495	0.46
496	0.52
497	0.59
498	0.67
499	0.69
500	0.71
501	0.68
502	0.71
503	0.76
504	0.74
505	0.7
506	0.66
507	0.68
508	0.67
509	0.69
510	0.69
511	0.69
512	0.73
513	0.77
514	0.8
515	0.81
516	0.77
517	0.78
518	0.77
519	0.76
520	0.74
521	0.74
522	0.73
523	0.74
524	0.81
525	0.77
526	0.75
527	0.72
528	0.72
529	0.71
530	0.68
531	0.62
532	0.55
533	0.53

A0A1Q3EHB5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer