FuNGI

A0A1Q3ED09

Protein Details

Accession

A0A1Q3ED09

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
124-145	FETFAATKKRYKPVERRTQPVP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cysk 9, cyto 8, nucl 6, cyto_pero 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR041588 Integrase_H2C2 IPR043128 Rev_trsase/Diguanyl_cyclase IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR041577 RT_RNaseH_2
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF17921 Integrase_H2C2 PF17919 RT_RNaseH_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE
CDD	cd01647 RT_LTR

Amino Acid Sequences

MEFEELQEGKEAAFIVELNTAELSADSSDFRGHVSIPLISASLGDSPGIDKINLAFIHAYAYFTYDAPTFESFTLCSAISAAEPAHPASPIHLNKSQTLLQQKLHSSPPKNCTQEISNKNIFTFETFAATKKRYKPVERRTQPVPATLPEKFRVVRHFPSDPLEHLPTLNPTPPPFVPTGRYTQERKEFIDSVHDREFLWPQEMDAIHHLMMLHEKAFAWCEEEKGQLKAEYFPPVEMPVIEHTPWRVPTLPIPPGLTDRIVDIVREKIRTGVYEPSNSSYRTRWFAVVKKDGSSLRLVHDLQPLNAVTVRDSSIPPVLEHLAEAYACRSVLATLDMYVGYDERMLAIPSRDYTTFQTPLGALRLTSIPMGWTNSLQIFHGDVTFILQPEIPEYTLPYVDDVNVRGPATRYELADGGYETIPENPGIRRFIWEHLNTLNRILTRMEYAGGTFSGMKTLLAVAEALITGHRCSYEGRIPDPTRLEKVVNWGPLQKLTDVRAFLGTVGVCRIFIDRFAEKAEPLVRLTRKDIPFQFGAEEAQSQKLLKDALVESPAIRPLDYSNGAPIVLSVDSCNIAIGYILMQLSTRDPSIRYINRFGSITLNEREARYSQAKLELYGLFRALRATRLWTVGAQHFVVEVDALYIRGMINNPDIQPNAAVNRWIAGILLFSFTMVHVPSERIAADGPSRRTRQPDDTPEDEDDFEDWIDHANGFMHFINDSPSLSSTLNALAALPIFAVEPIASAGEAEFVPYSVVPRSHRALSIDNRLESVRSYLQDLQRPGGLSDNQYHQFIKYCLQFFVDSSGRLWRKDPQGSHRLVIPQHRRLPIIKEAHDNMGHKGVWATTTTIRTRFWWPRQAEDVKWYVRTCHLCQLRQTEKLRIPPVVTEPMGLFAKCYMDVMEMPKSGGYKYIVHGRCSSSAYPEFRKLRRQTGEAIANWIFEEILCRWGALRVIVTDNGTPFVLALDILAKRYGIRHITISPYNSQAAGVIERKHYDVRESLVKAAKGDASSWSPTAHSVYWAERVTARRSTGASPYFLSHGCHPLLPLDIEEATYLLPPPDSVLSTEDLLARRARELQKRTEDLEDMRKHVHQNRLDGIHRFEQKHLQSIKNYDFKLGDLVIARNTRVEKTFSAKNRMRYMGPLIVIRRNRGGAYIVAELDGTVWRTPVGAFRVIPYLARSTLPLPNLTEFLDISTKELAELEASDANGGVDEEILIPE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.1
2	0.09
3	0.12
4	0.12
5	0.12
6	0.11
7	0.11
8	0.1
9	0.1
10	0.1
11	0.08
12	0.09
13	0.09
14	0.1
15	0.11
16	0.11
17	0.12
18	0.12
19	0.12
20	0.14
21	0.16
22	0.16
23	0.16
24	0.16
25	0.15
26	0.14
27	0.13
28	0.11
29	0.1
30	0.1
31	0.09
32	0.08
33	0.09
34	0.12
35	0.13
36	0.12
37	0.11
38	0.11
39	0.18
40	0.18
41	0.19
42	0.17
43	0.15
44	0.19
45	0.19
46	0.19
47	0.12
48	0.15
49	0.14
50	0.14
51	0.16
52	0.13
53	0.13
54	0.15
55	0.17
56	0.17
57	0.16
58	0.17
59	0.16
60	0.16
61	0.17
62	0.14
63	0.13
64	0.11
65	0.11
66	0.1
67	0.11
68	0.1
69	0.1
70	0.11
71	0.12
72	0.13
73	0.13
74	0.13
75	0.15
76	0.24
77	0.25
78	0.3
79	0.34
80	0.36
81	0.37
82	0.42
83	0.43
84	0.39
85	0.44
86	0.43
87	0.42
88	0.46
89	0.47
90	0.47
91	0.52
92	0.54
93	0.53
94	0.57
95	0.59
96	0.62
97	0.63
98	0.6
99	0.57
100	0.55
101	0.59
102	0.57
103	0.59
104	0.56
105	0.53
106	0.51
107	0.48
108	0.41
109	0.33
110	0.3
111	0.22
112	0.21
113	0.2
114	0.23
115	0.28
116	0.3
117	0.35
118	0.39
119	0.48
120	0.52
121	0.62
122	0.7
123	0.75
124	0.83
125	0.83
126	0.81
127	0.77
128	0.77
129	0.69
130	0.64
131	0.57
132	0.5
133	0.49
134	0.46
135	0.46
136	0.39
137	0.42
138	0.37
139	0.38
140	0.41
141	0.43
142	0.46
143	0.47
144	0.48
145	0.46
146	0.5
147	0.48
148	0.43
149	0.42
150	0.39
151	0.32
152	0.3
153	0.29
154	0.28
155	0.28
156	0.29
157	0.25
158	0.23
159	0.28
160	0.28
161	0.3
162	0.28
163	0.28
164	0.28
165	0.29
166	0.35
167	0.35
168	0.41
169	0.41
170	0.47
171	0.53
172	0.53
173	0.53
174	0.52
175	0.48
176	0.43
177	0.5
178	0.44
179	0.41
180	0.41
181	0.38
182	0.32
183	0.32
184	0.35
185	0.27
186	0.28
187	0.21
188	0.18
189	0.23
190	0.22
191	0.21
192	0.21
193	0.21
194	0.17
195	0.18
196	0.17
197	0.13
198	0.15
199	0.15
200	0.12
201	0.11
202	0.11
203	0.11
204	0.13
205	0.12
206	0.13
207	0.13
208	0.15
209	0.16
210	0.22
211	0.24
212	0.24
213	0.26
214	0.25
215	0.25
216	0.26
217	0.27
218	0.28
219	0.26
220	0.25
221	0.24
222	0.23
223	0.22
224	0.18
225	0.18
226	0.15
227	0.17
228	0.17
229	0.17
230	0.17
231	0.21
232	0.22
233	0.23
234	0.21
235	0.2
236	0.25
237	0.32
238	0.33
239	0.32
240	0.32
241	0.3
242	0.32
243	0.32
244	0.27
245	0.2
246	0.17
247	0.18
248	0.17
249	0.16
250	0.14
251	0.2
252	0.22
253	0.23
254	0.22
255	0.22
256	0.23
257	0.24
258	0.25
259	0.27
260	0.27
261	0.3
262	0.32
263	0.33
264	0.34
265	0.34
266	0.34
267	0.29
268	0.3
269	0.3
270	0.3
271	0.31
272	0.34
273	0.39
274	0.45
275	0.5
276	0.47
277	0.44
278	0.46
279	0.43
280	0.39
281	0.36
282	0.29
283	0.23
284	0.27
285	0.26
286	0.26
287	0.32
288	0.31
289	0.27
290	0.29
291	0.26
292	0.22
293	0.23
294	0.2
295	0.14
296	0.14
297	0.15
298	0.13
299	0.14
300	0.14
301	0.15
302	0.16
303	0.15
304	0.16
305	0.16
306	0.14
307	0.14
308	0.12
309	0.1
310	0.09
311	0.09
312	0.07
313	0.07
314	0.07
315	0.07
316	0.06
317	0.06
318	0.06
319	0.08
320	0.07
321	0.07
322	0.08
323	0.08
324	0.08
325	0.08
326	0.07
327	0.06
328	0.06
329	0.05
330	0.05
331	0.06
332	0.06
333	0.07
334	0.08
335	0.09
336	0.11
337	0.14
338	0.13
339	0.15
340	0.19
341	0.23
342	0.24
343	0.23
344	0.23
345	0.2
346	0.21
347	0.21
348	0.17
349	0.11
350	0.11
351	0.12
352	0.11
353	0.11
354	0.09
355	0.08
356	0.09
357	0.11
358	0.1
359	0.1
360	0.11
361	0.13
362	0.13
363	0.12
364	0.12
365	0.11
366	0.1
367	0.1
368	0.08
369	0.07
370	0.09
371	0.09
372	0.09
373	0.08
374	0.08
375	0.08
376	0.09
377	0.1
378	0.08
379	0.08
380	0.09
381	0.1
382	0.1
383	0.1
384	0.1
385	0.09
386	0.09
387	0.11
388	0.1
389	0.11
390	0.12
391	0.12
392	0.12
393	0.12
394	0.13
395	0.18
396	0.18
397	0.17
398	0.17
399	0.17
400	0.17
401	0.17
402	0.16
403	0.12
404	0.11
405	0.1
406	0.09
407	0.09
408	0.09
409	0.09
410	0.1
411	0.09
412	0.12
413	0.14
414	0.14
415	0.17
416	0.18
417	0.21
418	0.28
419	0.27
420	0.26
421	0.29
422	0.32
423	0.29
424	0.28
425	0.27
426	0.19
427	0.2
428	0.18
429	0.14
430	0.12
431	0.12
432	0.12
433	0.09
434	0.09
435	0.09
436	0.08
437	0.08
438	0.07
439	0.06
440	0.06
441	0.06
442	0.06
443	0.05
444	0.06
445	0.05
446	0.05
447	0.05
448	0.04
449	0.04
450	0.04
451	0.04
452	0.04
453	0.04
454	0.04
455	0.05
456	0.05
457	0.05
458	0.07
459	0.11
460	0.16
461	0.18
462	0.2
463	0.28
464	0.29
465	0.32
466	0.35
467	0.33
468	0.31
469	0.3
470	0.3
471	0.22
472	0.28
473	0.28
474	0.27
475	0.26
476	0.25
477	0.24
478	0.25
479	0.26
480	0.2
481	0.18
482	0.18
483	0.2
484	0.18
485	0.18
486	0.16
487	0.15
488	0.14
489	0.13
490	0.1
491	0.07
492	0.08
493	0.07
494	0.06
495	0.07
496	0.08
497	0.06
498	0.07
499	0.11
500	0.11
501	0.12
502	0.14
503	0.14
504	0.13
505	0.16
506	0.17
507	0.14
508	0.14
509	0.19
510	0.19
511	0.2
512	0.24
513	0.3
514	0.3
515	0.35
516	0.35
517	0.33
518	0.32
519	0.31
520	0.28
521	0.2
522	0.19
523	0.13
524	0.13
525	0.09
526	0.09
527	0.09
528	0.09
529	0.08
530	0.09
531	0.09
532	0.07
533	0.09
534	0.09
535	0.1
536	0.11
537	0.11
538	0.11
539	0.11
540	0.14
541	0.11
542	0.1
543	0.09
544	0.09
545	0.13
546	0.14
547	0.13
548	0.11
549	0.11
550	0.11
551	0.11
552	0.1
553	0.07
554	0.06
555	0.05
556	0.05
557	0.05
558	0.06
559	0.06
560	0.06
561	0.04
562	0.04
563	0.04
564	0.04
565	0.03
566	0.04
567	0.04
568	0.04
569	0.04
570	0.05
571	0.05
572	0.06
573	0.06
574	0.06
575	0.07
576	0.1
577	0.17
578	0.21
579	0.24
580	0.27
581	0.28
582	0.29
583	0.29
584	0.27
585	0.22
586	0.2
587	0.2
588	0.17
589	0.19
590	0.18
591	0.18
592	0.18
593	0.16
594	0.18
595	0.17
596	0.17
597	0.15
598	0.19
599	0.19
600	0.18
601	0.2
602	0.18
603	0.17
604	0.16
605	0.16
606	0.11
607	0.11
608	0.11
609	0.09
610	0.09
611	0.09
612	0.11
613	0.12
614	0.13
615	0.14
616	0.13
617	0.15
618	0.15
619	0.16
620	0.13
621	0.11
622	0.1
623	0.1
624	0.09
625	0.06
626	0.05
627	0.04
628	0.04
629	0.04
630	0.03
631	0.04
632	0.04
633	0.04
634	0.05
635	0.05
636	0.07
637	0.09
638	0.1
639	0.11
640	0.11
641	0.11
642	0.11
643	0.11
644	0.11
645	0.09
646	0.09
647	0.08
648	0.08
649	0.08
650	0.07
651	0.06
652	0.05
653	0.05
654	0.04
655	0.05
656	0.04
657	0.04
658	0.04
659	0.04
660	0.05
661	0.05
662	0.05
663	0.05
664	0.06
665	0.06
666	0.07
667	0.07
668	0.07
669	0.07
670	0.08
671	0.11
672	0.15
673	0.19
674	0.24
675	0.27
676	0.28
677	0.32
678	0.36
679	0.4
680	0.43
681	0.48
682	0.49
683	0.49
684	0.51
685	0.48
686	0.45
687	0.37
688	0.29
689	0.21
690	0.15
691	0.12
692	0.08
693	0.06
694	0.06
695	0.06
696	0.06
697	0.05
698	0.06
699	0.06
700	0.07
701	0.08
702	0.07
703	0.07
704	0.07
705	0.1
706	0.1
707	0.1
708	0.09
709	0.09
710	0.11
711	0.11
712	0.11
713	0.09
714	0.09
715	0.09
716	0.08
717	0.07
718	0.05
719	0.05
720	0.05
721	0.04
722	0.03
723	0.03
724	0.03
725	0.03
726	0.03
727	0.03
728	0.03
729	0.04
730	0.03
731	0.03
732	0.03
733	0.04
734	0.04
735	0.05
736	0.04
737	0.04
738	0.05
739	0.05
740	0.06
741	0.07
742	0.1
743	0.11
744	0.15
745	0.18
746	0.19
747	0.21
748	0.22
749	0.27
750	0.3
751	0.37
752	0.37
753	0.34
754	0.33
755	0.32
756	0.3
757	0.24
758	0.22
759	0.16
760	0.13
761	0.16
762	0.21
763	0.25
764	0.29
765	0.3
766	0.28
767	0.27
768	0.27
769	0.24
770	0.22
771	0.19
772	0.16
773	0.18
774	0.22
775	0.22
776	0.23
777	0.23
778	0.19
779	0.21
780	0.2
781	0.21
782	0.21
783	0.21
784	0.2
785	0.22
786	0.22
787	0.19
788	0.24
789	0.21
790	0.17
791	0.16
792	0.24
793	0.24
794	0.24
795	0.26
796	0.26
797	0.32
798	0.38
799	0.42
800	0.42
801	0.49
802	0.51
803	0.5
804	0.46
805	0.43
806	0.39
807	0.44
808	0.44
809	0.44
810	0.48
811	0.5
812	0.49
813	0.47
814	0.49
815	0.48
816	0.47
817	0.41
818	0.4
819	0.4
820	0.42
821	0.43
822	0.39
823	0.32
824	0.29
825	0.26
826	0.21
827	0.19
828	0.15
829	0.13
830	0.13
831	0.14
832	0.13
833	0.18
834	0.2
835	0.22
836	0.23
837	0.25
838	0.32
839	0.39
840	0.42
841	0.46
842	0.46
843	0.49
844	0.57
845	0.58
846	0.51
847	0.47
848	0.46
849	0.39
850	0.41
851	0.36
852	0.29
853	0.31
854	0.35
855	0.33
856	0.36
857	0.41
858	0.4
859	0.45
860	0.52
861	0.52
862	0.54
863	0.55
864	0.54
865	0.52
866	0.57
867	0.55
868	0.48
869	0.43
870	0.37
871	0.38
872	0.35
873	0.31
874	0.24
875	0.21
876	0.23
877	0.23
878	0.2
879	0.15
880	0.11
881	0.12
882	0.11
883	0.11
884	0.08
885	0.09
886	0.1
887	0.13
888	0.16
889	0.15
890	0.15
891	0.16
892	0.16
893	0.14
894	0.16
895	0.15
896	0.14
897	0.16
898	0.26
899	0.28
900	0.3
901	0.33
902	0.33
903	0.33
904	0.35
905	0.33
906	0.3
907	0.33
908	0.35
909	0.37
910	0.43
911	0.47
912	0.47
913	0.56
914	0.55
915	0.59
916	0.6
917	0.58
918	0.54
919	0.56
920	0.59
921	0.49
922	0.5
923	0.4
924	0.35
925	0.32
926	0.26
927	0.18
928	0.11
929	0.13
930	0.08
931	0.11
932	0.1
933	0.1
934	0.11
935	0.12
936	0.13
937	0.11
938	0.12
939	0.11
940	0.13
941	0.15
942	0.16
943	0.16
944	0.15
945	0.15
946	0.14
947	0.12
948	0.1
949	0.09
950	0.07
951	0.05
952	0.05
953	0.08
954	0.08
955	0.09
956	0.1
957	0.09
958	0.1
959	0.12
960	0.17
961	0.16
962	0.18
963	0.2
964	0.23
965	0.29
966	0.32
967	0.34
968	0.31
969	0.31
970	0.3
971	0.26
972	0.24
973	0.19
974	0.16
975	0.18
976	0.19
977	0.18
978	0.2
979	0.21
980	0.24
981	0.26
982	0.25
983	0.24
984	0.23
985	0.25
986	0.31
987	0.31
988	0.35
989	0.37
990	0.37
991	0.33
992	0.33
993	0.31
994	0.23
995	0.22
996	0.21
997	0.19
998	0.21
999	0.21
1000	0.2
1001	0.18
1002	0.18
1003	0.21
1004	0.18
1005	0.17
1006	0.17
1007	0.19
1008	0.24
1009	0.24
1010	0.24
1011	0.25
1012	0.29
1013	0.31
1014	0.33
1015	0.33
1016	0.29
1017	0.31
1018	0.33
1019	0.36
1020	0.36
1021	0.33
1022	0.3
1023	0.29
1024	0.29
1025	0.28
1026	0.28
1027	0.23
1028	0.24
1029	0.23
1030	0.22
1031	0.21
1032	0.2
1033	0.21
1034	0.19
1035	0.16
1036	0.14
1037	0.13
1038	0.13
1039	0.13
1040	0.11
1041	0.09
1042	0.09
1043	0.09
1044	0.07
1045	0.07
1046	0.06
1047	0.08
1048	0.1
1049	0.1
1050	0.11
1051	0.13
1052	0.15
1053	0.15
1054	0.17
1055	0.18
1056	0.17
1057	0.19
1058	0.2
1059	0.18
1060	0.18
1061	0.26
1062	0.33
1063	0.39
1064	0.44
1065	0.52
1066	0.59
1067	0.62
1068	0.63
1069	0.6
1070	0.55
1071	0.51
1072	0.55
1073	0.49
1074	0.43
1075	0.42
1076	0.42
1077	0.45
1078	0.49
1079	0.53
1080	0.48
1081	0.51
1082	0.54
1083	0.58
1084	0.59
1085	0.56
1086	0.54
1087	0.53
1088	0.55
1089	0.51
1090	0.47
1091	0.5
1092	0.48
1093	0.53
1094	0.53
1095	0.51
1096	0.49
1097	0.55
1098	0.6
1099	0.58
1100	0.56
1101	0.51
1102	0.46
1103	0.41
1104	0.39
1105	0.31
1106	0.25
1107	0.2
1108	0.21
1109	0.23
1110	0.24
1111	0.24
1112	0.24
1113	0.25
1114	0.26
1115	0.26
1116	0.29
1117	0.27
1118	0.31
1119	0.39
1120	0.43
1121	0.51
1122	0.53
1123	0.59
1124	0.63
1125	0.64
1126	0.6
1127	0.56
1128	0.55
1129	0.51
1130	0.48
1131	0.45
1132	0.41
1133	0.45
1134	0.47
1135	0.46
1136	0.43
1137	0.4
1138	0.37
1139	0.34
1140	0.32
1141	0.26
1142	0.27
1143	0.26
1144	0.22
1145	0.2
1146	0.19
1147	0.17
1148	0.15
1149	0.14
1150	0.12
1151	0.09
1152	0.09
1153	0.09
1154	0.1
1155	0.11
1156	0.16
1157	0.18
1158	0.2
1159	0.21
1160	0.22
1161	0.27
1162	0.27
1163	0.28
1164	0.25
1165	0.25
1166	0.22
1167	0.22
1168	0.23
1169	0.22
1170	0.27
1171	0.28
1172	0.28
1173	0.28
1174	0.28
1175	0.29
1176	0.28
1177	0.26
1178	0.21
1179	0.22
1180	0.22
1181	0.19
1182	0.19
1183	0.2
1184	0.18
1185	0.17
1186	0.17
1187	0.14
1188	0.11
1189	0.12
1190	0.13
1191	0.13
1192	0.13
1193	0.13
1194	0.12
1195	0.12
1196	0.11
1197	0.1
1198	0.07
1199	0.05
1200	0.06

A0A1Q3ED09

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer