Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C4F617

Protein Details
Accession A0A0C4F617    Localization Confidence High Confidence Score 22.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
234-258ETTLQPSTDKKKSRKRPLNSGEKEAHydrophilic
416-460AGTLAPAKKPPKKPKKQADLTPEEAEEKRKKQAEQRKIQKERKLAHydrophilic
750-773QAQQQQQHPHQHQHQHQHQQQQKQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
243-261KKKSRKRPLNSGEKEAMRR
397-409KKAASKKKTVERS
413-459SPAAGTLAPAKKPPKKPKKQADLTPEEAEEKRKKQAEQRKIQKERKL
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 11.5, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MFRQAGVYNLTRTIRSMLKRYRKEPPSLTMHLYSAGFRLGTKDSNLHAYDGEMKHWMDCIREQKMPNELLDVLDELGIRFYDGCLIVEVHDHRSAQQSSEQTQPTTDQHQSTGTNPQQPPGSAAAHQRPSSSHHHQNNNTSSTSTDLPNDQVSVHRLVLTPTCETLWRDILLMNEAKVTQLNRGSKSSSEFKWGPITEEEAVELEAAILDRTTPALCLSPSIITSRIANQMLSETTLQPSTDKKKSRKRPLNSGEKEAMRRQRERQERYMHIADEGYDQAFAPTLTLKIPKSTEIRFSRIDLIKRLRTTRPVTAAPKEPERKWNRRDLQQEQFKGFIPTTVSPSDLYLPGYPVHESKTESHQVPFPVGGSSGQMPSHSGRAPTPPLASADLPAPVSKKAASKKKTVERSETGSPAAGTLAPAKKPPKKPKKQADLTPEEAEEKRKKQAEQRKIQKERKLALAAAAKAEAAQKTAAAAHSHNTSINNNNVSTPSNVESSSAAAPTASENSILVPNRDHPVIQSTEYQHHQHGDISINVPDSIPVVTGDSIPVPNQFTSNNSNNSIPVPNLSNLSSRTSPATNNGIPVHRELSTNNSSIPVPAFSHSIPVPSPNHHNSIPVHQGIPVTTELLPMSATDSIHVPSPGTDINCIPVSNLVHHQTIDQHASIPVPQPQPQLWNPVFANFRAPPHPNHLHQRPQDIDIDVHLRASQPPAIPSLASIDVPHISIHPHSLHQPLLSQQEQQQYHQQQQAQQQQQHPHQHQHQHQHQQQQKQAFNNWSN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.35
3 0.42
4 0.48
5 0.57
6 0.65
7 0.69
8 0.76
9 0.76
10 0.79
11 0.75
12 0.73
13 0.71
14 0.67
15 0.67
16 0.59
17 0.52
18 0.46
19 0.4
20 0.33
21 0.25
22 0.22
23 0.16
24 0.14
25 0.16
26 0.16
27 0.18
28 0.2
29 0.23
30 0.23
31 0.3
32 0.31
33 0.29
34 0.26
35 0.25
36 0.31
37 0.28
38 0.28
39 0.24
40 0.24
41 0.23
42 0.26
43 0.25
44 0.19
45 0.25
46 0.32
47 0.34
48 0.39
49 0.41
50 0.43
51 0.49
52 0.49
53 0.43
54 0.38
55 0.33
56 0.28
57 0.27
58 0.23
59 0.15
60 0.14
61 0.13
62 0.09
63 0.1
64 0.09
65 0.08
66 0.07
67 0.07
68 0.1
69 0.1
70 0.11
71 0.11
72 0.12
73 0.12
74 0.17
75 0.19
76 0.19
77 0.22
78 0.21
79 0.21
80 0.28
81 0.29
82 0.26
83 0.3
84 0.3
85 0.31
86 0.38
87 0.39
88 0.32
89 0.33
90 0.34
91 0.31
92 0.33
93 0.35
94 0.29
95 0.28
96 0.31
97 0.31
98 0.3
99 0.37
100 0.35
101 0.4
102 0.38
103 0.4
104 0.39
105 0.38
106 0.39
107 0.33
108 0.3
109 0.24
110 0.32
111 0.36
112 0.4
113 0.4
114 0.37
115 0.35
116 0.38
117 0.43
118 0.44
119 0.46
120 0.49
121 0.58
122 0.63
123 0.71
124 0.73
125 0.68
126 0.6
127 0.51
128 0.43
129 0.36
130 0.33
131 0.25
132 0.19
133 0.18
134 0.19
135 0.19
136 0.19
137 0.16
138 0.16
139 0.18
140 0.19
141 0.18
142 0.17
143 0.17
144 0.18
145 0.21
146 0.21
147 0.19
148 0.17
149 0.17
150 0.18
151 0.19
152 0.21
153 0.2
154 0.18
155 0.17
156 0.18
157 0.18
158 0.2
159 0.19
160 0.16
161 0.14
162 0.14
163 0.13
164 0.15
165 0.14
166 0.15
167 0.21
168 0.26
169 0.28
170 0.3
171 0.32
172 0.31
173 0.36
174 0.37
175 0.31
176 0.34
177 0.32
178 0.32
179 0.38
180 0.36
181 0.34
182 0.29
183 0.32
184 0.25
185 0.25
186 0.23
187 0.15
188 0.15
189 0.12
190 0.1
191 0.06
192 0.05
193 0.05
194 0.04
195 0.04
196 0.03
197 0.04
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.06
202 0.07
203 0.08
204 0.09
205 0.1
206 0.1
207 0.11
208 0.12
209 0.13
210 0.12
211 0.13
212 0.15
213 0.19
214 0.19
215 0.18
216 0.17
217 0.17
218 0.17
219 0.18
220 0.16
221 0.11
222 0.12
223 0.13
224 0.12
225 0.12
226 0.17
227 0.23
228 0.3
229 0.37
230 0.46
231 0.56
232 0.66
233 0.77
234 0.81
235 0.82
236 0.85
237 0.86
238 0.88
239 0.82
240 0.78
241 0.73
242 0.66
243 0.63
244 0.58
245 0.57
246 0.52
247 0.52
248 0.52
249 0.56
250 0.62
251 0.65
252 0.67
253 0.67
254 0.65
255 0.67
256 0.64
257 0.54
258 0.45
259 0.38
260 0.3
261 0.23
262 0.19
263 0.12
264 0.09
265 0.08
266 0.07
267 0.08
268 0.07
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.06
273 0.1
274 0.1
275 0.13
276 0.14
277 0.18
278 0.21
279 0.23
280 0.31
281 0.32
282 0.36
283 0.35
284 0.36
285 0.4
286 0.4
287 0.41
288 0.38
289 0.4
290 0.42
291 0.43
292 0.46
293 0.41
294 0.43
295 0.45
296 0.44
297 0.43
298 0.43
299 0.44
300 0.44
301 0.49
302 0.44
303 0.49
304 0.49
305 0.45
306 0.49
307 0.54
308 0.59
309 0.56
310 0.64
311 0.62
312 0.65
313 0.71
314 0.68
315 0.69
316 0.69
317 0.67
318 0.58
319 0.53
320 0.45
321 0.39
322 0.31
323 0.22
324 0.17
325 0.15
326 0.17
327 0.16
328 0.16
329 0.14
330 0.15
331 0.15
332 0.13
333 0.13
334 0.1
335 0.11
336 0.1
337 0.11
338 0.11
339 0.1
340 0.11
341 0.11
342 0.13
343 0.14
344 0.2
345 0.23
346 0.23
347 0.24
348 0.25
349 0.24
350 0.22
351 0.2
352 0.15
353 0.11
354 0.1
355 0.09
356 0.07
357 0.08
358 0.08
359 0.08
360 0.07
361 0.09
362 0.09
363 0.12
364 0.11
365 0.11
366 0.11
367 0.14
368 0.17
369 0.17
370 0.17
371 0.15
372 0.15
373 0.16
374 0.15
375 0.13
376 0.11
377 0.1
378 0.1
379 0.1
380 0.09
381 0.08
382 0.08
383 0.09
384 0.14
385 0.2
386 0.29
387 0.32
388 0.38
389 0.46
390 0.54
391 0.62
392 0.61
393 0.6
394 0.54
395 0.56
396 0.53
397 0.46
398 0.38
399 0.29
400 0.25
401 0.18
402 0.15
403 0.09
404 0.06
405 0.09
406 0.11
407 0.11
408 0.15
409 0.21
410 0.29
411 0.38
412 0.49
413 0.56
414 0.65
415 0.75
416 0.82
417 0.87
418 0.87
419 0.85
420 0.83
421 0.79
422 0.73
423 0.64
424 0.54
425 0.45
426 0.38
427 0.37
428 0.32
429 0.28
430 0.29
431 0.31
432 0.33
433 0.4
434 0.5
435 0.54
436 0.6
437 0.68
438 0.73
439 0.8
440 0.84
441 0.82
442 0.79
443 0.71
444 0.67
445 0.58
446 0.48
447 0.43
448 0.4
449 0.34
450 0.27
451 0.24
452 0.17
453 0.15
454 0.17
455 0.12
456 0.08
457 0.08
458 0.07
459 0.07
460 0.08
461 0.09
462 0.09
463 0.09
464 0.1
465 0.11
466 0.12
467 0.13
468 0.14
469 0.15
470 0.17
471 0.21
472 0.21
473 0.19
474 0.19
475 0.19
476 0.19
477 0.18
478 0.17
479 0.15
480 0.14
481 0.14
482 0.14
483 0.13
484 0.14
485 0.13
486 0.11
487 0.09
488 0.08
489 0.08
490 0.08
491 0.09
492 0.07
493 0.07
494 0.07
495 0.08
496 0.12
497 0.13
498 0.13
499 0.12
500 0.15
501 0.17
502 0.17
503 0.16
504 0.13
505 0.17
506 0.18
507 0.19
508 0.2
509 0.21
510 0.25
511 0.28
512 0.29
513 0.26
514 0.26
515 0.24
516 0.21
517 0.21
518 0.19
519 0.17
520 0.17
521 0.16
522 0.16
523 0.15
524 0.13
525 0.11
526 0.1
527 0.08
528 0.07
529 0.06
530 0.07
531 0.07
532 0.07
533 0.08
534 0.08
535 0.08
536 0.09
537 0.1
538 0.11
539 0.11
540 0.12
541 0.12
542 0.14
543 0.21
544 0.26
545 0.28
546 0.28
547 0.29
548 0.29
549 0.3
550 0.28
551 0.22
552 0.18
553 0.17
554 0.16
555 0.17
556 0.17
557 0.18
558 0.18
559 0.23
560 0.22
561 0.2
562 0.22
563 0.22
564 0.22
565 0.24
566 0.29
567 0.24
568 0.27
569 0.29
570 0.28
571 0.28
572 0.29
573 0.27
574 0.21
575 0.21
576 0.18
577 0.23
578 0.25
579 0.24
580 0.22
581 0.22
582 0.21
583 0.21
584 0.21
585 0.15
586 0.13
587 0.13
588 0.16
589 0.14
590 0.17
591 0.17
592 0.17
593 0.16
594 0.19
595 0.2
596 0.21
597 0.29
598 0.29
599 0.34
600 0.32
601 0.36
602 0.33
603 0.37
604 0.4
605 0.34
606 0.31
607 0.27
608 0.28
609 0.24
610 0.24
611 0.18
612 0.14
613 0.12
614 0.13
615 0.11
616 0.11
617 0.11
618 0.08
619 0.1
620 0.09
621 0.09
622 0.09
623 0.1
624 0.11
625 0.13
626 0.13
627 0.11
628 0.1
629 0.12
630 0.15
631 0.14
632 0.16
633 0.14
634 0.18
635 0.19
636 0.18
637 0.16
638 0.17
639 0.18
640 0.19
641 0.24
642 0.24
643 0.24
644 0.24
645 0.25
646 0.24
647 0.27
648 0.27
649 0.22
650 0.2
651 0.19
652 0.2
653 0.21
654 0.2
655 0.23
656 0.23
657 0.27
658 0.29
659 0.3
660 0.36
661 0.36
662 0.43
663 0.36
664 0.39
665 0.36
666 0.38
667 0.39
668 0.32
669 0.37
670 0.3
671 0.34
672 0.34
673 0.37
674 0.35
675 0.42
676 0.48
677 0.48
678 0.56
679 0.6
680 0.63
681 0.65
682 0.7
683 0.64
684 0.6
685 0.57
686 0.49
687 0.42
688 0.35
689 0.34
690 0.25
691 0.23
692 0.2
693 0.17
694 0.16
695 0.19
696 0.2
697 0.19
698 0.2
699 0.22
700 0.23
701 0.21
702 0.2
703 0.22
704 0.19
705 0.17
706 0.16
707 0.16
708 0.15
709 0.16
710 0.16
711 0.12
712 0.12
713 0.13
714 0.17
715 0.17
716 0.19
717 0.22
718 0.25
719 0.27
720 0.25
721 0.27
722 0.27
723 0.33
724 0.32
725 0.32
726 0.33
727 0.4
728 0.42
729 0.43
730 0.48
731 0.46
732 0.53
733 0.55
734 0.54
735 0.51
736 0.58
737 0.65
738 0.64
739 0.65
740 0.65
741 0.68
742 0.73
743 0.78
744 0.74
745 0.73
746 0.73
747 0.76
748 0.78
749 0.8
750 0.81
751 0.81
752 0.81
753 0.82
754 0.8
755 0.8
756 0.78
757 0.77
758 0.73
759 0.69
760 0.7