Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C4EIX9

Protein Details
Accession A0A0C4EIX9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
261-282FFQPKEKKTTQTTKKVKEKTFIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
95-124RAERRGGARGGRGTRGRGAARGRGNGREER
291-332PSRAGGERGGRGRGRGRGDRDGERREFNGDRGAPRGRGGRGA
Subcellular Location(s) cyto 14.5, cyto_nucl 13.5, nucl 11.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Amino Acid Sequences MSTISSNPFALLSGGDSDDEGGATRSAAVKSTKAPVAVAPQPKKTIPGQQAKRDRGDYPSRGAPRKVYGGQSAGADTEVIGSKPAGQTEQGRDDRAERRGGARGGRGTRGRGAARGRGNGREERPDRHSATGTHDTDRKVASGWGAEEGKQELQAETEGFGDAKAALTPGDADEGWGAAAADDAAPATNGHAKNGDGADFREEEEEDKTKTFEEYLAEKASAANALPSLKKDVRKPNEGADDSQWKDAVKFVKGEEEEEVFFQPKEKKTTQTTKKVKEKTFIEVEPLGYRPSRAGGERGGRGRGRGRGDRDGERREFNGDRGAPRGRGGRGAKELNTEDANAFPSLS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.11
3 0.1
4 0.11
5 0.1
6 0.1
7 0.09
8 0.08
9 0.07
10 0.07
11 0.09
12 0.11
13 0.11
14 0.14
15 0.16
16 0.17
17 0.21
18 0.27
19 0.28
20 0.26
21 0.26
22 0.25
23 0.3
24 0.35
25 0.41
26 0.41
27 0.43
28 0.46
29 0.46
30 0.47
31 0.44
32 0.46
33 0.46
34 0.52
35 0.56
36 0.62
37 0.72
38 0.74
39 0.76
40 0.7
41 0.62
42 0.59
43 0.6
44 0.54
45 0.49
46 0.52
47 0.53
48 0.55
49 0.55
50 0.51
51 0.47
52 0.5
53 0.48
54 0.43
55 0.39
56 0.36
57 0.35
58 0.32
59 0.28
60 0.21
61 0.17
62 0.13
63 0.09
64 0.09
65 0.08
66 0.07
67 0.07
68 0.07
69 0.09
70 0.1
71 0.11
72 0.1
73 0.12
74 0.17
75 0.22
76 0.31
77 0.3
78 0.31
79 0.31
80 0.36
81 0.39
82 0.38
83 0.36
84 0.28
85 0.29
86 0.33
87 0.35
88 0.33
89 0.32
90 0.34
91 0.34
92 0.38
93 0.37
94 0.34
95 0.35
96 0.37
97 0.33
98 0.32
99 0.33
100 0.34
101 0.36
102 0.39
103 0.38
104 0.38
105 0.41
106 0.42
107 0.41
108 0.44
109 0.42
110 0.41
111 0.45
112 0.46
113 0.45
114 0.42
115 0.41
116 0.33
117 0.38
118 0.42
119 0.37
120 0.34
121 0.35
122 0.33
123 0.33
124 0.31
125 0.24
126 0.16
127 0.15
128 0.13
129 0.11
130 0.1
131 0.12
132 0.12
133 0.12
134 0.12
135 0.13
136 0.12
137 0.11
138 0.11
139 0.08
140 0.08
141 0.08
142 0.08
143 0.07
144 0.07
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.04
152 0.04
153 0.03
154 0.03
155 0.04
156 0.04
157 0.05
158 0.04
159 0.05
160 0.04
161 0.05
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.03
166 0.03
167 0.02
168 0.02
169 0.02
170 0.02
171 0.02
172 0.03
173 0.03
174 0.04
175 0.09
176 0.09
177 0.1
178 0.11
179 0.11
180 0.13
181 0.13
182 0.14
183 0.1
184 0.1
185 0.12
186 0.11
187 0.12
188 0.11
189 0.11
190 0.1
191 0.12
192 0.14
193 0.13
194 0.13
195 0.13
196 0.12
197 0.12
198 0.12
199 0.1
200 0.11
201 0.12
202 0.15
203 0.16
204 0.15
205 0.15
206 0.14
207 0.13
208 0.11
209 0.09
210 0.06
211 0.06
212 0.07
213 0.08
214 0.09
215 0.15
216 0.19
217 0.23
218 0.3
219 0.4
220 0.45
221 0.51
222 0.53
223 0.54
224 0.59
225 0.57
226 0.51
227 0.46
228 0.47
229 0.42
230 0.4
231 0.34
232 0.25
233 0.23
234 0.25
235 0.23
236 0.18
237 0.18
238 0.17
239 0.24
240 0.24
241 0.25
242 0.24
243 0.22
244 0.21
245 0.2
246 0.21
247 0.15
248 0.14
249 0.17
250 0.22
251 0.24
252 0.3
253 0.32
254 0.37
255 0.44
256 0.56
257 0.61
258 0.66
259 0.72
260 0.75
261 0.82
262 0.85
263 0.81
264 0.79
265 0.72
266 0.69
267 0.66
268 0.56
269 0.51
270 0.44
271 0.41
272 0.34
273 0.32
274 0.27
275 0.2
276 0.2
277 0.15
278 0.17
279 0.18
280 0.18
281 0.2
282 0.25
283 0.31
284 0.37
285 0.39
286 0.43
287 0.41
288 0.43
289 0.46
290 0.46
291 0.47
292 0.48
293 0.52
294 0.55
295 0.59
296 0.65
297 0.67
298 0.69
299 0.65
300 0.61
301 0.56
302 0.53
303 0.5
304 0.43
305 0.44
306 0.39
307 0.37
308 0.39
309 0.42
310 0.37
311 0.39
312 0.42
313 0.35
314 0.4
315 0.42
316 0.44
317 0.47
318 0.52
319 0.49
320 0.5
321 0.51
322 0.46
323 0.44
324 0.38
325 0.3
326 0.26
327 0.27