Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1R1PLF3

Protein Details
Accession A0A1R1PLF3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
234-262LNMANRKCKKWRMVQKSRHTKKNENNIRQHydrophilic
362-385RYDSRDRRQRDRSRAGSRKRDRYSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
331-383RKRNGRSSRERSNESDSRDSREQRRERGRSERYDSRDRRQRDRSRAGSRKRDR
Subcellular Location(s) nucl 12.5, mito_nucl 11.5, mito 9.5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR029123  RBM39_linker  
IPR006509  RBM39_SF  
IPR000504  RRM_dom  
IPR031926  TMEM135_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF15519  RBM39linker  
PF00076  RRM_1  
PF15982  TMEM135_C_rich  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12285  RRM3_RBM39_like  
cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MNYGPTMLMAVSTSYVAHALLKASHLFPRSYYRFLMTYSGFSTKLPGHLEDIFPLFTKLVDYEYETNSTALTRIPDGMKTYEMFEQHPVASSFADAHDKSLSHDWVQCAILHPYTPHCSVGFVHFLKEVFPKSLLIYLPLNFASAVIFKRKALIVDPVRSSTHILKASLRSSTFFALMVACAGTAPCYLKRILGFEHPSIYYVNGLFAGLSVLVEKPSRRMELGMADCRLTIKLNMANRKCKKWRMVQKSRHTKKNENNIRQEEDKKKYTSEKELENDRSHEEMKIRGMGMEPRKQNGSENDVKNGSERAARESEGLQEVEMEDVRETRDRKRNGRSSRERSNESDSRDSREQRRERGRSERYDSRDRRQRDRSRAGSRKRDRYSSRDRVRDFLRDTEEELTRGKAEPRNSLQEKHERDRRTVFINWIGFYSVAYVEFREIESAVKAVELSGQKLLGIPIIVQFSEAEKNRQAQPKEYGIGGVPINNDLTRVRQICVSNIPSAIGSEDLKSLFETFGSVESCVFRTRGETGEPKKAYITYTHSQNADSAAEKMDGFELLGNSIRVWIPRSSEVFSETGAQGPVQPESAANSPAQPAPTTPTVTLQKIPAEEDTKNAATDCILLCNMFDPDEESSDDWVHEIEEDTKDEVCKYGTVTAIKLIPSKLGEIYIRFSSADEAIAASKALDGRWFDGKKVSATFVSSDKYSTIFA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.08
3 0.08
4 0.09
5 0.09
6 0.1
7 0.11
8 0.13
9 0.15
10 0.17
11 0.22
12 0.23
13 0.23
14 0.24
15 0.34
16 0.36
17 0.38
18 0.38
19 0.37
20 0.36
21 0.37
22 0.4
23 0.31
24 0.3
25 0.29
26 0.3
27 0.27
28 0.25
29 0.27
30 0.23
31 0.27
32 0.26
33 0.24
34 0.25
35 0.28
36 0.29
37 0.27
38 0.28
39 0.24
40 0.21
41 0.21
42 0.16
43 0.14
44 0.14
45 0.12
46 0.12
47 0.12
48 0.17
49 0.19
50 0.22
51 0.24
52 0.24
53 0.23
54 0.22
55 0.21
56 0.16
57 0.14
58 0.14
59 0.12
60 0.15
61 0.17
62 0.19
63 0.22
64 0.23
65 0.24
66 0.23
67 0.24
68 0.24
69 0.24
70 0.23
71 0.23
72 0.24
73 0.22
74 0.24
75 0.22
76 0.2
77 0.18
78 0.17
79 0.15
80 0.14
81 0.2
82 0.17
83 0.18
84 0.19
85 0.19
86 0.22
87 0.26
88 0.27
89 0.24
90 0.27
91 0.27
92 0.28
93 0.29
94 0.26
95 0.23
96 0.24
97 0.22
98 0.19
99 0.19
100 0.21
101 0.25
102 0.25
103 0.24
104 0.21
105 0.22
106 0.22
107 0.25
108 0.28
109 0.24
110 0.24
111 0.24
112 0.23
113 0.24
114 0.27
115 0.25
116 0.19
117 0.2
118 0.19
119 0.18
120 0.22
121 0.2
122 0.19
123 0.2
124 0.18
125 0.2
126 0.19
127 0.18
128 0.14
129 0.14
130 0.12
131 0.11
132 0.13
133 0.15
134 0.17
135 0.16
136 0.19
137 0.2
138 0.2
139 0.2
140 0.28
141 0.29
142 0.34
143 0.36
144 0.36
145 0.36
146 0.36
147 0.37
148 0.31
149 0.31
150 0.28
151 0.27
152 0.29
153 0.32
154 0.34
155 0.34
156 0.31
157 0.26
158 0.26
159 0.26
160 0.22
161 0.18
162 0.16
163 0.12
164 0.11
165 0.1
166 0.07
167 0.06
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.06
172 0.08
173 0.09
174 0.11
175 0.11
176 0.14
177 0.15
178 0.17
179 0.19
180 0.24
181 0.28
182 0.27
183 0.3
184 0.28
185 0.27
186 0.25
187 0.23
188 0.17
189 0.12
190 0.11
191 0.08
192 0.08
193 0.07
194 0.06
195 0.06
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.06
201 0.07
202 0.08
203 0.11
204 0.15
205 0.16
206 0.16
207 0.17
208 0.18
209 0.25
210 0.3
211 0.31
212 0.28
213 0.27
214 0.26
215 0.26
216 0.24
217 0.18
218 0.12
219 0.12
220 0.15
221 0.21
222 0.3
223 0.35
224 0.45
225 0.49
226 0.57
227 0.61
228 0.64
229 0.65
230 0.67
231 0.73
232 0.73
233 0.8
234 0.81
235 0.85
236 0.89
237 0.89
238 0.88
239 0.84
240 0.82
241 0.8
242 0.81
243 0.81
244 0.78
245 0.8
246 0.76
247 0.73
248 0.69
249 0.68
250 0.65
251 0.61
252 0.57
253 0.49
254 0.47
255 0.49
256 0.49
257 0.5
258 0.45
259 0.45
260 0.44
261 0.51
262 0.53
263 0.48
264 0.45
265 0.39
266 0.37
267 0.31
268 0.29
269 0.22
270 0.19
271 0.18
272 0.18
273 0.16
274 0.14
275 0.14
276 0.19
277 0.23
278 0.28
279 0.28
280 0.27
281 0.29
282 0.29
283 0.32
284 0.29
285 0.3
286 0.32
287 0.32
288 0.34
289 0.33
290 0.33
291 0.3
292 0.27
293 0.21
294 0.15
295 0.14
296 0.15
297 0.16
298 0.16
299 0.17
300 0.16
301 0.17
302 0.16
303 0.16
304 0.11
305 0.1
306 0.09
307 0.09
308 0.08
309 0.06
310 0.05
311 0.05
312 0.06
313 0.1
314 0.12
315 0.19
316 0.27
317 0.33
318 0.4
319 0.49
320 0.58
321 0.62
322 0.72
323 0.74
324 0.74
325 0.78
326 0.76
327 0.71
328 0.65
329 0.64
330 0.57
331 0.52
332 0.52
333 0.43
334 0.44
335 0.44
336 0.45
337 0.44
338 0.5
339 0.49
340 0.5
341 0.59
342 0.58
343 0.59
344 0.65
345 0.65
346 0.61
347 0.64
348 0.63
349 0.59
350 0.64
351 0.63
352 0.62
353 0.64
354 0.62
355 0.63
356 0.67
357 0.7
358 0.69
359 0.74
360 0.74
361 0.76
362 0.81
363 0.81
364 0.81
365 0.81
366 0.81
367 0.75
368 0.74
369 0.68
370 0.68
371 0.7
372 0.69
373 0.69
374 0.67
375 0.65
376 0.62
377 0.6
378 0.58
379 0.5
380 0.43
381 0.39
382 0.32
383 0.33
384 0.31
385 0.29
386 0.23
387 0.21
388 0.18
389 0.14
390 0.14
391 0.16
392 0.16
393 0.18
394 0.24
395 0.27
396 0.36
397 0.37
398 0.4
399 0.41
400 0.46
401 0.5
402 0.51
403 0.55
404 0.48
405 0.49
406 0.51
407 0.48
408 0.44
409 0.4
410 0.35
411 0.34
412 0.34
413 0.3
414 0.26
415 0.24
416 0.19
417 0.16
418 0.14
419 0.08
420 0.07
421 0.07
422 0.07
423 0.07
424 0.07
425 0.07
426 0.07
427 0.07
428 0.07
429 0.07
430 0.07
431 0.06
432 0.06
433 0.05
434 0.05
435 0.09
436 0.09
437 0.1
438 0.1
439 0.1
440 0.1
441 0.11
442 0.11
443 0.07
444 0.07
445 0.05
446 0.07
447 0.08
448 0.07
449 0.07
450 0.08
451 0.09
452 0.15
453 0.15
454 0.17
455 0.18
456 0.22
457 0.27
458 0.35
459 0.35
460 0.34
461 0.38
462 0.4
463 0.39
464 0.36
465 0.3
466 0.23
467 0.24
468 0.19
469 0.16
470 0.11
471 0.11
472 0.12
473 0.11
474 0.11
475 0.09
476 0.12
477 0.17
478 0.18
479 0.18
480 0.21
481 0.22
482 0.24
483 0.3
484 0.3
485 0.25
486 0.24
487 0.24
488 0.19
489 0.19
490 0.16
491 0.12
492 0.09
493 0.08
494 0.09
495 0.09
496 0.1
497 0.1
498 0.1
499 0.09
500 0.08
501 0.08
502 0.07
503 0.09
504 0.1
505 0.09
506 0.09
507 0.1
508 0.12
509 0.13
510 0.12
511 0.1
512 0.12
513 0.14
514 0.15
515 0.19
516 0.27
517 0.3
518 0.4
519 0.41
520 0.39
521 0.38
522 0.37
523 0.34
524 0.29
525 0.32
526 0.27
527 0.32
528 0.35
529 0.35
530 0.34
531 0.33
532 0.31
533 0.25
534 0.21
535 0.16
536 0.14
537 0.14
538 0.13
539 0.13
540 0.11
541 0.1
542 0.09
543 0.09
544 0.08
545 0.08
546 0.1
547 0.09
548 0.09
549 0.1
550 0.11
551 0.11
552 0.13
553 0.14
554 0.17
555 0.21
556 0.25
557 0.25
558 0.25
559 0.27
560 0.25
561 0.24
562 0.23
563 0.19
564 0.17
565 0.15
566 0.14
567 0.14
568 0.15
569 0.15
570 0.12
571 0.12
572 0.1
573 0.13
574 0.16
575 0.15
576 0.14
577 0.14
578 0.16
579 0.17
580 0.18
581 0.15
582 0.14
583 0.18
584 0.21
585 0.23
586 0.21
587 0.26
588 0.3
589 0.32
590 0.34
591 0.31
592 0.31
593 0.29
594 0.31
595 0.29
596 0.28
597 0.26
598 0.27
599 0.3
600 0.28
601 0.27
602 0.25
603 0.2
604 0.16
605 0.19
606 0.16
607 0.13
608 0.13
609 0.12
610 0.12
611 0.14
612 0.14
613 0.11
614 0.11
615 0.11
616 0.13
617 0.15
618 0.17
619 0.16
620 0.18
621 0.18
622 0.18
623 0.15
624 0.13
625 0.11
626 0.1
627 0.11
628 0.12
629 0.13
630 0.15
631 0.16
632 0.18
633 0.18
634 0.18
635 0.17
636 0.15
637 0.14
638 0.14
639 0.17
640 0.2
641 0.21
642 0.21
643 0.24
644 0.25
645 0.26
646 0.27
647 0.24
648 0.23
649 0.22
650 0.24
651 0.21
652 0.22
653 0.23
654 0.22
655 0.26
656 0.24
657 0.24
658 0.22
659 0.22
660 0.21
661 0.19
662 0.17
663 0.13
664 0.12
665 0.12
666 0.12
667 0.11
668 0.09
669 0.1
670 0.1
671 0.1
672 0.13
673 0.14
674 0.18
675 0.27
676 0.28
677 0.28
678 0.34
679 0.36
680 0.37
681 0.37
682 0.38
683 0.3
684 0.31
685 0.33
686 0.3
687 0.3
688 0.27
689 0.25
690 0.22