Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1R1PIN0

Protein Details
Accession A0A1R1PIN0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
45-64DRFGRIRRSRSPQGGRYERSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
49-92RIRRSRSPQGGRYERSRSRSPGRDYRGGGGGGYRREGGYKGRGR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025239  DUF4187  
IPR039727  SE/Ars2  
IPR021933  SERRATE/Ars2_N  
Gene Ontology GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF13821  DUF4187  
PF12066  SERRATE_Ars2_N  
Amino Acid Sequences MSHADEGIRRSTDYISDEERNYDSGRQKYQRERESPDGYNGREVDRFGRIRRSRSPQGGRYERSRSRSPGRDYRGGGGGGYRREGGYKGRGRYREDSRGYSSRRYGSARGDEQSSEREGGMGEQQGQDMGGVMDPFKLDLVVPFKYFCEWKRLQNRGKKLEQEELHRQYEEYRRQTLNKMYQQFFDEHKEEDWFVERYKPEEQKTRQQEVKRLKKRYYEEFLGQLERGELDNTCLDQSKAEENAMDEDAQVQETYTLFIKTIPPTVARAALESELKKVEGFDYLSLSEPNATRNYHRFGWAKFVEGTDMDSVLQTLSELKVGETTFTLSKHTKSSTAQQRTAPEQTSLPERIKSDLEVIREAVKQFDERTDSETFKMGDAIRARMDSELAANTKAKAAASKSASTPTSTSTPTPEDDSEAELAVAKKELDLSIEYLRKVHYYCYYCSAVYENREDFSRKCAPVHYRRPCSSATPPSSN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.29
3 0.32
4 0.33
5 0.34
6 0.34
7 0.32
8 0.31
9 0.34
10 0.35
11 0.37
12 0.46
13 0.5
14 0.57
15 0.65
16 0.73
17 0.76
18 0.76
19 0.78
20 0.77
21 0.77
22 0.72
23 0.71
24 0.67
25 0.59
26 0.58
27 0.5
28 0.44
29 0.38
30 0.37
31 0.31
32 0.33
33 0.36
34 0.33
35 0.43
36 0.46
37 0.51
38 0.59
39 0.64
40 0.66
41 0.72
42 0.77
43 0.74
44 0.79
45 0.81
46 0.77
47 0.76
48 0.76
49 0.72
50 0.69
51 0.68
52 0.65
53 0.66
54 0.7
55 0.71
56 0.71
57 0.72
58 0.73
59 0.69
60 0.65
61 0.6
62 0.51
63 0.42
64 0.37
65 0.33
66 0.27
67 0.26
68 0.23
69 0.19
70 0.2
71 0.21
72 0.22
73 0.27
74 0.32
75 0.38
76 0.45
77 0.5
78 0.55
79 0.61
80 0.64
81 0.64
82 0.62
83 0.61
84 0.6
85 0.64
86 0.62
87 0.6
88 0.57
89 0.51
90 0.5
91 0.49
92 0.45
93 0.45
94 0.49
95 0.46
96 0.43
97 0.41
98 0.38
99 0.36
100 0.35
101 0.3
102 0.22
103 0.18
104 0.16
105 0.14
106 0.14
107 0.15
108 0.13
109 0.13
110 0.12
111 0.12
112 0.12
113 0.12
114 0.1
115 0.08
116 0.06
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.06
121 0.06
122 0.06
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.08
127 0.11
128 0.12
129 0.13
130 0.14
131 0.14
132 0.16
133 0.19
134 0.17
135 0.23
136 0.24
137 0.33
138 0.42
139 0.52
140 0.58
141 0.64
142 0.73
143 0.72
144 0.75
145 0.73
146 0.67
147 0.66
148 0.61
149 0.59
150 0.6
151 0.57
152 0.53
153 0.46
154 0.42
155 0.39
156 0.44
157 0.45
158 0.4
159 0.4
160 0.4
161 0.42
162 0.47
163 0.5
164 0.51
165 0.5
166 0.52
167 0.48
168 0.47
169 0.46
170 0.44
171 0.38
172 0.35
173 0.29
174 0.23
175 0.22
176 0.22
177 0.2
178 0.18
179 0.19
180 0.14
181 0.13
182 0.17
183 0.16
184 0.18
185 0.24
186 0.29
187 0.3
188 0.38
189 0.42
190 0.47
191 0.55
192 0.59
193 0.59
194 0.57
195 0.61
196 0.63
197 0.69
198 0.69
199 0.67
200 0.65
201 0.67
202 0.68
203 0.68
204 0.64
205 0.58
206 0.51
207 0.48
208 0.44
209 0.38
210 0.32
211 0.24
212 0.17
213 0.13
214 0.11
215 0.08
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.08
223 0.07
224 0.09
225 0.1
226 0.1
227 0.1
228 0.1
229 0.09
230 0.11
231 0.11
232 0.1
233 0.07
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.06
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.07
246 0.09
247 0.1
248 0.12
249 0.12
250 0.12
251 0.14
252 0.15
253 0.17
254 0.14
255 0.14
256 0.13
257 0.13
258 0.15
259 0.14
260 0.14
261 0.12
262 0.12
263 0.12
264 0.11
265 0.1
266 0.09
267 0.1
268 0.09
269 0.1
270 0.1
271 0.11
272 0.11
273 0.11
274 0.11
275 0.1
276 0.12
277 0.13
278 0.13
279 0.16
280 0.2
281 0.25
282 0.24
283 0.3
284 0.31
285 0.29
286 0.36
287 0.34
288 0.32
289 0.29
290 0.27
291 0.23
292 0.19
293 0.2
294 0.12
295 0.12
296 0.09
297 0.08
298 0.08
299 0.06
300 0.06
301 0.04
302 0.05
303 0.05
304 0.06
305 0.06
306 0.06
307 0.09
308 0.09
309 0.1
310 0.09
311 0.11
312 0.11
313 0.12
314 0.16
315 0.15
316 0.17
317 0.2
318 0.21
319 0.23
320 0.24
321 0.33
322 0.4
323 0.46
324 0.49
325 0.49
326 0.52
327 0.54
328 0.56
329 0.47
330 0.38
331 0.31
332 0.29
333 0.3
334 0.3
335 0.27
336 0.25
337 0.25
338 0.26
339 0.26
340 0.25
341 0.26
342 0.25
343 0.26
344 0.24
345 0.24
346 0.25
347 0.26
348 0.25
349 0.2
350 0.18
351 0.17
352 0.17
353 0.2
354 0.21
355 0.2
356 0.24
357 0.26
358 0.26
359 0.26
360 0.28
361 0.24
362 0.21
363 0.23
364 0.19
365 0.21
366 0.22
367 0.23
368 0.22
369 0.22
370 0.22
371 0.19
372 0.19
373 0.14
374 0.13
375 0.14
376 0.14
377 0.16
378 0.16
379 0.16
380 0.17
381 0.18
382 0.16
383 0.16
384 0.18
385 0.23
386 0.27
387 0.29
388 0.29
389 0.33
390 0.33
391 0.32
392 0.3
393 0.26
394 0.26
395 0.26
396 0.25
397 0.25
398 0.27
399 0.27
400 0.3
401 0.27
402 0.27
403 0.26
404 0.27
405 0.24
406 0.21
407 0.19
408 0.17
409 0.16
410 0.14
411 0.14
412 0.11
413 0.1
414 0.11
415 0.12
416 0.11
417 0.12
418 0.15
419 0.22
420 0.25
421 0.25
422 0.25
423 0.26
424 0.26
425 0.26
426 0.27
427 0.28
428 0.3
429 0.32
430 0.37
431 0.39
432 0.36
433 0.37
434 0.37
435 0.34
436 0.34
437 0.38
438 0.34
439 0.33
440 0.36
441 0.38
442 0.34
443 0.35
444 0.4
445 0.35
446 0.35
447 0.42
448 0.49
449 0.56
450 0.67
451 0.7
452 0.71
453 0.73
454 0.74
455 0.69
456 0.67
457 0.66
458 0.65