Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1R1PX53

Protein Details
Accession A0A1R1PX53    Localization Confidence Low Confidence Score 9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
908-933GVVQDIKIPRPKKKSNNNNNNINNINHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 10, cyto 6, mito 3, extr 3, cyto_pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015350  Beta-trefoil_DNA-bd_dom  
IPR036358  BTD_sf  
IPR013783  Ig-like_fold  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000978  F:RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF09270  BTD  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12230  RRM1_U2AF65  
cd12231  RRM2_U2AF65  
cd12232  RRM3_U2AF65  
Amino Acid Sequences MVAGGKVPSWCSGNGNGSNNNNNSNPNDKSVGDNSSSPCFVARSSVWDLFIIWLVDPYVMNSNNLAYDEVRVPGYPPPPVVALNPKVPPNFNFANTVGGEGGKKGIGAPIAIHYNQPVVLQCLSTGMVSPILILRKVERTSNATGSYYSNGMHCVAVGDPVSQLHKVAFELHQPHHLVPNYKAADSLNRNMAIPSKESGYPGTYLSCIGDIVGLQRSISGKHFTQSSANHIPYLFNRPSSSSFDLLDQQPYMLPSRSSTSTPIPLDMYSQLHNIKGGQKRRTMDQMDSFPARRRANTTIDLPVSNFALLKSTQPNHFHWCEDVGDSAVWTIVGTDCATYRFNYPNEPSLPSSSSSSLSTFGGMVCNPSLSSFSINSNTNTNTNTNTNTNTNSNSNTNISTNINSNSNNNPNLLLNPSLSAPIPSISNIHISPPKRSRTLSLASSLVNLDLFDKPSDFSSRASLNISGCNFTPSIKLLFNGIPPVYFEYKSPDSLFCLAPLYKDFTNIQINPNNGNFEVPIHLIDTSTVPLHLREPKLNLWDLAPPGFENLSAFEAKKAGLFPPPGQSLGSRNVASFNPSVLQESKSPSEIQDPEAKKKAEELVAKQQRRLYVGNIPYGVNEDAIAAFFNEQMENRGFAPAFSVMSVQINNDKNYAFVEFRSPEQATLGMGLDGVQFLACGLKVRRPKDYVAPAGQPPDVRPFRGGIGGAGGGGGAGGSGGNIGVLGLPTIVGETPFKIYVGNLPTYLDDHDVAELLQTFGPLKAFCLVRDVATGVSRGFAFCEYVDTSITDVACQGLNNMELGDCRIIVQRASVGSRSSTNPLGGGIGGGIGGGGGGSSSAHLLALQQAGIMPVNMPESLLAPAVSGTAARKSRVLQLLNMVSHEELLDDEEYLDILQDVRDECSKFGVVQDIKIPRPKKKSNNNNNNINNINNNTNNNNIEGGEQGGENKGVGKIFVCFRDISDASVALTALAGRKFADRTVVATYLSEEDFDNENF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.41
3 0.45
4 0.48
5 0.54
6 0.53
7 0.52
8 0.46
9 0.44
10 0.43
11 0.44
12 0.41
13 0.38
14 0.39
15 0.35
16 0.39
17 0.39
18 0.39
19 0.35
20 0.36
21 0.34
22 0.36
23 0.35
24 0.3
25 0.27
26 0.23
27 0.2
28 0.22
29 0.19
30 0.21
31 0.28
32 0.3
33 0.3
34 0.29
35 0.29
36 0.25
37 0.27
38 0.2
39 0.14
40 0.12
41 0.11
42 0.12
43 0.11
44 0.12
45 0.16
46 0.16
47 0.17
48 0.17
49 0.18
50 0.18
51 0.19
52 0.18
53 0.12
54 0.15
55 0.16
56 0.17
57 0.17
58 0.16
59 0.16
60 0.2
61 0.23
62 0.22
63 0.21
64 0.22
65 0.23
66 0.24
67 0.27
68 0.3
69 0.31
70 0.35
71 0.38
72 0.41
73 0.42
74 0.44
75 0.41
76 0.39
77 0.39
78 0.35
79 0.36
80 0.31
81 0.33
82 0.3
83 0.3
84 0.23
85 0.2
86 0.18
87 0.14
88 0.15
89 0.1
90 0.1
91 0.09
92 0.1
93 0.1
94 0.1
95 0.11
96 0.13
97 0.18
98 0.18
99 0.18
100 0.17
101 0.18
102 0.18
103 0.18
104 0.15
105 0.14
106 0.15
107 0.14
108 0.13
109 0.14
110 0.14
111 0.12
112 0.12
113 0.09
114 0.09
115 0.09
116 0.1
117 0.11
118 0.12
119 0.13
120 0.13
121 0.16
122 0.22
123 0.24
124 0.27
125 0.28
126 0.31
127 0.36
128 0.4
129 0.4
130 0.34
131 0.33
132 0.32
133 0.3
134 0.25
135 0.2
136 0.16
137 0.15
138 0.15
139 0.13
140 0.11
141 0.1
142 0.09
143 0.11
144 0.11
145 0.1
146 0.09
147 0.11
148 0.13
149 0.12
150 0.12
151 0.11
152 0.11
153 0.11
154 0.14
155 0.14
156 0.19
157 0.25
158 0.26
159 0.32
160 0.32
161 0.33
162 0.36
163 0.39
164 0.35
165 0.32
166 0.4
167 0.36
168 0.34
169 0.34
170 0.28
171 0.33
172 0.35
173 0.37
174 0.33
175 0.32
176 0.32
177 0.32
178 0.35
179 0.29
180 0.26
181 0.22
182 0.2
183 0.2
184 0.21
185 0.23
186 0.2
187 0.19
188 0.17
189 0.17
190 0.15
191 0.14
192 0.13
193 0.12
194 0.1
195 0.08
196 0.08
197 0.06
198 0.08
199 0.1
200 0.09
201 0.09
202 0.11
203 0.11
204 0.13
205 0.16
206 0.18
207 0.16
208 0.19
209 0.2
210 0.2
211 0.25
212 0.25
213 0.31
214 0.34
215 0.34
216 0.33
217 0.32
218 0.33
219 0.29
220 0.36
221 0.29
222 0.23
223 0.23
224 0.25
225 0.29
226 0.34
227 0.35
228 0.29
229 0.28
230 0.28
231 0.31
232 0.29
233 0.28
234 0.21
235 0.17
236 0.16
237 0.17
238 0.17
239 0.14
240 0.13
241 0.13
242 0.17
243 0.19
244 0.19
245 0.22
246 0.23
247 0.28
248 0.28
249 0.28
250 0.26
251 0.24
252 0.24
253 0.23
254 0.21
255 0.16
256 0.19
257 0.18
258 0.17
259 0.18
260 0.18
261 0.23
262 0.28
263 0.35
264 0.37
265 0.43
266 0.44
267 0.48
268 0.55
269 0.51
270 0.49
271 0.47
272 0.46
273 0.44
274 0.46
275 0.43
276 0.4
277 0.45
278 0.41
279 0.36
280 0.37
281 0.37
282 0.39
283 0.42
284 0.39
285 0.37
286 0.37
287 0.35
288 0.3
289 0.26
290 0.21
291 0.17
292 0.14
293 0.09
294 0.09
295 0.09
296 0.12
297 0.17
298 0.19
299 0.25
300 0.29
301 0.32
302 0.37
303 0.38
304 0.36
305 0.31
306 0.3
307 0.25
308 0.22
309 0.19
310 0.14
311 0.12
312 0.11
313 0.09
314 0.07
315 0.06
316 0.05
317 0.05
318 0.04
319 0.05
320 0.05
321 0.05
322 0.06
323 0.08
324 0.09
325 0.09
326 0.12
327 0.17
328 0.17
329 0.23
330 0.25
331 0.29
332 0.3
333 0.32
334 0.31
335 0.29
336 0.3
337 0.26
338 0.26
339 0.21
340 0.21
341 0.19
342 0.17
343 0.16
344 0.14
345 0.13
346 0.11
347 0.1
348 0.09
349 0.08
350 0.08
351 0.07
352 0.07
353 0.07
354 0.07
355 0.08
356 0.08
357 0.1
358 0.1
359 0.12
360 0.16
361 0.17
362 0.18
363 0.19
364 0.2
365 0.19
366 0.2
367 0.19
368 0.18
369 0.18
370 0.2
371 0.2
372 0.21
373 0.21
374 0.22
375 0.23
376 0.23
377 0.23
378 0.23
379 0.22
380 0.22
381 0.21
382 0.2
383 0.19
384 0.18
385 0.18
386 0.16
387 0.17
388 0.16
389 0.17
390 0.16
391 0.18
392 0.21
393 0.25
394 0.24
395 0.22
396 0.22
397 0.2
398 0.2
399 0.19
400 0.15
401 0.11
402 0.1
403 0.1
404 0.1
405 0.1
406 0.09
407 0.08
408 0.07
409 0.07
410 0.07
411 0.08
412 0.08
413 0.1
414 0.1
415 0.12
416 0.17
417 0.18
418 0.25
419 0.3
420 0.33
421 0.34
422 0.35
423 0.35
424 0.36
425 0.39
426 0.34
427 0.3
428 0.28
429 0.25
430 0.24
431 0.21
432 0.15
433 0.11
434 0.09
435 0.08
436 0.07
437 0.08
438 0.07
439 0.08
440 0.08
441 0.09
442 0.12
443 0.11
444 0.11
445 0.13
446 0.14
447 0.15
448 0.16
449 0.16
450 0.14
451 0.17
452 0.16
453 0.14
454 0.14
455 0.14
456 0.13
457 0.11
458 0.12
459 0.1
460 0.11
461 0.11
462 0.11
463 0.12
464 0.12
465 0.12
466 0.14
467 0.12
468 0.1
469 0.1
470 0.13
471 0.13
472 0.13
473 0.12
474 0.16
475 0.18
476 0.19
477 0.2
478 0.17
479 0.17
480 0.19
481 0.19
482 0.13
483 0.14
484 0.12
485 0.12
486 0.12
487 0.14
488 0.11
489 0.13
490 0.13
491 0.14
492 0.2
493 0.2
494 0.23
495 0.23
496 0.24
497 0.24
498 0.24
499 0.22
500 0.17
501 0.17
502 0.13
503 0.1
504 0.1
505 0.08
506 0.08
507 0.07
508 0.07
509 0.07
510 0.07
511 0.07
512 0.06
513 0.06
514 0.06
515 0.06
516 0.06
517 0.09
518 0.14
519 0.16
520 0.17
521 0.2
522 0.22
523 0.25
524 0.25
525 0.23
526 0.18
527 0.19
528 0.18
529 0.15
530 0.13
531 0.1
532 0.1
533 0.09
534 0.08
535 0.06
536 0.06
537 0.08
538 0.08
539 0.09
540 0.08
541 0.09
542 0.09
543 0.09
544 0.09
545 0.08
546 0.11
547 0.13
548 0.14
549 0.18
550 0.19
551 0.19
552 0.18
553 0.18
554 0.18
555 0.2
556 0.22
557 0.18
558 0.17
559 0.18
560 0.18
561 0.2
562 0.17
563 0.13
564 0.11
565 0.11
566 0.13
567 0.13
568 0.14
569 0.13
570 0.16
571 0.17
572 0.17
573 0.17
574 0.16
575 0.21
576 0.2
577 0.21
578 0.26
579 0.28
580 0.32
581 0.37
582 0.37
583 0.31
584 0.32
585 0.33
586 0.3
587 0.31
588 0.3
589 0.36
590 0.45
591 0.46
592 0.46
593 0.45
594 0.41
595 0.41
596 0.37
597 0.29
598 0.28
599 0.3
600 0.3
601 0.29
602 0.27
603 0.24
604 0.25
605 0.22
606 0.14
607 0.11
608 0.08
609 0.07
610 0.07
611 0.07
612 0.04
613 0.04
614 0.05
615 0.05
616 0.05
617 0.05
618 0.08
619 0.09
620 0.1
621 0.1
622 0.12
623 0.11
624 0.11
625 0.12
626 0.1
627 0.1
628 0.09
629 0.09
630 0.08
631 0.09
632 0.09
633 0.08
634 0.14
635 0.17
636 0.17
637 0.18
638 0.17
639 0.16
640 0.17
641 0.19
642 0.13
643 0.11
644 0.15
645 0.15
646 0.17
647 0.21
648 0.21
649 0.18
650 0.19
651 0.18
652 0.13
653 0.13
654 0.12
655 0.07
656 0.06
657 0.06
658 0.06
659 0.05
660 0.05
661 0.03
662 0.03
663 0.03
664 0.04
665 0.03
666 0.07
667 0.08
668 0.14
669 0.21
670 0.24
671 0.31
672 0.33
673 0.36
674 0.41
675 0.48
676 0.48
677 0.46
678 0.47
679 0.42
680 0.42
681 0.41
682 0.33
683 0.26
684 0.3
685 0.27
686 0.25
687 0.24
688 0.23
689 0.22
690 0.24
691 0.22
692 0.13
693 0.13
694 0.11
695 0.1
696 0.08
697 0.07
698 0.04
699 0.04
700 0.03
701 0.02
702 0.02
703 0.02
704 0.02
705 0.02
706 0.02
707 0.02
708 0.02
709 0.02
710 0.02
711 0.02
712 0.03
713 0.03
714 0.03
715 0.03
716 0.03
717 0.03
718 0.04
719 0.05
720 0.06
721 0.08
722 0.09
723 0.09
724 0.09
725 0.09
726 0.14
727 0.17
728 0.18
729 0.16
730 0.17
731 0.17
732 0.18
733 0.19
734 0.15
735 0.12
736 0.11
737 0.11
738 0.1
739 0.09
740 0.09
741 0.08
742 0.07
743 0.07
744 0.07
745 0.07
746 0.07
747 0.09
748 0.08
749 0.09
750 0.13
751 0.13
752 0.13
753 0.17
754 0.17
755 0.16
756 0.17
757 0.17
758 0.14
759 0.14
760 0.15
761 0.1
762 0.11
763 0.11
764 0.09
765 0.1
766 0.09
767 0.09
768 0.08
769 0.12
770 0.11
771 0.12
772 0.13
773 0.12
774 0.13
775 0.14
776 0.13
777 0.1
778 0.09
779 0.09
780 0.09
781 0.08
782 0.08
783 0.08
784 0.08
785 0.08
786 0.08
787 0.08
788 0.07
789 0.1
790 0.1
791 0.08
792 0.09
793 0.12
794 0.12
795 0.12
796 0.13
797 0.13
798 0.15
799 0.18
800 0.18
801 0.16
802 0.17
803 0.2
804 0.22
805 0.24
806 0.23
807 0.21
808 0.2
809 0.19
810 0.18
811 0.15
812 0.12
813 0.08
814 0.05
815 0.05
816 0.04
817 0.03
818 0.02
819 0.02
820 0.02
821 0.02
822 0.02
823 0.02
824 0.02
825 0.03
826 0.03
827 0.04
828 0.04
829 0.04
830 0.05
831 0.07
832 0.08
833 0.08
834 0.07
835 0.08
836 0.09
837 0.09
838 0.09
839 0.06
840 0.07
841 0.08
842 0.08
843 0.08
844 0.07
845 0.08
846 0.09
847 0.1
848 0.08
849 0.07
850 0.07
851 0.08
852 0.07
853 0.07
854 0.07
855 0.14
856 0.16
857 0.18
858 0.2
859 0.22
860 0.3
861 0.37
862 0.38
863 0.33
864 0.39
865 0.43
866 0.42
867 0.41
868 0.34
869 0.26
870 0.24
871 0.21
872 0.14
873 0.08
874 0.09
875 0.09
876 0.08
877 0.08
878 0.08
879 0.08
880 0.08
881 0.07
882 0.05
883 0.05
884 0.05
885 0.07
886 0.08
887 0.11
888 0.15
889 0.16
890 0.16
891 0.2
892 0.21
893 0.19
894 0.19
895 0.26
896 0.23
897 0.24
898 0.31
899 0.34
900 0.37
901 0.45
902 0.49
903 0.49
904 0.58
905 0.66
906 0.69
907 0.75
908 0.82
909 0.85
910 0.91
911 0.91
912 0.92
913 0.87
914 0.84
915 0.75
916 0.67
917 0.61
918 0.54
919 0.51
920 0.45
921 0.44
922 0.4
923 0.42
924 0.4
925 0.36
926 0.33
927 0.27
928 0.23
929 0.2
930 0.19
931 0.14
932 0.12
933 0.12
934 0.12
935 0.12
936 0.11
937 0.12
938 0.12
939 0.11
940 0.12
941 0.11
942 0.14
943 0.19
944 0.21
945 0.22
946 0.2
947 0.21
948 0.29
949 0.29
950 0.27
951 0.25
952 0.23
953 0.22
954 0.22
955 0.21
956 0.12
957 0.12
958 0.1
959 0.11
960 0.11
961 0.11
962 0.11
963 0.15
964 0.16
965 0.17
966 0.23
967 0.2
968 0.23
969 0.27
970 0.28
971 0.25
972 0.25
973 0.26
974 0.22
975 0.21
976 0.19
977 0.14
978 0.16