FuNGI

A0A1R1PS46

Protein Details

Accession

A0A1R1PS46

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
174-199	AEKTPVGKSKKEKKRKPIYYLTQSWE	Hydrophilic
516-535	QEKQKLKQLVLKNYQKQQRS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
180-189	GKSKKEKKRK

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 11.666, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016024 ARM-type_fold IPR003890 MIF4G-like_typ-3 IPR039762 Nmd2/UPF2 IPR007193 Upf2/Nmd2_C
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0003723 F:RNA binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF02854 MIF4G PF04050 Upf2

Amino Acid Sequences

MVAEILSRIHGWFGVKVVDNVMESVRIGLENRTHGNNQKIVSEVKYLGELFGHRMISPTELFELCYMLMNLGYERLESGKGGKVRFMIPVPGRECSLDPSDDYFRVRLMCVLLKSCSPLFSTKTEKIQLMVVMLVFQLYVLSKQQPTPLEVSYFVQDLFDSVMPLLPSPLVSAAEKTPVGKSKKEKKRKPIYYLTQSWEEVAGNLNEVVKNNTDLVRTLFEGEFGYHIEIKEKQPKPPVNGTVSSERPEEQKIQQEGQKEVKDGHDDEGEGEGEGEEDEVESVLDSIHELDEIYNTDDEQHDQTYKEDNIESSKRDQRDKQHHGSGDEDDNESDNESNIASGSSGSSEDESDNESDDRQKDEHEAEPEVVLVKQAEMQSEEERALQKQMADMFDTELNKLVMESLDGRKLEKVNTLDISIPMQLREQQLQFHYKKSTSTSATGVHQPIKLGSVERSNDTNDANDGQEKDGNENQENIRKFSLLLGKKQKPVIKNINVPDSSYLAIRNKAQMLAAMQEKQKLKQLVLKNYQKQQRSTFERLD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.18
2	0.19
3	0.2
4	0.21
5	0.21
6	0.2
7	0.2
8	0.18
9	0.14
10	0.13
11	0.13
12	0.12
13	0.1
14	0.11
15	0.14
16	0.17
17	0.22
18	0.25
19	0.29
20	0.33
21	0.39
22	0.45
23	0.45
24	0.43
25	0.39
26	0.39
27	0.37
28	0.35
29	0.33
30	0.28
31	0.24
32	0.25
33	0.23
34	0.2
35	0.19
36	0.18
37	0.17
38	0.2
39	0.2
40	0.17
41	0.18
42	0.19
43	0.2
44	0.2
45	0.18
46	0.17
47	0.16
48	0.17
49	0.16
50	0.16
51	0.13
52	0.14
53	0.13
54	0.1
55	0.1
56	0.09
57	0.09
58	0.1
59	0.1
60	0.08
61	0.09
62	0.1
63	0.1
64	0.1
65	0.13
66	0.17
67	0.21
68	0.22
69	0.24
70	0.25
71	0.26
72	0.29
73	0.28
74	0.3
75	0.29
76	0.37
77	0.37
78	0.36
79	0.35
80	0.33
81	0.33
82	0.28
83	0.28
84	0.22
85	0.2
86	0.24
87	0.27
88	0.27
89	0.28
90	0.24
91	0.22
92	0.22
93	0.21
94	0.18
95	0.17
96	0.19
97	0.19
98	0.21
99	0.21
100	0.21
101	0.24
102	0.22
103	0.21
104	0.19
105	0.2
106	0.21
107	0.25
108	0.32
109	0.33
110	0.39
111	0.41
112	0.39
113	0.37
114	0.36
115	0.31
116	0.24
117	0.2
118	0.14
119	0.11
120	0.1
121	0.09
122	0.06
123	0.05
124	0.04
125	0.04
126	0.05
127	0.07
128	0.1
129	0.12
130	0.13
131	0.18
132	0.2
133	0.22
134	0.24
135	0.23
136	0.22
137	0.22
138	0.22
139	0.19
140	0.18
141	0.15
142	0.12
143	0.1
144	0.09
145	0.1
146	0.09
147	0.08
148	0.07
149	0.09
150	0.08
151	0.09
152	0.09
153	0.06
154	0.06
155	0.06
156	0.07
157	0.07
158	0.07
159	0.09
160	0.09
161	0.12
162	0.13
163	0.13
164	0.15
165	0.21
166	0.24
167	0.29
168	0.38
169	0.46
170	0.57
171	0.67
172	0.72
173	0.76
174	0.84
175	0.88
176	0.87
177	0.86
178	0.85
179	0.83
180	0.8
181	0.73
182	0.66
183	0.56
184	0.48
185	0.38
186	0.29
187	0.2
188	0.15
189	0.11
190	0.08
191	0.08
192	0.08
193	0.08
194	0.09
195	0.1
196	0.09
197	0.1
198	0.11
199	0.12
200	0.11
201	0.11
202	0.13
203	0.13
204	0.13
205	0.14
206	0.13
207	0.12
208	0.12
209	0.11
210	0.1
211	0.09
212	0.1
213	0.08
214	0.09
215	0.1
216	0.12
217	0.16
218	0.26
219	0.27
220	0.3
221	0.38
222	0.42
223	0.46
224	0.5
225	0.51
226	0.45
227	0.46
228	0.44
229	0.41
230	0.38
231	0.34
232	0.28
233	0.24
234	0.21
235	0.21
236	0.22
237	0.19
238	0.26
239	0.26
240	0.28
241	0.3
242	0.31
243	0.32
244	0.34
245	0.32
246	0.25
247	0.24
248	0.23
249	0.23
250	0.21
251	0.2
252	0.14
253	0.13
254	0.13
255	0.13
256	0.11
257	0.09
258	0.07
259	0.05
260	0.05
261	0.05
262	0.04
263	0.03
264	0.03
265	0.03
266	0.03
267	0.02
268	0.02
269	0.03
270	0.02
271	0.02
272	0.03
273	0.03
274	0.03
275	0.03
276	0.03
277	0.03
278	0.04
279	0.05
280	0.06
281	0.06
282	0.06
283	0.07
284	0.07
285	0.08
286	0.09
287	0.1
288	0.09
289	0.1
290	0.11
291	0.15
292	0.15
293	0.15
294	0.14
295	0.13
296	0.17
297	0.19
298	0.2
299	0.22
300	0.27
301	0.29
302	0.34
303	0.39
304	0.44
305	0.53
306	0.59
307	0.6
308	0.61
309	0.6
310	0.56
311	0.54
312	0.46
313	0.39
314	0.31
315	0.25
316	0.19
317	0.17
318	0.15
319	0.14
320	0.11
321	0.08
322	0.07
323	0.06
324	0.06
325	0.05
326	0.05
327	0.04
328	0.04
329	0.04
330	0.05
331	0.05
332	0.05
333	0.06
334	0.07
335	0.07
336	0.07
337	0.09
338	0.09
339	0.1
340	0.1
341	0.1
342	0.13
343	0.14
344	0.16
345	0.15
346	0.16
347	0.17
348	0.2
349	0.23
350	0.22
351	0.22
352	0.2
353	0.2
354	0.19
355	0.17
356	0.13
357	0.1
358	0.07
359	0.06
360	0.09
361	0.09
362	0.1
363	0.11
364	0.13
365	0.14
366	0.15
367	0.16
368	0.15
369	0.15
370	0.16
371	0.16
372	0.14
373	0.13
374	0.15
375	0.17
376	0.16
377	0.16
378	0.15
379	0.16
380	0.18
381	0.18
382	0.16
383	0.15
384	0.14
385	0.13
386	0.12
387	0.1
388	0.07
389	0.08
390	0.11
391	0.12
392	0.17
393	0.17
394	0.18
395	0.21
396	0.22
397	0.23
398	0.26
399	0.25
400	0.25
401	0.26
402	0.27
403	0.25
404	0.24
405	0.24
406	0.2
407	0.18
408	0.14
409	0.14
410	0.17
411	0.19
412	0.23
413	0.22
414	0.23
415	0.27
416	0.36
417	0.37
418	0.37
419	0.39
420	0.36
421	0.38
422	0.39
423	0.41
424	0.36
425	0.37
426	0.36
427	0.34
428	0.36
429	0.39
430	0.38
431	0.35
432	0.31
433	0.29
434	0.26
435	0.25
436	0.23
437	0.19
438	0.18
439	0.22
440	0.23
441	0.25
442	0.27
443	0.27
444	0.28
445	0.27
446	0.26
447	0.21
448	0.2
449	0.19
450	0.21
451	0.2
452	0.2
453	0.22
454	0.21
455	0.24
456	0.26
457	0.29
458	0.27
459	0.3
460	0.32
461	0.37
462	0.39
463	0.37
464	0.35
465	0.3
466	0.29
467	0.3
468	0.36
469	0.34
470	0.41
471	0.49
472	0.54
473	0.59
474	0.66
475	0.66
476	0.61
477	0.66
478	0.67
479	0.65
480	0.67
481	0.68
482	0.7
483	0.65
484	0.62
485	0.54
486	0.46
487	0.37
488	0.3
489	0.29
490	0.23
491	0.27
492	0.27
493	0.3
494	0.3
495	0.3
496	0.29
497	0.27
498	0.25
499	0.26
500	0.28
501	0.28
502	0.28
503	0.34
504	0.36
505	0.36
506	0.42
507	0.4
508	0.39
509	0.42
510	0.5
511	0.54
512	0.62
513	0.7
514	0.7
515	0.76
516	0.81
517	0.79
518	0.77
519	0.75
520	0.74
521	0.73

A0A1R1PS46

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer