FuNGI

A0A1R1PR52

Protein Details

Accession

A0A1R1PR52

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
268-287	SCFHCLKRGHRARDCRYRDS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 24, mito 1, cyto 1, pero 1, cyto_mito 1, cyto_pero 1

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR001584 Integrase_cat-core IPR021109 Peptidase_aspartic_dom_sf IPR005162 Retrotrans_gag_dom IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR001878 Znf_CCHC IPR036875 Znf_CCHC_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF03732 Retrotrans_gag PF08284 RVP_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd00303 retropepsin_like

Amino Acid Sequences

MSNKERIEEKKSIKTPTNIDAYQSRMFNFNRWPEPEVFSGELSQEPEEWLKRTEAYFKRLGLEEIEYSDYVERYLEGKARSWYIVYNDSISAWSKFKEKFKARFYTKEHELIAWKKLQSYRQTDEGIMEVAQTLTTLFKKAKVTLETDKIKYFIMAVRLRYRRKLLESKSTSLYDLLDLALEEEQFEKVDAIGRPSRVSTNREWKDKSHYKTEDPKPPITNNKTEYDDLVNQFKKLSVNVLQVMKKLENSKDEDTYERNKEELMRNGSCFHCLKRGHRARDCRYRDSHDDEDYDSENEVKLDCIEVEKINKVDDYEVLAAEKRKIVDFNLDPFKRTKTVDEDIVMARITPRMATRSTNKTEPVAATNPGPNLREYKMVSKSEKKPTKNSKDTKVIKIPQLQRSKPLTKIAKYDKPYSIKNKLIESDAGITVSQLIQVSPEIRSEIIDLCKRSETAKEVNTTYLRNEVQDTTNCRARIKINGIDHWAVIDTGAACSVISPTLVESLDLPVCTEKDLVIITADGKKHSITGKVLGLPINIANNIFTVDALIMPNRKNEIILGTDWCKSHSVNIDLARNMLTLPIETNNIVLPFYTEQQVVECNRMDSSSEEEDSSDNEYKVWELYAIAKETISKTPKISNPDTESIINSNLEDYQHYELTKLVEKYNSIFVDDESELTQTNVIEHSIDTGDHKPIKQAPYRIPHRLKDLAKEEINKMLIKKAHELYSLEILRYNAIKNYLTSGLYPNNADEEFRRKLRNQARLYKLNNDKLYRNSLKYGLLEVLNEENEISKITEIHEEAHLGVSNTWEAVKKMYAGITHKTTTAYRPQSNGQVERLNGAIKNILAKICESDKDNWDCYLWKAMFAIRVTKNRNTNYSPAELLFGVELDMPNTWKPNGEVYDYEEAVLERIKLINDEIPELRNLGIQNSTKAKNLEKKFYDKTVRKFSFKIGNFVWLRISAIVNKFDAVWEGPYRITEVSNNGTYYITDKEGYTDIVHGDRLKLYHGATNMIPEIQSGNARST

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.69
2	0.66
3	0.64
4	0.65
5	0.55
6	0.53
7	0.49
8	0.47
9	0.46
10	0.42
11	0.36
12	0.34
13	0.35
14	0.36
15	0.41
16	0.44
17	0.47
18	0.49
19	0.53
20	0.5
21	0.53
22	0.5
23	0.46
24	0.4
25	0.33
26	0.3
27	0.27
28	0.25
29	0.23
30	0.21
31	0.16
32	0.16
33	0.2
34	0.22
35	0.23
36	0.23
37	0.23
38	0.25
39	0.27
40	0.35
41	0.36
42	0.4
43	0.43
44	0.42
45	0.44
46	0.43
47	0.42
48	0.35
49	0.32
50	0.28
51	0.25
52	0.26
53	0.21
54	0.21
55	0.22
56	0.19
57	0.15
58	0.14
59	0.12
60	0.1
61	0.14
62	0.18
63	0.18
64	0.21
65	0.25
66	0.27
67	0.28
68	0.28
69	0.28
70	0.28
71	0.31
72	0.29
73	0.28
74	0.25
75	0.25
76	0.25
77	0.24
78	0.22
79	0.19
80	0.19
81	0.23
82	0.29
83	0.36
84	0.44
85	0.52
86	0.58
87	0.66
88	0.75
89	0.75
90	0.79
91	0.79
92	0.77
93	0.74
94	0.7
95	0.63
96	0.55
97	0.56
98	0.5
99	0.48
100	0.45
101	0.39
102	0.39
103	0.42
104	0.46
105	0.48
106	0.52
107	0.52
108	0.52
109	0.54
110	0.49
111	0.46
112	0.39
113	0.32
114	0.23
115	0.18
116	0.12
117	0.09
118	0.08
119	0.07
120	0.06
121	0.08
122	0.09
123	0.12
124	0.12
125	0.17
126	0.21
127	0.25
128	0.32
129	0.33
130	0.38
131	0.43
132	0.51
133	0.53
134	0.53
135	0.51
136	0.45
137	0.41
138	0.35
139	0.29
140	0.23
141	0.25
142	0.26
143	0.3
144	0.38
145	0.46
146	0.51
147	0.55
148	0.58
149	0.56
150	0.6
151	0.65
152	0.62
153	0.65
154	0.67
155	0.65
156	0.64
157	0.59
158	0.51
159	0.42
160	0.36
161	0.25
162	0.19
163	0.14
164	0.1
165	0.08
166	0.08
167	0.08
168	0.07
169	0.07
170	0.07
171	0.07
172	0.07
173	0.08
174	0.07
175	0.06
176	0.12
177	0.12
178	0.17
179	0.21
180	0.22
181	0.23
182	0.24
183	0.31
184	0.3
185	0.35
186	0.38
187	0.45
188	0.51
189	0.58
190	0.59
191	0.56
192	0.62
193	0.66
194	0.63
195	0.62
196	0.6
197	0.6
198	0.68
199	0.73
200	0.73
201	0.69
202	0.7
203	0.65
204	0.66
205	0.69
206	0.65
207	0.64
208	0.58
209	0.57
210	0.55
211	0.51
212	0.46
213	0.42
214	0.41
215	0.35
216	0.4
217	0.36
218	0.32
219	0.31
220	0.3
221	0.26
222	0.21
223	0.24
224	0.2
225	0.24
226	0.28
227	0.34
228	0.33
229	0.34
230	0.36
231	0.32
232	0.31
233	0.31
234	0.3
235	0.3
236	0.34
237	0.36
238	0.36
239	0.37
240	0.37
241	0.37
242	0.4
243	0.4
244	0.35
245	0.31
246	0.29
247	0.33
248	0.36
249	0.39
250	0.39
251	0.36
252	0.37
253	0.4
254	0.4
255	0.39
256	0.34
257	0.28
258	0.29
259	0.3
260	0.34
261	0.42
262	0.51
263	0.56
264	0.63
265	0.71
266	0.73
267	0.79
268	0.81
269	0.77
270	0.74
271	0.71
272	0.69
273	0.66
274	0.62
275	0.54
276	0.49
277	0.43
278	0.4
279	0.34
280	0.29
281	0.21
282	0.17
283	0.13
284	0.12
285	0.11
286	0.08
287	0.07
288	0.07
289	0.06
290	0.07
291	0.09
292	0.11
293	0.13
294	0.15
295	0.16
296	0.16
297	0.16
298	0.15
299	0.15
300	0.13
301	0.15
302	0.13
303	0.13
304	0.12
305	0.14
306	0.15
307	0.15
308	0.16
309	0.13
310	0.13
311	0.14
312	0.14
313	0.2
314	0.21
315	0.27
316	0.35
317	0.35
318	0.35
319	0.36
320	0.38
321	0.33
322	0.32
323	0.29
324	0.26
325	0.3
326	0.31
327	0.3
328	0.3
329	0.27
330	0.27
331	0.22
332	0.15
333	0.12
334	0.1
335	0.09
336	0.08
337	0.09
338	0.1
339	0.12
340	0.17
341	0.22
342	0.3
343	0.34
344	0.37
345	0.37
346	0.35
347	0.36
348	0.33
349	0.31
350	0.25
351	0.22
352	0.2
353	0.21
354	0.21
355	0.21
356	0.21
357	0.17
358	0.18
359	0.18
360	0.21
361	0.21
362	0.26
363	0.31
364	0.35
365	0.39
366	0.44
367	0.51
368	0.57
369	0.63
370	0.61
371	0.64
372	0.71
373	0.76
374	0.78
375	0.77
376	0.74
377	0.77
378	0.78
379	0.76
380	0.74
381	0.68
382	0.63
383	0.65
384	0.64
385	0.62
386	0.65
387	0.59
388	0.57
389	0.6
390	0.58
391	0.53
392	0.54
393	0.52
394	0.46
395	0.53
396	0.54
397	0.54
398	0.54
399	0.56
400	0.54
401	0.52
402	0.56
403	0.55
404	0.55
405	0.53
406	0.51
407	0.48
408	0.43
409	0.4
410	0.35
411	0.28
412	0.23
413	0.18
414	0.15
415	0.12
416	0.11
417	0.09
418	0.08
419	0.07
420	0.05
421	0.04
422	0.04
423	0.05
424	0.06
425	0.07
426	0.07
427	0.07
428	0.07
429	0.07
430	0.08
431	0.1
432	0.13
433	0.16
434	0.16
435	0.17
436	0.18
437	0.18
438	0.18
439	0.18
440	0.18
441	0.2
442	0.23
443	0.24
444	0.24
445	0.27
446	0.28
447	0.26
448	0.22
449	0.22
450	0.19
451	0.16
452	0.17
453	0.16
454	0.17
455	0.2
456	0.24
457	0.24
458	0.28
459	0.28
460	0.26
461	0.27
462	0.25
463	0.28
464	0.29
465	0.31
466	0.29
467	0.31
468	0.34
469	0.33
470	0.31
471	0.24
472	0.19
473	0.12
474	0.09
475	0.08
476	0.04
477	0.04
478	0.04
479	0.04
480	0.03
481	0.03
482	0.04
483	0.03
484	0.03
485	0.03
486	0.03
487	0.05
488	0.05
489	0.05
490	0.05
491	0.07
492	0.07
493	0.07
494	0.07
495	0.06
496	0.07
497	0.07
498	0.07
499	0.05
500	0.05
501	0.06
502	0.05
503	0.05
504	0.05
505	0.06
506	0.09
507	0.09
508	0.09
509	0.09
510	0.09
511	0.11
512	0.12
513	0.14
514	0.12
515	0.15
516	0.16
517	0.17
518	0.18
519	0.17
520	0.15
521	0.13
522	0.12
523	0.1
524	0.08
525	0.07
526	0.06
527	0.05
528	0.06
529	0.06
530	0.05
531	0.04
532	0.04
533	0.05
534	0.05
535	0.06
536	0.07
537	0.08
538	0.09
539	0.1
540	0.1
541	0.1
542	0.1
543	0.11
544	0.11
545	0.11
546	0.13
547	0.13
548	0.16
549	0.16
550	0.16
551	0.15
552	0.14
553	0.16
554	0.17
555	0.18
556	0.2
557	0.23
558	0.25
559	0.24
560	0.24
561	0.21
562	0.17
563	0.15
564	0.11
565	0.08
566	0.05
567	0.06
568	0.07
569	0.07
570	0.07
571	0.08
572	0.08
573	0.08
574	0.08
575	0.06
576	0.07
577	0.07
578	0.08
579	0.09
580	0.09
581	0.09
582	0.09
583	0.13
584	0.12
585	0.14
586	0.13
587	0.12
588	0.12
589	0.12
590	0.13
591	0.11
592	0.15
593	0.14
594	0.15
595	0.14
596	0.15
597	0.15
598	0.15
599	0.18
600	0.15
601	0.13
602	0.12
603	0.12
604	0.12
605	0.12
606	0.11
607	0.07
608	0.05
609	0.09
610	0.11
611	0.12
612	0.12
613	0.11
614	0.13
615	0.15
616	0.2
617	0.19
618	0.19
619	0.19
620	0.25
621	0.29
622	0.35
623	0.36
624	0.37
625	0.4
626	0.41
627	0.42
628	0.36
629	0.33
630	0.28
631	0.26
632	0.2
633	0.14
634	0.12
635	0.1
636	0.1
637	0.09
638	0.1
639	0.12
640	0.13
641	0.13
642	0.13
643	0.13
644	0.15
645	0.19
646	0.18
647	0.17
648	0.17
649	0.18
650	0.19
651	0.25
652	0.22
653	0.19
654	0.18
655	0.16
656	0.19
657	0.19
658	0.18
659	0.12
660	0.12
661	0.11
662	0.11
663	0.12
664	0.07
665	0.07
666	0.07
667	0.06
668	0.06
669	0.06
670	0.08
671	0.07
672	0.07
673	0.1
674	0.11
675	0.16
676	0.18
677	0.18
678	0.2
679	0.25
680	0.3
681	0.33
682	0.37
683	0.4
684	0.48
685	0.54
686	0.61
687	0.62
688	0.59
689	0.6
690	0.63
691	0.57
692	0.55
693	0.54
694	0.5
695	0.48
696	0.48
697	0.43
698	0.39
699	0.39
700	0.33
701	0.29
702	0.27
703	0.26
704	0.25
705	0.29
706	0.28
707	0.29
708	0.3
709	0.3
710	0.27
711	0.33
712	0.31
713	0.26
714	0.24
715	0.22
716	0.21
717	0.21
718	0.19
719	0.13
720	0.15
721	0.15
722	0.14
723	0.17
724	0.18
725	0.17
726	0.17
727	0.19
728	0.19
729	0.2
730	0.2
731	0.17
732	0.17
733	0.16
734	0.16
735	0.15
736	0.19
737	0.23
738	0.26
739	0.3
740	0.29
741	0.39
742	0.47
743	0.55
744	0.57
745	0.62
746	0.67
747	0.71
748	0.73
749	0.73
750	0.73
751	0.72
752	0.69
753	0.63
754	0.58
755	0.54
756	0.6
757	0.55
758	0.49
759	0.44
760	0.4
761	0.39
762	0.36
763	0.34
764	0.27
765	0.22
766	0.19
767	0.18
768	0.17
769	0.15
770	0.14
771	0.11
772	0.1
773	0.09
774	0.1
775	0.09
776	0.07
777	0.08
778	0.09
779	0.13
780	0.13
781	0.14
782	0.14
783	0.14
784	0.14
785	0.15
786	0.15
787	0.12
788	0.11
789	0.11
790	0.1
791	0.09
792	0.1
793	0.1
794	0.09
795	0.1
796	0.11
797	0.11
798	0.12
799	0.14
800	0.17
801	0.2
802	0.24
803	0.27
804	0.27
805	0.27
806	0.28
807	0.28
808	0.28
809	0.34
810	0.38
811	0.36
812	0.39
813	0.42
814	0.48
815	0.53
816	0.52
817	0.47
818	0.43
819	0.4
820	0.38
821	0.35
822	0.29
823	0.22
824	0.2
825	0.17
826	0.13
827	0.16
828	0.16
829	0.16
830	0.15
831	0.15
832	0.17
833	0.18
834	0.2
835	0.21
836	0.24
837	0.31
838	0.35
839	0.37
840	0.34
841	0.33
842	0.32
843	0.3
844	0.35
845	0.27
846	0.23
847	0.22
848	0.23
849	0.27
850	0.27
851	0.33
852	0.3
853	0.38
854	0.43
855	0.49
856	0.56
857	0.55
858	0.61
859	0.58
860	0.58
861	0.54
862	0.52
863	0.47
864	0.39
865	0.36
866	0.29
867	0.25
868	0.18
869	0.13
870	0.1
871	0.09
872	0.09
873	0.07
874	0.08
875	0.09
876	0.11
877	0.13
878	0.13
879	0.14
880	0.15
881	0.21
882	0.24
883	0.26
884	0.26
885	0.29
886	0.35
887	0.33
888	0.32
889	0.25
890	0.22
891	0.2
892	0.19
893	0.14
894	0.09
895	0.1
896	0.1
897	0.11
898	0.13
899	0.16
900	0.16
901	0.2
902	0.2
903	0.2
904	0.21
905	0.21
906	0.19
907	0.18
908	0.17
909	0.15
910	0.2
911	0.2
912	0.26
913	0.31
914	0.33
915	0.34
916	0.37
917	0.43
918	0.47
919	0.52
920	0.56
921	0.56
922	0.62
923	0.64
924	0.7
925	0.73
926	0.72
927	0.74
928	0.75
929	0.75
930	0.72
931	0.69
932	0.66
933	0.66
934	0.6
935	0.58
936	0.48
937	0.52
938	0.48
939	0.47
940	0.42
941	0.32
942	0.31
943	0.25
944	0.25
945	0.22
946	0.25
947	0.27
948	0.25
949	0.25
950	0.23
951	0.22
952	0.23
953	0.18
954	0.18
955	0.17
956	0.19
957	0.19
958	0.19
959	0.21
960	0.2
961	0.2
962	0.18
963	0.21
964	0.25
965	0.28
966	0.28
967	0.27
968	0.26
969	0.25
970	0.25
971	0.22
972	0.19
973	0.17
974	0.16
975	0.18
976	0.19
977	0.2
978	0.19
979	0.17
980	0.17
981	0.18
982	0.2
983	0.19
984	0.2
985	0.2
986	0.2
987	0.21
988	0.22
989	0.22
990	0.24
991	0.24
992	0.25
993	0.23
994	0.27
995	0.25
996	0.23
997	0.21
998	0.17
999	0.17
1000	0.16
1001	0.2

A0A1R1PR52

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer