FuNGI

A0A1R1PU17

Protein Details

Accession

A0A1R1PU17

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
242-262	PTCYHCGRKGHRKYECRQLAQ	Hydrophilic
1083-1113	GLDNSKVKKLKQKGYYDKKVKEKLFRKNDIV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
157-180	IKAVVKPKPLSSKDRLNEARKRFQ
183-183	R
306-366	YKKKEHLNINIKKFEVKLKENKIKNTKVIKPNKTIKEIEMKKAPTLRSRESDPKAKAYTKK

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR041588 Integrase_H2C2 IPR021109 Peptidase_aspartic_dom_sf IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR041373 RT_RNaseH IPR001878 Znf_CCHC
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF17921 Integrase_H2C2 PF17917 RT_RNaseH PF00665 rve PF08284 RVP_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd00303 retropepsin_like cd09274 RNase_HI_RT_Ty3

Amino Acid Sequences

MMEKPVIFEAQGSFDPKEWIYRYKLIAKVNKWTDTDAIELIQLYLGKKELQWYKKNIKEFKDWDTLVTKFTEKYSSKEMNFVYWKKIQMIKQEDFASIEDFELELEELFEKAEVTDEGVKWNCLMNALSEKNKRKVLESDHKKWADTIKLIKKSEQIKAVVKPKPLSSKDRLNEARKRFQDSREKFEQRNKMKEKAKQDNDYNDMMKQFEKLSVNVMNKVDEVVDRRLNKTRGRTYHDRFIPTCYHCGRKGHRKYECRQLAQEETEYETSSEDSDDLNCIEVEDISYDEVYGADRVDKNKPAIGPYKKKEHLNINIKKFEVKLKENKIKNTKVIKPNKTIKEIEMKKAPTLRSRESDPKAKAYTKKKYTIKAAENTDSYSLKEDLGTVFPKISMIQLLEASPKLAKEMVNLCKRVEDKEVNEIKYKETKTSNCKVTVEVFGQEVKTILDTGAACSVATPELVENWGLEVERDTSQMIITADGSKHASLGKVLDVPIRIGKQVFNADLTVMDRYDQSLILGTDWLVRHKATIDLELSQLIISNGGFSVHLPLKTSKATVLTSYDESELRTRASSSGLGTNVHRHDRCKNKEWTWSETEEKALSNLKQALLDAPVLAHPDWERMFIVTTDASIDGIGAIISQKYESGERPIAYISRKTTKHERNYSISHLEGLAVVWAVVKFKYYIWGRKFIIKTDHKSLLNLFNGKELTGRVARWAMLLRNYDYEIQHLPGKKNPADSLSRLSMETATDEEEDDAEYVDLNCLEIGEYNRIIDNLMTSDNLLENQDESRSASDAHSGKRYILKDGELYIKIGNTEKQVLNTDNASEEICKVHFETHEGVENTFKRIKQRFYGKNLFKITQGVVRSCEVCQLFKGNKSRKNYLNTVEGNRPFEIWGIDAMGPINPVSKSGNRYILTAVDYCTKWPVALPVPNLLSSTIINFIIYKIVMDYGVPTQLITDQGSSFMSEATKAVYKWLGIKHAPTSGYRPQSNGQVERLNRSIKSIMAKQIDEDYLNWDTYLWKTLLILRTLSSKTTGFTPAELLYGKDLTMAHNWTPTNLIDRRNELVHHRIEFLSTGLKQIRELGLDNSKVKKLKQKGYYDKKVKEKLFRKNDIVLKFIEGEKTKFQRIWKGPYKVEKILINGTYVIVDSEGNSELVNGDTLKLFHESN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.22
2	0.25
3	0.24
4	0.3
5	0.29
6	0.32
7	0.34
8	0.39
9	0.44
10	0.49
11	0.54
12	0.56
13	0.61
14	0.6
15	0.64
16	0.66
17	0.66
18	0.59
19	0.56
20	0.5
21	0.43
22	0.42
23	0.32
24	0.25
25	0.2
26	0.18
27	0.16
28	0.14
29	0.14
30	0.12
31	0.12
32	0.13
33	0.13
34	0.14
35	0.22
36	0.3
37	0.37
38	0.45
39	0.53
40	0.62
41	0.68
42	0.76
43	0.76
44	0.73
45	0.74
46	0.71
47	0.69
48	0.68
49	0.62
50	0.56
51	0.54
52	0.48
53	0.4
54	0.38
55	0.32
56	0.24
57	0.26
58	0.31
59	0.27
60	0.31
61	0.38
62	0.44
63	0.43
64	0.48
65	0.47
66	0.46
67	0.53
68	0.51
69	0.49
70	0.45
71	0.47
72	0.46
73	0.52
74	0.48
75	0.5
76	0.56
77	0.52
78	0.53
79	0.52
80	0.48
81	0.43
82	0.39
83	0.31
84	0.23
85	0.2
86	0.14
87	0.12
88	0.11
89	0.1
90	0.09
91	0.06
92	0.07
93	0.07
94	0.07
95	0.07
96	0.07
97	0.06
98	0.06
99	0.08
100	0.07
101	0.1
102	0.15
103	0.15
104	0.21
105	0.22
106	0.22
107	0.21
108	0.23
109	0.2
110	0.17
111	0.18
112	0.16
113	0.23
114	0.27
115	0.35
116	0.42
117	0.49
118	0.54
119	0.59
120	0.57
121	0.53
122	0.57
123	0.59
124	0.61
125	0.63
126	0.64
127	0.69
128	0.69
129	0.65
130	0.6
131	0.56
132	0.52
133	0.48
134	0.5
135	0.5
136	0.57
137	0.58
138	0.59
139	0.59
140	0.59
141	0.59
142	0.55
143	0.51
144	0.49
145	0.55
146	0.61
147	0.59
148	0.58
149	0.55
150	0.55
151	0.59
152	0.59
153	0.59
154	0.57
155	0.62
156	0.59
157	0.67
158	0.69
159	0.68
160	0.71
161	0.72
162	0.75
163	0.68
164	0.74
165	0.68
166	0.69
167	0.71
168	0.68
169	0.68
170	0.68
171	0.71
172	0.67
173	0.72
174	0.73
175	0.71
176	0.75
177	0.73
178	0.72
179	0.74
180	0.76
181	0.77
182	0.78
183	0.78
184	0.76
185	0.77
186	0.76
187	0.72
188	0.69
189	0.6
190	0.51
191	0.43
192	0.36
193	0.29
194	0.22
195	0.19
196	0.2
197	0.2
198	0.19
199	0.22
200	0.27
201	0.29
202	0.33
203	0.33
204	0.28
205	0.26
206	0.26
207	0.22
208	0.17
209	0.19
210	0.2
211	0.25
212	0.27
213	0.31
214	0.39
215	0.43
216	0.47
217	0.52
218	0.56
219	0.57
220	0.64
221	0.7
222	0.69
223	0.74
224	0.74
225	0.7
226	0.61
227	0.59
228	0.58
229	0.51
230	0.51
231	0.45
232	0.45
233	0.43
234	0.5
235	0.54
236	0.58
237	0.65
238	0.68
239	0.73
240	0.77
241	0.78
242	0.81
243	0.81
244	0.76
245	0.69
246	0.65
247	0.61
248	0.55
249	0.52
250	0.42
251	0.36
252	0.32
253	0.28
254	0.22
255	0.17
256	0.14
257	0.13
258	0.12
259	0.08
260	0.08
261	0.08
262	0.09
263	0.08
264	0.09
265	0.08
266	0.08
267	0.08
268	0.07
269	0.07
270	0.06
271	0.07
272	0.06
273	0.06
274	0.06
275	0.06
276	0.06
277	0.06
278	0.06
279	0.06
280	0.09
281	0.11
282	0.14
283	0.19
284	0.23
285	0.24
286	0.27
287	0.28
288	0.3
289	0.37
290	0.44
291	0.49
292	0.5
293	0.59
294	0.61
295	0.64
296	0.65
297	0.65
298	0.65
299	0.66
300	0.7
301	0.68
302	0.67
303	0.63
304	0.59
305	0.51
306	0.48
307	0.44
308	0.43
309	0.44
310	0.5
311	0.59
312	0.62
313	0.7
314	0.72
315	0.7
316	0.71
317	0.71
318	0.69
319	0.71
320	0.76
321	0.74
322	0.74
323	0.78
324	0.76
325	0.73
326	0.66
327	0.59
328	0.6
329	0.57
330	0.54
331	0.51
332	0.46
333	0.44
334	0.47
335	0.46
336	0.43
337	0.45
338	0.44
339	0.4
340	0.45
341	0.51
342	0.51
343	0.57
344	0.53
345	0.53
346	0.53
347	0.55
348	0.57
349	0.58
350	0.63
351	0.61
352	0.68
353	0.67
354	0.69
355	0.72
356	0.73
357	0.71
358	0.68
359	0.66
360	0.6
361	0.55
362	0.5
363	0.43
364	0.34
365	0.27
366	0.23
367	0.18
368	0.14
369	0.13
370	0.13
371	0.11
372	0.13
373	0.14
374	0.11
375	0.11
376	0.1
377	0.11
378	0.1
379	0.09
380	0.08
381	0.07
382	0.08
383	0.08
384	0.09
385	0.1
386	0.1
387	0.1
388	0.1
389	0.09
390	0.09
391	0.1
392	0.09
393	0.12
394	0.19
395	0.27
396	0.33
397	0.34
398	0.34
399	0.36
400	0.37
401	0.36
402	0.35
403	0.31
404	0.27
405	0.36
406	0.42
407	0.4
408	0.43
409	0.41
410	0.38
411	0.4
412	0.39
413	0.33
414	0.34
415	0.38
416	0.41
417	0.49
418	0.51
419	0.47
420	0.47
421	0.44
422	0.4
423	0.38
424	0.31
425	0.24
426	0.2
427	0.17
428	0.16
429	0.15
430	0.12
431	0.08
432	0.07
433	0.07
434	0.06
435	0.07
436	0.07
437	0.08
438	0.08
439	0.08
440	0.08
441	0.07
442	0.08
443	0.06
444	0.06
445	0.05
446	0.04
447	0.04
448	0.05
449	0.05
450	0.05
451	0.05
452	0.05
453	0.05
454	0.05
455	0.05
456	0.07
457	0.08
458	0.08
459	0.08
460	0.08
461	0.08
462	0.1
463	0.09
464	0.07
465	0.07
466	0.09
467	0.09
468	0.1
469	0.11
470	0.09
471	0.09
472	0.09
473	0.09
474	0.07
475	0.08
476	0.08
477	0.09
478	0.09
479	0.1
480	0.1
481	0.11
482	0.13
483	0.13
484	0.12
485	0.12
486	0.12
487	0.13
488	0.15
489	0.14
490	0.13
491	0.12
492	0.12
493	0.12
494	0.12
495	0.09
496	0.07
497	0.07
498	0.06
499	0.07
500	0.07
501	0.07
502	0.06
503	0.07
504	0.07
505	0.07
506	0.07
507	0.06
508	0.09
509	0.09
510	0.1
511	0.1
512	0.09
513	0.1
514	0.1
515	0.13
516	0.1
517	0.12
518	0.12
519	0.12
520	0.13
521	0.12
522	0.12
523	0.09
524	0.08
525	0.06
526	0.05
527	0.04
528	0.04
529	0.04
530	0.04
531	0.04
532	0.04
533	0.08
534	0.09
535	0.09
536	0.11
537	0.12
538	0.14
539	0.15
540	0.15
541	0.12
542	0.13
543	0.14
544	0.13
545	0.14
546	0.14
547	0.15
548	0.15
549	0.15
550	0.13
551	0.13
552	0.14
553	0.12
554	0.1
555	0.1
556	0.09
557	0.09
558	0.1
559	0.1
560	0.1
561	0.12
562	0.12
563	0.13
564	0.13
565	0.17
566	0.18
567	0.22
568	0.22
569	0.22
570	0.29
571	0.38
572	0.44
573	0.47
574	0.52
575	0.51
576	0.59
577	0.6
578	0.58
579	0.52
580	0.5
581	0.44
582	0.37
583	0.35
584	0.26
585	0.23
586	0.18
587	0.17
588	0.13
589	0.13
590	0.14
591	0.13
592	0.13
593	0.13
594	0.12
595	0.11
596	0.11
597	0.07
598	0.06
599	0.06
600	0.07
601	0.07
602	0.07
603	0.06
604	0.09
605	0.09
606	0.1
607	0.1
608	0.09
609	0.1
610	0.09
611	0.1
612	0.07
613	0.07
614	0.06
615	0.06
616	0.06
617	0.05
618	0.05
619	0.03
620	0.03
621	0.03
622	0.03
623	0.03
624	0.03
625	0.03
626	0.03
627	0.03
628	0.04
629	0.06
630	0.07
631	0.11
632	0.14
633	0.14
634	0.15
635	0.15
636	0.16
637	0.17
638	0.19
639	0.19
640	0.24
641	0.25
642	0.29
643	0.39
644	0.46
645	0.54
646	0.59
647	0.61
648	0.59
649	0.61
650	0.61
651	0.53
652	0.44
653	0.35
654	0.26
655	0.21
656	0.15
657	0.11
658	0.07
659	0.04
660	0.04
661	0.04
662	0.04
663	0.04
664	0.04
665	0.05
666	0.05
667	0.05
668	0.13
669	0.16
670	0.24
671	0.27
672	0.34
673	0.35
674	0.42
675	0.43
676	0.38
677	0.45
678	0.43
679	0.46
680	0.45
681	0.5
682	0.43
683	0.43
684	0.43
685	0.39
686	0.36
687	0.33
688	0.27
689	0.23
690	0.23
691	0.22
692	0.2
693	0.14
694	0.14
695	0.13
696	0.13
697	0.12
698	0.13
699	0.13
700	0.14
701	0.15
702	0.14
703	0.16
704	0.19
705	0.18
706	0.18
707	0.2
708	0.21
709	0.19
710	0.2
711	0.16
712	0.16
713	0.19
714	0.21
715	0.21
716	0.22
717	0.28
718	0.27
719	0.29
720	0.29
721	0.29
722	0.29
723	0.3
724	0.31
725	0.28
726	0.27
727	0.24
728	0.23
729	0.2
730	0.16
731	0.15
732	0.1
733	0.09
734	0.08
735	0.09
736	0.08
737	0.08
738	0.08
739	0.07
740	0.07
741	0.05
742	0.05
743	0.05
744	0.05
745	0.05
746	0.05
747	0.04
748	0.04
749	0.04
750	0.06
751	0.07
752	0.09
753	0.1
754	0.1
755	0.11
756	0.11
757	0.11
758	0.09
759	0.08
760	0.07
761	0.07
762	0.07
763	0.07
764	0.07
765	0.07
766	0.08
767	0.08
768	0.07
769	0.07
770	0.07
771	0.08
772	0.08
773	0.09
774	0.09
775	0.09
776	0.1
777	0.1
778	0.15
779	0.18
780	0.2
781	0.23
782	0.23
783	0.24
784	0.29
785	0.3
786	0.27
787	0.26
788	0.25
789	0.23
790	0.25
791	0.28
792	0.23
793	0.23
794	0.19
795	0.17
796	0.17
797	0.17
798	0.16
799	0.13
800	0.18
801	0.18
802	0.19
803	0.22
804	0.23
805	0.23
806	0.21
807	0.2
808	0.16
809	0.15
810	0.14
811	0.11
812	0.1
813	0.1
814	0.09
815	0.1
816	0.1
817	0.12
818	0.12
819	0.15
820	0.17
821	0.17
822	0.24
823	0.23
824	0.23
825	0.26
826	0.27
827	0.28
828	0.29
829	0.28
830	0.3
831	0.36
832	0.4
833	0.43
834	0.53
835	0.57
836	0.62
837	0.72
838	0.68
839	0.71
840	0.71
841	0.63
842	0.54
843	0.48
844	0.4
845	0.35
846	0.32
847	0.25
848	0.23
849	0.23
850	0.23
851	0.21
852	0.25
853	0.21
854	0.19
855	0.19
856	0.23
857	0.25
858	0.3
859	0.4
860	0.43
861	0.48
862	0.54
863	0.61
864	0.61
865	0.65
866	0.65
867	0.59
868	0.6
869	0.58
870	0.56
871	0.57
872	0.53
873	0.49
874	0.43
875	0.39
876	0.31
877	0.27
878	0.22
879	0.15
880	0.12
881	0.11
882	0.11
883	0.1
884	0.1
885	0.1
886	0.09
887	0.09
888	0.1
889	0.08
890	0.09
891	0.12
892	0.16
893	0.2
894	0.24
895	0.32
896	0.31
897	0.32
898	0.32
899	0.31
900	0.29
901	0.26
902	0.23
903	0.2
904	0.19
905	0.19
906	0.2
907	0.18
908	0.15
909	0.15
910	0.19
911	0.2
912	0.25
913	0.26
914	0.29
915	0.3
916	0.3
917	0.3
918	0.25
919	0.2
920	0.16
921	0.15
922	0.12
923	0.11
924	0.11
925	0.1
926	0.1
927	0.11
928	0.1
929	0.09
930	0.07
931	0.08
932	0.07
933	0.07
934	0.09
935	0.08
936	0.1
937	0.1
938	0.09
939	0.09
940	0.1
941	0.12
942	0.11
943	0.11
944	0.1
945	0.11
946	0.12
947	0.12
948	0.11
949	0.1
950	0.09
951	0.08
952	0.08
953	0.1
954	0.12
955	0.12
956	0.14
957	0.15
958	0.15
959	0.2
960	0.23
961	0.27
962	0.26
963	0.3
964	0.3
965	0.33
966	0.34
967	0.31
968	0.34
969	0.36
970	0.42
971	0.4
972	0.41
973	0.39
974	0.46
975	0.51
976	0.48
977	0.44
978	0.44
979	0.45
980	0.47
981	0.49
982	0.44
983	0.37
984	0.38
985	0.35
986	0.31
987	0.36
988	0.35
989	0.38
990	0.39
991	0.39
992	0.36
993	0.39
994	0.37
995	0.32
996	0.27
997	0.24
998	0.21
999	0.21
1000	0.19
1001	0.16
1002	0.16
1003	0.16
1004	0.19
1005	0.14
1006	0.12
1007	0.13
1008	0.19
1009	0.24
1010	0.24
1011	0.23
1012	0.2
1013	0.26
1014	0.27
1015	0.27
1016	0.24
1017	0.2
1018	0.2
1019	0.22
1020	0.26
1021	0.21
1022	0.2
1023	0.22
1024	0.2
1025	0.21
1026	0.21
1027	0.18
1028	0.16
1029	0.16
1030	0.15
1031	0.14
1032	0.13
1033	0.14
1034	0.17
1035	0.2
1036	0.19
1037	0.24
1038	0.24
1039	0.23
1040	0.25
1041	0.23
1042	0.27
1043	0.27
1044	0.32
1045	0.32
1046	0.36
1047	0.39
1048	0.39
1049	0.41
1050	0.39
1051	0.42
1052	0.42
1053	0.4
1054	0.38
1055	0.35
1056	0.34
1057	0.32
1058	0.27
1059	0.26
1060	0.2
1061	0.24
1062	0.24
1063	0.25
1064	0.24
1065	0.28
1066	0.28
1067	0.25
1068	0.26
1069	0.26
1070	0.3
1071	0.35
1072	0.39
1073	0.39
1074	0.43
1075	0.44
1076	0.46
1077	0.5
1078	0.53
1079	0.57
1080	0.62
1081	0.69
1082	0.75
1083	0.82
1084	0.89
1085	0.89
1086	0.88
1087	0.89
1088	0.89
1089	0.85
1090	0.85
1091	0.83
1092	0.83
1093	0.83
1094	0.83
1095	0.79
1096	0.78
1097	0.78
1098	0.71
1099	0.64
1100	0.55
1101	0.47
1102	0.42
1103	0.37
1104	0.36
1105	0.31
1106	0.31
1107	0.38
1108	0.41
1109	0.43
1110	0.44
1111	0.48
1112	0.51
1113	0.56
1114	0.63
1115	0.64
1116	0.67
1117	0.7
1118	0.76
1119	0.79
1120	0.73
1121	0.71
1122	0.64
1123	0.59
1124	0.58
1125	0.51
1126	0.42
1127	0.35
1128	0.3
1129	0.25
1130	0.21
1131	0.17
1132	0.1
1133	0.09
1134	0.08
1135	0.1
1136	0.11
1137	0.1
1138	0.1
1139	0.1
1140	0.1
1141	0.1
1142	0.11
1143	0.09
1144	0.09
1145	0.1
1146	0.11
1147	0.13

A0A1R1PU17

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer