FuNGI

A0A0C4F9D2

Protein Details

Accession

A0A0C4F9D2

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
982-1004	VAEVLDCRKKRRKTEYLIAWNGY	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 14, cyto 6, cyto_mito 5.5, mito 3, plas 1, extr 1, pero 1, E.R. 1

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016197 Chromo-like_dom_sf IPR000953 Chromo/chromo_shadow_dom IPR023780 Chromo_domain IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR041588 Integrase_H2C2 IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR041577 RT_RNaseH_2 IPR036875 Znf_CCHC_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF00385 Chromo PF17921 Integrase_H2C2 PF14223 Retrotran_gag_2 PF17919 RT_RNaseH_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50013 CHROMO_2 PS50994 INTEGRASE
CDD	cd00024 CD_CSD cd09274 RNase_HI_RT_Ty3

Amino Acid Sequences

MPARTTQNPLALIGNVPVLDGNSVGFPAWRTRLEELFAIQGVHNIVTGRLLRLETDCKEKEPRPLTQGSQHLYYAKELATDWDSLSNIACATLKMMLSIDLAIRYKDTKPVSVLFKTICDAYEKNTRARRMMLQDAFWCARHDPNKPIATWIARICNTASDLKSVKLAPADQQICDRLLCGLDKTWKPIWDYLVYSPNEMSLDDAIGALKAHEVSMQVSFDHTPEAFASPAVARQKKPGCWACREIGHHSSACPNPLAKNKGKARFETWAGAVSTVRLGGGGQSKNEEDEEEEDNFDREIDFWFSARGLDKIASGVFSLSESEHYFSHSQVSQDFQSVNFRFLIPVQLNSRAAFKTLKTAFTTAPILKIASPYKPFLLECDCSNFALGAVLSQVCNWDGELHPVAYLSRSLIQAEQNYEIFDKELLAIVAAFKEWQHYLEGNSNWLKAIMYNNHRNLESFMTTKSPTRRQVWPDALSRRSNLAPKGEEKLTFGQILRPKNITPETFSAIAEADEFFVNESIDLEDATHWFEVDASGAKEVNLEPEESKEDLIPSDLELMSAICEASTRDSRLTDLMKDCQEQEGSAQGWSSKDGIVYRAGLVEVPADEAIRTAIVRSRHDCRTAGHPGRAKTLALVRQCFTWPSQKKFVNWYVDGCGSCQRVKSSTQNPFGSLEPLPIPAGPWTDISYDLITDLPKSNGCNSILTVANRLTKMVHFIPCKKTMTSVELADLMLQHVWKLHGTPKTIVSDRGSIFISQITRELSSQLGIRLCPSTAYHPQTDGQSKISNKSVEQYLRHFVGYWQDDWESLLAMAEFSHNNNRHTSTGIYLFKANYGFDLLLGGILSPTQCLPAVDARLKTLAKVQDELAAHLEEAQKAMKTQFDQHVRPTPDWKIGDSVWLSSKDISTTRPSPKLGHRWLGPFPISDKISPSVHKLTLPLSMKGVHPTFHVSVLRKHSVDTISGRVEEAPGPVTVEGEDRWEVAEVLDCRKKRRKTEYLIAWNGYGPEDNSWEPEENLAHCQELLTDFNTKFPDAARRHTRKGDSNE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.2
2	0.14
3	0.13
4	0.12
5	0.1
6	0.09
7	0.08
8	0.08
9	0.07
10	0.07
11	0.07
12	0.08
13	0.09
14	0.14
15	0.19
16	0.21
17	0.25
18	0.29
19	0.32
20	0.34
21	0.34
22	0.3
23	0.29
24	0.27
25	0.24
26	0.2
27	0.19
28	0.18
29	0.16
30	0.15
31	0.12
32	0.11
33	0.14
34	0.15
35	0.14
36	0.16
37	0.16
38	0.17
39	0.2
40	0.27
41	0.26
42	0.34
43	0.34
44	0.36
45	0.44
46	0.46
47	0.52
48	0.51
49	0.55
50	0.52
51	0.57
52	0.57
53	0.57
54	0.61
55	0.55
56	0.53
57	0.48
58	0.44
59	0.39
60	0.36
61	0.3
62	0.23
63	0.2
64	0.17
65	0.19
66	0.18
67	0.18
68	0.17
69	0.17
70	0.17
71	0.17
72	0.17
73	0.14
74	0.11
75	0.11
76	0.11
77	0.08
78	0.1
79	0.12
80	0.11
81	0.11
82	0.12
83	0.11
84	0.12
85	0.13
86	0.12
87	0.13
88	0.14
89	0.13
90	0.15
91	0.17
92	0.18
93	0.24
94	0.26
95	0.26
96	0.29
97	0.35
98	0.4
99	0.39
100	0.42
101	0.35
102	0.34
103	0.32
104	0.29
105	0.24
106	0.22
107	0.21
108	0.22
109	0.31
110	0.32
111	0.38
112	0.45
113	0.48
114	0.46
115	0.5
116	0.52
117	0.5
118	0.57
119	0.52
120	0.49
121	0.47
122	0.5
123	0.47
124	0.41
125	0.36
126	0.28
127	0.32
128	0.34
129	0.37
130	0.38
131	0.45
132	0.48
133	0.46
134	0.48
135	0.46
136	0.43
137	0.43
138	0.4
139	0.39
140	0.35
141	0.36
142	0.33
143	0.3
144	0.3
145	0.3
146	0.27
147	0.25
148	0.25
149	0.25
150	0.27
151	0.25
152	0.24
153	0.22
154	0.22
155	0.21
156	0.29
157	0.3
158	0.28
159	0.31
160	0.31
161	0.29
162	0.28
163	0.24
164	0.15
165	0.15
166	0.15
167	0.14
168	0.16
169	0.23
170	0.24
171	0.3
172	0.33
173	0.35
174	0.37
175	0.39
176	0.39
177	0.35
178	0.37
179	0.35
180	0.39
181	0.36
182	0.34
183	0.31
184	0.27
185	0.24
186	0.2
187	0.17
188	0.1
189	0.1
190	0.08
191	0.09
192	0.07
193	0.07
194	0.07
195	0.06
196	0.06
197	0.05
198	0.05
199	0.06
200	0.07
201	0.08
202	0.1
203	0.11
204	0.1
205	0.11
206	0.12
207	0.11
208	0.13
209	0.11
210	0.11
211	0.11
212	0.13
213	0.11
214	0.1
215	0.12
216	0.1
217	0.15
218	0.22
219	0.25
220	0.25
221	0.33
222	0.4
223	0.42
224	0.51
225	0.55
226	0.52
227	0.55
228	0.6
229	0.55
230	0.56
231	0.57
232	0.53
233	0.49
234	0.46
235	0.4
236	0.36
237	0.38
238	0.33
239	0.3
240	0.25
241	0.23
242	0.24
243	0.32
244	0.38
245	0.36
246	0.44
247	0.51
248	0.59
249	0.61
250	0.6
251	0.57
252	0.56
253	0.54
254	0.48
255	0.4
256	0.35
257	0.31
258	0.28
259	0.23
260	0.17
261	0.15
262	0.11
263	0.1
264	0.06
265	0.05
266	0.07
267	0.14
268	0.14
269	0.15
270	0.17
271	0.18
272	0.19
273	0.19
274	0.17
275	0.12
276	0.14
277	0.16
278	0.15
279	0.16
280	0.15
281	0.16
282	0.15
283	0.13
284	0.1
285	0.08
286	0.09
287	0.11
288	0.11
289	0.1
290	0.11
291	0.11
292	0.13
293	0.13
294	0.12
295	0.1
296	0.1
297	0.1
298	0.1
299	0.1
300	0.09
301	0.08
302	0.08
303	0.06
304	0.06
305	0.07
306	0.06
307	0.08
308	0.09
309	0.1
310	0.1
311	0.13
312	0.13
313	0.13
314	0.16
315	0.16
316	0.16
317	0.15
318	0.18
319	0.16
320	0.17
321	0.17
322	0.14
323	0.22
324	0.21
325	0.22
326	0.2
327	0.19
328	0.18
329	0.18
330	0.23
331	0.15
332	0.19
333	0.2
334	0.23
335	0.24
336	0.24
337	0.26
338	0.2
339	0.21
340	0.19
341	0.17
342	0.21
343	0.22
344	0.25
345	0.24
346	0.26
347	0.24
348	0.26
349	0.3
350	0.21
351	0.21
352	0.18
353	0.17
354	0.15
355	0.19
356	0.18
357	0.18
358	0.2
359	0.2
360	0.2
361	0.22
362	0.21
363	0.2
364	0.23
365	0.2
366	0.19
367	0.23
368	0.23
369	0.21
370	0.22
371	0.19
372	0.13
373	0.13
374	0.11
375	0.05
376	0.05
377	0.05
378	0.05
379	0.05
380	0.06
381	0.05
382	0.06
383	0.06
384	0.07
385	0.07
386	0.11
387	0.12
388	0.11
389	0.11
390	0.11
391	0.11
392	0.1
393	0.1
394	0.07
395	0.08
396	0.08
397	0.09
398	0.11
399	0.13
400	0.14
401	0.16
402	0.17
403	0.15
404	0.15
405	0.15
406	0.13
407	0.11
408	0.09
409	0.08
410	0.06
411	0.06
412	0.05
413	0.05
414	0.05
415	0.05
416	0.05
417	0.04
418	0.04
419	0.03
420	0.05
421	0.06
422	0.07
423	0.08
424	0.09
425	0.11
426	0.17
427	0.17
428	0.19
429	0.2
430	0.19
431	0.17
432	0.17
433	0.15
434	0.1
435	0.14
436	0.17
437	0.23
438	0.3
439	0.34
440	0.36
441	0.36
442	0.35
443	0.33
444	0.29
445	0.25
446	0.18
447	0.15
448	0.16
449	0.17
450	0.2
451	0.24
452	0.28
453	0.32
454	0.35
455	0.41
456	0.43
457	0.51
458	0.53
459	0.52
460	0.52
461	0.52
462	0.52
463	0.47
464	0.43
465	0.37
466	0.33
467	0.32
468	0.27
469	0.25
470	0.23
471	0.24
472	0.27
473	0.26
474	0.24
475	0.24
476	0.24
477	0.21
478	0.2
479	0.18
480	0.19
481	0.22
482	0.25
483	0.24
484	0.23
485	0.22
486	0.25
487	0.28
488	0.24
489	0.22
490	0.22
491	0.23
492	0.22
493	0.22
494	0.18
495	0.15
496	0.14
497	0.11
498	0.08
499	0.06
500	0.05
501	0.05
502	0.05
503	0.05
504	0.05
505	0.04
506	0.05
507	0.04
508	0.04
509	0.04
510	0.04
511	0.04
512	0.05
513	0.06
514	0.05
515	0.05
516	0.05
517	0.05
518	0.04
519	0.05
520	0.06
521	0.05
522	0.06
523	0.06
524	0.06
525	0.06
526	0.06
527	0.08
528	0.08
529	0.08
530	0.08
531	0.09
532	0.12
533	0.11
534	0.12
535	0.1
536	0.09
537	0.09
538	0.09
539	0.08
540	0.06
541	0.07
542	0.07
543	0.07
544	0.06
545	0.06
546	0.06
547	0.06
548	0.05
549	0.03
550	0.03
551	0.04
552	0.07
553	0.09
554	0.1
555	0.1
556	0.11
557	0.12
558	0.15
559	0.16
560	0.16
561	0.17
562	0.19
563	0.2
564	0.21
565	0.2
566	0.19
567	0.18
568	0.14
569	0.13
570	0.12
571	0.11
572	0.1
573	0.1
574	0.09
575	0.09
576	0.1
577	0.1
578	0.07
579	0.08
580	0.08
581	0.1
582	0.1
583	0.1
584	0.1
585	0.09
586	0.09
587	0.08
588	0.07
589	0.06
590	0.05
591	0.05
592	0.05
593	0.05
594	0.04
595	0.05
596	0.05
597	0.04
598	0.04
599	0.04
600	0.07
601	0.11
602	0.14
603	0.17
604	0.22
605	0.26
606	0.29
607	0.29
608	0.28
609	0.32
610	0.39
611	0.4
612	0.41
613	0.42
614	0.4
615	0.43
616	0.42
617	0.35
618	0.27
619	0.28
620	0.27
621	0.27
622	0.28
623	0.24
624	0.24
625	0.25
626	0.24
627	0.21
628	0.26
629	0.29
630	0.33
631	0.41
632	0.43
633	0.44
634	0.5
635	0.55
636	0.51
637	0.46
638	0.42
639	0.36
640	0.36
641	0.34
642	0.28
643	0.25
644	0.21
645	0.21
646	0.2
647	0.19
648	0.18
649	0.22
650	0.29
651	0.34
652	0.41
653	0.47
654	0.47
655	0.47
656	0.47
657	0.43
658	0.38
659	0.29
660	0.22
661	0.15
662	0.15
663	0.13
664	0.11
665	0.11
666	0.09
667	0.11
668	0.1
669	0.1
670	0.11
671	0.11
672	0.12
673	0.13
674	0.12
675	0.1
676	0.1
677	0.09
678	0.08
679	0.09
680	0.1
681	0.09
682	0.1
683	0.12
684	0.14
685	0.17
686	0.18
687	0.18
688	0.17
689	0.19
690	0.21
691	0.2
692	0.21
693	0.19
694	0.21
695	0.2
696	0.2
697	0.18
698	0.15
699	0.19
700	0.21
701	0.24
702	0.26
703	0.33
704	0.38
705	0.42
706	0.45
707	0.4
708	0.4
709	0.37
710	0.37
711	0.34
712	0.29
713	0.24
714	0.22
715	0.22
716	0.18
717	0.15
718	0.11
719	0.08
720	0.07
721	0.06
722	0.06
723	0.07
724	0.07
725	0.09
726	0.14
727	0.18
728	0.21
729	0.23
730	0.26
731	0.31
732	0.32
733	0.34
734	0.31
735	0.32
736	0.29
737	0.29
738	0.26
739	0.21
740	0.2
741	0.2
742	0.18
743	0.12
744	0.14
745	0.13
746	0.13
747	0.13
748	0.14
749	0.11
750	0.12
751	0.13
752	0.14
753	0.14
754	0.13
755	0.14
756	0.14
757	0.14
758	0.14
759	0.14
760	0.17
761	0.24
762	0.28
763	0.28
764	0.29
765	0.31
766	0.35
767	0.38
768	0.33
769	0.28
770	0.3
771	0.3
772	0.32
773	0.36
774	0.32
775	0.28
776	0.31
777	0.34
778	0.34
779	0.35
780	0.35
781	0.35
782	0.35
783	0.35
784	0.31
785	0.26
786	0.29
787	0.28
788	0.25
789	0.22
790	0.21
791	0.21
792	0.21
793	0.2
794	0.12
795	0.09
796	0.09
797	0.06
798	0.06
799	0.06
800	0.07
801	0.07
802	0.09
803	0.18
804	0.21
805	0.23
806	0.26
807	0.29
808	0.28
809	0.3
810	0.29
811	0.23
812	0.28
813	0.29
814	0.27
815	0.27
816	0.26
817	0.26
818	0.25
819	0.22
820	0.14
821	0.14
822	0.13
823	0.1
824	0.11
825	0.09
826	0.08
827	0.08
828	0.07
829	0.04
830	0.05
831	0.05
832	0.05
833	0.05
834	0.06
835	0.06
836	0.07
837	0.09
838	0.14
839	0.19
840	0.23
841	0.24
842	0.24
843	0.29
844	0.29
845	0.27
846	0.28
847	0.29
848	0.27
849	0.28
850	0.27
851	0.28
852	0.28
853	0.29
854	0.25
855	0.2
856	0.18
857	0.19
858	0.2
859	0.14
860	0.15
861	0.15
862	0.13
863	0.14
864	0.15
865	0.16
866	0.17
867	0.23
868	0.31
869	0.37
870	0.4
871	0.45
872	0.53
873	0.54
874	0.54
875	0.53
876	0.49
877	0.49
878	0.48
879	0.43
880	0.37
881	0.33
882	0.37
883	0.32
884	0.3
885	0.26
886	0.26
887	0.26
888	0.23
889	0.24
890	0.2
891	0.21
892	0.22
893	0.25
894	0.3
895	0.37
896	0.41
897	0.43
898	0.46
899	0.54
900	0.61
901	0.62
902	0.62
903	0.59
904	0.59
905	0.6
906	0.6
907	0.52
908	0.44
909	0.38
910	0.38
911	0.35
912	0.31
913	0.3
914	0.28
915	0.31
916	0.31
917	0.34
918	0.33
919	0.33
920	0.33
921	0.31
922	0.29
923	0.34
924	0.35
925	0.31
926	0.27
927	0.27
928	0.28
929	0.33
930	0.32
931	0.25
932	0.23
933	0.28
934	0.27
935	0.3
936	0.34
937	0.3
938	0.36
939	0.43
940	0.48
941	0.42
942	0.41
943	0.41
944	0.38
945	0.4
946	0.37
947	0.34
948	0.31
949	0.31
950	0.31
951	0.26
952	0.26
953	0.22
954	0.19
955	0.15
956	0.12
957	0.14
958	0.13
959	0.13
960	0.12
961	0.13
962	0.11
963	0.14
964	0.14
965	0.13
966	0.13
967	0.14
968	0.13
969	0.12
970	0.18
971	0.16
972	0.24
973	0.31
974	0.32
975	0.4
976	0.5
977	0.58
978	0.62
979	0.71
980	0.73
981	0.76
982	0.85
983	0.87
984	0.88
985	0.86
986	0.78
987	0.68
988	0.59
989	0.5
990	0.4
991	0.3
992	0.21
993	0.16
994	0.18
995	0.18
996	0.2
997	0.23
998	0.24
999	0.22
1000	0.24
1001	0.24
1002	0.22
1003	0.25
1004	0.24
1005	0.21
1006	0.19
1007	0.18
1008	0.16
1009	0.17
1010	0.17
1011	0.15
1012	0.21
1013	0.2
1014	0.24
1015	0.27
1016	0.26
1017	0.24
1018	0.25
1019	0.33
1020	0.31
1021	0.41
1022	0.48
1023	0.54
1024	0.61
1025	0.69
1026	0.74

A0A0C4F9D2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer