Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C4FAV4

Protein Details
Accession A0A0C4FAV4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
307-329SEEKKIHKILKDKKIRGEKDKLYBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
314-322KILKDKKIR
Subcellular Location(s) cyto_nucl 11, nucl 10.5, cyto 10.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016197  Chromo-like_dom_sf  
IPR001584  Integrase_cat-core  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0015074  P:DNA integration  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50994  INTEGRASE  
CDD cd00024  CD_CSD  
Amino Acid Sequences MDWVTGLPPGGKKNYNACLVIVDRFSKTPIFLPCHKDDTAMDTAIMIWQQVISWTGLFKHIISDRDPKFTSDLWRGLYRLFGTKLSFSTAYHPQTDGLAERMIQTLEDMLRRFCAYGLEFKDSDGFTHDWVTLLPALELAYRTSTHASTGKTPAILEKGWNPRLPQYSLKKDLVEVHPTAASFKNMLDKARKHAQQSMDNAFEYSKQNWEKKHKVPSFKIGDLVLISTTNFSNIKGPKKLRNAFVGPFVVKALHGPNAVEVELYGELEKKHPTFPVSLLKHYNESDAELFPLRKEISEAEVPPLEESEEKKIHKILKDKKIRGEKDKLYLVRYRNPIHEDEWLPEKDIKDADKYLRRFKNSKHKD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.49
3 0.47
4 0.42
5 0.4
6 0.39
7 0.38
8 0.33
9 0.29
10 0.25
11 0.25
12 0.27
13 0.23
14 0.22
15 0.24
16 0.29
17 0.33
18 0.37
19 0.44
20 0.47
21 0.51
22 0.49
23 0.46
24 0.39
25 0.39
26 0.37
27 0.3
28 0.24
29 0.19
30 0.19
31 0.18
32 0.17
33 0.1
34 0.06
35 0.05
36 0.06
37 0.06
38 0.08
39 0.07
40 0.08
41 0.09
42 0.09
43 0.12
44 0.13
45 0.12
46 0.17
47 0.2
48 0.22
49 0.26
50 0.34
51 0.34
52 0.4
53 0.41
54 0.37
55 0.37
56 0.37
57 0.39
58 0.37
59 0.38
60 0.35
61 0.36
62 0.35
63 0.32
64 0.33
65 0.28
66 0.26
67 0.24
68 0.22
69 0.22
70 0.23
71 0.23
72 0.24
73 0.23
74 0.19
75 0.22
76 0.27
77 0.28
78 0.28
79 0.28
80 0.24
81 0.24
82 0.24
83 0.21
84 0.15
85 0.12
86 0.11
87 0.11
88 0.12
89 0.11
90 0.09
91 0.08
92 0.09
93 0.1
94 0.12
95 0.12
96 0.12
97 0.13
98 0.14
99 0.14
100 0.12
101 0.14
102 0.12
103 0.19
104 0.22
105 0.25
106 0.24
107 0.24
108 0.27
109 0.24
110 0.23
111 0.19
112 0.17
113 0.13
114 0.14
115 0.14
116 0.11
117 0.11
118 0.12
119 0.09
120 0.09
121 0.08
122 0.07
123 0.07
124 0.07
125 0.08
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.09
130 0.1
131 0.1
132 0.12
133 0.15
134 0.16
135 0.18
136 0.21
137 0.21
138 0.19
139 0.19
140 0.18
141 0.18
142 0.16
143 0.14
144 0.18
145 0.25
146 0.28
147 0.3
148 0.29
149 0.31
150 0.35
151 0.37
152 0.38
153 0.38
154 0.42
155 0.46
156 0.47
157 0.42
158 0.39
159 0.42
160 0.37
161 0.33
162 0.26
163 0.21
164 0.2
165 0.2
166 0.2
167 0.16
168 0.13
169 0.09
170 0.09
171 0.14
172 0.14
173 0.17
174 0.21
175 0.22
176 0.27
177 0.35
178 0.38
179 0.34
180 0.39
181 0.42
182 0.42
183 0.46
184 0.44
185 0.38
186 0.35
187 0.33
188 0.27
189 0.24
190 0.21
191 0.16
192 0.19
193 0.22
194 0.26
195 0.32
196 0.41
197 0.47
198 0.51
199 0.61
200 0.6
201 0.64
202 0.64
203 0.67
204 0.65
205 0.57
206 0.53
207 0.42
208 0.36
209 0.28
210 0.24
211 0.15
212 0.08
213 0.08
214 0.07
215 0.06
216 0.08
217 0.08
218 0.08
219 0.14
220 0.18
221 0.24
222 0.31
223 0.35
224 0.42
225 0.52
226 0.57
227 0.55
228 0.57
229 0.56
230 0.5
231 0.5
232 0.45
233 0.35
234 0.3
235 0.27
236 0.2
237 0.15
238 0.15
239 0.12
240 0.12
241 0.12
242 0.12
243 0.13
244 0.14
245 0.14
246 0.12
247 0.1
248 0.09
249 0.08
250 0.09
251 0.08
252 0.08
253 0.08
254 0.1
255 0.14
256 0.13
257 0.15
258 0.17
259 0.19
260 0.2
261 0.24
262 0.32
263 0.32
264 0.36
265 0.39
266 0.39
267 0.41
268 0.39
269 0.37
270 0.28
271 0.27
272 0.24
273 0.2
274 0.2
275 0.19
276 0.19
277 0.16
278 0.2
279 0.17
280 0.15
281 0.16
282 0.16
283 0.18
284 0.23
285 0.24
286 0.24
287 0.25
288 0.25
289 0.24
290 0.23
291 0.19
292 0.16
293 0.17
294 0.21
295 0.25
296 0.26
297 0.29
298 0.33
299 0.38
300 0.42
301 0.5
302 0.53
303 0.57
304 0.67
305 0.71
306 0.76
307 0.81
308 0.83
309 0.81
310 0.81
311 0.77
312 0.74
313 0.77
314 0.7
315 0.64
316 0.63
317 0.6
318 0.58
319 0.59
320 0.56
321 0.53
322 0.55
323 0.53
324 0.49
325 0.51
326 0.45
327 0.41
328 0.43
329 0.38
330 0.37
331 0.37
332 0.34
333 0.3
334 0.32
335 0.31
336 0.3
337 0.34
338 0.4
339 0.46
340 0.51
341 0.58
342 0.63
343 0.68
344 0.69
345 0.73