Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4R873

Protein Details
Accession C4R873    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
84-108FAEIEERLKRRNKRKNEVQEDEEPLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
92-97KRRNKR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12, cyto 4.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR010491  PRP1_N  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG ppa:PAS_chr4_0538  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06424  PRP1_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MERKAFLDQEPPPGYVAGLGRGATGFTTQADVGTGRIVPASFSDEESDDEDFVDDRFKDADETENGLNGFKEKDDSDNEADQVFAEIEERLKRRNKRKNEVQEDEEPLDEIKKNFQELKKNLTSISEEEWFNLPESGDLTRKNKRARLEEQQQQRFYAVPDSVINGVVADTMETSNSIDVTKISVAKDRLLGLRLDEQLDTEGNDVQEYLDSLKEQEDFSAKFGDINRARLILNSLRKTEPHRGSSWIASARLEEQSKNFSKAKELIMQGCKMCPRDENVWLERIRLNKTTDTTLCKIIVTEGLQYNVKSVKLWLQAIDLENESFSRKRILRKALENLPRSVPLWRRMIEEESSQEEKLKLLTKAVELIPDNSELCVDYIRMEQKHNLERAKLFLKDSLTKIPQSVDLTLLSCEIKEYEQNSGNEPTSTEILSIVFLDVLQSLKNQDKKLTFKEWLKYCEEYEKKGEYKNLVKVIIENTVTFGFEDVPEPELVATVNKIAYEYEGTELARLSSLIYYALTEKFPFNSSAWKSFINHDKSGIEDRFEKCLDKNPTWVEFWISYNSTLLKNGNIEKARDVLDRATKHNPRDPKLIVKSIEFCFNGPNRTESLELIEKGIAKFPELKIFYVYKIKISDALKISSNKLLQVCDDGISKHSKAEEMYLLKSEILIKGGDIDTARTTLEQGITNCSQSLSLRLKLCFLDEFKMRIITRARTVLELAVTEIKSDLTWFELIRFENRNRSKEDAQIVLSKALQKHPSSVLLLILRIQFEERASKRRNLYIEALKKTNEDKLLVSVIAHNLWRRDGKPEKAFKFFKQSLESSVENGDILSIYYNFIRKNGSPEQLQDFWTTVDKIDKDQLKKGYYWIQETQDLTPWKQTEEMIENTARKLDNDLIYV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.26
3 0.25
4 0.18
5 0.17
6 0.16
7 0.15
8 0.15
9 0.15
10 0.12
11 0.12
12 0.1
13 0.08
14 0.11
15 0.1
16 0.1
17 0.12
18 0.11
19 0.11
20 0.12
21 0.11
22 0.09
23 0.1
24 0.1
25 0.09
26 0.11
27 0.15
28 0.15
29 0.16
30 0.18
31 0.18
32 0.2
33 0.22
34 0.22
35 0.16
36 0.16
37 0.15
38 0.13
39 0.12
40 0.15
41 0.12
42 0.13
43 0.13
44 0.13
45 0.15
46 0.15
47 0.21
48 0.19
49 0.24
50 0.23
51 0.25
52 0.24
53 0.23
54 0.23
55 0.18
56 0.16
57 0.13
58 0.15
59 0.14
60 0.18
61 0.22
62 0.28
63 0.32
64 0.33
65 0.33
66 0.3
67 0.29
68 0.25
69 0.21
70 0.15
71 0.1
72 0.08
73 0.08
74 0.11
75 0.18
76 0.2
77 0.26
78 0.34
79 0.44
80 0.54
81 0.64
82 0.72
83 0.76
84 0.86
85 0.9
86 0.92
87 0.9
88 0.86
89 0.82
90 0.78
91 0.69
92 0.58
93 0.47
94 0.37
95 0.31
96 0.28
97 0.21
98 0.21
99 0.22
100 0.26
101 0.33
102 0.38
103 0.46
104 0.47
105 0.56
106 0.55
107 0.54
108 0.5
109 0.46
110 0.44
111 0.36
112 0.36
113 0.31
114 0.25
115 0.26
116 0.28
117 0.25
118 0.23
119 0.21
120 0.16
121 0.12
122 0.14
123 0.15
124 0.16
125 0.21
126 0.25
127 0.33
128 0.4
129 0.47
130 0.5
131 0.55
132 0.61
133 0.63
134 0.68
135 0.7
136 0.71
137 0.74
138 0.79
139 0.72
140 0.65
141 0.58
142 0.48
143 0.4
144 0.36
145 0.26
146 0.18
147 0.17
148 0.18
149 0.18
150 0.17
151 0.15
152 0.1
153 0.1
154 0.08
155 0.07
156 0.05
157 0.06
158 0.05
159 0.06
160 0.06
161 0.07
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.06
166 0.07
167 0.09
168 0.11
169 0.13
170 0.13
171 0.19
172 0.2
173 0.22
174 0.24
175 0.24
176 0.24
177 0.24
178 0.23
179 0.2
180 0.24
181 0.23
182 0.23
183 0.2
184 0.18
185 0.18
186 0.18
187 0.16
188 0.11
189 0.11
190 0.1
191 0.1
192 0.09
193 0.08
194 0.08
195 0.08
196 0.08
197 0.07
198 0.07
199 0.08
200 0.09
201 0.1
202 0.1
203 0.11
204 0.14
205 0.14
206 0.15
207 0.17
208 0.16
209 0.17
210 0.18
211 0.27
212 0.25
213 0.28
214 0.28
215 0.27
216 0.27
217 0.25
218 0.29
219 0.26
220 0.32
221 0.32
222 0.34
223 0.34
224 0.36
225 0.42
226 0.47
227 0.47
228 0.43
229 0.42
230 0.43
231 0.45
232 0.45
233 0.44
234 0.37
235 0.31
236 0.26
237 0.25
238 0.23
239 0.24
240 0.24
241 0.2
242 0.18
243 0.25
244 0.28
245 0.32
246 0.32
247 0.28
248 0.31
249 0.34
250 0.36
251 0.34
252 0.34
253 0.36
254 0.38
255 0.4
256 0.36
257 0.34
258 0.34
259 0.29
260 0.27
261 0.22
262 0.23
263 0.25
264 0.3
265 0.34
266 0.33
267 0.37
268 0.36
269 0.37
270 0.34
271 0.33
272 0.31
273 0.29
274 0.3
275 0.27
276 0.29
277 0.33
278 0.33
279 0.36
280 0.34
281 0.33
282 0.3
283 0.27
284 0.24
285 0.2
286 0.19
287 0.14
288 0.15
289 0.13
290 0.15
291 0.16
292 0.16
293 0.17
294 0.16
295 0.15
296 0.12
297 0.12
298 0.16
299 0.19
300 0.2
301 0.19
302 0.18
303 0.2
304 0.21
305 0.22
306 0.16
307 0.12
308 0.12
309 0.11
310 0.12
311 0.1
312 0.1
313 0.15
314 0.18
315 0.25
316 0.33
317 0.41
318 0.46
319 0.52
320 0.59
321 0.62
322 0.67
323 0.62
324 0.57
325 0.5
326 0.44
327 0.38
328 0.36
329 0.32
330 0.29
331 0.31
332 0.3
333 0.31
334 0.32
335 0.35
336 0.31
337 0.28
338 0.25
339 0.25
340 0.26
341 0.23
342 0.22
343 0.19
344 0.18
345 0.18
346 0.19
347 0.14
348 0.14
349 0.15
350 0.14
351 0.17
352 0.17
353 0.18
354 0.15
355 0.16
356 0.15
357 0.15
358 0.15
359 0.11
360 0.11
361 0.08
362 0.08
363 0.07
364 0.06
365 0.06
366 0.09
367 0.13
368 0.14
369 0.15
370 0.18
371 0.24
372 0.29
373 0.33
374 0.32
375 0.3
376 0.3
377 0.33
378 0.32
379 0.28
380 0.23
381 0.21
382 0.23
383 0.24
384 0.25
385 0.27
386 0.26
387 0.25
388 0.24
389 0.22
390 0.22
391 0.2
392 0.19
393 0.14
394 0.13
395 0.13
396 0.12
397 0.12
398 0.09
399 0.07
400 0.07
401 0.06
402 0.06
403 0.08
404 0.09
405 0.12
406 0.17
407 0.18
408 0.21
409 0.22
410 0.22
411 0.2
412 0.19
413 0.16
414 0.12
415 0.12
416 0.09
417 0.07
418 0.07
419 0.07
420 0.06
421 0.05
422 0.04
423 0.04
424 0.04
425 0.04
426 0.04
427 0.04
428 0.04
429 0.06
430 0.1
431 0.15
432 0.15
433 0.19
434 0.23
435 0.28
436 0.32
437 0.35
438 0.36
439 0.37
440 0.43
441 0.44
442 0.43
443 0.42
444 0.39
445 0.35
446 0.39
447 0.36
448 0.32
449 0.32
450 0.32
451 0.3
452 0.31
453 0.32
454 0.28
455 0.31
456 0.34
457 0.33
458 0.29
459 0.28
460 0.27
461 0.26
462 0.24
463 0.19
464 0.14
465 0.12
466 0.12
467 0.12
468 0.1
469 0.09
470 0.06
471 0.06
472 0.07
473 0.06
474 0.07
475 0.07
476 0.07
477 0.07
478 0.06
479 0.06
480 0.05
481 0.05
482 0.04
483 0.05
484 0.05
485 0.05
486 0.05
487 0.06
488 0.06
489 0.07
490 0.07
491 0.08
492 0.08
493 0.08
494 0.08
495 0.07
496 0.06
497 0.06
498 0.05
499 0.04
500 0.05
501 0.05
502 0.05
503 0.05
504 0.07
505 0.08
506 0.08
507 0.09
508 0.09
509 0.1
510 0.11
511 0.13
512 0.12
513 0.19
514 0.21
515 0.24
516 0.25
517 0.26
518 0.26
519 0.29
520 0.37
521 0.35
522 0.32
523 0.31
524 0.29
525 0.3
526 0.35
527 0.3
528 0.24
529 0.23
530 0.24
531 0.26
532 0.26
533 0.25
534 0.2
535 0.28
536 0.33
537 0.29
538 0.33
539 0.32
540 0.34
541 0.34
542 0.34
543 0.28
544 0.23
545 0.23
546 0.21
547 0.18
548 0.16
549 0.15
550 0.17
551 0.14
552 0.14
553 0.13
554 0.12
555 0.14
556 0.16
557 0.22
558 0.22
559 0.23
560 0.22
561 0.23
562 0.24
563 0.22
564 0.21
565 0.18
566 0.23
567 0.25
568 0.28
569 0.35
570 0.38
571 0.41
572 0.46
573 0.5
574 0.48
575 0.53
576 0.51
577 0.52
578 0.52
579 0.54
580 0.49
581 0.44
582 0.44
583 0.38
584 0.41
585 0.32
586 0.27
587 0.26
588 0.27
589 0.28
590 0.24
591 0.25
592 0.2
593 0.22
594 0.23
595 0.18
596 0.2
597 0.2
598 0.2
599 0.19
600 0.19
601 0.18
602 0.17
603 0.2
604 0.15
605 0.13
606 0.17
607 0.17
608 0.24
609 0.24
610 0.24
611 0.25
612 0.26
613 0.27
614 0.31
615 0.3
616 0.25
617 0.25
618 0.25
619 0.27
620 0.27
621 0.31
622 0.26
623 0.28
624 0.29
625 0.29
626 0.31
627 0.3
628 0.3
629 0.27
630 0.25
631 0.24
632 0.2
633 0.22
634 0.2
635 0.17
636 0.17
637 0.14
638 0.15
639 0.19
640 0.18
641 0.17
642 0.17
643 0.17
644 0.16
645 0.19
646 0.22
647 0.21
648 0.22
649 0.22
650 0.22
651 0.2
652 0.2
653 0.19
654 0.13
655 0.12
656 0.1
657 0.08
658 0.11
659 0.11
660 0.12
661 0.1
662 0.11
663 0.11
664 0.12
665 0.12
666 0.09
667 0.1
668 0.1
669 0.13
670 0.14
671 0.14
672 0.2
673 0.21
674 0.21
675 0.2
676 0.19
677 0.17
678 0.14
679 0.21
680 0.2
681 0.25
682 0.28
683 0.28
684 0.3
685 0.29
686 0.31
687 0.27
688 0.25
689 0.24
690 0.23
691 0.25
692 0.24
693 0.3
694 0.28
695 0.3
696 0.33
697 0.32
698 0.34
699 0.37
700 0.36
701 0.31
702 0.32
703 0.28
704 0.24
705 0.2
706 0.18
707 0.17
708 0.16
709 0.14
710 0.14
711 0.12
712 0.11
713 0.11
714 0.1
715 0.08
716 0.1
717 0.09
718 0.11
719 0.14
720 0.16
721 0.2
722 0.26
723 0.27
724 0.36
725 0.43
726 0.45
727 0.47
728 0.52
729 0.51
730 0.52
731 0.54
732 0.47
733 0.43
734 0.44
735 0.41
736 0.35
737 0.33
738 0.31
739 0.28
740 0.31
741 0.34
742 0.3
743 0.32
744 0.34
745 0.35
746 0.33
747 0.31
748 0.29
749 0.25
750 0.24
751 0.23
752 0.21
753 0.18
754 0.16
755 0.17
756 0.14
757 0.14
758 0.23
759 0.24
760 0.32
761 0.37
762 0.43
763 0.47
764 0.52
765 0.54
766 0.5
767 0.54
768 0.55
769 0.6
770 0.59
771 0.57
772 0.51
773 0.5
774 0.48
775 0.46
776 0.39
777 0.32
778 0.27
779 0.28
780 0.29
781 0.26
782 0.24
783 0.21
784 0.19
785 0.19
786 0.2
787 0.2
788 0.19
789 0.23
790 0.28
791 0.26
792 0.34
793 0.4
794 0.47
795 0.54
796 0.63
797 0.64
798 0.69
799 0.72
800 0.68
801 0.7
802 0.65
803 0.61
804 0.58
805 0.54
806 0.5
807 0.5
808 0.46
809 0.38
810 0.35
811 0.29
812 0.22
813 0.2
814 0.15
815 0.09
816 0.09
817 0.09
818 0.07
819 0.08
820 0.11
821 0.14
822 0.15
823 0.16
824 0.21
825 0.21
826 0.28
827 0.35
828 0.38
829 0.38
830 0.42
831 0.48
832 0.45
833 0.45
834 0.4
835 0.33
836 0.29
837 0.29
838 0.25
839 0.2
840 0.25
841 0.23
842 0.25
843 0.33
844 0.39
845 0.4
846 0.46
847 0.52
848 0.49
849 0.49
850 0.51
851 0.52
852 0.49
853 0.51
854 0.5
855 0.47
856 0.49
857 0.5
858 0.46
859 0.45
860 0.44
861 0.39
862 0.41
863 0.37
864 0.34
865 0.33
866 0.32
867 0.31
868 0.33
869 0.35
870 0.32
871 0.36
872 0.36
873 0.35
874 0.39
875 0.32
876 0.27
877 0.29
878 0.31