Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

C4R873

Protein Details
Accession C4R873    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
84-108FAEIEERLKRRNKRKNEVQEDEEPLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
92-97KRRNKR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12, cyto 4.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR010491  PRP1_N  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG ppa:PAS_chr4_0538  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06424  PRP1_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MERKAFLDQEPPPGYVAGLGRGATGFTTQADVGTGRIVPASFSDEESDDEDFVDDRFKDADETENGLNGFKEKDDSDNEADQVFAEIEERLKRRNKRKNEVQEDEEPLDEIKKNFQELKKNLTSISEEEWFNLPESGDLTRKNKRARLEEQQQQRFYAVPDSVINGVVADTMETSNSIDVTKISVAKDRLLGLRLDEQLDTEGNDVQEYLDSLKEQEDFSAKFGDINRARLILNSLRKTEPHRGSSWIASARLEEQSKNFSKAKELIMQGCKMCPRDENVWLERIRLNKTTDTTLCKIIVTEGLQYNVKSVKLWLQAIDLENESFSRKRILRKALENLPRSVPLWRRMIEEESSQEEKLKLLTKAVELIPDNSELCVDYIRMEQKHNLERAKLFLKDSLTKIPQSVDLTLLSCEIKEYEQNSGNEPTSTEILSIVFLDVLQSLKNQDKKLTFKEWLKYCEEYEKKGEYKNLVKVIIENTVTFGFEDVPEPELVATVNKIAYEYEGTELARLSSLIYYALTEKFPFNSSAWKSFINHDKSGIEDRFEKCLDKNPTWVEFWISYNSTLLKNGNIEKARDVLDRATKHNPRDPKLIVKSIEFCFNGPNRTESLELIEKGIAKFPELKIFYVYKIKISDALKISSNKLLQVCDDGISKHSKAEEMYLLKSEILIKGGDIDTARTTLEQGITNCSQSLSLRLKLCFLDEFKMRIITRARTVLELAVTEIKSDLTWFELIRFENRNRSKEDAQIVLSKALQKHPSSVLLLILRIQFEERASKRRNLYIEALKKTNEDKLLVSVIAHNLWRRDGKPEKAFKFFKQSLESSVENGDILSIYYNFIRKNGSPEQLQDFWTTVDKIDKDQLKKGYYWIQETQDLTPWKQTEEMIENTARKLDNDLIYV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.26
3 0.25
4 0.18
5 0.17
6 0.16
7 0.15
8 0.15
9 0.15
10 0.12
11 0.12
12 0.1
13 0.08
14 0.11
15 0.1
16 0.1
17 0.12
18 0.11
19 0.11
20 0.12
21 0.11
22 0.09
23 0.1
24 0.1
25 0.09
26 0.11
27 0.15
28 0.15
29 0.16
30 0.18
31 0.18
32 0.2
33 0.22
34 0.22
35 0.16
36 0.16
37 0.15
38 0.13
39 0.12
40 0.15
41 0.12
42 0.13
43 0.13
44 0.13
45 0.15
46 0.15
47 0.21
48 0.19
49 0.24
50 0.23
51 0.25
52 0.24
53 0.23
54 0.23
55 0.18
56 0.16
57 0.13
58 0.15
59 0.14
60 0.18
61 0.22
62 0.28
63 0.32
64 0.33
65 0.33
66 0.3
67 0.29
68 0.25
69 0.21
70 0.15
71 0.1
72 0.08
73 0.08
74 0.11
75 0.18
76 0.2
77 0.26
78 0.34
79 0.44
80 0.54
81 0.64
82 0.72
83 0.76
84 0.86
85 0.9
86 0.92
87 0.9
88 0.86
89 0.82
90 0.78
91 0.69
92 0.58
93 0.47
94 0.37
95 0.31
96 0.28
97 0.21
98 0.21
99 0.22
100 0.26
101 0.33
102 0.38
103 0.46
104 0.47
105 0.56
106 0.55
107 0.54
108 0.5
109 0.46
110 0.44
111 0.36
112 0.36
113 0.31
114 0.25
115 0.26
116 0.28
117 0.25
118 0.23
119 0.21
120 0.16
121 0.12
122 0.14
123 0.15
124 0.16
125 0.21
126 0.25
127 0.33
128 0.4
129 0.47
130 0.5
131 0.55
132 0.61
133 0.63
134 0.68
135 0.7
136 0.71
137 0.74
138 0.79
139 0.72
140 0.65
141 0.58
142 0.48
143 0.4
144 0.36
145 0.26
146 0.18
147 0.17
148 0.18
149 0.18
150 0.17
151 0.15
152 0.1
153 0.1
154 0.08
155 0.07
156 0.05
157 0.06
158 0.05
159 0.06
160 0.06
161 0.07
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.06
166 0.07
167 0.09
168 0.11
169 0.13
170 0.13
171 0.19
172 0.2
173 0.22
174 0.24
175 0.24
176 0.24
177 0.24
178 0.23
179 0.2
180 0.24
181 0.23
182 0.23
183 0.2
184 0.18
185 0.18
186 0.18
187 0.16
188 0.11
189 0.11
190 0.1
191 0.1
192 0.09
193 0.08
194 0.08
195 0.08
196 0.08
197 0.07
198 0.07
199 0.08
200 0.09
201 0.1
202 0.1
203 0.11
204 0.14
205 0.14
206 0.15
207 0.17
208 0.16
209 0.17
210 0.18
211 0.27
212 0.25
213 0.28
214 0.28
215 0.27
216 0.27
217 0.25
218 0.29
219 0.26
220 0.32
221 0.32
222 0.34
223 0.34
224 0.36
225 0.42
226 0.47
227 0.47
228 0.43
229 0.42
230 0.43
231 0.45
232 0.45
233 0.44
234 0.37
235 0.31
236 0.26
237 0.25
238 0.23
239 0.24
240 0.24
241 0.2
242 0.18
243 0.25
244 0.28
245 0.32
246 0.32
247 0.28
248 0.31
249 0.34
250 0.36
251 0.34
252 0.34
253 0.36
254 0.38
255 0.4
256 0.36
257 0.34
258 0.34
259 0.29
260 0.27
261 0.22
262 0.23
263 0.25
264 0.3
265 0.34
266 0.33
267 0.37
268 0.36
269 0.37
270 0.34
271 0.33
272 0.31
273 0.29
274 0.3
275 0.27
276 0.29
277 0.33
278 0.33
279 0.36
280 0.34
281 0.33
282 0.3
283 0.27
284 0.24
285 0.2
286 0.19
287 0.14
288 0.15
289 0.13
290 0.15
291 0.16
292 0.16
293 0.17
294 0.16
295 0.15
296 0.12
297 0.12
298 0.16
299 0.19
300 0.2
301 0.19
302 0.18
303 0.2
304 0.21
305 0.22
306 0.16
307 0.12
308 0.12
309 0.11
310 0.12
311 0.1
312 0.1
313 0.15
314 0.18
315 0.25
316 0.33
317 0.41
318 0.46
319 0.52
320 0.59
321 0.62
322 0.67
323 0.62
324 0.57
325 0.5
326 0.44
327 0.38
328 0.36
329 0.32
330 0.29
331 0.31
332 0.3
333 0.31
334 0.32
335 0.35
336 0.31
337 0.28
338 0.25
339 0.25
340 0.26
341 0.23
342 0.22
343 0.19
344 0.18
345 0.18
346 0.19
347 0.14
348 0.14
349 0.15
350 0.14
351 0.17
352 0.17
353 0.18
354 0.15
355 0.16
356 0.15
357 0.15
358 0.15
359 0.11
360 0.11
361 0.08
362 0.08
363 0.07
364 0.06
365 0.06
366 0.09
367 0.13
368 0.14
369 0.15
370 0.18
371 0.24
372 0.29
373 0.33
374 0.32
375 0.3
376 0.3
377 0.33
378 0.32
379 0.28
380 0.23
381 0.21
382 0.23
383 0.24
384 0.25
385 0.27
386 0.26
387 0.25
388 0.24
389 0.22
390 0.22
391 0.2
392 0.19
393 0.14
394 0.13
395 0.13
396 0.12
397 0.12
398 0.09
399 0.07
400 0.07
401 0.06
402 0.06
403 0.08
404 0.09
405 0.12
406 0.17
407 0.18
408 0.21
409 0.22
410 0.22
411 0.2
412 0.19
413 0.16
414 0.12
415 0.12
416 0.09
417 0.07
418 0.07
419 0.07
420 0.06
421 0.05
422 0.04
423 0.04
424 0.04
425 0.04
426 0.04
427 0.04
428 0.04
429 0.06
430 0.1
431 0.15
432 0.15
433 0.19
434 0.23
435 0.28
436 0.32
437 0.35
438 0.36
439 0.37
440 0.43
441 0.44
442 0.43
443 0.42
444 0.39
445 0.35
446 0.39
447 0.36
448 0.32
449 0.32
450 0.32
451 0.3
452 0.31
453 0.32
454 0.28
455 0.31
456 0.34
457 0.33
458 0.29
459 0.28
460 0.27
461 0.26
462 0.24
463 0.19
464 0.14
465 0.12
466 0.12
467 0.12
468 0.1
469 0.09
470 0.06
471 0.06
472 0.07
473 0.06
474 0.07
475 0.07
476 0.07
477 0.07
478 0.06
479 0.06
480 0.05
481 0.05
482 0.04
483 0.05
484 0.05
485 0.05
486 0.05
487 0.06
488 0.06
489 0.07
490 0.07
491 0.08
492 0.08
493 0.08
494 0.08
495 0.07
496 0.06
497 0.06
498 0.05
499 0.04
500 0.05
501 0.05
502 0.05
503 0.05
504 0.07
505 0.08
506 0.08
507 0.09
508 0.09
509 0.1
510 0.11
511 0.13
512 0.12
513 0.19
514 0.21
515 0.24
516 0.25
517 0.26
518 0.26
519 0.29
520 0.37
521 0.35
522 0.32
523 0.31
524 0.29
525 0.3
526 0.35
527 0.3
528 0.24
529 0.23
530 0.24
531 0.26
532 0.26
533 0.25
534 0.2
535 0.28
536 0.33
537 0.29
538 0.33
539 0.32
540 0.34
541 0.34
542 0.34
543 0.28
544 0.23
545 0.23
546 0.21
547 0.18
548 0.16
549 0.15
550 0.17
551 0.14
552 0.14
553 0.13
554 0.12
555 0.14
556 0.16
557 0.22
558 0.22
559 0.23
560 0.22
561 0.23
562 0.24
563 0.22
564 0.21
565 0.18
566 0.23
567 0.25
568 0.28
569 0.35
570 0.38
571 0.41
572 0.46
573 0.5
574 0.48
575 0.53
576 0.51
577 0.52
578 0.52
579 0.54
580 0.49
581 0.44
582 0.44
583 0.38
584 0.41
585 0.32
586 0.27
587 0.26
588 0.27
589 0.28
590 0.24
591 0.25
592 0.2
593 0.22
594 0.23
595 0.18
596 0.2
597 0.2
598 0.2
599 0.19
600 0.19
601 0.18
602 0.17
603 0.2
604 0.15
605 0.13
606 0.17
607 0.17
608 0.24
609 0.24
610 0.24
611 0.25
612 0.26
613 0.27
614 0.31
615 0.3
616 0.25
617 0.25
618 0.25
619 0.27
620 0.27
621 0.31
622 0.26
623 0.28
624 0.29
625 0.29
626 0.31
627 0.3
628 0.3
629 0.27
630 0.25
631 0.24
632 0.2
633 0.22
634 0.2
635 0.17
636 0.17
637 0.14
638 0.15
639 0.19
640 0.18
641 0.17
642 0.17
643 0.17
644 0.16
645 0.19
646 0.22
647 0.21
648 0.22
649 0.22
650 0.22
651 0.2
652 0.2
653 0.19
654 0.13
655 0.12
656 0.1
657 0.08
658 0.11
659 0.11
660 0.12
661 0.1
662 0.11
663 0.11
664 0.12
665 0.12
666 0.09
667 0.1
668 0.1
669 0.13
670 0.14
671 0.14
672 0.2
673 0.21
674 0.21
675 0.2
676 0.19
677 0.17
678 0.14
679 0.21
680 0.2
681 0.25
682 0.28
683 0.28
684 0.3
685 0.29
686 0.31
687 0.27
688 0.25
689 0.24
690 0.23
691 0.25
692 0.24
693 0.3
694 0.28
695 0.3
696 0.33
697 0.32
698 0.34
699 0.37
700 0.36
701 0.31
702 0.32
703 0.28
704 0.24
705 0.2
706 0.18
707 0.17
708 0.16
709 0.14
710 0.14
711 0.12
712 0.11
713 0.11
714 0.1
715 0.08
716 0.1
717 0.09
718 0.11
719 0.14
720 0.16
721 0.2
722 0.26
723 0.27
724 0.36
725 0.43
726 0.45
727 0.47
728 0.52
729 0.51
730 0.52
731 0.54
732 0.47
733 0.43
734 0.44
735 0.41
736 0.35
737 0.33
738 0.31
739 0.28
740 0.31
741 0.34
742 0.3
743 0.32
744 0.34
745 0.35
746 0.33
747 0.31
748 0.29
749 0.25
750 0.24
751 0.23
752 0.21
753 0.18
754 0.16
755 0.17
756 0.14
757 0.14
758 0.23
759 0.24
760 0.32
761 0.37
762 0.43
763 0.47
764 0.52
765 0.54
766 0.5
767 0.54
768 0.55
769 0.6
770 0.59
771 0.57
772 0.51
773 0.5
774 0.48
775 0.46
776 0.39
777 0.32
778 0.27
779 0.28
780 0.29
781 0.26
782 0.24
783 0.21
784 0.19
785 0.19
786 0.2
787 0.2
788 0.19
789 0.23
790 0.28
791 0.26
792 0.34
793 0.4
794 0.47
795 0.54
796 0.63
797 0.64
798 0.69
799 0.72
800 0.68
801 0.7
802 0.65
803 0.61
804 0.58
805 0.54
806 0.5
807 0.5
808 0.46
809 0.38
810 0.35
811 0.29
812 0.22
813 0.2
814 0.15
815 0.09
816 0.09
817 0.09
818 0.07
819 0.08
820 0.11
821 0.14
822 0.15
823 0.16
824 0.21
825 0.21
826 0.28
827 0.35
828 0.38
829 0.38
830 0.42
831 0.48
832 0.45
833 0.45
834 0.4
835 0.33
836 0.29
837 0.29
838 0.25
839 0.2
840 0.25
841 0.23
842 0.25
843 0.33
844 0.39
845 0.4
846 0.46
847 0.52
848 0.49
849 0.49
850 0.51
851 0.52
852 0.49
853 0.51
854 0.5
855 0.47
856 0.49
857 0.5
858 0.46
859 0.45
860 0.44
861 0.39
862 0.41
863 0.37
864 0.34
865 0.33
866 0.32
867 0.31
868 0.33
869 0.35
870 0.32
871 0.36
872 0.36
873 0.35
874 0.39
875 0.32
876 0.27
877 0.29
878 0.31