Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G8YM04

Protein Details
Accession G8YM04    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
44-67EGDLKKEIKKLQKYRDQIKTWQSNHydrophilic
151-173EYEKLSQKKIRKKNSTMIEERKQHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012270  CCR4-NOT_su3/5  
IPR007207  Not_N  
Gene Ontology GO:0030015  C:CCR4-NOT core complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000932  C:P-body  
GO:0000289  P:nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF04065  Not3  
Amino Acid Sequences MSHRKLQKEAETIFKKINEGVELFNYYYSRHQSSGSDSQREKLEGDLKKEIKKLQKYRDQIKTWQSNESVEAAILPSKLQEHRRMVEEAMECYKEVEKNSKMKSYSNQSIMLAALEQDQYLDLSPEAESALEFLNHSIDELAKQNEELESEYEKLSQKKIRKKNSTMIEERKQEIDSLSSRNKFHMEKLSHVVDFLKRGKVDPDSVMSIQEDINFYLESNQDPDFVDDENLYDELVKEVESNLENSSFSKDPTRDNDVSHDDLEDKRTTAGDTRSSTTDLSNEHPQETADTVSRSVSNNSSSSFPIRSASTPQKSSTPAPPTPESSSPAIVKNLKFSTAPTNPVGNIKWSTAAASGPSPTPSPINYSVLSHTSNGSANNDVEGKTSSTAAKENGSQELPNKFTVHNNERNQPQTQERFQTYDNSKSKTPSRDILEMLSKDPLSEYVEILRNSSISSAELDLFSDLNLIKLPPGIQDLVISFTATRKVSMDNSRFILSTLPYKPYSTPIRRPFLPDRIQSSINQYLAPCEGRHIDSPLHISKFQSYWNHIRANNKFEQFLKEIQLLSTNPENSQVVNELTMVLFYGYYYGATPIECLIAETCLFKLNWKPYGPSNNSQNITNKQRNQITNNSPEKHSLASRQYYYWLKCIKVLSAPKVNSGDLTEHGDYQVFDLISWETYIKYSFRLDLNSCQLEASKMI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.45
3 0.39
4 0.39
5 0.32
6 0.29
7 0.29
8 0.28
9 0.29
10 0.28
11 0.27
12 0.24
13 0.22
14 0.25
15 0.28
16 0.28
17 0.26
18 0.28
19 0.28
20 0.36
21 0.44
22 0.46
23 0.49
24 0.47
25 0.5
26 0.52
27 0.51
28 0.44
29 0.39
30 0.41
31 0.37
32 0.43
33 0.48
34 0.49
35 0.53
36 0.57
37 0.59
38 0.6
39 0.66
40 0.69
41 0.7
42 0.74
43 0.78
44 0.83
45 0.86
46 0.82
47 0.8
48 0.8
49 0.79
50 0.72
51 0.69
52 0.61
53 0.53
54 0.49
55 0.43
56 0.33
57 0.23
58 0.21
59 0.15
60 0.15
61 0.13
62 0.11
63 0.09
64 0.13
65 0.19
66 0.25
67 0.33
68 0.38
69 0.42
70 0.46
71 0.47
72 0.44
73 0.45
74 0.41
75 0.36
76 0.33
77 0.3
78 0.26
79 0.25
80 0.28
81 0.24
82 0.25
83 0.29
84 0.32
85 0.39
86 0.44
87 0.5
88 0.48
89 0.5
90 0.55
91 0.57
92 0.58
93 0.54
94 0.52
95 0.45
96 0.44
97 0.39
98 0.32
99 0.22
100 0.14
101 0.12
102 0.09
103 0.09
104 0.08
105 0.08
106 0.08
107 0.08
108 0.08
109 0.06
110 0.07
111 0.07
112 0.07
113 0.07
114 0.07
115 0.06
116 0.06
117 0.07
118 0.07
119 0.07
120 0.07
121 0.08
122 0.08
123 0.08
124 0.08
125 0.07
126 0.09
127 0.12
128 0.14
129 0.13
130 0.13
131 0.14
132 0.14
133 0.14
134 0.14
135 0.13
136 0.14
137 0.15
138 0.15
139 0.18
140 0.21
141 0.22
142 0.27
143 0.32
144 0.38
145 0.47
146 0.56
147 0.64
148 0.71
149 0.76
150 0.79
151 0.81
152 0.82
153 0.81
154 0.8
155 0.78
156 0.72
157 0.67
158 0.6
159 0.5
160 0.42
161 0.33
162 0.29
163 0.23
164 0.25
165 0.3
166 0.32
167 0.32
168 0.33
169 0.37
170 0.34
171 0.36
172 0.39
173 0.35
174 0.36
175 0.41
176 0.42
177 0.37
178 0.36
179 0.34
180 0.26
181 0.28
182 0.27
183 0.26
184 0.23
185 0.24
186 0.27
187 0.27
188 0.29
189 0.25
190 0.25
191 0.24
192 0.24
193 0.24
194 0.21
195 0.19
196 0.16
197 0.16
198 0.13
199 0.1
200 0.11
201 0.09
202 0.09
203 0.11
204 0.11
205 0.1
206 0.11
207 0.11
208 0.11
209 0.12
210 0.13
211 0.12
212 0.12
213 0.12
214 0.1
215 0.1
216 0.1
217 0.09
218 0.08
219 0.07
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.06
224 0.05
225 0.05
226 0.07
227 0.08
228 0.09
229 0.09
230 0.1
231 0.1
232 0.1
233 0.15
234 0.13
235 0.13
236 0.18
237 0.18
238 0.22
239 0.27
240 0.35
241 0.32
242 0.32
243 0.36
244 0.35
245 0.36
246 0.32
247 0.28
248 0.21
249 0.2
250 0.23
251 0.18
252 0.14
253 0.12
254 0.12
255 0.13
256 0.15
257 0.17
258 0.19
259 0.2
260 0.22
261 0.23
262 0.24
263 0.24
264 0.2
265 0.19
266 0.16
267 0.17
268 0.22
269 0.22
270 0.21
271 0.2
272 0.2
273 0.19
274 0.18
275 0.16
276 0.1
277 0.1
278 0.1
279 0.1
280 0.12
281 0.12
282 0.13
283 0.13
284 0.14
285 0.14
286 0.15
287 0.16
288 0.16
289 0.17
290 0.16
291 0.15
292 0.14
293 0.14
294 0.15
295 0.19
296 0.26
297 0.28
298 0.3
299 0.3
300 0.32
301 0.33
302 0.35
303 0.36
304 0.34
305 0.32
306 0.34
307 0.35
308 0.36
309 0.37
310 0.36
311 0.31
312 0.26
313 0.26
314 0.23
315 0.23
316 0.22
317 0.22
318 0.21
319 0.23
320 0.22
321 0.21
322 0.19
323 0.19
324 0.24
325 0.23
326 0.26
327 0.22
328 0.23
329 0.22
330 0.24
331 0.23
332 0.18
333 0.17
334 0.14
335 0.13
336 0.12
337 0.12
338 0.1
339 0.1
340 0.08
341 0.07
342 0.08
343 0.07
344 0.08
345 0.08
346 0.08
347 0.09
348 0.09
349 0.13
350 0.14
351 0.17
352 0.16
353 0.17
354 0.18
355 0.19
356 0.2
357 0.16
358 0.14
359 0.12
360 0.13
361 0.13
362 0.12
363 0.12
364 0.11
365 0.11
366 0.11
367 0.1
368 0.1
369 0.1
370 0.1
371 0.09
372 0.1
373 0.09
374 0.1
375 0.11
376 0.11
377 0.11
378 0.13
379 0.14
380 0.15
381 0.15
382 0.15
383 0.17
384 0.2
385 0.2
386 0.2
387 0.2
388 0.18
389 0.21
390 0.29
391 0.33
392 0.39
393 0.4
394 0.44
395 0.47
396 0.49
397 0.47
398 0.42
399 0.41
400 0.38
401 0.38
402 0.38
403 0.36
404 0.35
405 0.35
406 0.39
407 0.36
408 0.4
409 0.4
410 0.38
411 0.38
412 0.39
413 0.44
414 0.42
415 0.42
416 0.38
417 0.39
418 0.39
419 0.38
420 0.38
421 0.38
422 0.32
423 0.3
424 0.26
425 0.21
426 0.17
427 0.17
428 0.15
429 0.12
430 0.12
431 0.11
432 0.13
433 0.18
434 0.18
435 0.19
436 0.18
437 0.15
438 0.14
439 0.14
440 0.11
441 0.07
442 0.08
443 0.08
444 0.08
445 0.08
446 0.09
447 0.09
448 0.08
449 0.07
450 0.07
451 0.06
452 0.06
453 0.06
454 0.06
455 0.06
456 0.07
457 0.07
458 0.07
459 0.09
460 0.09
461 0.09
462 0.1
463 0.1
464 0.12
465 0.12
466 0.11
467 0.09
468 0.09
469 0.13
470 0.13
471 0.13
472 0.11
473 0.14
474 0.2
475 0.29
476 0.32
477 0.31
478 0.33
479 0.33
480 0.32
481 0.3
482 0.26
483 0.18
484 0.22
485 0.21
486 0.22
487 0.23
488 0.24
489 0.25
490 0.29
491 0.38
492 0.39
493 0.47
494 0.51
495 0.56
496 0.56
497 0.63
498 0.64
499 0.63
500 0.63
501 0.58
502 0.56
503 0.54
504 0.54
505 0.48
506 0.48
507 0.44
508 0.37
509 0.33
510 0.27
511 0.24
512 0.25
513 0.25
514 0.18
515 0.15
516 0.17
517 0.18
518 0.2
519 0.21
520 0.2
521 0.2
522 0.26
523 0.29
524 0.29
525 0.27
526 0.27
527 0.27
528 0.27
529 0.31
530 0.31
531 0.32
532 0.37
533 0.42
534 0.48
535 0.47
536 0.55
537 0.55
538 0.57
539 0.58
540 0.52
541 0.49
542 0.44
543 0.47
544 0.41
545 0.39
546 0.35
547 0.3
548 0.28
549 0.26
550 0.28
551 0.22
552 0.23
553 0.26
554 0.23
555 0.21
556 0.24
557 0.24
558 0.2
559 0.21
560 0.19
561 0.15
562 0.14
563 0.14
564 0.11
565 0.1
566 0.1
567 0.08
568 0.06
569 0.05
570 0.04
571 0.05
572 0.05
573 0.05
574 0.06
575 0.07
576 0.08
577 0.08
578 0.09
579 0.08
580 0.09
581 0.08
582 0.09
583 0.08
584 0.09
585 0.1
586 0.1
587 0.1
588 0.13
589 0.13
590 0.15
591 0.22
592 0.28
593 0.34
594 0.35
595 0.38
596 0.42
597 0.53
598 0.57
599 0.56
600 0.58
601 0.6
602 0.59
603 0.61
604 0.6
605 0.58
606 0.61
607 0.63
608 0.61
609 0.61
610 0.68
611 0.7
612 0.69
613 0.71
614 0.69
615 0.7
616 0.73
617 0.68
618 0.62
619 0.59
620 0.55
621 0.49
622 0.44
623 0.42
624 0.41
625 0.44
626 0.45
627 0.42
628 0.46
629 0.5
630 0.49
631 0.49
632 0.46
633 0.4
634 0.42
635 0.43
636 0.4
637 0.41
638 0.46
639 0.46
640 0.5
641 0.5
642 0.52
643 0.53
644 0.5
645 0.43
646 0.37
647 0.32
648 0.25
649 0.31
650 0.26
651 0.23
652 0.23
653 0.23
654 0.21
655 0.19
656 0.22
657 0.14
658 0.13
659 0.14
660 0.14
661 0.14
662 0.15
663 0.14
664 0.1
665 0.11
666 0.14
667 0.13
668 0.16
669 0.18
670 0.21
671 0.23
672 0.29
673 0.32
674 0.38
675 0.45
676 0.45
677 0.42
678 0.39
679 0.37