Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4R6D0

Protein Details
Accession C4R6D0    Localization Confidence High Confidence Score 20.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
294-313KEPREHSKANKPKKPEPELRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
213-235PKGREPRESRESREPRPPRREEP
247-276PKFTPREPREPREQRESGEPREQKPFRPRK
286-310RGSAVPKAKEPREHSKANKPKKPEP
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
KEGG ppa:PAS_chr3_1054  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MTKMDLGSFLEDDSFGGSWADDDVDMSAVSLTTAIPLPPPKAPIGTLKRDRVNYPIPRSGPYKAVVNNLPWDINEETFAKWLDHVLSLTFDSIVELSMPMDVIHDRPKGFAFVTFNKRSELEQAVNSEGLTFNGRSIYISVASPERDESTKEFDWSNARGSAQKPSSTSREEHEFDWDNVRGSAQPAVRERRAPREPREEIDLDWGARGTAVPKGREPRESRESREPRPPRREEPELDWGARGTAVPKFTPREPREPREQRESGEPREQKPFRPRKQEVEFDWSARGSAVPKAKEPREHSKANKPKKPEPELRWESLRANNAQKKEEVRPTSSASATSVPQEKKDAHRVKQSLFHVLADQSDDDGQNIQELENQAADLALNKD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.09
3 0.08
4 0.08
5 0.08
6 0.08
7 0.09
8 0.06
9 0.07
10 0.07
11 0.08
12 0.07
13 0.07
14 0.07
15 0.06
16 0.06
17 0.06
18 0.05
19 0.06
20 0.07
21 0.07
22 0.1
23 0.14
24 0.17
25 0.19
26 0.22
27 0.22
28 0.23
29 0.25
30 0.32
31 0.37
32 0.44
33 0.5
34 0.55
35 0.6
36 0.61
37 0.61
38 0.58
39 0.6
40 0.59
41 0.59
42 0.59
43 0.55
44 0.55
45 0.57
46 0.53
47 0.47
48 0.4
49 0.38
50 0.33
51 0.37
52 0.37
53 0.36
54 0.37
55 0.34
56 0.33
57 0.26
58 0.28
59 0.23
60 0.2
61 0.2
62 0.17
63 0.16
64 0.17
65 0.18
66 0.14
67 0.12
68 0.13
69 0.12
70 0.12
71 0.12
72 0.11
73 0.12
74 0.12
75 0.12
76 0.1
77 0.09
78 0.08
79 0.08
80 0.07
81 0.06
82 0.05
83 0.05
84 0.05
85 0.05
86 0.05
87 0.06
88 0.06
89 0.08
90 0.13
91 0.16
92 0.16
93 0.17
94 0.18
95 0.19
96 0.19
97 0.2
98 0.21
99 0.26
100 0.35
101 0.38
102 0.38
103 0.38
104 0.38
105 0.36
106 0.34
107 0.31
108 0.25
109 0.23
110 0.24
111 0.24
112 0.23
113 0.22
114 0.18
115 0.13
116 0.11
117 0.11
118 0.09
119 0.08
120 0.08
121 0.08
122 0.08
123 0.09
124 0.1
125 0.08
126 0.08
127 0.09
128 0.11
129 0.11
130 0.11
131 0.11
132 0.12
133 0.11
134 0.13
135 0.14
136 0.2
137 0.2
138 0.21
139 0.2
140 0.2
141 0.23
142 0.23
143 0.23
144 0.17
145 0.17
146 0.19
147 0.2
148 0.26
149 0.24
150 0.24
151 0.24
152 0.26
153 0.3
154 0.3
155 0.3
156 0.25
157 0.29
158 0.29
159 0.27
160 0.29
161 0.27
162 0.25
163 0.28
164 0.26
165 0.2
166 0.18
167 0.18
168 0.13
169 0.11
170 0.15
171 0.12
172 0.15
173 0.19
174 0.24
175 0.25
176 0.3
177 0.31
178 0.36
179 0.43
180 0.46
181 0.47
182 0.52
183 0.53
184 0.5
185 0.53
186 0.45
187 0.37
188 0.36
189 0.3
190 0.21
191 0.18
192 0.16
193 0.11
194 0.09
195 0.09
196 0.05
197 0.08
198 0.12
199 0.13
200 0.16
201 0.23
202 0.25
203 0.32
204 0.35
205 0.39
206 0.46
207 0.48
208 0.51
209 0.56
210 0.6
211 0.57
212 0.64
213 0.65
214 0.66
215 0.72
216 0.72
217 0.68
218 0.69
219 0.71
220 0.64
221 0.61
222 0.6
223 0.53
224 0.47
225 0.41
226 0.33
227 0.27
228 0.23
229 0.17
230 0.09
231 0.09
232 0.1
233 0.11
234 0.14
235 0.17
236 0.22
237 0.32
238 0.35
239 0.44
240 0.5
241 0.55
242 0.62
243 0.68
244 0.69
245 0.68
246 0.66
247 0.57
248 0.6
249 0.6
250 0.55
251 0.55
252 0.54
253 0.48
254 0.56
255 0.56
256 0.53
257 0.58
258 0.63
259 0.62
260 0.69
261 0.71
262 0.71
263 0.77
264 0.77
265 0.71
266 0.68
267 0.61
268 0.52
269 0.49
270 0.39
271 0.31
272 0.23
273 0.19
274 0.12
275 0.16
276 0.21
277 0.21
278 0.26
279 0.34
280 0.38
281 0.46
282 0.51
283 0.56
284 0.56
285 0.63
286 0.64
287 0.68
288 0.74
289 0.77
290 0.76
291 0.73
292 0.75
293 0.77
294 0.8
295 0.79
296 0.76
297 0.76
298 0.77
299 0.73
300 0.69
301 0.62
302 0.57
303 0.52
304 0.51
305 0.45
306 0.49
307 0.5
308 0.5
309 0.5
310 0.49
311 0.49
312 0.51
313 0.55
314 0.51
315 0.49
316 0.49
317 0.52
318 0.52
319 0.47
320 0.4
321 0.33
322 0.3
323 0.26
324 0.27
325 0.3
326 0.27
327 0.29
328 0.32
329 0.34
330 0.39
331 0.5
332 0.54
333 0.53
334 0.62
335 0.64
336 0.64
337 0.68
338 0.64
339 0.61
340 0.54
341 0.48
342 0.4
343 0.36
344 0.33
345 0.27
346 0.24
347 0.17
348 0.18
349 0.17
350 0.14
351 0.15
352 0.14
353 0.14
354 0.14
355 0.12
356 0.14
357 0.16
358 0.17
359 0.15
360 0.15
361 0.13
362 0.12
363 0.12