FuNGI

A0A1Q5U1V4

Protein Details

Accession

A0A1Q5U1V4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
104-123	GVAPRAKMNQQRARRFRSAQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
411-445	RRRRQAEERKAANEKRRKEQDQARNEERARKRRRS

Subcellular Location(s)

mito 11, nucl 7, cyto 7, cyto_nucl 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4 IPR001878 Znf_CCHC
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPALFRWLSNKYPKIVSSVIEELPQEVNGEVIPVDGTRPNPNGEEMDNLYLDMNGIVHPCTHPEGRPPPANEQEMMLEIFTYTDRVINMVRPRKLLMIAIDGVAPRAKMNQQRARRFRSAQEARENDEKKEELQKLLDKQQSKKTGDAAIREEVIQKTWDSNVITPGTPFMDILAASLRYWIAYKLNTDPAWEKMKIIISDATVPGEGEHKIMEFVRSQRASPEHDPNTRHVIYGLDADLIMLGLATHEPHFRVLREDVFFQESKPRTCRLCGQVGHKAEECTGKAKEKSGEFDEKQHASPLKPFIWLHVSVLREYLAVEMQVPQQPFPFDLERALDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLDIRENGIDTLIAIWRDNIPAMGGYLTQDGHVDLKRAQLILQGLAKQEDAIFRRRRQAEERKAANEKRRKEQDQARNEERARKRRRSSPVYDANAKQRSKGEADPDPTGGLELIKPSRAHLTKEDKDLTHSMIVNRGAIYRANMENKSAAAVLKSKLMKGSQSEPVADEVPATAENEEGAAEPTSPSVLGKRKVDESTEATEQETEDAGTPGRDSPAVPPPKPNNNDEMPPDTVKLWEPGYADRYYEQKFGVDPQDHEFRHKVARAYAEGLAWVLLYYFQGCPSWDWYYPYHYAPFAADFVDIADMVIEFDKGKPFRPYEQLMGVLPASSNHALPKVFHDLMSNPESEIIDFYPEDFALDLNGKKFAWQGVILLPFIDEKRLLAAMEKVYPLLTDEERIRNTHGQEVLLMSEQHPLYQDLVGNFYSKKPGPPEYKLNMRISEGLGGLVERNDTYIPHGSLVSPLQEYGMPSLDDDHTLTVNYKIPKSTHIHKSMLLRGVKFATPMLNSADIRAVKGRAQHSGRSYGGAPLNGRGRGGHMDYSSDRPNPFAAHLDPRFMHAPPGGMPPMPSGWVPPAPGAGDYSRGPPGPPRGGMNHQYPSHQGPGQYQGHQGYNQGPNQGYQGYQGQQGQGNQGQQGYYGGYQDRGRGGGGNGGHRGGRFRGQNRDNYGGHRGGGGGGGGGGYNRY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.46
2	0.47
3	0.49
4	0.47
5	0.41
6	0.37
7	0.37
8	0.34
9	0.31
10	0.3
11	0.26
12	0.25
13	0.24
14	0.18
15	0.13
16	0.12
17	0.1
18	0.1
19	0.08
20	0.07
21	0.07
22	0.06
23	0.08
24	0.11
25	0.14
26	0.19
27	0.22
28	0.24
29	0.26
30	0.28
31	0.29
32	0.28
33	0.31
34	0.28
35	0.28
36	0.26
37	0.24
38	0.22
39	0.19
40	0.17
41	0.12
42	0.09
43	0.07
44	0.08
45	0.08
46	0.09
47	0.1
48	0.12
49	0.17
50	0.19
51	0.2
52	0.29
53	0.37
54	0.43
55	0.51
56	0.52
57	0.56
58	0.61
59	0.62
60	0.53
61	0.47
62	0.41
63	0.35
64	0.31
65	0.22
66	0.14
67	0.11
68	0.11
69	0.1
70	0.09
71	0.07
72	0.09
73	0.09
74	0.11
75	0.13
76	0.19
77	0.28
78	0.36
79	0.39
80	0.39
81	0.41
82	0.42
83	0.43
84	0.39
85	0.32
86	0.29
87	0.27
88	0.25
89	0.24
90	0.21
91	0.2
92	0.18
93	0.15
94	0.1
95	0.13
96	0.19
97	0.26
98	0.36
99	0.45
100	0.54
101	0.65
102	0.74
103	0.79
104	0.8
105	0.77
106	0.73
107	0.75
108	0.74
109	0.71
110	0.73
111	0.68
112	0.65
113	0.7
114	0.66
115	0.56
116	0.53
117	0.46
118	0.39
119	0.44
120	0.41
121	0.35
122	0.39
123	0.44
124	0.44
125	0.52
126	0.55
127	0.52
128	0.55
129	0.61
130	0.65
131	0.61
132	0.58
133	0.53
134	0.54
135	0.52
136	0.51
137	0.46
138	0.4
139	0.37
140	0.35
141	0.35
142	0.28
143	0.26
144	0.22
145	0.18
146	0.17
147	0.17
148	0.2
149	0.18
150	0.19
151	0.22
152	0.23
153	0.23
154	0.21
155	0.22
156	0.19
157	0.17
158	0.15
159	0.11
160	0.1
161	0.09
162	0.1
163	0.11
164	0.1
165	0.1
166	0.11
167	0.1
168	0.09
169	0.1
170	0.11
171	0.12
172	0.13
173	0.16
174	0.2
175	0.27
176	0.27
177	0.29
178	0.3
179	0.32
180	0.36
181	0.33
182	0.29
183	0.26
184	0.32
185	0.28
186	0.29
187	0.26
188	0.21
189	0.24
190	0.24
191	0.21
192	0.15
193	0.15
194	0.13
195	0.13
196	0.12
197	0.09
198	0.09
199	0.08
200	0.09
201	0.1
202	0.11
203	0.13
204	0.16
205	0.24
206	0.25
207	0.25
208	0.29
209	0.32
210	0.38
211	0.4
212	0.47
213	0.45
214	0.5
215	0.52
216	0.5
217	0.55
218	0.48
219	0.42
220	0.33
221	0.27
222	0.22
223	0.23
224	0.19
225	0.11
226	0.1
227	0.1
228	0.09
229	0.08
230	0.06
231	0.03
232	0.03
233	0.03
234	0.03
235	0.04
236	0.05
237	0.07
238	0.08
239	0.11
240	0.13
241	0.14
242	0.18
243	0.2
244	0.24
245	0.25
246	0.26
247	0.25
248	0.28
249	0.27
250	0.24
251	0.3
252	0.28
253	0.31
254	0.33
255	0.35
256	0.33
257	0.36
258	0.44
259	0.4
260	0.46
261	0.45
262	0.49
263	0.53
264	0.53
265	0.54
266	0.47
267	0.42
268	0.36
269	0.35
270	0.29
271	0.25
272	0.25
273	0.27
274	0.27
275	0.3
276	0.33
277	0.31
278	0.35
279	0.37
280	0.43
281	0.38
282	0.43
283	0.45
284	0.43
285	0.41
286	0.41
287	0.37
288	0.3
289	0.33
290	0.32
291	0.27
292	0.29
293	0.28
294	0.26
295	0.29
296	0.28
297	0.26
298	0.24
299	0.25
300	0.2
301	0.21
302	0.18
303	0.13
304	0.13
305	0.11
306	0.08
307	0.06
308	0.07
309	0.08
310	0.1
311	0.13
312	0.14
313	0.13
314	0.14
315	0.15
316	0.15
317	0.17
318	0.17
319	0.14
320	0.15
321	0.17
322	0.16
323	0.17
324	0.17
325	0.13
326	0.11
327	0.11
328	0.1
329	0.08
330	0.07
331	0.06
332	0.05
333	0.05
334	0.06
335	0.06
336	0.06
337	0.06
338	0.07
339	0.07
340	0.08
341	0.08
342	0.08
343	0.07
344	0.08
345	0.12
346	0.15
347	0.16
348	0.15
349	0.16
350	0.16
351	0.15
352	0.15
353	0.1
354	0.06
355	0.06
356	0.07
357	0.07
358	0.06
359	0.07
360	0.08
361	0.08
362	0.08
363	0.07
364	0.06
365	0.06
366	0.06
367	0.06
368	0.05
369	0.06
370	0.06
371	0.06
372	0.06
373	0.06
374	0.06
375	0.09
376	0.09
377	0.1
378	0.1
379	0.12
380	0.13
381	0.13
382	0.13
383	0.13
384	0.14
385	0.15
386	0.16
387	0.15
388	0.14
389	0.15
390	0.14
391	0.12
392	0.11
393	0.13
394	0.13
395	0.2
396	0.26
397	0.28
398	0.37
399	0.39
400	0.43
401	0.48
402	0.57
403	0.59
404	0.63
405	0.65
406	0.62
407	0.68
408	0.69
409	0.69
410	0.66
411	0.61
412	0.6
413	0.64
414	0.63
415	0.63
416	0.68
417	0.68
418	0.7
419	0.73
420	0.68
421	0.66
422	0.64
423	0.65
424	0.63
425	0.64
426	0.63
427	0.64
428	0.66
429	0.68
430	0.76
431	0.75
432	0.73
433	0.73
434	0.73
435	0.69
436	0.68
437	0.62
438	0.61
439	0.6
440	0.53
441	0.46
442	0.38
443	0.36
444	0.34
445	0.34
446	0.3
447	0.28
448	0.31
449	0.3
450	0.28
451	0.25
452	0.22
453	0.19
454	0.14
455	0.09
456	0.06
457	0.07
458	0.07
459	0.09
460	0.09
461	0.1
462	0.17
463	0.18
464	0.2
465	0.26
466	0.35
467	0.36
468	0.41
469	0.43
470	0.36
471	0.38
472	0.37
473	0.31
474	0.24
475	0.22
476	0.17
477	0.19
478	0.19
479	0.16
480	0.15
481	0.13
482	0.11
483	0.1
484	0.11
485	0.1
486	0.12
487	0.16
488	0.16
489	0.16
490	0.16
491	0.15
492	0.15
493	0.12
494	0.1
495	0.07
496	0.09
497	0.09
498	0.13
499	0.13
500	0.13
501	0.14
502	0.15
503	0.16
504	0.16
505	0.2
506	0.2
507	0.21
508	0.21
509	0.2
510	0.21
511	0.19
512	0.17
513	0.13
514	0.07
515	0.07
516	0.07
517	0.06
518	0.05
519	0.04
520	0.04
521	0.04
522	0.04
523	0.04
524	0.05
525	0.05
526	0.05
527	0.05
528	0.05
529	0.05
530	0.05
531	0.05
532	0.08
533	0.12
534	0.16
535	0.18
536	0.2
537	0.23
538	0.24
539	0.26
540	0.25
541	0.24
542	0.24
543	0.24
544	0.23
545	0.2
546	0.19
547	0.17
548	0.14
549	0.11
550	0.07
551	0.06
552	0.06
553	0.06
554	0.06
555	0.06
556	0.06
557	0.06
558	0.06
559	0.06
560	0.09
561	0.18
562	0.23
563	0.23
564	0.3
565	0.35
566	0.44
567	0.46
568	0.45
569	0.41
570	0.38
571	0.4
572	0.36
573	0.35
574	0.28
575	0.26
576	0.25
577	0.2
578	0.19
579	0.17
580	0.16
581	0.12
582	0.12
583	0.12
584	0.13
585	0.16
586	0.16
587	0.16
588	0.15
589	0.19
590	0.18
591	0.19
592	0.17
593	0.14
594	0.14
595	0.17
596	0.22
597	0.2
598	0.19
599	0.21
600	0.29
601	0.28
602	0.31
603	0.29
604	0.25
605	0.28
606	0.3
607	0.27
608	0.22
609	0.25
610	0.24
611	0.25
612	0.25
613	0.2
614	0.17
615	0.15
616	0.12
617	0.09
618	0.07
619	0.04
620	0.03
621	0.03
622	0.05
623	0.05
624	0.05
625	0.06
626	0.07
627	0.08
628	0.12
629	0.15
630	0.15
631	0.18
632	0.19
633	0.23
634	0.25
635	0.26
636	0.23
637	0.2
638	0.19
639	0.17
640	0.17
641	0.12
642	0.1
643	0.09
644	0.07
645	0.07
646	0.07
647	0.06
648	0.05
649	0.04
650	0.03
651	0.04
652	0.04
653	0.04
654	0.04
655	0.05
656	0.1
657	0.11
658	0.14
659	0.18
660	0.21
661	0.25
662	0.31
663	0.34
664	0.32
665	0.34
666	0.33
667	0.28
668	0.27
669	0.22
670	0.16
671	0.13
672	0.1
673	0.1
674	0.09
675	0.1
676	0.09
677	0.11
678	0.11
679	0.12
680	0.16
681	0.2
682	0.2
683	0.2
684	0.21
685	0.2
686	0.24
687	0.26
688	0.22
689	0.15
690	0.16
691	0.15
692	0.14
693	0.14
694	0.09
695	0.09
696	0.09
697	0.09
698	0.09
699	0.08
700	0.09
701	0.07
702	0.07
703	0.06
704	0.09
705	0.1
706	0.09
707	0.11
708	0.11
709	0.11
710	0.13
711	0.12
712	0.12
713	0.11
714	0.12
715	0.14
716	0.16
717	0.15
718	0.14
719	0.13
720	0.13
721	0.12
722	0.12
723	0.08
724	0.07
725	0.09
726	0.09
727	0.09
728	0.09
729	0.12
730	0.13
731	0.15
732	0.15
733	0.13
734	0.13
735	0.13
736	0.13
737	0.13
738	0.11
739	0.12
740	0.16
741	0.21
742	0.23
743	0.24
744	0.27
745	0.28
746	0.29
747	0.32
748	0.29
749	0.24
750	0.24
751	0.23
752	0.2
753	0.17
754	0.16
755	0.11
756	0.15
757	0.14
758	0.14
759	0.14
760	0.14
761	0.14
762	0.15
763	0.17
764	0.12
765	0.15
766	0.15
767	0.15
768	0.15
769	0.14
770	0.18
771	0.17
772	0.21
773	0.23
774	0.31
775	0.37
776	0.42
777	0.5
778	0.52
779	0.6
780	0.63
781	0.62
782	0.55
783	0.5
784	0.46
785	0.38
786	0.34
787	0.24
788	0.18
789	0.13
790	0.12
791	0.1
792	0.08
793	0.08
794	0.06
795	0.07
796	0.07
797	0.07
798	0.11
799	0.15
800	0.15
801	0.15
802	0.16
803	0.15
804	0.17
805	0.18
806	0.16
807	0.12
808	0.12
809	0.11
810	0.12
811	0.13
812	0.12
813	0.13
814	0.11
815	0.11
816	0.13
817	0.13
818	0.13
819	0.13
820	0.12
821	0.11
822	0.11
823	0.12
824	0.12
825	0.17
826	0.19
827	0.2
828	0.22
829	0.23
830	0.29
831	0.34
832	0.4
833	0.45
834	0.49
835	0.49
836	0.5
837	0.56
838	0.56
839	0.57
840	0.52
841	0.43
842	0.39
843	0.4
844	0.36
845	0.31
846	0.25
847	0.21
848	0.18
849	0.19
850	0.2
851	0.21
852	0.21
853	0.21
854	0.26
855	0.22
856	0.23
857	0.24
858	0.23
859	0.2
860	0.27
861	0.28
862	0.31
863	0.34
864	0.39
865	0.4
866	0.45
867	0.43
868	0.39
869	0.38
870	0.35
871	0.34
872	0.31
873	0.28
874	0.27
875	0.31
876	0.29
877	0.29
878	0.23
879	0.23
880	0.25
881	0.27
882	0.25
883	0.21
884	0.25
885	0.27
886	0.32
887	0.34
888	0.33
889	0.3
890	0.28
891	0.29
892	0.27
893	0.26
894	0.25
895	0.25
896	0.3
897	0.31
898	0.35
899	0.33
900	0.36
901	0.36
902	0.31
903	0.31
904	0.23
905	0.23
906	0.2
907	0.26
908	0.23
909	0.22
910	0.22
911	0.21
912	0.21
913	0.2
914	0.18
915	0.15
916	0.18
917	0.19
918	0.2
919	0.18
920	0.19
921	0.18
922	0.18
923	0.19
924	0.15
925	0.17
926	0.17
927	0.2
928	0.21
929	0.21
930	0.21
931	0.24
932	0.32
933	0.34
934	0.35
935	0.37
936	0.4
937	0.47
938	0.52
939	0.53
940	0.52
941	0.48
942	0.48
943	0.48
944	0.46
945	0.44
946	0.4
947	0.35
948	0.31
949	0.38
950	0.4
951	0.39
952	0.39
953	0.37
954	0.38
955	0.37
956	0.36
957	0.35
958	0.37
959	0.37
960	0.37
961	0.34
962	0.31
963	0.33
964	0.32
965	0.25
966	0.21
967	0.24
968	0.21
969	0.25
970	0.26
971	0.27
972	0.29
973	0.3
974	0.33
975	0.32
976	0.32
977	0.29
978	0.28
979	0.25
980	0.22
981	0.22
982	0.18
983	0.15
984	0.16
985	0.15
986	0.18
987	0.2
988	0.22
989	0.23
990	0.21
991	0.21
992	0.21
993	0.2
994	0.22
995	0.23
996	0.25
997	0.25
998	0.26
999	0.27
1000	0.25
1001	0.28
1002	0.26
1003	0.3
1004	0.34
1005	0.39
1006	0.48
1007	0.53
1008	0.61
1009	0.65
1010	0.69
1011	0.64
1012	0.6
1013	0.6
1014	0.51
1015	0.45
1016	0.37
1017	0.3
1018	0.23
1019	0.22
1020	0.16
1021	0.09
1022	0.07
1023	0.07
1024	0.06

A0A1Q5U1V4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer