Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Q5SU88

Protein Details
Accession A0A1Q5SU88    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
85-105LFHLWGTRKNRRKVRDWAKAHHydrophilic
410-431KYLDRESQKGQRKSMKKYSRKGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
370-401KKLRRVEEEEKAEERKLAAEKIKKEERERLLR
414-431RESQKGQRKSMKKYSRKG
Subcellular Location(s) cyto 12.5, cyto_nucl 10, nucl 6.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012879  CCDC47  
Gene Ontology GO:0005783  C:endoplasmic reticulum  
GO:0016020  C:membrane  
GO:0005509  F:calcium ion binding  
GO:0032469  P:endoplasmic reticulum calcium ion homeostasis  
Pfam View protein in Pfam  
PF07946  CCDC47  
Amino Acid Sequences MAGMFKNVFGSQPSGAANPDDDFADFVEAPNPSPASLVADTTTIPAFSTGGAVPYTKWYRIWERTSPSDFMQEAIIMPFILVVVLFHLWGTRKNRRKVRDWAKAHIPALQKEFAVVGFDGISRSGPEEVTVELANPEKLLKEKSAHEFAAYATGRQNVAFLDIALTMPKRYNPITYIMEYVFSFFFETWEAPAEKYEALMYAFDGKEKDLVPVLAKESSSLKVANSTYDGFIWAVVHKSHMRKFRTDRYDASITFSKDHPKLPSWVTVMSESAEITDTLLTPELIQAIEQAGNDFEFLIVTDQPIDKPTKIDETVPKKRIQLSVNLSSGYESTLPLFNQFLRFADKLVSVAHWRGEVMRKIRNVRDEEIKKLRRVEEEEKAEERKLAAEKIKKEERERLLRGMTAEEQRKYLDRESQKGQRKSMKKYSRKG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.2
3 0.2
4 0.19
5 0.17
6 0.17
7 0.14
8 0.13
9 0.13
10 0.12
11 0.15
12 0.13
13 0.13
14 0.16
15 0.15
16 0.16
17 0.19
18 0.19
19 0.15
20 0.15
21 0.15
22 0.17
23 0.18
24 0.18
25 0.15
26 0.15
27 0.15
28 0.16
29 0.16
30 0.1
31 0.1
32 0.09
33 0.08
34 0.08
35 0.1
36 0.08
37 0.1
38 0.1
39 0.1
40 0.11
41 0.19
42 0.22
43 0.22
44 0.23
45 0.28
46 0.36
47 0.44
48 0.5
49 0.5
50 0.53
51 0.6
52 0.63
53 0.6
54 0.52
55 0.5
56 0.43
57 0.35
58 0.29
59 0.22
60 0.18
61 0.15
62 0.14
63 0.08
64 0.08
65 0.07
66 0.05
67 0.05
68 0.04
69 0.03
70 0.04
71 0.05
72 0.05
73 0.05
74 0.07
75 0.08
76 0.15
77 0.23
78 0.32
79 0.41
80 0.51
81 0.6
82 0.66
83 0.73
84 0.78
85 0.81
86 0.81
87 0.78
88 0.76
89 0.76
90 0.75
91 0.67
92 0.62
93 0.55
94 0.49
95 0.47
96 0.41
97 0.31
98 0.25
99 0.25
100 0.19
101 0.17
102 0.13
103 0.09
104 0.07
105 0.08
106 0.08
107 0.08
108 0.08
109 0.06
110 0.07
111 0.08
112 0.07
113 0.08
114 0.08
115 0.08
116 0.1
117 0.1
118 0.08
119 0.09
120 0.1
121 0.09
122 0.08
123 0.08
124 0.08
125 0.1
126 0.12
127 0.13
128 0.16
129 0.21
130 0.26
131 0.31
132 0.3
133 0.28
134 0.27
135 0.24
136 0.29
137 0.24
138 0.19
139 0.16
140 0.17
141 0.17
142 0.17
143 0.17
144 0.08
145 0.1
146 0.1
147 0.08
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.08
152 0.08
153 0.07
154 0.08
155 0.09
156 0.11
157 0.12
158 0.14
159 0.14
160 0.2
161 0.22
162 0.23
163 0.24
164 0.21
165 0.21
166 0.19
167 0.19
168 0.13
169 0.1
170 0.09
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.09
177 0.1
178 0.09
179 0.1
180 0.1
181 0.09
182 0.09
183 0.09
184 0.07
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.09
189 0.09
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.11
194 0.11
195 0.11
196 0.08
197 0.09
198 0.09
199 0.1
200 0.11
201 0.1
202 0.09
203 0.1
204 0.11
205 0.11
206 0.11
207 0.11
208 0.09
209 0.12
210 0.13
211 0.12
212 0.13
213 0.13
214 0.12
215 0.11
216 0.12
217 0.08
218 0.08
219 0.08
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.09
224 0.12
225 0.17
226 0.22
227 0.29
228 0.32
229 0.38
230 0.44
231 0.51
232 0.55
233 0.55
234 0.52
235 0.51
236 0.54
237 0.46
238 0.45
239 0.4
240 0.33
241 0.31
242 0.3
243 0.29
244 0.26
245 0.29
246 0.27
247 0.25
248 0.28
249 0.28
250 0.32
251 0.27
252 0.27
253 0.25
254 0.23
255 0.21
256 0.18
257 0.16
258 0.11
259 0.09
260 0.08
261 0.07
262 0.06
263 0.06
264 0.05
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.05
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.05
273 0.05
274 0.06
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.07
281 0.06
282 0.05
283 0.04
284 0.04
285 0.06
286 0.05
287 0.06
288 0.07
289 0.08
290 0.08
291 0.11
292 0.14
293 0.12
294 0.14
295 0.16
296 0.2
297 0.21
298 0.26
299 0.33
300 0.4
301 0.5
302 0.52
303 0.53
304 0.51
305 0.55
306 0.56
307 0.49
308 0.48
309 0.45
310 0.49
311 0.47
312 0.44
313 0.39
314 0.33
315 0.31
316 0.23
317 0.16
318 0.09
319 0.1
320 0.11
321 0.12
322 0.12
323 0.14
324 0.14
325 0.16
326 0.17
327 0.16
328 0.2
329 0.2
330 0.2
331 0.21
332 0.2
333 0.18
334 0.18
335 0.19
336 0.16
337 0.18
338 0.18
339 0.16
340 0.16
341 0.18
342 0.25
343 0.29
344 0.31
345 0.36
346 0.41
347 0.48
348 0.53
349 0.58
350 0.56
351 0.54
352 0.6
353 0.57
354 0.6
355 0.64
356 0.65
357 0.61
358 0.62
359 0.62
360 0.58
361 0.62
362 0.6
363 0.59
364 0.6
365 0.61
366 0.6
367 0.58
368 0.52
369 0.45
370 0.38
371 0.33
372 0.29
373 0.3
374 0.34
375 0.38
376 0.44
377 0.52
378 0.6
379 0.62
380 0.65
381 0.69
382 0.7
383 0.72
384 0.71
385 0.68
386 0.63
387 0.59
388 0.54
389 0.49
390 0.45
391 0.43
392 0.45
393 0.4
394 0.38
395 0.38
396 0.41
397 0.41
398 0.4
399 0.41
400 0.42
401 0.47
402 0.54
403 0.62
404 0.68
405 0.7
406 0.74
407 0.75
408 0.75
409 0.79
410 0.81
411 0.83