FuNGI

A0A1Q5SYE2

Protein Details

Accession

A0A1Q5SYE2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
214-237	VEIQRRGRGRPPGSKNKPKPQTTV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
218-233	RRGRGRPPGSKNKPKP

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 9, nucl 8.5, cyto 8.5, cysk 7

Family & Domain DBs

CDD	cd09272 RNase_HI_RT_Ty1

Amino Acid Sequences

MSIKVKEVPVEAHNSVGKVERYHAPLRRAYEILREELKNENIDREMILQMAVKAVNDSAGPDGIVPTLLVFGAYPRMTEMDPPSPSVVKRAEAIRAATKEVRRLHAERQVNDALAMRNGPNITTTLDLPLQSDVRVWREKGGWKGPYKLLAMDGEICTVDMPYGPTKFRSTVVKPYHREELPEGEGEQRRIRAEDDQVDRTVDSEPVNEPDKPVEIQRRGRGRPPGSKNKPKPQTTVRRSTRGNPTHHQDLEDQFINTIWEGQDVAMALMTNKERADMELSIKLRNDGVITTPGLPFDQSRNEEIEGLIARGVFDFVRYDPVKHAGIRIFNSRLVNEIKGKATGTPFEKSRLVIQAYNDEGKGMILTQSPTIQRASQRVIVALAPSLSEKNISLSIRDITQAYVQSTTSLNRLILAHLPKEIKSKFSAGTIMVVRKPLYGIPEAGTHWWATYHKHHREKLEMVTSPYDPCLLISTAKEAFGVVGMQTDDTLILGSDEFAKLEAKELAEAKFSAKPKDTLSPENPLIFNGCVLTQKEGDVAVELRQKEQGKKLKLIDHKSKDLKQAYMEQRARGAYIATICQPEAAFDLSVAAQHQDPTEADVNALNKRIIWQMKNLDRGIKYVAVDLPTAKHFVFVDGSFANNKDFSSQIGYEIILANESAQNEEFEITGNLIHWSSTKSKRVTRSVLASEIYGMVGGVDMAIAIGTTIKMIMDQLGFEKIPTIVCTDSYSLYECLVKLGTTKEKRLMIDIMALRQSYERREIMEIRWINGSDNPADAMTKADPNTALEKFITTNTLRVRVEGWVERK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.3
2	0.29
3	0.3
4	0.29
5	0.23
6	0.27
7	0.29
8	0.33
9	0.41
10	0.47
11	0.48
12	0.51
13	0.54
14	0.55
15	0.51
16	0.47
17	0.48
18	0.45
19	0.44
20	0.45
21	0.41
22	0.38
23	0.42
24	0.44
25	0.4
26	0.37
27	0.36
28	0.31
29	0.31
30	0.3
31	0.25
32	0.23
33	0.17
34	0.17
35	0.14
36	0.13
37	0.14
38	0.14
39	0.11
40	0.11
41	0.11
42	0.11
43	0.09
44	0.11
45	0.1
46	0.1
47	0.1
48	0.09
49	0.1
50	0.09
51	0.09
52	0.08
53	0.06
54	0.06
55	0.06
56	0.06
57	0.05
58	0.06
59	0.12
60	0.12
61	0.12
62	0.12
63	0.15
64	0.15
65	0.2
66	0.24
67	0.26
68	0.27
69	0.3
70	0.32
71	0.33
72	0.33
73	0.34
74	0.31
75	0.25
76	0.28
77	0.29
78	0.31
79	0.31
80	0.35
81	0.36
82	0.35
83	0.38
84	0.41
85	0.41
86	0.43
87	0.45
88	0.46
89	0.46
90	0.48
91	0.5
92	0.53
93	0.58
94	0.52
95	0.55
96	0.52
97	0.45
98	0.42
99	0.38
100	0.3
101	0.23
102	0.23
103	0.16
104	0.17
105	0.17
106	0.16
107	0.14
108	0.14
109	0.14
110	0.14
111	0.15
112	0.14
113	0.16
114	0.16
115	0.16
116	0.17
117	0.16
118	0.15
119	0.17
120	0.16
121	0.21
122	0.25
123	0.25
124	0.26
125	0.31
126	0.37
127	0.42
128	0.48
129	0.49
130	0.49
131	0.54
132	0.53
133	0.53
134	0.49
135	0.42
136	0.36
137	0.29
138	0.27
139	0.24
140	0.21
141	0.16
142	0.15
143	0.14
144	0.11
145	0.1
146	0.08
147	0.06
148	0.08
149	0.11
150	0.14
151	0.15
152	0.18
153	0.21
154	0.23
155	0.25
156	0.31
157	0.32
158	0.39
159	0.48
160	0.55
161	0.56
162	0.59
163	0.64
164	0.56
165	0.55
166	0.48
167	0.44
168	0.38
169	0.35
170	0.32
171	0.3
172	0.33
173	0.32
174	0.32
175	0.27
176	0.26
177	0.26
178	0.27
179	0.24
180	0.27
181	0.32
182	0.35
183	0.35
184	0.35
185	0.35
186	0.33
187	0.29
188	0.25
189	0.18
190	0.14
191	0.12
192	0.13
193	0.15
194	0.18
195	0.18
196	0.17
197	0.17
198	0.19
199	0.18
200	0.22
201	0.28
202	0.33
203	0.4
204	0.47
205	0.54
206	0.55
207	0.61
208	0.65
209	0.63
210	0.65
211	0.68
212	0.72
213	0.73
214	0.81
215	0.84
216	0.85
217	0.87
218	0.82
219	0.8
220	0.79
221	0.8
222	0.77
223	0.78
224	0.74
225	0.73
226	0.71
227	0.71
228	0.71
229	0.68
230	0.66
231	0.61
232	0.61
233	0.62
234	0.59
235	0.53
236	0.46
237	0.4
238	0.38
239	0.34
240	0.27
241	0.19
242	0.19
243	0.17
244	0.13
245	0.12
246	0.08
247	0.06
248	0.06
249	0.06
250	0.07
251	0.06
252	0.06
253	0.05
254	0.05
255	0.05
256	0.07
257	0.07
258	0.08
259	0.08
260	0.09
261	0.09
262	0.1
263	0.14
264	0.13
265	0.15
266	0.19
267	0.21
268	0.22
269	0.22
270	0.21
271	0.18
272	0.17
273	0.14
274	0.09
275	0.1
276	0.1
277	0.11
278	0.12
279	0.12
280	0.12
281	0.12
282	0.12
283	0.11
284	0.11
285	0.16
286	0.17
287	0.19
288	0.21
289	0.21
290	0.21
291	0.2
292	0.19
293	0.14
294	0.12
295	0.1
296	0.08
297	0.07
298	0.07
299	0.07
300	0.05
301	0.05
302	0.06
303	0.06
304	0.13
305	0.13
306	0.14
307	0.15
308	0.19
309	0.2
310	0.2
311	0.22
312	0.18
313	0.21
314	0.23
315	0.26
316	0.24
317	0.25
318	0.26
319	0.23
320	0.24
321	0.22
322	0.22
323	0.21
324	0.21
325	0.19
326	0.19
327	0.19
328	0.18
329	0.17
330	0.18
331	0.18
332	0.19
333	0.19
334	0.22
335	0.22
336	0.21
337	0.22
338	0.23
339	0.22
340	0.21
341	0.21
342	0.22
343	0.23
344	0.23
345	0.2
346	0.16
347	0.14
348	0.12
349	0.1
350	0.06
351	0.05
352	0.05
353	0.06
354	0.06
355	0.09
356	0.1
357	0.11
358	0.12
359	0.13
360	0.14
361	0.17
362	0.2
363	0.21
364	0.21
365	0.2
366	0.2
367	0.18
368	0.16
369	0.13
370	0.1
371	0.06
372	0.06
373	0.06
374	0.05
375	0.06
376	0.05
377	0.06
378	0.1
379	0.1
380	0.1
381	0.11
382	0.11
383	0.11
384	0.12
385	0.11
386	0.08
387	0.1
388	0.1
389	0.1
390	0.1
391	0.09
392	0.1
393	0.1
394	0.1
395	0.1
396	0.09
397	0.09
398	0.09
399	0.09
400	0.09
401	0.13
402	0.13
403	0.13
404	0.15
405	0.16
406	0.16
407	0.22
408	0.21
409	0.19
410	0.19
411	0.21
412	0.19
413	0.19
414	0.2
415	0.14
416	0.17
417	0.17
418	0.17
419	0.15
420	0.16
421	0.15
422	0.13
423	0.14
424	0.11
425	0.12
426	0.11
427	0.11
428	0.11
429	0.12
430	0.13
431	0.13
432	0.13
433	0.1
434	0.09
435	0.1
436	0.09
437	0.11
438	0.2
439	0.29
440	0.38
441	0.46
442	0.5
443	0.52
444	0.57
445	0.57
446	0.53
447	0.48
448	0.41
449	0.35
450	0.33
451	0.31
452	0.26
453	0.22
454	0.18
455	0.12
456	0.1
457	0.1
458	0.09
459	0.09
460	0.09
461	0.12
462	0.12
463	0.12
464	0.12
465	0.09
466	0.08
467	0.08
468	0.07
469	0.04
470	0.05
471	0.05
472	0.05
473	0.04
474	0.05
475	0.04
476	0.04
477	0.04
478	0.03
479	0.03
480	0.03
481	0.03
482	0.04
483	0.04
484	0.04
485	0.05
486	0.06
487	0.06
488	0.08
489	0.09
490	0.08
491	0.1
492	0.12
493	0.12
494	0.12
495	0.13
496	0.13
497	0.17
498	0.18
499	0.2
500	0.21
501	0.22
502	0.24
503	0.31
504	0.33
505	0.35
506	0.37
507	0.39
508	0.39
509	0.4
510	0.37
511	0.3
512	0.28
513	0.2
514	0.17
515	0.11
516	0.1
517	0.1
518	0.11
519	0.13
520	0.12
521	0.12
522	0.12
523	0.12
524	0.11
525	0.1
526	0.09
527	0.11
528	0.15
529	0.15
530	0.15
531	0.2
532	0.23
533	0.26
534	0.34
535	0.39
536	0.4
537	0.46
538	0.5
539	0.52
540	0.58
541	0.63
542	0.65
543	0.62
544	0.66
545	0.67
546	0.66
547	0.67
548	0.62
549	0.55
550	0.47
551	0.51
552	0.49
553	0.53
554	0.51
555	0.43
556	0.43
557	0.41
558	0.38
559	0.29
560	0.23
561	0.14
562	0.13
563	0.13
564	0.12
565	0.13
566	0.12
567	0.13
568	0.12
569	0.11
570	0.11
571	0.11
572	0.09
573	0.08
574	0.09
575	0.08
576	0.09
577	0.08
578	0.08
579	0.07
580	0.08
581	0.08
582	0.08
583	0.09
584	0.13
585	0.15
586	0.14
587	0.14
588	0.15
589	0.18
590	0.18
591	0.2
592	0.15
593	0.13
594	0.15
595	0.21
596	0.24
597	0.24
598	0.29
599	0.36
600	0.43
601	0.49
602	0.48
603	0.48
604	0.43
605	0.43
606	0.4
607	0.33
608	0.27
609	0.23
610	0.24
611	0.19
612	0.19
613	0.18
614	0.17
615	0.16
616	0.18
617	0.15
618	0.14
619	0.13
620	0.14
621	0.17
622	0.14
623	0.17
624	0.15
625	0.17
626	0.16
627	0.17
628	0.16
629	0.14
630	0.14
631	0.12
632	0.12
633	0.12
634	0.17
635	0.16
636	0.16
637	0.17
638	0.17
639	0.16
640	0.17
641	0.15
642	0.09
643	0.09
644	0.08
645	0.09
646	0.1
647	0.1
648	0.1
649	0.1
650	0.1
651	0.11
652	0.1
653	0.09
654	0.09
655	0.08
656	0.08
657	0.08
658	0.09
659	0.08
660	0.08
661	0.08
662	0.11
663	0.19
664	0.26
665	0.34
666	0.39
667	0.46
668	0.54
669	0.61
670	0.64
671	0.63
672	0.64
673	0.6
674	0.58
675	0.52
676	0.43
677	0.36
678	0.3
679	0.23
680	0.15
681	0.1
682	0.06
683	0.05
684	0.04
685	0.03
686	0.02
687	0.02
688	0.02
689	0.02
690	0.02
691	0.02
692	0.03
693	0.03
694	0.03
695	0.03
696	0.03
697	0.04
698	0.05
699	0.07
700	0.07
701	0.08
702	0.09
703	0.13
704	0.13
705	0.13
706	0.14
707	0.12
708	0.13
709	0.13
710	0.15
711	0.12
712	0.13
713	0.16
714	0.17
715	0.18
716	0.18
717	0.2
718	0.18
719	0.18
720	0.19
721	0.16
722	0.16
723	0.15
724	0.14
725	0.13
726	0.19
727	0.28
728	0.32
729	0.37
730	0.42
731	0.47
732	0.48
733	0.5
734	0.46
735	0.37
736	0.4
737	0.37
738	0.34
739	0.32
740	0.31
741	0.27
742	0.28
743	0.3
744	0.26
745	0.3
746	0.27
747	0.28
748	0.33
749	0.36
750	0.35
751	0.42
752	0.4
753	0.35
754	0.38
755	0.35
756	0.32
757	0.31
758	0.32
759	0.23
760	0.22
761	0.21
762	0.18
763	0.18
764	0.16
765	0.16
766	0.15
767	0.19
768	0.19
769	0.2
770	0.2
771	0.23
772	0.29
773	0.26
774	0.26
775	0.21
776	0.22
777	0.22
778	0.22
779	0.25
780	0.2
781	0.26
782	0.29
783	0.36
784	0.35
785	0.34
786	0.34
787	0.32
788	0.38

A0A1Q5SYE2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer