Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Q5U1M6

Protein Details
Accession A0A1Q5U1M6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-24DDGVGPRKRRRIGPPGSEPYVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-14KRRR
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 10.5, cyto 4.5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001180  CNH_dom  
IPR032914  Vam6/VPS39/TRAP1  
IPR019453  VPS39/TGF_beta_rcpt-assoc_2  
Gene Ontology GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF10367  Vps39_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50219  CNH  
Amino Acid Sequences MASDDGVGPRKRRRIGPPGSEPYVLRSLFDDVPLATDDSSDVYITCVEYWDGNLYIGTSAAEVLHFVCLPATSDDDSSEPIFILASRLPIPFQNEPSDSDPQGVRQIVILPSVNKACILCNGMVTFYMLPELSPAFGNTKVNHCRWIGGLDLNQDAASEEDPVVMIAVQNSIMLIRIGEGARRIKQIKFPGCLVAARRGTIACAADTHSYSLLEVEHQQKIPLFPISSSSEVFESGHVEDIPAAPQTPLKRSPSSSYPSSPPMDPHVHGRSSSLNTFVGMLQPHAQRGHSRSPSGTPDPFTSTGSIRRSSSEERDEGEEGSKQQTSKSPEREAQAAESDNVKPLPPLPPPKPAQKQLQPHVVSPTPSEFLLVTGTEETEPGVGLFVDMDGEVVRGTINFHRYPKSVVIDAGEDDQSLQPNDDSKEEYVLALIDVGEDGKQQTRLEIQRWDDDPAEIERHKKWLDIPSSSDEVLSARVGLRHTLSPSDLDQNEIGKLLQMVRLKTPLLSPHVATVDPRTQDSIEQQKTEKELFESQELTESEGSKKGDSGSADRDWESQRNAEEAKFVRGLGKLRSSLVLWSGSQVWRLLKNPLVIQLENTLQKAQQVDSKGRITLQRDAVMELMVSIQDIEPKTETEFLGLGYVKQKASLLLYGDLLSMHADHRADPTIRNTERALLSGNLDPRLALLFIPLLRCEVLQGPQGIWIQSGLADTTAKYLKQVEQMSDATEVHSSVLNMVKRFLLSWQQKRGYGSIPDETYVLDSTDAALLHLVLEQDAHLSAQQRASSTRSELNKLVDNWKGNFERAVALLEQYRRLYILSRLYQSQKMSRNVLKTWRRIIDGESDAGGEVTGAGVEAQMRKYLVKIKDAQLVEEYGSWLAGRNPALGIQVFADHSSRVRLEPADVVALLKERAPNAVQVYLEHLVFTKHYTQYADDLIAYYLDEVLSVLESSLEARESLAESYSTYRALRPPKPTYLNFITENTPAEPWWQSRLRLLQLLSGTSGTQFSTTALPSGITYSIPNVLARIEPYQDNLVSESIILDGLQGHHRAALRLLTHGLGDYDSAIRYCLFGGPRSTTTSGGTQPELAGHDLQTTLFRHLLDEFLQIQDLTERIERTSDLLARFGAWFDVREVLELVPEDWSVDILGGFLVQVFRTLVSQSREARIERALSAGLNLRVSVQYTDSMEKAGPWVEDGEGLRRLKGASKTEAGVSAGGDVITAGEDSDFGDVVSPTV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.68
2 0.74
3 0.78
4 0.8
5 0.8
6 0.78
7 0.73
8 0.64
9 0.58
10 0.55
11 0.45
12 0.35
13 0.28
14 0.29
15 0.27
16 0.27
17 0.23
18 0.16
19 0.18
20 0.19
21 0.18
22 0.13
23 0.12
24 0.12
25 0.12
26 0.13
27 0.11
28 0.09
29 0.09
30 0.1
31 0.11
32 0.1
33 0.1
34 0.1
35 0.1
36 0.12
37 0.14
38 0.14
39 0.14
40 0.13
41 0.13
42 0.12
43 0.12
44 0.1
45 0.07
46 0.07
47 0.07
48 0.06
49 0.06
50 0.07
51 0.08
52 0.08
53 0.08
54 0.08
55 0.08
56 0.11
57 0.12
58 0.15
59 0.15
60 0.15
61 0.17
62 0.17
63 0.2
64 0.18
65 0.17
66 0.14
67 0.12
68 0.11
69 0.1
70 0.12
71 0.1
72 0.12
73 0.14
74 0.15
75 0.16
76 0.19
77 0.25
78 0.28
79 0.31
80 0.34
81 0.34
82 0.38
83 0.42
84 0.44
85 0.38
86 0.36
87 0.33
88 0.29
89 0.33
90 0.29
91 0.24
92 0.2
93 0.24
94 0.21
95 0.24
96 0.24
97 0.19
98 0.23
99 0.24
100 0.23
101 0.2
102 0.2
103 0.18
104 0.19
105 0.22
106 0.18
107 0.19
108 0.19
109 0.19
110 0.18
111 0.19
112 0.15
113 0.12
114 0.13
115 0.1
116 0.09
117 0.1
118 0.1
119 0.09
120 0.1
121 0.11
122 0.12
123 0.15
124 0.19
125 0.19
126 0.28
127 0.35
128 0.36
129 0.4
130 0.38
131 0.37
132 0.35
133 0.35
134 0.28
135 0.26
136 0.26
137 0.24
138 0.24
139 0.23
140 0.21
141 0.19
142 0.17
143 0.13
144 0.1
145 0.09
146 0.08
147 0.08
148 0.08
149 0.08
150 0.08
151 0.06
152 0.06
153 0.05
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.05
159 0.06
160 0.06
161 0.05
162 0.05
163 0.08
164 0.09
165 0.1
166 0.15
167 0.2
168 0.24
169 0.3
170 0.33
171 0.33
172 0.4
173 0.49
174 0.52
175 0.5
176 0.49
177 0.47
178 0.46
179 0.46
180 0.42
181 0.4
182 0.34
183 0.31
184 0.3
185 0.26
186 0.25
187 0.25
188 0.23
189 0.14
190 0.13
191 0.16
192 0.17
193 0.18
194 0.18
195 0.15
196 0.14
197 0.14
198 0.14
199 0.11
200 0.11
201 0.15
202 0.18
203 0.21
204 0.21
205 0.23
206 0.24
207 0.25
208 0.26
209 0.25
210 0.21
211 0.17
212 0.21
213 0.24
214 0.25
215 0.24
216 0.23
217 0.19
218 0.19
219 0.19
220 0.15
221 0.13
222 0.12
223 0.13
224 0.11
225 0.11
226 0.11
227 0.11
228 0.11
229 0.1
230 0.1
231 0.08
232 0.12
233 0.14
234 0.19
235 0.25
236 0.29
237 0.33
238 0.36
239 0.41
240 0.45
241 0.48
242 0.47
243 0.45
244 0.44
245 0.45
246 0.45
247 0.4
248 0.36
249 0.36
250 0.36
251 0.33
252 0.36
253 0.36
254 0.35
255 0.34
256 0.33
257 0.32
258 0.32
259 0.32
260 0.27
261 0.22
262 0.21
263 0.21
264 0.2
265 0.17
266 0.13
267 0.14
268 0.16
269 0.17
270 0.2
271 0.2
272 0.21
273 0.23
274 0.28
275 0.36
276 0.35
277 0.37
278 0.36
279 0.39
280 0.45
281 0.46
282 0.43
283 0.36
284 0.34
285 0.37
286 0.37
287 0.34
288 0.29
289 0.25
290 0.29
291 0.3
292 0.3
293 0.26
294 0.27
295 0.31
296 0.34
297 0.38
298 0.37
299 0.36
300 0.35
301 0.38
302 0.37
303 0.32
304 0.29
305 0.24
306 0.19
307 0.2
308 0.2
309 0.16
310 0.17
311 0.22
312 0.28
313 0.34
314 0.4
315 0.43
316 0.45
317 0.48
318 0.49
319 0.45
320 0.39
321 0.34
322 0.29
323 0.24
324 0.23
325 0.2
326 0.19
327 0.18
328 0.15
329 0.12
330 0.13
331 0.17
332 0.21
333 0.29
334 0.3
335 0.38
336 0.42
337 0.52
338 0.58
339 0.59
340 0.62
341 0.62
342 0.68
343 0.66
344 0.72
345 0.64
346 0.58
347 0.57
348 0.5
349 0.42
350 0.35
351 0.31
352 0.22
353 0.2
354 0.19
355 0.14
356 0.12
357 0.12
358 0.1
359 0.09
360 0.08
361 0.09
362 0.08
363 0.08
364 0.07
365 0.06
366 0.06
367 0.05
368 0.05
369 0.04
370 0.04
371 0.04
372 0.03
373 0.03
374 0.03
375 0.04
376 0.03
377 0.04
378 0.03
379 0.04
380 0.04
381 0.03
382 0.06
383 0.09
384 0.14
385 0.17
386 0.2
387 0.23
388 0.24
389 0.28
390 0.3
391 0.3
392 0.27
393 0.24
394 0.23
395 0.21
396 0.2
397 0.19
398 0.14
399 0.11
400 0.11
401 0.1
402 0.1
403 0.1
404 0.09
405 0.08
406 0.11
407 0.12
408 0.13
409 0.14
410 0.13
411 0.15
412 0.15
413 0.14
414 0.11
415 0.1
416 0.09
417 0.07
418 0.06
419 0.04
420 0.03
421 0.04
422 0.04
423 0.04
424 0.05
425 0.06
426 0.08
427 0.08
428 0.09
429 0.16
430 0.19
431 0.22
432 0.26
433 0.27
434 0.31
435 0.33
436 0.34
437 0.28
438 0.25
439 0.24
440 0.21
441 0.22
442 0.18
443 0.19
444 0.18
445 0.22
446 0.22
447 0.21
448 0.23
449 0.27
450 0.31
451 0.3
452 0.33
453 0.32
454 0.34
455 0.33
456 0.29
457 0.21
458 0.17
459 0.15
460 0.12
461 0.08
462 0.06
463 0.08
464 0.08
465 0.09
466 0.1
467 0.11
468 0.12
469 0.13
470 0.13
471 0.13
472 0.14
473 0.19
474 0.17
475 0.17
476 0.17
477 0.17
478 0.16
479 0.15
480 0.13
481 0.08
482 0.08
483 0.07
484 0.11
485 0.13
486 0.13
487 0.14
488 0.16
489 0.16
490 0.16
491 0.17
492 0.16
493 0.18
494 0.19
495 0.18
496 0.18
497 0.19
498 0.19
499 0.18
500 0.18
501 0.18
502 0.17
503 0.17
504 0.16
505 0.16
506 0.17
507 0.21
508 0.27
509 0.25
510 0.26
511 0.26
512 0.26
513 0.29
514 0.29
515 0.24
516 0.17
517 0.19
518 0.19
519 0.2
520 0.19
521 0.16
522 0.2
523 0.19
524 0.18
525 0.16
526 0.15
527 0.14
528 0.16
529 0.17
530 0.13
531 0.13
532 0.12
533 0.13
534 0.13
535 0.15
536 0.17
537 0.18
538 0.19
539 0.19
540 0.21
541 0.21
542 0.22
543 0.2
544 0.17
545 0.17
546 0.18
547 0.18
548 0.16
549 0.18
550 0.16
551 0.18
552 0.16
553 0.16
554 0.16
555 0.17
556 0.19
557 0.17
558 0.19
559 0.17
560 0.17
561 0.18
562 0.16
563 0.15
564 0.14
565 0.13
566 0.1
567 0.1
568 0.11
569 0.11
570 0.11
571 0.12
572 0.12
573 0.13
574 0.14
575 0.15
576 0.16
577 0.18
578 0.17
579 0.22
580 0.23
581 0.21
582 0.2
583 0.2
584 0.2
585 0.19
586 0.19
587 0.14
588 0.11
589 0.12
590 0.12
591 0.11
592 0.12
593 0.13
594 0.15
595 0.19
596 0.2
597 0.19
598 0.19
599 0.22
600 0.22
601 0.24
602 0.25
603 0.24
604 0.23
605 0.24
606 0.22
607 0.19
608 0.15
609 0.1
610 0.08
611 0.04
612 0.04
613 0.03
614 0.03
615 0.06
616 0.06
617 0.07
618 0.07
619 0.08
620 0.09
621 0.1
622 0.1
623 0.09
624 0.09
625 0.08
626 0.09
627 0.09
628 0.09
629 0.09
630 0.11
631 0.1
632 0.1
633 0.1
634 0.09
635 0.1
636 0.1
637 0.1
638 0.09
639 0.1
640 0.1
641 0.09
642 0.09
643 0.08
644 0.06
645 0.05
646 0.05
647 0.06
648 0.06
649 0.06
650 0.08
651 0.1
652 0.11
653 0.12
654 0.15
655 0.23
656 0.23
657 0.25
658 0.24
659 0.25
660 0.24
661 0.24
662 0.22
663 0.14
664 0.15
665 0.16
666 0.17
667 0.14
668 0.13
669 0.12
670 0.11
671 0.11
672 0.09
673 0.06
674 0.05
675 0.06
676 0.07
677 0.07
678 0.07
679 0.07
680 0.07
681 0.07
682 0.08
683 0.08
684 0.09
685 0.11
686 0.11
687 0.11
688 0.14
689 0.15
690 0.14
691 0.13
692 0.11
693 0.08
694 0.08
695 0.08
696 0.05
697 0.05
698 0.05
699 0.05
700 0.07
701 0.08
702 0.08
703 0.09
704 0.1
705 0.12
706 0.18
707 0.2
708 0.19
709 0.21
710 0.22
711 0.22
712 0.22
713 0.2
714 0.14
715 0.13
716 0.12
717 0.08
718 0.09
719 0.07
720 0.07
721 0.11
722 0.12
723 0.13
724 0.13
725 0.13
726 0.13
727 0.13
728 0.13
729 0.19
730 0.26
731 0.33
732 0.4
733 0.43
734 0.45
735 0.46
736 0.46
737 0.4
738 0.35
739 0.31
740 0.27
741 0.25
742 0.23
743 0.21
744 0.2
745 0.17
746 0.14
747 0.11
748 0.07
749 0.06
750 0.06
751 0.07
752 0.07
753 0.06
754 0.05
755 0.05
756 0.05
757 0.06
758 0.05
759 0.04
760 0.04
761 0.04
762 0.04
763 0.05
764 0.05
765 0.05
766 0.07
767 0.08
768 0.1
769 0.11
770 0.12
771 0.13
772 0.16
773 0.16
774 0.17
775 0.22
776 0.23
777 0.26
778 0.27
779 0.28
780 0.31
781 0.31
782 0.32
783 0.3
784 0.31
785 0.28
786 0.32
787 0.31
788 0.27
789 0.26
790 0.22
791 0.19
792 0.17
793 0.17
794 0.11
795 0.11
796 0.14
797 0.14
798 0.16
799 0.15
800 0.14
801 0.13
802 0.13
803 0.14
804 0.15
805 0.22
806 0.23
807 0.25
808 0.28
809 0.32
810 0.35
811 0.36
812 0.39
813 0.38
814 0.39
815 0.43
816 0.44
817 0.45
818 0.44
819 0.51
820 0.52
821 0.5
822 0.53
823 0.5
824 0.48
825 0.45
826 0.44
827 0.41
828 0.35
829 0.3
830 0.23
831 0.2
832 0.17
833 0.16
834 0.14
835 0.06
836 0.04
837 0.03
838 0.03
839 0.02
840 0.02
841 0.02
842 0.04
843 0.05
844 0.06
845 0.07
846 0.08
847 0.08
848 0.1
849 0.18
850 0.2
851 0.25
852 0.29
853 0.32
854 0.39
855 0.39
856 0.38
857 0.32
858 0.3
859 0.25
860 0.2
861 0.17
862 0.1
863 0.09
864 0.08
865 0.07
866 0.07
867 0.1
868 0.1
869 0.1
870 0.1
871 0.11
872 0.12
873 0.12
874 0.11
875 0.08
876 0.09
877 0.09
878 0.09
879 0.09
880 0.08
881 0.09
882 0.11
883 0.11
884 0.11
885 0.13
886 0.13
887 0.14
888 0.15
889 0.16
890 0.14
891 0.13
892 0.13
893 0.11
894 0.11
895 0.1
896 0.1
897 0.1
898 0.09
899 0.12
900 0.12
901 0.15
902 0.16
903 0.18
904 0.17
905 0.16
906 0.2
907 0.2
908 0.19
909 0.16
910 0.13
911 0.12
912 0.12
913 0.14
914 0.15
915 0.15
916 0.17
917 0.18
918 0.19
919 0.21
920 0.23
921 0.21
922 0.15
923 0.15
924 0.13
925 0.12
926 0.1
927 0.08
928 0.06
929 0.05
930 0.05
931 0.04
932 0.04
933 0.04
934 0.04
935 0.04
936 0.04
937 0.04
938 0.05
939 0.05
940 0.06
941 0.05
942 0.05
943 0.06
944 0.08
945 0.08
946 0.08
947 0.08
948 0.09
949 0.12
950 0.13
951 0.14
952 0.13
953 0.15
954 0.21
955 0.29
956 0.34
957 0.4
958 0.45
959 0.52
960 0.59
961 0.58
962 0.6
963 0.57
964 0.56
965 0.5
966 0.46
967 0.4
968 0.34
969 0.35
970 0.28
971 0.23
972 0.18
973 0.18
974 0.19
975 0.18
976 0.23
977 0.25
978 0.25
979 0.3
980 0.35
981 0.36
982 0.37
983 0.36
984 0.33
985 0.31
986 0.31
987 0.26
988 0.21
989 0.18
990 0.14
991 0.14
992 0.1
993 0.09
994 0.08
995 0.08
996 0.1
997 0.1
998 0.11
999 0.1
1000 0.1
1001 0.1
1002 0.12
1003 0.11
1004 0.09
1005 0.1
1006 0.1
1007 0.13
1008 0.13
1009 0.13
1010 0.11
1011 0.12
1012 0.12
1013 0.14
1014 0.14
1015 0.15
1016 0.14
1017 0.17
1018 0.2
1019 0.2
1020 0.2
1021 0.19
1022 0.17
1023 0.15
1024 0.14
1025 0.11
1026 0.08
1027 0.08
1028 0.06
1029 0.05
1030 0.06
1031 0.08
1032 0.11
1033 0.11
1034 0.11
1035 0.14
1036 0.16
1037 0.16
1038 0.17
1039 0.19
1040 0.17
1041 0.18
1042 0.2
1043 0.17
1044 0.16
1045 0.16
1046 0.15
1047 0.11
1048 0.1
1049 0.09
1050 0.09
1051 0.09
1052 0.09
1053 0.09
1054 0.09
1055 0.09
1056 0.1
1057 0.12
1058 0.13
1059 0.16
1060 0.2
1061 0.24
1062 0.26
1063 0.31
1064 0.32
1065 0.3
1066 0.3
1067 0.31
1068 0.31
1069 0.3
1070 0.29
1071 0.24
1072 0.22
1073 0.22
1074 0.22
1075 0.2
1076 0.17
1077 0.14
1078 0.14
1079 0.13
1080 0.13
1081 0.15
1082 0.15
1083 0.16
1084 0.17
1085 0.17
1086 0.17
1087 0.17
1088 0.19
1089 0.17
1090 0.19
1091 0.17
1092 0.16
1093 0.17
1094 0.15
1095 0.15
1096 0.14
1097 0.13
1098 0.12
1099 0.14
1100 0.14
1101 0.14
1102 0.16
1103 0.16
1104 0.17
1105 0.22
1106 0.24
1107 0.22
1108 0.23
1109 0.22
1110 0.22
1111 0.22
1112 0.2
1113 0.17
1114 0.13
1115 0.13
1116 0.13
1117 0.18
1118 0.16
1119 0.17
1120 0.18
1121 0.15
1122 0.16
1123 0.16
1124 0.15
1125 0.11
1126 0.11
1127 0.1
1128 0.09
1129 0.09
1130 0.07
1131 0.07
1132 0.06
1133 0.05
1134 0.05
1135 0.04
1136 0.04
1137 0.05
1138 0.05
1139 0.05
1140 0.06
1141 0.07
1142 0.08
1143 0.09
1144 0.11
1145 0.16
1146 0.19
1147 0.26
1148 0.29
1149 0.34
1150 0.38
1151 0.38
1152 0.4
1153 0.38
1154 0.37
1155 0.31
1156 0.29
1157 0.25
1158 0.2
1159 0.21
1160 0.24
1161 0.22
1162 0.19
1163 0.19
1164 0.18
1165 0.18
1166 0.2
1167 0.19
1168 0.15
1169 0.16
1170 0.19
1171 0.22
1172 0.21
1173 0.21
1174 0.2
1175 0.19
1176 0.19
1177 0.18
1178 0.15
1179 0.14
1180 0.15
1181 0.13
1182 0.17
1183 0.18
1184 0.21
1185 0.25
1186 0.25
1187 0.25
1188 0.24
1189 0.25
1190 0.28
1191 0.34
1192 0.35
1193 0.35
1194 0.38
1195 0.4
1196 0.4
1197 0.41
1198 0.36
1199 0.29
1200 0.23
1201 0.17
1202 0.14
1203 0.12
1204 0.09
1205 0.07
1206 0.06
1207 0.06
1208 0.05
1209 0.05
1210 0.04
1211 0.05
1212 0.05
1213 0.07
1214 0.06
1215 0.06
1216 0.08