FuNGI

A0A1Q5UHD4

Protein Details

Accession

A0A1Q5UHD4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
59-85	YSEWSLRPYRKPTTKLRKAYERADWDR	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
327-330	RWRG

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 8.5, cyto 8, nucl 7, mito 7, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR036691 Endo/exonu/phosph_ase_sf IPR012337 RNaseH-like_sf IPR002156 RNaseH_domain IPR036397 RNaseH_sf IPR000477 RT_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0004523 F:RNA-DNA hybrid ribonuclease activity
Pfam	View protein in Pfam PF00075 RNase_H PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50879 RNASE_H_1 PS50878 RT_POL
CDD	cd09276 Rnase_HI_RT_non_LTR cd01650 RT_nLTR_like

Amino Acid Sequences

MSLGHHLHTCLPRGTATFWPLNDPGKSTTIDQTVSDRPDMLIKCHLYHENYGSDHRATYSEWSLRPYRKPTTKLRKAYERADWDRIGAEVLLRMGPWKEIKTRPALDEAVERLTEITISAVENHTPNRRLSPYSKRWFTPDLKAQQSEVNHVRRKWQESCAEHGRHHTQSETLFEEMQEKRRTWTRTIEKAKRLYWKQFLDGAGEGKLWKAATYMKPRETWGGIPALQVESNELAENEEKAQAFLDTFFPKMNEPDEDPPVQVPPELPWPPITELEIHRALKATKGSTAPGEDGLPALVWKHLWQPLRQLITRIFTASIKLGHHPRRWRGAKIVVLRKPGKPDYSVPGAYRPISLLNTLGKLLETVVARRLSYLAEKHGLLPDTQFGGRPGRTTEQALLVLSNAIDRAWYKCKVVTLIAFDLKGAFNGVNKTSLDSRLHAKGIPATARKWIASFMSDRFASIGFDDFRTEIAPLLNAGLAQGSPLSPILFIFFNSDLVDQPVTSQGGASAFIDDYFRWRVGHSAEENLANIQSEDIPRIEEWARRTGSSFATEKTELIHLTRRKGEQLQGEVVMNGNTIEPSSKAKLLGVIFDHELRWKEHVQQAIKRATKVAIALAGLRHLRPEQMRQIYQACVAPVVDYASTVWHDPLRDKTHLRHLNTVQRVPLIRILSAFRTVATTTLEVEAHVLPTHLRLRHRAQRTIAKLHTLPRSHPIWNALLRAQRRRNNIGTSPRFPLAEALKTMNLERLDELETIDPSPLPPWRAEPFTVIDVGSDRETAVERAEAARSTSDIVVYSDASGRESHLGAAVVTLDDNLQVVESKQIQVGPMDRWSVHVAELIGIFYAISMVFMLAHQGSTNRQKQATILCDSRSALQATQNPRNKSGQRIVYAILQAATEAQAAGIALRLQWVPGHCDNPGNDAADRLAKDAACPGKTHPFRPLLSRESARLRGNILDQWEQEWRSSNKGGHLRKIDSALPANYTRRLYGSLPRNRAYLLTQLRTGHNWLSTYAKTFGFRDNDKCVCGAQETVTHVLVDCPELRGIRRKLRSEAGDAFGSVSSLLGVSTDGKRGKPDTVARARTVQAVLDFAEASQRFWSRAPRGQPNIGNGN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.33
2	0.32
3	0.34
4	0.34
5	0.32
6	0.36
7	0.38
8	0.41
9	0.38
10	0.36
11	0.34
12	0.32
13	0.33
14	0.3
15	0.33
16	0.31
17	0.31
18	0.29
19	0.31
20	0.34
21	0.36
22	0.34
23	0.29
24	0.25
25	0.31
26	0.31
27	0.3
28	0.31
29	0.31
30	0.32
31	0.36
32	0.41
33	0.37
34	0.41
35	0.42
36	0.39
37	0.39
38	0.41
39	0.4
40	0.36
41	0.32
42	0.28
43	0.25
44	0.22
45	0.25
46	0.28
47	0.31
48	0.31
49	0.36
50	0.42
51	0.47
52	0.54
53	0.56
54	0.59
55	0.62
56	0.68
57	0.74
58	0.77
59	0.81
60	0.83
61	0.85
62	0.85
63	0.83
64	0.83
65	0.81
66	0.8
67	0.77
68	0.74
69	0.65
70	0.55
71	0.49
72	0.42
73	0.33
74	0.23
75	0.17
76	0.11
77	0.12
78	0.11
79	0.1
80	0.11
81	0.11
82	0.15
83	0.18
84	0.21
85	0.28
86	0.33
87	0.39
88	0.46
89	0.5
90	0.49
91	0.5
92	0.47
93	0.42
94	0.41
95	0.38
96	0.32
97	0.28
98	0.25
99	0.2
100	0.18
101	0.16
102	0.11
103	0.09
104	0.07
105	0.07
106	0.09
107	0.1
108	0.12
109	0.14
110	0.19
111	0.25
112	0.27
113	0.29
114	0.33
115	0.36
116	0.4
117	0.46
118	0.52
119	0.56
120	0.63
121	0.67
122	0.63
123	0.65
124	0.67
125	0.64
126	0.63
127	0.62
128	0.61
129	0.61
130	0.61
131	0.57
132	0.54
133	0.5
134	0.48
135	0.47
136	0.47
137	0.47
138	0.46
139	0.54
140	0.56
141	0.62
142	0.58
143	0.58
144	0.58
145	0.56
146	0.63
147	0.64
148	0.61
149	0.55
150	0.58
151	0.56
152	0.5
153	0.48
154	0.4
155	0.34
156	0.32
157	0.34
158	0.3
159	0.25
160	0.22
161	0.21
162	0.26
163	0.26
164	0.32
165	0.33
166	0.3
167	0.33
168	0.41
169	0.45
170	0.42
171	0.5
172	0.52
173	0.58
174	0.68
175	0.73
176	0.74
177	0.76
178	0.77
179	0.77
180	0.75
181	0.73
182	0.71
183	0.66
184	0.61
185	0.59
186	0.54
187	0.47
188	0.42
189	0.35
190	0.26
191	0.23
192	0.19
193	0.14
194	0.15
195	0.11
196	0.09
197	0.09
198	0.15
199	0.23
200	0.33
201	0.4
202	0.43
203	0.44
204	0.46
205	0.5
206	0.46
207	0.39
208	0.32
209	0.29
210	0.26
211	0.24
212	0.24
213	0.21
214	0.18
215	0.16
216	0.15
217	0.12
218	0.12
219	0.12
220	0.1
221	0.11
222	0.11
223	0.12
224	0.11
225	0.13
226	0.12
227	0.12
228	0.13
229	0.11
230	0.11
231	0.11
232	0.14
233	0.13
234	0.13
235	0.14
236	0.15
237	0.16
238	0.17
239	0.18
240	0.17
241	0.2
242	0.24
243	0.28
244	0.28
245	0.28
246	0.26
247	0.25
248	0.22
249	0.18
250	0.14
251	0.12
252	0.19
253	0.2
254	0.2
255	0.2
256	0.23
257	0.25
258	0.26
259	0.25
260	0.2
261	0.21
262	0.26
263	0.3
264	0.27
265	0.25
266	0.26
267	0.25
268	0.25
269	0.27
270	0.22
271	0.2
272	0.21
273	0.22
274	0.22
275	0.24
276	0.21
277	0.18
278	0.17
279	0.14
280	0.12
281	0.11
282	0.09
283	0.07
284	0.06
285	0.06
286	0.06
287	0.07
288	0.11
289	0.16
290	0.19
291	0.21
292	0.28
293	0.35
294	0.4
295	0.4
296	0.38
297	0.36
298	0.36
299	0.36
300	0.29
301	0.23
302	0.18
303	0.19
304	0.17
305	0.17
306	0.15
307	0.19
308	0.27
309	0.34
310	0.4
311	0.47
312	0.51
313	0.59
314	0.62
315	0.61
316	0.59
317	0.59
318	0.59
319	0.6
320	0.64
321	0.57
322	0.61
323	0.61
324	0.57
325	0.57
326	0.54
327	0.47
328	0.41
329	0.4
330	0.37
331	0.4
332	0.4
333	0.34
334	0.34
335	0.33
336	0.3
337	0.27
338	0.22
339	0.18
340	0.16
341	0.16
342	0.14
343	0.13
344	0.13
345	0.13
346	0.12
347	0.1
348	0.09
349	0.09
350	0.1
351	0.09
352	0.09
353	0.14
354	0.15
355	0.15
356	0.15
357	0.15
358	0.13
359	0.16
360	0.17
361	0.16
362	0.17
363	0.18
364	0.19
365	0.21
366	0.21
367	0.17
368	0.16
369	0.14
370	0.14
371	0.14
372	0.13
373	0.12
374	0.16
375	0.16
376	0.16
377	0.18
378	0.19
379	0.2
380	0.22
381	0.21
382	0.19
383	0.2
384	0.19
385	0.15
386	0.13
387	0.11
388	0.09
389	0.07
390	0.05
391	0.04
392	0.04
393	0.05
394	0.09
395	0.13
396	0.15
397	0.16
398	0.17
399	0.19
400	0.2
401	0.22
402	0.2
403	0.2
404	0.21
405	0.22
406	0.2
407	0.18
408	0.18
409	0.16
410	0.13
411	0.1
412	0.07
413	0.07
414	0.09
415	0.1
416	0.11
417	0.12
418	0.14
419	0.14
420	0.18
421	0.18
422	0.18
423	0.21
424	0.21
425	0.22
426	0.21
427	0.2
428	0.18
429	0.2
430	0.23
431	0.22
432	0.2
433	0.23
434	0.24
435	0.23
436	0.21
437	0.2
438	0.15
439	0.15
440	0.17
441	0.14
442	0.16
443	0.16
444	0.15
445	0.14
446	0.14
447	0.12
448	0.1
449	0.11
450	0.09
451	0.09
452	0.1
453	0.09
454	0.09
455	0.1
456	0.09
457	0.07
458	0.07
459	0.06
460	0.06
461	0.06
462	0.06
463	0.05
464	0.05
465	0.04
466	0.04
467	0.03
468	0.03
469	0.03
470	0.03
471	0.04
472	0.04
473	0.04
474	0.04
475	0.06
476	0.06
477	0.06
478	0.08
479	0.08
480	0.09
481	0.09
482	0.1
483	0.09
484	0.1
485	0.1
486	0.07
487	0.07
488	0.08
489	0.08
490	0.07
491	0.07
492	0.06
493	0.06
494	0.07
495	0.06
496	0.05
497	0.05
498	0.05
499	0.06
500	0.06
501	0.08
502	0.09
503	0.1
504	0.09
505	0.1
506	0.11
507	0.12
508	0.17
509	0.15
510	0.15
511	0.16
512	0.16
513	0.16
514	0.14
515	0.13
516	0.09
517	0.08
518	0.06
519	0.06
520	0.05
521	0.06
522	0.06
523	0.07
524	0.07
525	0.1
526	0.11
527	0.13
528	0.15
529	0.2
530	0.2
531	0.2
532	0.21
533	0.21
534	0.21
535	0.22
536	0.2
537	0.15
538	0.18
539	0.18
540	0.17
541	0.16
542	0.15
543	0.12
544	0.12
545	0.19
546	0.17
547	0.2
548	0.24
549	0.24
550	0.25
551	0.27
552	0.3
553	0.27
554	0.28
555	0.26
556	0.23
557	0.23
558	0.2
559	0.18
560	0.14
561	0.09
562	0.06
563	0.05
564	0.04
565	0.04
566	0.04
567	0.05
568	0.07
569	0.09
570	0.1
571	0.1
572	0.1
573	0.14
574	0.14
575	0.14
576	0.12
577	0.13
578	0.12
579	0.13
580	0.13
581	0.12
582	0.13
583	0.12
584	0.14
585	0.14
586	0.17
587	0.2
588	0.26
589	0.28
590	0.3
591	0.36
592	0.41
593	0.42
594	0.38
595	0.36
596	0.31
597	0.27
598	0.24
599	0.18
600	0.1
601	0.09
602	0.09
603	0.08
604	0.1
605	0.09
606	0.09
607	0.09
608	0.09
609	0.12
610	0.13
611	0.17
612	0.23
613	0.28
614	0.29
615	0.3
616	0.32
617	0.3
618	0.3
619	0.26
620	0.18
621	0.13
622	0.12
623	0.1
624	0.08
625	0.08
626	0.06
627	0.05
628	0.05
629	0.06
630	0.06
631	0.07
632	0.07
633	0.07
634	0.08
635	0.1
636	0.17
637	0.21
638	0.24
639	0.27
640	0.29
641	0.39
642	0.45
643	0.46
644	0.46
645	0.47
646	0.52
647	0.54
648	0.52
649	0.42
650	0.38
651	0.36
652	0.3
653	0.29
654	0.21
655	0.16
656	0.16
657	0.17
658	0.16
659	0.17
660	0.15
661	0.11
662	0.12
663	0.11
664	0.11
665	0.11
666	0.1
667	0.09
668	0.1
669	0.1
670	0.09
671	0.1
672	0.09
673	0.08
674	0.08
675	0.07
676	0.06
677	0.09
678	0.14
679	0.16
680	0.17
681	0.22
682	0.3
683	0.39
684	0.45
685	0.47
686	0.48
687	0.54
688	0.58
689	0.6
690	0.54
691	0.49
692	0.45
693	0.46
694	0.47
695	0.4
696	0.36
697	0.33
698	0.35
699	0.33
700	0.32
701	0.3
702	0.27
703	0.28
704	0.28
705	0.26
706	0.29
707	0.32
708	0.39
709	0.45
710	0.46
711	0.5
712	0.54
713	0.56
714	0.56
715	0.59
716	0.6
717	0.58
718	0.56
719	0.53
720	0.48
721	0.43
722	0.38
723	0.35
724	0.27
725	0.23
726	0.21
727	0.2
728	0.2
729	0.2
730	0.2
731	0.2
732	0.17
733	0.15
734	0.14
735	0.14
736	0.15
737	0.14
738	0.15
739	0.12
740	0.12
741	0.12
742	0.12
743	0.1
744	0.08
745	0.1
746	0.11
747	0.11
748	0.11
749	0.15
750	0.18
751	0.21
752	0.22
753	0.23
754	0.23
755	0.23
756	0.23
757	0.18
758	0.15
759	0.13
760	0.14
761	0.12
762	0.09
763	0.08
764	0.08
765	0.09
766	0.09
767	0.09
768	0.08
769	0.08
770	0.09
771	0.1
772	0.1
773	0.1
774	0.1
775	0.1
776	0.11
777	0.11
778	0.1
779	0.09
780	0.1
781	0.1
782	0.1
783	0.1
784	0.1
785	0.1
786	0.11
787	0.1
788	0.11
789	0.11
790	0.11
791	0.11
792	0.1
793	0.1
794	0.09
795	0.09
796	0.08
797	0.06
798	0.06
799	0.06
800	0.04
801	0.04
802	0.04
803	0.04
804	0.04
805	0.04
806	0.05
807	0.08
808	0.09
809	0.1
810	0.11
811	0.12
812	0.12
813	0.14
814	0.16
815	0.15
816	0.16
817	0.17
818	0.16
819	0.19
820	0.2
821	0.19
822	0.17
823	0.16
824	0.14
825	0.13
826	0.13
827	0.11
828	0.08
829	0.07
830	0.07
831	0.05
832	0.05
833	0.03
834	0.03
835	0.03
836	0.03
837	0.04
838	0.04
839	0.06
840	0.05
841	0.06
842	0.06
843	0.07
844	0.12
845	0.21
846	0.27
847	0.3
848	0.3
849	0.31
850	0.33
851	0.4
852	0.4
853	0.37
854	0.34
855	0.31
856	0.33
857	0.33
858	0.32
859	0.27
860	0.24
861	0.19
862	0.22
863	0.27
864	0.33
865	0.42
866	0.47
867	0.47
868	0.49
869	0.56
870	0.53
871	0.55
872	0.56
873	0.53
874	0.49
875	0.48
876	0.46
877	0.42
878	0.4
879	0.32
880	0.24
881	0.17
882	0.14
883	0.12
884	0.11
885	0.07
886	0.06
887	0.05
888	0.04
889	0.05
890	0.05
891	0.05
892	0.05
893	0.04
894	0.06
895	0.06
896	0.07
897	0.09
898	0.1
899	0.16
900	0.19
901	0.21
902	0.21
903	0.25
904	0.25
905	0.28
906	0.29
907	0.25
908	0.22
909	0.21
910	0.22
911	0.22
912	0.21
913	0.18
914	0.18
915	0.16
916	0.16
917	0.22
918	0.26
919	0.22
920	0.23
921	0.26
922	0.34
923	0.38
924	0.4
925	0.41
926	0.42
927	0.43
928	0.49
929	0.52
930	0.46
931	0.5
932	0.5
933	0.48
934	0.48
935	0.53
936	0.49
937	0.44
938	0.41
939	0.36
940	0.37
941	0.34
942	0.32
943	0.3
944	0.28
945	0.29
946	0.32
947	0.29
948	0.28
949	0.32
950	0.29
951	0.3
952	0.35
953	0.34
954	0.38
955	0.46
956	0.51
957	0.52
958	0.57
959	0.55
960	0.53
961	0.55
962	0.49
963	0.44
964	0.44
965	0.37
966	0.34
967	0.36
968	0.36
969	0.37
970	0.35
971	0.31
972	0.28
973	0.3
974	0.29
975	0.33
976	0.41
977	0.45
978	0.51
979	0.52
980	0.51
981	0.48
982	0.47
983	0.4
984	0.4
985	0.38
986	0.35
987	0.37
988	0.39
989	0.41
990	0.42
991	0.42
992	0.36
993	0.31
994	0.28
995	0.26
996	0.28
997	0.27
998	0.29
999	0.28
1000	0.27
1001	0.27
1002	0.28
1003	0.33
1004	0.35
1005	0.39
1006	0.4
1007	0.45
1008	0.46
1009	0.45
1010	0.44
1011	0.37
1012	0.32
1013	0.29
1014	0.25
1015	0.19
1016	0.2
1017	0.23
1018	0.25
1019	0.25
1020	0.23
1021	0.21
1022	0.2
1023	0.19
1024	0.17
1025	0.14
1026	0.13
1027	0.16
1028	0.17
1029	0.21
1030	0.3
1031	0.37
1032	0.44
1033	0.52
1034	0.56
1035	0.6
1036	0.67
1037	0.68
1038	0.65
1039	0.63
1040	0.57
1041	0.5
1042	0.44
1043	0.39
1044	0.3
1045	0.25
1046	0.18
1047	0.12
1048	0.07
1049	0.06
1050	0.06
1051	0.04
1052	0.05
1053	0.09
1054	0.11
1055	0.18
1056	0.2
1057	0.22
1058	0.27
1059	0.29
1060	0.32
1061	0.37
1062	0.43
1063	0.47
1064	0.55
1065	0.59
1066	0.58
1067	0.6
1068	0.57
1069	0.54
1070	0.47
1071	0.39
1072	0.29
1073	0.25
1074	0.23
1075	0.2
1076	0.18
1077	0.14
1078	0.21
1079	0.18
1080	0.19
1081	0.22
1082	0.22
1083	0.23
1084	0.26
1085	0.36
1086	0.35
1087	0.43
1088	0.51
1089	0.56
1090	0.62
1091	0.69
1092	0.71

A0A1Q5UHD4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer