Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Q5TRM4

Protein Details
Accession A0A1Q5TRM4    Localization Confidence Low Confidence Score 9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
88-112EEGKAASVKKRSRRRAPETNTHETDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
94-102SVKKRSRRR
Subcellular Location(s) mito 21, nucl 3, cyto 3, cyto_nucl 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR043519  NT_sf  
IPR045862  Trf4-like  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0031499  C:TRAMP complex  
GO:0043631  P:RNA polyadenylation  
Amino Acid Sequences MRLSGVQSSRLSQITTRRLRSIPPPSQDDDIFANSLRKTLDAHRTSNRARLIRKTYPRAPSPGLFRPYIPPENRAGYQPPPPPEIGSEEGKAASVKKRSRRRAPETNTHETDARPERNAIRTVGDGASGRISQTPWLSSLPNNGAPGDASAYLDAEIQALHRYLAPSPDEQNQVTQLGAMVSALLEPIVPQKPTLIGSRRTGLALAHSDLDFLLPFEDLPRSLDRTRRPSPTRPQIRDAHLNLLRQVETALQNTPEFKDQVRLSGKRSLVLEARHRPTGLSLQFYCGERVPAFTEYLQDYLVEYPSLRPLYATTRALLEARGLFGPSQAGISPDALAMLLVAFLKINHGRFPGPHRLGDQLLAFLQLYGTDVDLQSVGVAVDPPGFFDAGTLRNIVIEESAYLRGQRSLIAAKRTAAGRGNLPASRRLCVQDPTHYMNDLGRSCTRTPELQSVFATAYDQLRSACDSWESSREESSILTKALRAKFDGLEKMREQIVHPQTC
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.48
3 0.5
4 0.52
5 0.53
6 0.56
7 0.62
8 0.63
9 0.61
10 0.59
11 0.61
12 0.59
13 0.62
14 0.57
15 0.5
16 0.43
17 0.37
18 0.31
19 0.27
20 0.27
21 0.22
22 0.24
23 0.21
24 0.18
25 0.19
26 0.25
27 0.34
28 0.35
29 0.42
30 0.47
31 0.55
32 0.57
33 0.61
34 0.61
35 0.58
36 0.58
37 0.61
38 0.63
39 0.65
40 0.72
41 0.73
42 0.74
43 0.75
44 0.76
45 0.73
46 0.69
47 0.64
48 0.62
49 0.62
50 0.57
51 0.5
52 0.46
53 0.46
54 0.48
55 0.52
56 0.47
57 0.42
58 0.42
59 0.46
60 0.46
61 0.43
62 0.4
63 0.34
64 0.4
65 0.43
66 0.42
67 0.4
68 0.4
69 0.37
70 0.35
71 0.37
72 0.32
73 0.3
74 0.26
75 0.24
76 0.23
77 0.22
78 0.21
79 0.18
80 0.21
81 0.26
82 0.33
83 0.41
84 0.52
85 0.62
86 0.72
87 0.8
88 0.83
89 0.85
90 0.86
91 0.87
92 0.86
93 0.84
94 0.77
95 0.69
96 0.61
97 0.5
98 0.49
99 0.46
100 0.41
101 0.33
102 0.34
103 0.35
104 0.39
105 0.42
106 0.35
107 0.29
108 0.27
109 0.28
110 0.24
111 0.22
112 0.17
113 0.15
114 0.15
115 0.13
116 0.13
117 0.11
118 0.11
119 0.12
120 0.13
121 0.14
122 0.13
123 0.15
124 0.16
125 0.16
126 0.21
127 0.23
128 0.24
129 0.24
130 0.22
131 0.21
132 0.19
133 0.19
134 0.15
135 0.11
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.07
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.07
149 0.08
150 0.09
151 0.12
152 0.14
153 0.15
154 0.17
155 0.22
156 0.24
157 0.23
158 0.24
159 0.22
160 0.21
161 0.18
162 0.15
163 0.11
164 0.08
165 0.07
166 0.06
167 0.04
168 0.03
169 0.03
170 0.03
171 0.03
172 0.02
173 0.03
174 0.07
175 0.09
176 0.09
177 0.09
178 0.1
179 0.11
180 0.14
181 0.19
182 0.21
183 0.23
184 0.25
185 0.27
186 0.27
187 0.26
188 0.25
189 0.19
190 0.17
191 0.14
192 0.13
193 0.12
194 0.11
195 0.11
196 0.1
197 0.11
198 0.08
199 0.06
200 0.05
201 0.04
202 0.04
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.08
207 0.09
208 0.13
209 0.15
210 0.21
211 0.26
212 0.34
213 0.39
214 0.46
215 0.5
216 0.54
217 0.62
218 0.67
219 0.71
220 0.68
221 0.69
222 0.65
223 0.65
224 0.64
225 0.56
226 0.53
227 0.46
228 0.42
229 0.37
230 0.33
231 0.28
232 0.21
233 0.19
234 0.13
235 0.12
236 0.12
237 0.11
238 0.1
239 0.11
240 0.12
241 0.12
242 0.12
243 0.11
244 0.1
245 0.15
246 0.15
247 0.21
248 0.27
249 0.28
250 0.29
251 0.35
252 0.35
253 0.31
254 0.32
255 0.28
256 0.25
257 0.27
258 0.32
259 0.33
260 0.35
261 0.34
262 0.33
263 0.31
264 0.29
265 0.32
266 0.26
267 0.23
268 0.2
269 0.22
270 0.24
271 0.24
272 0.24
273 0.17
274 0.17
275 0.13
276 0.14
277 0.14
278 0.13
279 0.14
280 0.12
281 0.14
282 0.13
283 0.14
284 0.12
285 0.1
286 0.09
287 0.09
288 0.09
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.11
293 0.11
294 0.1
295 0.1
296 0.11
297 0.16
298 0.21
299 0.21
300 0.18
301 0.18
302 0.2
303 0.2
304 0.18
305 0.15
306 0.1
307 0.1
308 0.1
309 0.1
310 0.09
311 0.09
312 0.09
313 0.07
314 0.07
315 0.06
316 0.07
317 0.07
318 0.08
319 0.08
320 0.07
321 0.07
322 0.06
323 0.06
324 0.04
325 0.03
326 0.03
327 0.03
328 0.03
329 0.03
330 0.03
331 0.07
332 0.1
333 0.11
334 0.13
335 0.15
336 0.16
337 0.18
338 0.25
339 0.32
340 0.33
341 0.34
342 0.33
343 0.35
344 0.35
345 0.35
346 0.28
347 0.19
348 0.16
349 0.15
350 0.13
351 0.1
352 0.09
353 0.06
354 0.07
355 0.06
356 0.06
357 0.06
358 0.06
359 0.07
360 0.07
361 0.07
362 0.06
363 0.06
364 0.05
365 0.04
366 0.04
367 0.04
368 0.07
369 0.07
370 0.08
371 0.08
372 0.08
373 0.08
374 0.08
375 0.11
376 0.1
377 0.11
378 0.11
379 0.1
380 0.11
381 0.11
382 0.11
383 0.09
384 0.07
385 0.07
386 0.09
387 0.11
388 0.1
389 0.11
390 0.12
391 0.13
392 0.13
393 0.13
394 0.14
395 0.2
396 0.24
397 0.29
398 0.29
399 0.29
400 0.32
401 0.32
402 0.33
403 0.29
404 0.27
405 0.25
406 0.28
407 0.32
408 0.3
409 0.31
410 0.35
411 0.33
412 0.33
413 0.33
414 0.31
415 0.31
416 0.35
417 0.37
418 0.38
419 0.43
420 0.47
421 0.46
422 0.44
423 0.4
424 0.37
425 0.39
426 0.32
427 0.3
428 0.27
429 0.3
430 0.3
431 0.35
432 0.36
433 0.34
434 0.37
435 0.42
436 0.42
437 0.41
438 0.41
439 0.38
440 0.36
441 0.31
442 0.28
443 0.2
444 0.19
445 0.15
446 0.16
447 0.14
448 0.14
449 0.18
450 0.17
451 0.17
452 0.17
453 0.2
454 0.23
455 0.29
456 0.31
457 0.3
458 0.31
459 0.3
460 0.28
461 0.26
462 0.26
463 0.23
464 0.2
465 0.19
466 0.2
467 0.28
468 0.32
469 0.33
470 0.33
471 0.33
472 0.36
473 0.42
474 0.48
475 0.44
476 0.46
477 0.45
478 0.45
479 0.44
480 0.41
481 0.37
482 0.38