FuNGI

A0A1Q5TIC2

Protein Details

Accession

A0A1Q5TIC2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-27	MPSEKIDKKRKRSSDRHERPTKKTALQ	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
8-22	KKRKRSSDRHERPTK
465-494	KGGKAEAAARRVARLRIPLEFPKVSRGARK

Subcellular Location(s)

nucl 11, cyto_nucl 10.333, mito_nucl 9.833, cyto 8.5, mito 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR009668 RNA_pol-assoc_fac_A49-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF06870 RNA_pol_I_A49

Amino Acid Sequences

MPSEKIDKKRKRSSDRHERPTKKTALQALPTLAASVVEDKSELAPVIATTPGVLNSKGLRFNPYTKTRHDVERTTTRNPGIVSTEMLLQSSEHQKMDFIGREGTGEDADSQLKHYIAVVDPERKTWQVIEARRVTVRGAVRSRKPEEDEEESEEEMSTMRAQRTNLTNTFGTKQSRKAVQSMAENAQLSSAPAGTLNEAGAALISSLPANVASGLAKASNVQAEVQAAKPLPQPDLTAVHPSDVYSLETLVPGGHSTLRQLTGIDEWTQQVEAGLGVVTGSRYVSNRVVAVAQSGNPTQIQVLRFIQLLLEFTRSLKSMGRDKGAGPGSKKLPPRDDFRKILSSTSGAAKAGKEEEESNVELLPDSVVDAVRRRFAPQGGFLSKHDLTLLHTTICALSFHIPPQPAKDGGSSSLGGNSPNELATDPSDLRDDLRLDSSTIQQYFRELGCRIDKPRESEFSKWNIKGGKAEAAARRVARLRIPLEFPKVSRGARK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.92
2	0.93
3	0.94
4	0.94
5	0.92
6	0.89
7	0.88
8	0.85
9	0.79
10	0.75
11	0.74
12	0.71
13	0.67
14	0.64
15	0.56
16	0.5
17	0.44
18	0.37
19	0.27
20	0.19
21	0.15
22	0.14
23	0.12
24	0.1
25	0.1
26	0.11
27	0.12
28	0.13
29	0.12
30	0.09
31	0.09
32	0.08
33	0.1
34	0.09
35	0.08
36	0.07
37	0.08
38	0.11
39	0.12
40	0.12
41	0.13
42	0.17
43	0.22
44	0.26
45	0.27
46	0.3
47	0.33
48	0.39
49	0.46
50	0.51
51	0.51
52	0.5
53	0.55
54	0.52
55	0.58
56	0.58
57	0.54
58	0.54
59	0.59
60	0.6
61	0.59
62	0.61
63	0.52
64	0.49
65	0.44
66	0.38
67	0.31
68	0.27
69	0.24
70	0.2
71	0.22
72	0.19
73	0.18
74	0.16
75	0.12
76	0.15
77	0.2
78	0.22
79	0.19
80	0.19
81	0.19
82	0.21
83	0.27
84	0.25
85	0.21
86	0.2
87	0.2
88	0.2
89	0.2
90	0.19
91	0.13
92	0.11
93	0.09
94	0.09
95	0.1
96	0.1
97	0.11
98	0.12
99	0.12
100	0.11
101	0.11
102	0.12
103	0.12
104	0.17
105	0.19
106	0.25
107	0.25
108	0.28
109	0.3
110	0.28
111	0.28
112	0.24
113	0.27
114	0.28
115	0.32
116	0.39
117	0.4
118	0.42
119	0.42
120	0.42
121	0.35
122	0.32
123	0.31
124	0.3
125	0.34
126	0.38
127	0.44
128	0.51
129	0.55
130	0.54
131	0.54
132	0.52
133	0.5
134	0.5
135	0.47
136	0.44
137	0.42
138	0.37
139	0.34
140	0.28
141	0.22
142	0.15
143	0.12
144	0.09
145	0.1
146	0.11
147	0.14
148	0.14
149	0.19
150	0.24
151	0.3
152	0.29
153	0.3
154	0.29
155	0.3
156	0.32
157	0.31
158	0.31
159	0.28
160	0.31
161	0.33
162	0.38
163	0.38
164	0.38
165	0.38
166	0.37
167	0.38
168	0.37
169	0.34
170	0.31
171	0.29
172	0.26
173	0.22
174	0.18
175	0.14
176	0.1
177	0.08
178	0.05
179	0.05
180	0.05
181	0.05
182	0.06
183	0.05
184	0.05
185	0.05
186	0.05
187	0.04
188	0.04
189	0.03
190	0.03
191	0.03
192	0.03
193	0.03
194	0.03
195	0.03
196	0.03
197	0.03
198	0.04
199	0.04
200	0.04
201	0.04
202	0.04
203	0.05
204	0.05
205	0.06
206	0.06
207	0.06
208	0.06
209	0.06
210	0.07
211	0.08
212	0.08
213	0.09
214	0.09
215	0.1
216	0.12
217	0.13
218	0.13
219	0.12
220	0.13
221	0.13
222	0.16
223	0.15
224	0.17
225	0.16
226	0.15
227	0.14
228	0.14
229	0.13
230	0.11
231	0.1
232	0.06
233	0.07
234	0.06
235	0.06
236	0.06
237	0.05
238	0.05
239	0.04
240	0.05
241	0.05
242	0.05
243	0.06
244	0.07
245	0.08
246	0.08
247	0.08
248	0.09
249	0.09
250	0.1
251	0.11
252	0.1
253	0.09
254	0.1
255	0.09
256	0.08
257	0.07
258	0.06
259	0.04
260	0.04
261	0.03
262	0.03
263	0.03
264	0.03
265	0.03
266	0.03
267	0.03
268	0.04
269	0.05
270	0.08
271	0.09
272	0.1
273	0.11
274	0.11
275	0.11
276	0.11
277	0.12
278	0.1
279	0.09
280	0.1
281	0.1
282	0.1
283	0.1
284	0.1
285	0.09
286	0.11
287	0.11
288	0.12
289	0.13
290	0.14
291	0.14
292	0.14
293	0.13
294	0.1
295	0.11
296	0.09
297	0.1
298	0.09
299	0.1
300	0.11
301	0.11
302	0.12
303	0.13
304	0.16
305	0.22
306	0.26
307	0.28
308	0.28
309	0.28
310	0.34
311	0.36
312	0.35
313	0.29
314	0.32
315	0.33
316	0.37
317	0.42
318	0.4
319	0.44
320	0.44
321	0.51
322	0.54
323	0.58
324	0.56
325	0.56
326	0.58
327	0.5
328	0.48
329	0.41
330	0.33
331	0.28
332	0.27
333	0.23
334	0.17
335	0.17
336	0.15
337	0.15
338	0.16
339	0.14
340	0.13
341	0.13
342	0.15
343	0.17
344	0.18
345	0.16
346	0.15
347	0.14
348	0.12
349	0.11
350	0.09
351	0.05
352	0.05
353	0.05
354	0.06
355	0.07
356	0.11
357	0.12
358	0.17
359	0.17
360	0.19
361	0.22
362	0.25
363	0.27
364	0.29
365	0.35
366	0.35
367	0.37
368	0.36
369	0.4
370	0.36
371	0.33
372	0.28
373	0.2
374	0.2
375	0.23
376	0.23
377	0.16
378	0.16
379	0.16
380	0.16
381	0.17
382	0.13
383	0.09
384	0.11
385	0.13
386	0.15
387	0.19
388	0.21
389	0.21
390	0.26
391	0.28
392	0.26
393	0.26
394	0.27
395	0.24
396	0.24
397	0.26
398	0.22
399	0.18
400	0.2
401	0.19
402	0.18
403	0.16
404	0.15
405	0.13
406	0.12
407	0.13
408	0.1
409	0.11
410	0.12
411	0.16
412	0.15
413	0.16
414	0.17
415	0.17
416	0.18
417	0.2
418	0.2
419	0.18
420	0.21
421	0.2
422	0.2
423	0.22
424	0.26
425	0.28
426	0.29
427	0.28
428	0.25
429	0.26
430	0.28
431	0.27
432	0.27
433	0.21
434	0.26
435	0.32
436	0.38
437	0.4
438	0.46
439	0.5
440	0.51
441	0.57
442	0.59
443	0.57
444	0.58
445	0.6
446	0.59
447	0.64
448	0.59
449	0.57
450	0.54
451	0.51
452	0.5
453	0.47
454	0.45
455	0.39
456	0.44
457	0.44
458	0.43
459	0.46
460	0.41
461	0.42
462	0.39
463	0.4
464	0.38
465	0.41
466	0.41
467	0.41
468	0.47
469	0.49
470	0.52
471	0.53
472	0.49
473	0.49
474	0.51

A0A1Q5TIC2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer