FuNGI

A0A1Q5UA24

Protein Details

Accession

A0A1Q5UA24

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
59-88	KSVTTASSGRKRGRPRKAQRPKPQPMETSE	Hydrophilic
241-260	QPSPERLQKRKQPHSEDLSL	Hydrophilic
1097-1122	VLLAATAKRRVRRRIKERWAQEWAKE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
67-81	GRKRGRPRKAQRPKP
154-169	RARARTAKAREARARN
1104-1155	AKRRVRRRIKERWAQEWAKERTGKPNQRPPGTVPARRNRAGASAGRRKRSAR

Subcellular Location(s)

nucl 14, cyto_nucl 11, cyto 6, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036691 Endo/exonu/phosph_ase_sf IPR005135 Endo/exonuclease/phosphatase IPR012337 RNaseH-like_sf IPR002156 RNaseH_domain IPR036397 RNaseH_sf IPR000477 RT_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0004523 F:RNA-DNA hybrid ribonuclease activity
Pfam	View protein in Pfam PF14529 Exo_endo_phos_2 PF00075 RNase_H PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50879 RNASE_H_1
CDD	cd09276 Rnase_HI_RT_non_LTR

Amino Acid Sequences

SWGTPRDSSSEELTSGVESSGLAPAARPSNGGEGTGPTPASRTDTGLQASQYATNESDKSVTTASSGRKRGRPRKAQRPKPQPMETSEDKASPIEGRSQKQPIVLDQPTFQFSTEPSAFQFSAGSTFAPLPTDTINFQPEASQATSSAQSRAERARARTAKAREARARNIAERKTSSSDASNKSARRTELAETASQERIESELSSELDEVNMRDLERQLEAQRALTGSSGHRSGESDEDFQPSPERLQKRKQPHSEDLSLNIRSKDVVMAQFLREEEVISADIIAIQEPWENPFQDNTHHPLKQTHEILYPAADDTGGRARVCMFISKKIGEHTYLAHSRDCQEIRIKTESSGELRIVNIYNDQQQGAALGLLQDKLPPIREQKGVSYLVLGDFNLHHPAWGGEDAPRDAKAEDLLDLMDAAGLDNWLAPGSVTRNQAGSQSTIDLVLASYSLREQMIACEVDYSVHTDSDHLPILTLLEINVPEAADPVKRRNWKAMDIEKFLTFALANISAMQLPKEPKPHEIDYAVDHLLDIVQQAAQASTPWAKPSVWARQGWTPECTEAISASRRQYRQYMSTHSEEDWGEYKTVRNAKGRVIGKALKQGFRQWVRDTVDKGPRGLWKVSKWARMRDQATSSNIPTLHSQEGNTPAVTSQQKVDLLRQVFFPSPPAADLSDIDSSHLPNQLTFPAMSQQEVIDAIKRAPPDKAPGEDGIPNRVWKILADNCHDFVAVLTAIFDACMRTGYNPRHFQASITVTLRKGGPRDFRQPKSYRLVALLNTLGKILESIIAMRIVWAVEEYGLLPKTHLGGRKGISVDHAIHLILDRVHRAWGRGKKVSMLLLDVAGAYDNVSHERLLNNIKQLRLGQFALWIASFLRNRSTRIKLPGYLSDSFPTPTALWEARILCVIDKNAEAARASYDKIEIESLFQQAALDRTPTVLFFTDGSGYEGMVGASAVAPREGIFNRRHLGTTDESTVYVAELNGIEMAIAKFVEQQQNNNNRPTKLVIFSDCQAAIQAVQNPKRSSGQFVLTTIYDHVRALRSLTPTFDQIPIEIRWIPAHVGVPGNETADVEAKLAATGGVENGAEQPXPEGSAGRVLLAATAKRRVRRRIKERWAQEWAKERTGKPNQRPPGTVPARRNRAGASAGRRKRSARIDWQAQGVKTLGRRNAKTAADREAVEEYIQHHQRTPPIENEAGEIPGMEIRGRQQANVRAD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.22
2	0.19
3	0.16
4	0.11
5	0.08
6	0.09
7	0.1
8	0.1
9	0.09
10	0.09
11	0.13
12	0.17
13	0.17
14	0.17
15	0.18
16	0.24
17	0.25
18	0.25
19	0.22
20	0.22
21	0.23
22	0.24
23	0.22
24	0.15
25	0.16
26	0.17
27	0.21
28	0.18
29	0.22
30	0.22
31	0.26
32	0.29
33	0.3
34	0.3
35	0.26
36	0.26
37	0.25
38	0.23
39	0.21
40	0.2
41	0.21
42	0.21
43	0.21
44	0.21
45	0.18
46	0.2
47	0.18
48	0.17
49	0.15
50	0.2
51	0.28
52	0.35
53	0.42
54	0.47
55	0.54
56	0.65
57	0.73
58	0.79
59	0.82
60	0.83
61	0.87
62	0.91
63	0.94
64	0.94
65	0.95
66	0.95
67	0.94
68	0.91
69	0.85
70	0.8
71	0.77
72	0.71
73	0.66
74	0.58
75	0.49
76	0.41
77	0.36
78	0.32
79	0.26
80	0.23
81	0.26
82	0.3
83	0.32
84	0.39
85	0.44
86	0.44
87	0.46
88	0.46
89	0.42
90	0.44
91	0.44
92	0.39
93	0.36
94	0.37
95	0.35
96	0.33
97	0.29
98	0.21
99	0.18
100	0.24
101	0.23
102	0.21
103	0.2
104	0.24
105	0.24
106	0.23
107	0.23
108	0.15
109	0.17
110	0.16
111	0.15
112	0.11
113	0.12
114	0.12
115	0.14
116	0.13
117	0.12
118	0.13
119	0.15
120	0.15
121	0.18
122	0.2
123	0.18
124	0.18
125	0.18
126	0.17
127	0.19
128	0.19
129	0.16
130	0.14
131	0.16
132	0.2
133	0.2
134	0.21
135	0.21
136	0.21
137	0.25
138	0.29
139	0.35
140	0.37
141	0.41
142	0.49
143	0.51
144	0.55
145	0.6
146	0.6
147	0.62
148	0.63
149	0.68
150	0.67
151	0.69
152	0.7
153	0.7
154	0.69
155	0.67
156	0.69
157	0.64
158	0.61
159	0.58
160	0.56
161	0.53
162	0.5
163	0.45
164	0.43
165	0.47
166	0.45
167	0.47
168	0.49
169	0.46
170	0.49
171	0.52
172	0.46
173	0.42
174	0.4
175	0.38
176	0.38
177	0.38
178	0.35
179	0.33
180	0.35
181	0.34
182	0.3
183	0.26
184	0.2
185	0.18
186	0.16
187	0.13
188	0.12
189	0.13
190	0.13
191	0.14
192	0.14
193	0.12
194	0.12
195	0.13
196	0.11
197	0.11
198	0.11
199	0.11
200	0.13
201	0.14
202	0.15
203	0.16
204	0.19
205	0.18
206	0.22
207	0.23
208	0.22
209	0.22
210	0.2
211	0.19
212	0.17
213	0.17
214	0.13
215	0.16
216	0.16
217	0.15
218	0.15
219	0.16
220	0.18
221	0.22
222	0.23
223	0.23
224	0.23
225	0.26
226	0.26
227	0.25
228	0.26
229	0.21
230	0.22
231	0.26
232	0.33
233	0.36
234	0.45
235	0.53
236	0.62
237	0.71
238	0.77
239	0.78
240	0.79
241	0.8
242	0.78
243	0.71
244	0.65
245	0.61
246	0.54
247	0.48
248	0.39
249	0.32
250	0.25
251	0.24
252	0.2
253	0.18
254	0.16
255	0.17
256	0.19
257	0.19
258	0.21
259	0.2
260	0.2
261	0.16
262	0.15
263	0.11
264	0.11
265	0.11
266	0.08
267	0.08
268	0.06
269	0.07
270	0.07
271	0.06
272	0.05
273	0.05
274	0.07
275	0.07
276	0.1
277	0.12
278	0.13
279	0.13
280	0.16
281	0.17
282	0.19
283	0.23
284	0.26
285	0.3
286	0.31
287	0.31
288	0.33
289	0.38
290	0.42
291	0.41
292	0.39
293	0.34
294	0.34
295	0.33
296	0.29
297	0.24
298	0.16
299	0.13
300	0.1
301	0.07
302	0.08
303	0.13
304	0.15
305	0.14
306	0.14
307	0.15
308	0.18
309	0.19
310	0.23
311	0.2
312	0.24
313	0.29
314	0.3
315	0.3
316	0.31
317	0.32
318	0.27
319	0.26
320	0.22
321	0.25
322	0.28
323	0.28
324	0.26
325	0.26
326	0.26
327	0.31
328	0.29
329	0.25
330	0.28
331	0.3
332	0.34
333	0.37
334	0.36
335	0.3
336	0.33
337	0.33
338	0.28
339	0.27
340	0.23
341	0.19
342	0.19
343	0.2
344	0.17
345	0.14
346	0.13
347	0.13
348	0.16
349	0.17
350	0.16
351	0.14
352	0.14
353	0.13
354	0.11
355	0.1
356	0.05
357	0.05
358	0.06
359	0.06
360	0.06
361	0.06
362	0.07
363	0.08
364	0.1
365	0.13
366	0.17
367	0.21
368	0.25
369	0.26
370	0.28
371	0.33
372	0.32
373	0.29
374	0.25
375	0.2
376	0.18
377	0.16
378	0.13
379	0.09
380	0.08
381	0.09
382	0.12
383	0.11
384	0.1
385	0.1
386	0.1
387	0.11
388	0.11
389	0.11
390	0.09
391	0.12
392	0.13
393	0.14
394	0.14
395	0.13
396	0.12
397	0.12
398	0.11
399	0.1
400	0.09
401	0.08
402	0.08
403	0.07
404	0.07
405	0.06
406	0.05
407	0.04
408	0.04
409	0.03
410	0.03
411	0.03
412	0.03
413	0.03
414	0.03
415	0.03
416	0.03
417	0.04
418	0.08
419	0.13
420	0.15
421	0.15
422	0.16
423	0.17
424	0.19
425	0.19
426	0.18
427	0.13
428	0.13
429	0.12
430	0.11
431	0.11
432	0.08
433	0.07
434	0.05
435	0.05
436	0.04
437	0.04
438	0.04
439	0.05
440	0.05
441	0.05
442	0.05
443	0.06
444	0.09
445	0.1
446	0.09
447	0.09
448	0.09
449	0.09
450	0.09
451	0.11
452	0.09
453	0.09
454	0.09
455	0.1
456	0.11
457	0.13
458	0.14
459	0.11
460	0.1
461	0.09
462	0.1
463	0.09
464	0.07
465	0.05
466	0.05
467	0.05
468	0.05
469	0.06
470	0.05
471	0.05
472	0.05
473	0.06
474	0.07
475	0.09
476	0.13
477	0.2
478	0.25
479	0.27
480	0.35
481	0.38
482	0.41
483	0.48
484	0.53
485	0.52
486	0.51
487	0.51
488	0.43
489	0.4
490	0.33
491	0.25
492	0.16
493	0.11
494	0.08
495	0.07
496	0.07
497	0.06
498	0.07
499	0.07
500	0.07
501	0.07
502	0.09
503	0.11
504	0.13
505	0.2
506	0.21
507	0.24
508	0.3
509	0.31
510	0.31
511	0.3
512	0.28
513	0.24
514	0.26
515	0.22
516	0.16
517	0.13
518	0.11
519	0.09
520	0.08
521	0.06
522	0.03
523	0.03
524	0.03
525	0.04
526	0.04
527	0.04
528	0.04
529	0.05
530	0.07
531	0.08
532	0.08
533	0.1
534	0.1
535	0.12
536	0.17
537	0.25
538	0.27
539	0.28
540	0.29
541	0.33
542	0.37
543	0.36
544	0.33
545	0.25
546	0.21
547	0.2
548	0.18
549	0.14
550	0.1
551	0.11
552	0.11
553	0.13
554	0.16
555	0.22
556	0.22
557	0.24
558	0.28
559	0.29
560	0.32
561	0.33
562	0.36
563	0.34
564	0.36
565	0.35
566	0.31
567	0.3
568	0.25
569	0.23
570	0.18
571	0.14
572	0.12
573	0.11
574	0.12
575	0.14
576	0.19
577	0.21
578	0.23
579	0.24
580	0.26
581	0.34
582	0.35
583	0.31
584	0.32
585	0.31
586	0.28
587	0.35
588	0.34
589	0.3
590	0.29
591	0.31
592	0.34
593	0.35
594	0.37
595	0.31
596	0.35
597	0.35
598	0.37
599	0.37
600	0.36
601	0.39
602	0.36
603	0.35
604	0.31
605	0.31
606	0.31
607	0.3
608	0.27
609	0.22
610	0.3
611	0.34
612	0.4
613	0.4
614	0.43
615	0.46
616	0.5
617	0.5
618	0.45
619	0.45
620	0.4
621	0.41
622	0.38
623	0.32
624	0.28
625	0.26
626	0.23
627	0.2
628	0.19
629	0.16
630	0.15
631	0.15
632	0.14
633	0.18
634	0.18
635	0.17
636	0.14
637	0.12
638	0.16
639	0.17
640	0.15
641	0.12
642	0.13
643	0.16
644	0.16
645	0.18
646	0.19
647	0.19
648	0.19
649	0.19
650	0.19
651	0.18
652	0.17
653	0.17
654	0.12
655	0.11
656	0.11
657	0.11
658	0.1
659	0.09
660	0.1
661	0.11
662	0.12
663	0.11
664	0.12
665	0.11
666	0.11
667	0.12
668	0.15
669	0.12
670	0.1
671	0.11
672	0.11
673	0.12
674	0.11
675	0.1
676	0.11
677	0.12
678	0.12
679	0.11
680	0.1
681	0.09
682	0.1
683	0.1
684	0.08
685	0.08
686	0.08
687	0.1
688	0.11
689	0.11
690	0.12
691	0.13
692	0.17
693	0.19
694	0.21
695	0.21
696	0.22
697	0.23
698	0.26
699	0.25
700	0.23
701	0.22
702	0.2
703	0.18
704	0.18
705	0.16
706	0.11
707	0.17
708	0.16
709	0.2
710	0.25
711	0.26
712	0.27
713	0.27
714	0.26
715	0.2
716	0.16
717	0.13
718	0.08
719	0.06
720	0.05
721	0.05
722	0.05
723	0.05
724	0.05
725	0.03
726	0.04
727	0.05
728	0.05
729	0.07
730	0.14
731	0.2
732	0.29
733	0.33
734	0.34
735	0.38
736	0.37
737	0.36
738	0.36
739	0.32
740	0.29
741	0.26
742	0.28
743	0.23
744	0.24
745	0.25
746	0.21
747	0.2
748	0.21
749	0.28
750	0.31
751	0.42
752	0.5
753	0.53
754	0.6
755	0.61
756	0.62
757	0.6
758	0.57
759	0.47
760	0.41
761	0.4
762	0.31
763	0.3
764	0.26
765	0.2
766	0.18
767	0.16
768	0.13
769	0.1
770	0.09
771	0.07
772	0.06
773	0.05
774	0.05
775	0.06
776	0.06
777	0.06
778	0.06
779	0.06
780	0.05
781	0.05
782	0.05
783	0.04
784	0.04
785	0.04
786	0.05
787	0.07
788	0.08
789	0.08
790	0.08
791	0.08
792	0.1
793	0.13
794	0.17
795	0.16
796	0.2
797	0.22
798	0.26
799	0.26
800	0.25
801	0.24
802	0.22
803	0.22
804	0.18
805	0.17
806	0.12
807	0.12
808	0.12
809	0.11
810	0.09
811	0.09
812	0.09
813	0.09
814	0.13
815	0.13
816	0.16
817	0.23
818	0.29
819	0.35
820	0.39
821	0.39
822	0.39
823	0.41
824	0.42
825	0.34
826	0.28
827	0.22
828	0.17
829	0.16
830	0.12
831	0.1
832	0.07
833	0.06
834	0.04
835	0.04
836	0.05
837	0.06
838	0.07
839	0.07
840	0.08
841	0.09
842	0.12
843	0.16
844	0.19
845	0.25
846	0.27
847	0.27
848	0.29
849	0.31
850	0.31
851	0.29
852	0.28
853	0.2
854	0.19
855	0.19
856	0.18
857	0.15
858	0.13
859	0.09
860	0.14
861	0.15
862	0.14
863	0.2
864	0.22
865	0.26
866	0.32
867	0.37
868	0.38
869	0.44
870	0.48
871	0.45
872	0.47
873	0.49
874	0.48
875	0.44
876	0.4
877	0.33
878	0.3
879	0.27
880	0.23
881	0.19
882	0.13
883	0.13
884	0.15
885	0.14
886	0.14
887	0.18
888	0.18
889	0.17
890	0.18
891	0.18
892	0.14
893	0.16
894	0.16
895	0.13
896	0.13
897	0.14
898	0.13
899	0.14
900	0.14
901	0.11
902	0.14
903	0.14
904	0.14
905	0.13
906	0.14
907	0.13
908	0.13
909	0.15
910	0.12
911	0.13
912	0.14
913	0.14
914	0.13
915	0.13
916	0.12
917	0.11
918	0.12
919	0.1
920	0.1
921	0.09
922	0.1
923	0.11
924	0.11
925	0.12
926	0.11
927	0.11
928	0.1
929	0.12
930	0.12
931	0.12
932	0.14
933	0.12
934	0.11
935	0.1
936	0.1
937	0.08
938	0.07
939	0.06
940	0.04
941	0.04
942	0.05
943	0.05
944	0.05
945	0.05
946	0.05
947	0.09
948	0.11
949	0.15
950	0.18
951	0.23
952	0.26
953	0.27
954	0.28
955	0.25
956	0.29
957	0.28
958	0.29
959	0.28
960	0.26
961	0.25
962	0.24
963	0.23
964	0.18
965	0.14
966	0.1
967	0.07
968	0.06
969	0.06
970	0.06
971	0.06
972	0.05
973	0.06
974	0.06
975	0.06
976	0.06
977	0.06
978	0.08
979	0.13
980	0.21
981	0.21
982	0.27
983	0.36
984	0.46
985	0.5
986	0.56
987	0.57
988	0.49
989	0.51
990	0.5
991	0.45
992	0.39
993	0.39
994	0.34
995	0.33
996	0.33
997	0.35
998	0.3
999	0.26
1000	0.22
1001	0.18
1002	0.15
1003	0.15
1004	0.2
1005	0.24
1006	0.3
1007	0.36
1008	0.37
1009	0.4
1010	0.44
1011	0.42
1012	0.42
1013	0.39
1014	0.4
1015	0.35
1016	0.35
1017	0.35
1018	0.3
1019	0.3
1020	0.25
1021	0.22
1022	0.17
1023	0.15
1024	0.16
1025	0.16
1026	0.16
1027	0.18
1028	0.2
1029	0.23
1030	0.24
1031	0.27
1032	0.27
1033	0.27
1034	0.29
1035	0.29
1036	0.25
1037	0.21
1038	0.24
1039	0.21
1040	0.22
1041	0.2
1042	0.19
1043	0.18
1044	0.18
1045	0.18
1046	0.17
1047	0.17
1048	0.16
1049	0.17
1050	0.17
1051	0.19
1052	0.19
1053	0.19
1054	0.16
1055	0.15
1056	0.14
1057	0.14
1058	0.14
1059	0.11
1060	0.11
1061	0.1
1062	0.09
1063	0.09
1064	0.08
1065	0.06
1066	0.06
1067	0.05
1068	0.06
1069	0.06
1070	0.06
1071	0.09
1072	0.1
1073	0.1
1074	0.09
1075	0.09
1076	0.09
1077	0.12
1078	0.12
1079	0.1
1080	0.1
1081	0.11
1082	0.11
1083	0.11
1084	0.11
1085	0.1
1086	0.13
1087	0.15
1088	0.18
1089	0.26
1090	0.3
1091	0.38
1092	0.46
1093	0.55
1094	0.63
1095	0.71
1096	0.78
1097	0.81
1098	0.87
1099	0.9
1100	0.9
1101	0.88
1102	0.87
1103	0.8
1104	0.77
1105	0.76
1106	0.71
1107	0.68
1108	0.66
1109	0.59
1110	0.6
1111	0.67
1112	0.7
1113	0.7
1114	0.75
1115	0.76
1116	0.76
1117	0.78
1118	0.73
1119	0.73
1120	0.72
1121	0.7
1122	0.69
1123	0.7
1124	0.72
1125	0.71
1126	0.67
1127	0.58
1128	0.53
1129	0.51
1130	0.49
1131	0.49
1132	0.51
1133	0.57
1134	0.61
1135	0.64
1136	0.62
1137	0.64
1138	0.66
1139	0.65
1140	0.65
1141	0.68
1142	0.71
1143	0.7
1144	0.76
1145	0.73
1146	0.64
1147	0.57
1148	0.47
1149	0.41
1150	0.37
1151	0.4
1152	0.39
1153	0.43
1154	0.45
1155	0.48
1156	0.55
1157	0.57
1158	0.59
1159	0.56
1160	0.56
1161	0.51
1162	0.49
1163	0.46
1164	0.41
1165	0.36
1166	0.28
1167	0.25
1168	0.21
1169	0.27
1170	0.31
1171	0.29
1172	0.3
1173	0.33
1174	0.38
1175	0.43
1176	0.46
1177	0.42
1178	0.44
1179	0.46
1180	0.43
1181	0.43
1182	0.38
1183	0.33
1184	0.27
1185	0.21
1186	0.15
1187	0.13
1188	0.13
1189	0.1
1190	0.1
1191	0.12
1192	0.22
1193	0.22
1194	0.24
1195	0.31

A0A1Q5UA24

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer