FuNGI

A0A1Q5TGW9

Protein Details

Accession

A0A1Q5TGW9

Localization Confidence

High

Confidence Score

24.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
33-52	GDPLVRPKRRPARPLGAAPG	Hydrophilic
135-155	ESQFTRPVRLHRRDPRARAHE	Basic
413-437	REARRTFGKKVRKALKKRERNFDYS	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
23-47	PMRIRRARNAGDPLVRPKRRPARPL
408-432	REKKEREARRTFGKKVRKALKKRER
490-509	GRPKHTDALKKPAGSRKRLG

Subcellular Location(s)

nucl 20, cyto 4, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSTPTNASNGPTPTGSNGAPPPPMRIRRARNAGDPLVRPKRRPARPLGAAPGANTAIKTLPARPSVPGTPSLPLPQKTRPAAVPDLRTVNGFSGPLLSQKYTDYPLVTTRKALREGMKHHIARFSSKRAIDPRDESQFTRPVRLHRRDPRARAHESHGEKMVGPDGQQLDEAEREALDARRAARDKERAENMAQIAPSVGSTTKRPNAPKQKTQQVFKSDMTKEEIARARIKYEEALPWHLEDFDNRNIWVGNYEAALSETHAVFVLENNKMRMIPAEKWYKFSAKQQFKALTIEEAEKHMSKRMKDPRWFMEKQKEVKEKQELELFAKQHKVYAGKQGGVAGREGLEASEMDFEEDRFADDEEHADLFNDEQDEETKAAEQRIKEDQLKANVFDLKEEKDYEDEEEREKKEREARRTFGKKVRKALKKRERNFDYSSGSDVNPYTDEESSDDSEVERQKEEEKRKAEEERIQKEKDSATSTKGSNTPSGRPKHTDALKKPAGSRKRLGSPGSDASGTDTSRKKAKNMHQPTSRPMSPSAAQAGKKRIRNLPLGGSGSGSDVDVGGRSTPIPSGQPFPTPAEIHAAIPATGITSSALLRVFRPRIGESKENHRRFIAIVKDVGLYGKEDKLLRPGTWRPT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.28
2	0.26
3	0.25
4	0.27
5	0.27
6	0.31
7	0.31
8	0.36
9	0.42
10	0.48
11	0.5
12	0.56
13	0.62
14	0.67
15	0.76
16	0.74
17	0.73
18	0.74
19	0.74
20	0.71
21	0.67
22	0.67
23	0.68
24	0.68
25	0.62
26	0.65
27	0.68
28	0.7
29	0.73
30	0.73
31	0.72
32	0.76
33	0.8
34	0.77
35	0.73
36	0.65
37	0.57
38	0.51
39	0.42
40	0.34
41	0.27
42	0.21
43	0.15
44	0.17
45	0.18
46	0.19
47	0.23
48	0.27
49	0.29
50	0.3
51	0.35
52	0.36
53	0.37
54	0.36
55	0.32
56	0.3
57	0.31
58	0.36
59	0.37
60	0.37
61	0.39
62	0.42
63	0.48
64	0.49
65	0.51
66	0.48
67	0.47
68	0.52
69	0.53
70	0.51
71	0.47
72	0.48
73	0.44
74	0.41
75	0.36
76	0.29
77	0.24
78	0.2
79	0.15
80	0.13
81	0.13
82	0.16
83	0.18
84	0.17
85	0.16
86	0.18
87	0.21
88	0.21
89	0.23
90	0.2
91	0.19
92	0.26
93	0.31
94	0.3
95	0.33
96	0.36
97	0.39
98	0.41
99	0.44
100	0.43
101	0.45
102	0.5
103	0.53
104	0.56
105	0.53
106	0.52
107	0.53
108	0.48
109	0.48
110	0.48
111	0.47
112	0.45
113	0.44
114	0.49
115	0.51
116	0.55
117	0.53
118	0.53
119	0.52
120	0.53
121	0.54
122	0.49
123	0.47
124	0.49
125	0.43
126	0.45
127	0.41
128	0.43
129	0.51
130	0.56
131	0.61
132	0.64
133	0.74
134	0.76
135	0.8
136	0.81
137	0.79
138	0.78
139	0.71
140	0.68
141	0.66
142	0.62
143	0.59
144	0.51
145	0.44
146	0.38
147	0.34
148	0.3
149	0.21
150	0.17
151	0.17
152	0.15
153	0.15
154	0.15
155	0.14
156	0.14
157	0.14
158	0.14
159	0.09
160	0.08
161	0.08
162	0.1
163	0.1
164	0.1
165	0.12
166	0.13
167	0.2
168	0.22
169	0.24
170	0.3
171	0.37
172	0.39
173	0.45
174	0.48
175	0.44
176	0.44
177	0.45
178	0.39
179	0.34
180	0.29
181	0.21
182	0.17
183	0.14
184	0.13
185	0.1
186	0.09
187	0.08
188	0.11
189	0.17
190	0.22
191	0.27
192	0.33
193	0.42
194	0.52
195	0.59
196	0.66
197	0.68
198	0.73
199	0.74
200	0.75
201	0.72
202	0.67
203	0.64
204	0.57
205	0.56
206	0.47
207	0.43
208	0.42
209	0.37
210	0.31
211	0.33
212	0.34
213	0.29
214	0.33
215	0.31
216	0.27
217	0.26
218	0.27
219	0.21
220	0.2
221	0.21
222	0.19
223	0.22
224	0.21
225	0.21
226	0.2
227	0.19
228	0.17
229	0.15
230	0.17
231	0.17
232	0.17
233	0.17
234	0.17
235	0.16
236	0.16
237	0.15
238	0.11
239	0.08
240	0.07
241	0.07
242	0.06
243	0.07
244	0.07
245	0.07
246	0.07
247	0.07
248	0.07
249	0.06
250	0.06
251	0.06
252	0.07
253	0.11
254	0.13
255	0.14
256	0.14
257	0.15
258	0.15
259	0.15
260	0.16
261	0.15
262	0.16
263	0.22
264	0.31
265	0.31
266	0.34
267	0.36
268	0.37
269	0.35
270	0.41
271	0.44
272	0.42
273	0.45
274	0.48
275	0.48
276	0.46
277	0.46
278	0.38
279	0.29
280	0.23
281	0.21
282	0.15
283	0.14
284	0.14
285	0.13
286	0.13
287	0.17
288	0.19
289	0.19
290	0.28
291	0.36
292	0.44
293	0.48
294	0.53
295	0.55
296	0.6
297	0.62
298	0.58
299	0.57
300	0.56
301	0.55
302	0.59
303	0.59
304	0.52
305	0.56
306	0.58
307	0.5
308	0.45
309	0.44
310	0.36
311	0.33
312	0.36
313	0.31
314	0.25
315	0.27
316	0.24
317	0.21
318	0.22
319	0.21
320	0.18
321	0.26
322	0.27
323	0.24
324	0.24
325	0.25
326	0.25
327	0.22
328	0.21
329	0.12
330	0.1
331	0.09
332	0.08
333	0.06
334	0.05
335	0.04
336	0.05
337	0.05
338	0.05
339	0.06
340	0.06
341	0.06
342	0.06
343	0.07
344	0.07
345	0.06
346	0.07
347	0.07
348	0.07
349	0.07
350	0.08
351	0.08
352	0.07
353	0.07
354	0.07
355	0.06
356	0.07
357	0.06
358	0.05
359	0.05
360	0.06
361	0.08
362	0.08
363	0.08
364	0.09
365	0.1
366	0.12
367	0.14
368	0.14
369	0.16
370	0.21
371	0.25
372	0.26
373	0.29
374	0.31
375	0.36
376	0.37
377	0.34
378	0.31
379	0.3
380	0.27
381	0.25
382	0.23
383	0.18
384	0.19
385	0.19
386	0.17
387	0.15
388	0.16
389	0.17
390	0.19
391	0.18
392	0.2
393	0.24
394	0.25
395	0.29
396	0.29
397	0.3
398	0.35
399	0.42
400	0.48
401	0.51
402	0.53
403	0.59
404	0.65
405	0.68
406	0.69
407	0.71
408	0.68
409	0.69
410	0.75
411	0.75
412	0.77
413	0.81
414	0.83
415	0.84
416	0.85
417	0.87
418	0.83
419	0.79
420	0.75
421	0.7
422	0.64
423	0.54
424	0.49
425	0.4
426	0.34
427	0.29
428	0.24
429	0.19
430	0.14
431	0.14
432	0.13
433	0.11
434	0.12
435	0.12
436	0.15
437	0.15
438	0.15
439	0.14
440	0.12
441	0.17
442	0.19
443	0.19
444	0.17
445	0.16
446	0.22
447	0.31
448	0.38
449	0.42
450	0.43
451	0.46
452	0.51
453	0.56
454	0.56
455	0.56
456	0.58
457	0.58
458	0.6
459	0.57
460	0.53
461	0.5
462	0.46
463	0.42
464	0.38
465	0.31
466	0.29
467	0.32
468	0.31
469	0.32
470	0.33
471	0.32
472	0.32
473	0.34
474	0.37
475	0.41
476	0.46
477	0.47
478	0.49
479	0.51
480	0.54
481	0.58
482	0.61
483	0.58
484	0.62
485	0.63
486	0.6
487	0.62
488	0.62
489	0.63
490	0.59
491	0.59
492	0.57
493	0.59
494	0.62
495	0.58
496	0.53
497	0.51
498	0.48
499	0.45
500	0.37
501	0.29
502	0.28
503	0.29
504	0.26
505	0.26
506	0.25
507	0.26
508	0.33
509	0.35
510	0.36
511	0.42
512	0.51
513	0.56
514	0.63
515	0.7
516	0.72
517	0.74
518	0.76
519	0.75
520	0.68
521	0.59
522	0.51
523	0.47
524	0.39
525	0.39
526	0.39
527	0.36
528	0.37
529	0.4
530	0.48
531	0.5
532	0.54
533	0.56
534	0.57
535	0.57
536	0.6
537	0.59
538	0.56
539	0.55
540	0.53
541	0.47
542	0.4
543	0.35
544	0.29
545	0.24
546	0.17
547	0.1
548	0.07
549	0.07
550	0.07
551	0.07
552	0.07
553	0.07
554	0.07
555	0.08
556	0.09
557	0.11
558	0.14
559	0.16
560	0.21
561	0.22
562	0.26
563	0.28
564	0.31
565	0.35
566	0.32
567	0.31
568	0.32
569	0.31
570	0.28
571	0.27
572	0.24
573	0.19
574	0.18
575	0.17
576	0.11
577	0.09
578	0.09
579	0.07
580	0.07
581	0.07
582	0.1
583	0.12
584	0.12
585	0.14
586	0.22
587	0.25
588	0.26
589	0.31
590	0.32
591	0.38
592	0.45
593	0.5
594	0.46
595	0.55
596	0.64
597	0.64
598	0.63
599	0.56
600	0.5
601	0.45
602	0.48
603	0.45
604	0.39
605	0.37
606	0.35
607	0.35
608	0.33
609	0.32
610	0.25
611	0.2
612	0.18
613	0.18
614	0.21
615	0.22
616	0.23
617	0.3
618	0.34
619	0.32
620	0.37

A0A1Q5TGW9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer